cour 1 Flashcards
Ronéo 1
Dans le cytoplasme seulement quelque molécule peuvent interagir entre elle?
non toutes ces molécules vont interagir entre elles.
ex:
Lipopolysaccharides (lipides associés à des glucides).
o Lipoprotéines (lipides associés à des protéines).
o Peptidoglycanes (peptides associés à des glucides)
Quel est la compositions des Protéine?
Les protéines sont composées d’acides aminés.
Quel est le nom de l’ordre que les acide amine ont dans la protéine.
L’ordre dans lequel les acides aminés sont liés les uns aux autres est
appelé la séquence peptidique
combien d’acide amine sont qualifié pour faire partie des proteines
21.
ce sont les acide aminé protéinogène.
Le 21ème acide aminé est la sélénocystéine
qu’es ce qu’une Protéine
Ce sont les macromolécules les plus polyvalentes dans la cellule.
quel sont les rôle de la protéine
De liaison : certaines vont pouvoirse fixer sur l’ADN et jouent un rôle
dans la régulation de l’expression de gènes : on parle de facteur
transcriptionnel.
o Dansle métabolisme : l’insuline ou hormone de croissance.
o De structure : l’actine est une molécule qui compose les fibres
musculaires.
o Catalyseur biologique : sans les enzymes il ne se passerait rien dans
l’organisme.
o De transport : cas de l’albumine (60g/L de sang) qui permet de
transporter des hormones et d’autres types de composés.
o Commutateurs de signalisation : rôle dans la transmission du signal
d’un d’endroit de la cellule à un autre. Certaines protéines comme
la protéine RAS peuvent changer de structure avec une forme
active et une forme inactive. En fonction des modifications subies,
on aura une structure différente
Qu’elle est la composition d’un acide aminé?
♦ Les acides aminés sont constitués
de molécules de carbone avec
une structure tétraédrique.
♦ Les différents composés des
acides aminés sont :
o Un groupe carboxyle.
o Une fonction amine.
o Un atome d’hydrogène.
o Un groupe R (chaîne
latérale)Q
Tout les acide aminé seront totalement différent les uns des autres ?
Non. Tous les acides aminés ont des fonctions communes liées à cette
structure générique.
Et aussi des fonctions particulières qui dépendent de la nature de la
chaîne latérale. Les propriétés des chaînes latérales sont
extrêmement importantes.
Quel est la différence entre un acide aminé inclus et isolé ?
o Quand il est isolé les propriétés de cet acide vont dépendre de la
fonction carboxylique, de la fonction amine et de la chaîne
latérale.
o Quand il est inclus à l’intérieur d’une chaîne protéique les
propriétés dépendent uniquement de la chaîne latérale
Qui sont les acide aminé indispensable a l’homme?
Du nombre de neuf:
o Histidine (HIS)
o Leucine (LEU)
o Thréonine (THR)
o Lysine (LYS)
o Tryptophane (TRP)
o Phénylalanine (PHE)
o Valine (VAL)
o Méthionine (MET)
o Isoleucine (ILE)
Hystérique le très lyrique Tristan fait vachement méditer Iseult
propriétés physicochimiques des acides aminés liées à la nature de la
chaîne latérale R, varie en fonction de :
Leur forme dans l’espace
Leur taille
la chaine latéral r vas représenté
Une variation de réactivité chimique et physique (basicité ou acidité)
et donc la charge que va prendre la molécule.
♦ Une variation de solubilité dans l’eau et donc la polarité
compositions des ACIDES AMINES HYDROPHOBES et la conséquence?
Leur chaîne latérale comporte uniquement des atomes de Carbone et d’Hydrogène.
Il seront donc Très peu polarisés = ils sont apolaires et donc Hydrophobe se comportant comme dans des lipide
sauf :proline
compositions des ACIDES AMINES HYDROPHILE et la conséquence?
♦ Leur chaîne latérale comporte des atomes de Carbone et d’Hydrogène mais aussi de l’Oxygène, du
Soufre, de l’Azote.
♦ Ils ont une affinité pour l’eau, ils sont donc solubles dans l’eau.
C’est quoi un ACIDES AMINES AMPHIPATHIQUE
A la foi hydrophile et hydrophobe. ideal pour la formation d’interface
Que dire sur la symétrie d’un acide aminé
Les acides aminés sont des molécules asymétriques.
♦ Ce Carbone α a 4 groupements différents qui l’entourent.
o Sauf la glycine qui est symétrique.
♦ La présence de ce carbone asymétrique permet d’avoir une
molécule chirale (non superposable !).
les AA de serie L sont plus dans les végétaux et les animaux.
oui.
pense a L = Life
Les acides aminés qu’on trouve dans les protéines, dans les
végétaux et dans les animaux sont plutôt de la série L.
♦ Les acides aminés de la série D on les trouve dans les bactéries, les
peptides antibiotiques et aussi dans les glycopeptides bactériens.
comment savoir si un AA est de serie L ou D
Si la fonction amine est sur la gauche alors cet acide aminé
appartient à la série L (left).
Si la fonction amine estsurla droite alors cet acide aminé appartient
à la série D (droite).
Quel est la propriété optique d’une molécule
Les molécules asymétriques dévient la lumière polarisée, cette déviation de
la lumière est appelée le pouvoir rotatoire.
♦ Tous les acides aminés ont cette propriété SAUF la glycine
Un acide aminé deviant la lumiere vers la gauhe est appeler lévogyre (-)
OUI.
o aminés pouvant dévier la lumière vers la droite : on les
appelle acides aminés dextrogyres (+).
o acides aminés pouvant dévier la lumière vers la gauche : acides
aminés lévogyre (-).
La raison de la déviation vers la gauche ou la droite dépend de la taille des
différents substituants autour du carbone asymétrique.
Si un AA est de serie L alors il est Lévogyre
NON
le fait de se dire que l’acide aminé appartient à la série L ne veut pas
dire qu’il est lévogyre. Car il y a des acides aminés de la série L qui sont
dextrogyres et des acides aminés de la série D qui sont lévogyres.
Quel est le nom de la loi pouvant mesurer le pouvoir Rotatoire
Loi de Biot
En solutions comment agissent deux AA Dextrogyre (+)?
♦ En solution, les pouvoir rotatoires d’un mélange d’acides aminés
s’additionnent
Donc addiotions de +
et si L et D alors diminution car +-
Pouvoir rotatoire de la glycine est tres elevé ?
non, le pouvoir rotatoire de la glycine est de 0°
Quel est le nom de la mesure de l’absorbtion de des AA
Mesure par spectrophotométrie
Quel sont les 3 AA (aromatique) concerné par la spectophometrie
3 AAs aromatiques sont concernés grâce à̀
leurs noyaux aromatiques :
o Phénylalanine (260nm)
o Tyrosine (275nm)
o Tryptophane (280nm)
En principe, l’absorbance des Tyr est prépondérante
Radical du Tryptophane ?
Acide aminé aromatique et possédant la plus grande chaîne latérale.
♦ Le radical est un méthyle suivi d’un noyau indole.
Radical de la Tyrosine
Le noyau aromatique de la tyrosine est le parahydroxyphénylalanine.
♦ Le radical est un méthyle suivi d’un cycle benzénique hydroxyléAYR
Les 3 AA aromatique sont amphipatique
non
Seulement la tyrosine et le tryptophane
Quel est la cause de la polarisation?
La polarisation d’une liaison covalente découle de la différence
d’électronégativité (=EN)
→ Si deux atomes ont des EN égales, le partage des électrons est équitable
alors la liaison ne sera pas polarisée.
→Si les électronégativités des atomes sont différentes, on observe alors la
création d’un moment dipolaire qui va de l’électronégativité δ- → δ+.
o Les atomes O, N et S sont plus électronégatifs que l’atome d’H
oui
voila hein
L’interaction électro statique depend de ?
La force de cette interaction dépend de :
o La distance entre groupes concernés
o L’environnement (notamment la constante diélectrique du milieu).
Les AAs polaires chargés peuvent posséder 2 chose dans leur chaîne latéral :
o Soit une fonction acide carboxylique,
o Soit une fonction basique dans leur chaîne latéral.
Les acides aminés basiques ont combien d’atome de carbone ?
♦ Elles ont 6 atomes de carbones, d’où également appelés “bases hexaniques”.
