enzymologie Flashcards
R3
qu’es ce que le métabolisme
correspond à l’ensemble des réactions chimiques se
déroulant dans une cellule ou au niveau d’un organisme
Qui sont les principal actrices et levier de voie métaboliques
Les enzymes sont les principales actrices et leviers des différentes voies
métaboliques
Qu’es ce qu’une enzyme
Ce sont des protéines (polymère dAA) ayant une activité de catalyse spécifique d’une
réaction chimique : elles catalysent spécifiquement une réaction du
métabolisme de l’être vivant.
Qu’es ce que la catalyse dans une réaction chimique
La catalyse est l’augmentation de la vitesse d’une réaction physico-chimique.
Elle se fait grâce à un catalyseur
Si l’Energie d’activation d’une réaction est élever alors elle se feras plus rapidement
non
Si elle est importante, la vitesse de réaction est faible. Si elle est faible, la vitesse de réaction est rapide
Qu’es ce que la Courbe Gausse ?
Le graphique qui représente le nombre de chocs intermoléculaires en intervalle de
temps t en fonction de l’énergie libérée par les chocs intermoléculaire
Si l’energie d’activation est élevé alors le il y auras un grand nombre de choque
non.
De manière générale, plus l’énergie d’activation est élevée, plus la probabilité de
rencontre efficace est faible et plus la vitesse de réaction est lente
Quel effet a la catalyse sur l’energie necessaire ?
La catalyse diminue l’énergie d’activation nécessaire.
Par conséquent, la proportion de chocs qui générera un ΔG supérieur à l’énergie
d’activation augmente car le niveau d’énergie d’activation aura baissé. Ainsi la
vitesse de formation du produit C sera donc augmenté
La principale propriété fonctionnelle d’une enzyme est :
- ## Augmentation vitesse de reaction (donc diminution Energie d’activation
Qu’es ce qu’un holoprotéine et une hétéroprotéine
Holoprotéine : polypeptide constitué uniquement d’AAs.
Hétéroprotéine : assemblage d’AAs et d’autre éléments.
Qu’es ce qu’une Apoenzyme
Chez les hétéroprotéines, la partie protéique de l’enzyme est appelée
« apoenzyme »
quel est l’autre nom du model de koshland sur l’emboitement du substrat sur le site actif
induce fit
Qu’es ce qu’un cofacteur
Les cofacteurs sont des molécules ou de simples atomes qui vont être
directement impliqués dans la réaction enzymatique.
Les cofacteurs ou coenzyme sont nécessaire pour toute enzyme
non
bien qu’ils sont présents dans la majorité des enzymes : Toutes les enzymes n’ont
pas besoin de cofacteur pour fonctionner par conséquent ils ne sont pas
présents dans toutes les enzymes !
Quel est l’utilité des cofacteurs ?
o Transporter ou compléter un substrat
o Accepter un produit
o Participer à la structure de l’enzyme
Qu’es ce qui différencies les coenzyme libre de celle lié
Les groupes prosthétiques sont des cofacteurs non protéiques qui sont solidement liés à une enzyme et qui sont essentiels à son activité catalytique. Contrairement aux coenzymes libres qui se dissocient après la catalyse, les groupes prosthétiques restent fixés à l’enzyme tout au long de la réaction
Les 6 classe d’enzyme sont ?
- Oxydoréductases : transfert d’électrons.
- Transférases : Transfert de groupes chimiques d’un composé à un autre.
- Hydrolases : Coupure de liaisons grâce à l’apport d’eau.
- Lyases ou Synthases : Addition de groupes sur une double liaison ou formation d’une
double liaison par soustraction d’un groupe. - Isomérases : Transfert de groupe à l’intérieur d’une molécule pour former un isomère.
- Ligases ou Synthétases : Formation de liaisons C-C, C-S, C-O ou C-N utilisant l’énergie
fournie par la rupture d’une liaison pyrophosphate d’un triphosphonucléotide tel
que l’ATP
Pour une réaction enzymatique, la vitesse de cette réaction dépend de :
o de la probabilité de formation de P (produit)
o de la probabilité de formation du complexe ES car la formation de P en
dépend
o des concentrations de E et de S car la formation de ES en dépend
Qu’es ce que
V1= K1 [E][S]
C’est le calcul de la vitesse d’une réaction enzymatique. en effet
Les concentrations de E, S et P sont déterminées par 4 processus se
déroulent à une vitesse propre, et qui dépendent :
o de leur constante de vitesse « K »
o de la concentration des réactants .
Il est difficilement possible de mesurer la concentration enzymatique d’un complexe ES
oui
car sa
concentration est très faible comparée à la concentration en substrat ([E]««_space;[S])!!
Que se passe t’il lors d’une trop grande presence de [S] par rapport a [E]
Il y a saturation de l’enzyme.
La courbe obtenue est différente du premier protocole, c’est une
asymptote caractéristique de la réaction de Michaelienne. on remarque VMAX
