Enzymologie Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une enzyme

A

Catalyseur biologique catalysant une réaction biochimique
Est spécifique à un ou des substrats
Est généralement une protéine

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Q

Quelle molécule ayant une activité cataytique n’est pas une protéine

A

Une ribozyme, une molécule d’ARN

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3
Q

Donne des exemples d’enzymes

A

Lipases: dans l’intestin pour la dégradation des graisses
Amylases: dans la salive pour aider à transformer l’Amidon en sucres
Maltase: dans la salive pour briser le maltose en glucose
Trypsine: dans l’intestin grêle pour décomposer les protéines en aa
Lactase: dans l’intestin grêle pour briser le lactose en glucose et galactose
Acétycholinestérase: dans les nerfs et muscles pour décomposer l’acétylcholine neurotransmetteur
DNA polymérase: dans le noyau des cellules pour synthétiser de l’ADN à partir de désoxyribionucléotides

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4
Q

COmment peut-on utiliser des enzyes comme médicament

A

Thérapie enzymatique pour corriger une déficience en enzymes, comme le lactaid utilisé dans le traitement de l’intolérance au lactose, c’est une lactase, une enzyme de la famille de béta-galactosidases clivant le lactose en glucose et galactose

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5
Q

C quoi AN-PEP

A

Aspergillus niger-derived prolyl endoprotease that qui peut arrêter le glutène d’entrer le petit intestin pour les patients intolérants au glutène

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6
Q

Que fait l’enzyme pour catalyser une réaction

A

Abaisse l’énergie d’Activation de la réaction
Elles abaissent les barrières bloquant les réactions biochimiques
Augmentnent la vitesse de réaction

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7
Q

Que requièrent les réactions en lab

A

pH, temp, pression extrêmes, pas compatibles avec la vie

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8
Q

Que permettent les enzymes

A

Des rx qui ne pourraient pas se produire à la température, pH et pression du corps

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9
Q

Quels facteurs peuvent affecter l’Activité des enzymes

A

Température et pH, chaque enzyme a un pH et une température optimale selon l’environnement dans lequel elles évoluent

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10
Q

Qu’arrive-t-il si la température est trop élevée pour une enzyme

A

Dénaturation, elle perd sa conformation fonctionnelle

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11
Q

Ou se fait la réaction catalytique

A

Site actif

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12
Q

Donne les cartaxctéristiques des enzymes

A

Très sélectives et convertissent les substrats en produits sans être elles-mêmes modifiées
Recylclées à la fin de la rx et peuvent recommencer un nouveau cycle de catalyse
Une seul molécule d’enzyme produit de nombreuses molécules de produit

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13
Q

COmment se fait la reconnaissance enzyme substrat

A

Par les liaisons chimiques faibles (Van der Whaals, ponts-H, interactions hydrophobes, liaisons ioniques)

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14
Q

Qu’Arrive-t’il s’il y a plus de liaisons faibles

A

Plus l’interaction entre 2 molécules est grande, plus l’Affinité et la spécificité sera grande

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15
Q

Quel est le mode d’action des enzymes

A

Liaison du substrat
Changement de conformation du substrat et de l’Enzyme pour que la catalyse soit possible
Produits de la réaction enzymatique

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16
Q

Quels sont les sous-sites du site actif

A

Sous-site de liaison: formé des aa maintenant le substrat en place lors de la catalyse
Sous-site catalytique: formé des aa performant la catalyse

17
Q

Quel est le rôle du sous-site de liaison

A

Détermine la spécificité de l’enzyme pour son substrat par les liens faibles

18
Q

Rôles du sous-site catalytique

A

Diminue l’énergie d’activation nécessaire
Stabilise la structure intermédiare (état de transition) durant la réaction
Catalyse la réaction

19
Q

Comment varie la vitesse de réaction en gardant [E] constante et augmentant [S]

A

Vitesse augmente jusqu’à un plateau (Vmax) quand l’enzyme est saturée de substrat

20
Q

Effet de la [E] sur la vitesse initiale de la rx

A

V Augmente proportionnellement à[E]

21
Q

C quoi Km

A

Mesure de l’affinité de l’enzyme pour le substrat
Plus Km est petit, plus l’Affinité sera grande (plus l’enzyme est efficace à petite concentration de substrat)
Concentration du substrat à laquelle la réaction est à la moitié de Vmax

22
Q

De quoi dépend l’efficacité d’une enzyme

A

Vitesse à laquelle elle transforme son substrat

23
Q

C quoi l’inhibition réversible

A

Inhibitueur se lie de façon réversible à l’enzyme par des liaisons faibles

24
Q

C quoi l’inhibtion irréversible

A

Inhibituer se lie de manière irréversible à l’enzyme par des liaisons fortes, covalentes

25
Q

Types d’inhibition réversible

A

Compétitive: substrat et inhibiteur compétitionnent pour le site actif
Non-compétitive: inhibiteur se lie à un site allostérique (autre que le site actif), induisant un changement de conformation du site actif et réduisant l’Accessibilité du site au substrat, d’où l’inhibition

26
Q

Caractéristiques de l’inhibition compétitive

A

Inhibiteur se lie au site catalytique et compétionne le substrat
Vmax ne change pas, mais Km apparent augmente (affinité diminue)

27
Q

Caractéristiques de l’inhibition non-compétitive

A

Vmax diminue
Km apparent ne change pas

28
Q

C quoi le rétrocontrôle

A

Contrôle de l’activité catalytique des enzymes dans des voies métaboliques en fonction de la quantité du produit final (réversible)
Plus rapide que de controler le niveau d’expression du gène de l’enzyme

29
Q

Types de rétrocontrôle

A

Négatif (rétroinhibition) ou le produit final inhibe la première enzyme spécifique en amont de façon non-compétitive en général
Positif

30
Q

DOnne l’exemple de rétrocontrôle dses aa

A

Négatif au niveau de plusieurs sites permets de contrôler les réactions de plusieurs voies interdépendantes
Chaque aa controle la première enzyme spécifique de sa voie de biosynthèse
Inhibition possible e la voie commune de synthèse impliquant la transformation de l’aspartate en phosphate d’aspartyl

31
Q

Quel est le mode d’inhibition de l’aspirine

A

Irréversible
Inhibe COX1 et COX2 par changement du site actif par acétylation d’une sérine , des prostaglandines synthases ou cyclooxygénases, impliqués dans les voies de douleur, d’inflammation et de fièvre et d’aggrégation plaquettaire
Produit donc un obstacle stérique empêchant le AA d’être métabolisé

32
Q

Mode d’inhibition de l’ibuprofène

A

Inhibiteur compétitif des COX, enzymes catalysant la première étape de la synthèse des médiateurs de l’inflammation: prostaglandines et thromboxane (agrégation plaquettaire)

33
Q

Que fait la péniciline

A

Inhibityeur des transpeptidases qui catalysent la synthèse de la paroi bactérienne

34
Q

Que font tétracycline et stroptomycine

A

Inhibiteurs de la synthèse protéique bactérienne

35
Q

Comment agissent la plupart des médicaments

A

Inhibent des enzymes

36
Q

Les protéines-G sont actives sous quelle forme

A

Liée à la GTP et désactivées lorsque la GTP est hydrolysée en GDP