Enzymes part 1

Question 1

کمپلکس آنزیم سوبسترا چگونه باعث کاهش انرژی فعال‌سازی می‌شود

Answer 1

قرارگیری سوبسترا در موقعیت مناسب برای انجام واکنش
آزادشدن انرژی به دنبال ایجاد پیوند بین سوبسترا و آنزیم
حلال زدایی سوبسترا بعد از شکسته‌شدن پیوند هیدروژنی با آب

Question 2

حالت انتقالی و انرژی فعال‌سازی و انرژی ازاد چیست

Answer 2

Question 3

اتصال سه نقطه‌ای آنزیم به سوبسترا را توضیح دهید و بگویید چرا لاکتات دهیدروژناز تنها روی ال لاکتات اثر کرده و نه دی لاکتات

Answer 3

Question 4

کدام آمینواسیدها در جایگاه فعال آنزیم نقش کلیدی دارند و چرا

Answer 4

هیستیدین، آسپارتات، سرین، سیستئین و گلوتامات
با برقرار کردن پیوندهای قوی و ضعیف با سوبسترا و دادن و گرفتن پروتون کمک به کاتالیز کردن می‌کنند

Question 5

سه مثال از پروتئاز‌های سرینی بزنید و بگویید شناسایی آن‌ها چگونه انجام می‌شود
یک مثال از پروتئاز آسپارتیکی

Answer 5

تریپسین ، کیموتریپسین و الاستاز
با استفاده از ماده‌ای که آنزیم و جایگاه فعال را غیرفعال می‌کند. دی‌ایزوپروپیل‌فلوروفسفات
DIFP
پپسین

Question 6

انواع واکنش‌های دو-دو را با مثال توضیح دهید

Answer 6

متوالی یا تک‌جایگزینی : تصادفی : دهیدروژناز و کیناز
منظم: اکسیدوردوکتاز وابسته به NAD(P)H
پینگ‌پنگی : آمینوترانسفراز

Question 7

انواع کوفاکتورهای معدنی را با مثال توضیح دهید

Answer 7

کوفاکتور یون‌های فلزی با اتصال سست متصل می‌شوند به آن‌ها یون فعال‌کننده و آنزیم فعال‌شونده توسط فلز می‌گونید مثل کینازها که با یون منیزیم فعال می‌شوند و این یون الکترون‌های آدنوزین‌تری‌فسفات را خنثی می‌کند

کوفاکتور‌های محکم و متالوآنزیم که به کوفاکتور گروه پروستتیک و آنزیم بدون کوفاکتور را آپولو‌آنزیم و با کوفاکتور هولوآنزیم. در این آنزیم‌ها کوفاکتور یا در واکنش اکسیداسیون احیا شرکت کرده یا با ایجاد پل فلزی اتصال آنزیم به سوبسترا را تسهیل می‌کند مثل انیدراز کربنیک دارای روی

Question 8

انواع کوآنزیم‌هارا با مثال توضیح دهید
کوآنزیم همان کوفاکتورآلی است

Answer 8

اگر اتصال سست: کوسوبسترا
این مواد به آنزیم اتصال یافته و در حین واکنش دچار تغییر می‌شوند اما چون اتصال سست است جدا شده و به کمک آنزیم دیگری به حالت عادی بازمی‌گردند مثال
NADH
که در واکنش الکترون از دست داده و سپس توسط آنزیمی یون هیدرونیوم (یک پروتون با دو الکترون) دریافت می‌کند

کوآنزیم با اتصال محکم گروه پروستتیک
این‌ها اتصال محکم به آنزیم دارند و با وجود تغییر در حین واکنش در نهایت به حالت اصلی برمی‌گردند تا هولوآنزیم فعالیت کاتالیکی خود را حفظ کند
FAD

Question 9

کوآنزیم‌هایی که منشا ویتامینی دارند را توضیح دهید

Answer 9

اکثرا باید فعال شوند اما بعضی مثل بیوتین مستقیما شرکت می‌کنند
B, A, K , C
تامین از غذا

Question 10

کوآنزیم‌های متابولیتی را توضیح دهید

Answer 10

در مسیر متابولیکی تولید می‌شوند. اغلب کوسوبسترا مثل
ATP
دهنده فسفریل در تبدیل گلوکز به گلوکز ۶ فسفات

Question 11

کوآنزیم‌های پروتئینی را توضیح دهید

Answer 11

معمولا کوچک‌تر و پایداری بیشتری به حرارت یا جز ساختار آنزیم و یا گروه پروستتیک دارای یون فلزی مثل هم، آهن و سالفور و سولفیدریل و شرکت در اکسیداسیون احیا

Question 12

نام‌گذاری آنزیم چگونه انجام می‌شود

Answer 12

Question 13

کلاس یک آنزیم‌ها را با مثال و با کوآنزیم‌های آنها توضیح دهید

Answer 13

اکسیدوردوکتاز‌ها: هر آنزیمی که با هیدروژن و اکسیژن کار دارد و در واکنش اکسیداسیون احیا شرکت می‌کند. ردوکتاز (احیا کننده) دهیدروژناز (هیدروژن می‌گیرد) اکسیداز (می‌تواند اکسیژن بدهد یا انتقال اکسیژن کند) پراکسیداز (مثل کاتالاز) اکسی‌ژناز (مونواکسی‌ژناز: دهنده‌ی یک اتم اکسیژن و دی‌اکسی‌ژناز دهنده یک مولکول اکسیژن) و هیدروکسیلاز اضافه کردن گروه هیدروکسیل . کوآنزیم‌ها
NADP+, NAD+, FAD+, FMN

Question 14

دهیدروژنازهای بی‌هوازی چه آنزیم‌هایی هستند و در چه واکنش‌هایی شرکت می‌کنند و کوآنزیم معمول

Answer 14

در غیاب اکسیژن یون هیدروژن را از یک سوبسترا به سوبسترای دیگر منتقل می‌کنند و با اکسید کردن سوبسترای اول سبب احیای سوبسترای دوم
کوآنزیم‌ها نیکوتین‌آمیدی یا فلاوینی
NAD+, NADP+, FAD , FMN

AH2 + B —-> A + BH2

Question 15

نام دیگر دهیدروژناز‌های هوازی چیست و کار آن‌هارا توضیح دهید

Answer 15

اکسیدازها با استفاده از اکسیژن سوبسترا را اکسید کرده و تولید آب یا آب‌اکسیژنه می‌کنند. اغلب متالوآنزیم هستند و اگر نیاز به حاملی برای انتقال الکترون داشته باشند، یک نوکلئوتید به ساختار آنزیم چسبیده پس به آن متالوفلاووآنزیم می‌گویند

AH2+1/2O2—> H2O + A
AH2 + O2 —> A + H2O2

Question 16

MFO چیست

Answer 16

اکسیداز با عمل مرکب . این آنزیم‌ها با اکسید کردن یک ترکیب و آزاد شدن دو هیدروژن و ترکیب آن با یک اتم اکسیژن تولید آب می‌کنند. اتم اکسیژن دیگر می‌تواند دو سرنوشت داشته باشد

اگر ترکیب دیگری نیز اکسید شود یک مولکول دیگر آب تولید می‌شود مانند سیستم آسیل کوآ چرب دسچوراز در شبکه آندوپلاسمی که دو هیدروژن از آسیل‌کوآ گرفته شده و تولید پیوند دوگانه می‌کند و هیدروژن دیگر از
NADPH + H+
یعنی یک سوبسترا و دیگری کوسوبسترا
اگر هیدروژن های کوسوبسترا به سوبسترا انتقال پیداکنند مونواکسیژناز

Question 17

منواکسیژنازها نام دیگرشان چیست از چه نوع آنزیمی هستند و چه‌عملی انجام می‌دهند

Answer 17

نوعی اکسیداز مرکب هستند به آن‌ها هیدروکسیلاز هم گفته‌می‌شود
با اکسید کردن یک سوبسترا و یک کوسوبسترا دو اتم هیدروژن را به یک اتم اکسیژن داده.و تولید آب می‌کنند سپس یک اتم اکسیژن دیگر را به سوبسترا داده و تولید هیدروکسیل می‌کند

Question 18

تتراهیدروبیوتین کوسوبسترای چه واکنشی و چه آنزیمی‌ست و نوع واکنش چیست

Answer 18

هیدروکسیله‌کننده‌ی اسید‌آمینه‌های آروماتیک فنیل‌آلانین، تیروزین و تریپتوفان
طی واکنش تتراهیدروبیوتین به دی‌هیدروبیوتین تبدیل می‌شود
نوع آنزیم هیدروکسیلاز یا مونو‌اکسی‌ژناز

Question 19

what is P450 cytochrome and where is it found and what’s its function

Answer 19

در شبکه‌آندوپلاسمی صاف تمامی سلول‌ها ولی در میتوکوندری کورتکس آدرنال و بقیه‌ی سلول‌های تولید کننده‌ی هورمون استروئیدی
آنزیم مونو‌اکسی‌ژناز یا هیدروکسیلاز است
نقش در متابولیسم اسیدهای چرب، استروئیدها، ایکوزانوئیدها و داروها

Question 20

دی‌اکسیژناز ها چه کاری انجام می‌دهند و دومثال بزنید

Answer 20

انتقال هردواتم اکسیژن به سوبسترا
در مسیر کاتابولیسم تیروزین : هموژنتیسات دی‌اکسیژناز و پاراهیدروکسی‌فنیلییرووات‌‌دی‌اکسیداز
در کاتابولیسم تریپتوفان: تریپتوفان پیرولاز

Question 21

هیدروپراکسیداز و پراکسیداز چیست و مثال برای هر کدام
گروه پروستتیک هیدروپراکسیداز‌ها چیست

Answer 21

هیدروپراکسیدازها اکسیداسیون یک سوبسترا و احیای دیگری
گیرنده‌ی الکترون یا احیا شونده پراکسید آلی یا آب‌اکسیژنه
اگر دهنده‌ی الکترون گلوتاتیون یا اسیدآسکوربیک باشد واکنش پراکسیداز
H-OOH +2 GSH -> H-O-H + GS-SG + H2O
کاتالاز هیدروپراکسیداز است که گروه پروستتیک هم دارد
H-OOH + H-OOH -> 2H2O + O2

Question 22

سوپراکسید دیس موتاز چه نوع آنزیمی‌ست و نقش آن‌را توضیح دهید

Answer 22

ردوکتاز است با احیای یک سوپر اکسید (رادیکال مخرب) و اکسیداسیون دیگری تولید آب‌اکسیژنه و اکسیژن می‌کندکه توسط کاتالاز خنثی می‌شود
O2- + O2- + 2H+ -> H2O2 + O2

Question 23

ترانسفرازها چه‌نوع آنزیمی هستند ۵ مثال بزنید

Answer 23

در انتقال گروه غیر از هیدروژن و اکسیژن نقش دارند
آمینوترانسفراز : مهم در ستنز آمینواسید / متیل ترانسفراز
آسیل ترانسفراز: مهم در سنتز چربی
کیناز ها گروه فسفریل را انتقال می‌دهند مثلا گلوکوکیناز از آت.پ به گلوکز و تولید گلوکز ۶ فسفات
فسفریلازها با انتقال گروه فسفات مثلا گلیکوژن فسفریلاز از گلیکوژن آزاد کردن گلوکز ۱ فسفات با شکستین پیوند گلیکوزیدی کوولان و آزادکردن قند فسفریله

Question 24

تیولاز چه نوع آنزیمی‌ست و چه‌کاری انجام می‌دهد

Answer 24

یک نوع ترانسفراز است که پیوند کربن کربن را طی تیولیز می‌شکند. تیولیز یعنی شکستن پیوند با افزودن تیول. تیولاز با اصافه کردن کوآنزیم آ به استواستیل کوآ تولید دو استیل‌کوآ می‌کند

Question 25

استرازها چه نوع آنزیمیی هستند یک مثال بزنید

Answer 25

هیدرولاز است یعنی با اضافه کردن مولکول آب یک پیوند سوبسترا را می‌شکند. استراز مثل لیپاز که با شکستن پیوند استری باعث تولید یک الکل و یک اسید می‌شود
R1-COO-R2 + H2O → R1-COOH + R2OH

Question 26

فسفواسترازها چه نوع آنزیمی هستند مثال بزنید

Answer 26

یک هیدرولاز است که دو نوع دارد مونوفسفواستراز و دی‌فسفواستراز
فسفاتاز پیوند مونوفسفواستری را می‌شکند و یک الکل و یک فسفات آزاد می‌کند
R-PO4 + H2O → R-OH + HPO4
نوکلئاز پیوند فسفودی‌استری را می‌شکند و یک الکل و یک مونوفسفو‌استر آزاد می‌کند
-R1ًPO4-R2 + H2O → R1-HPO4 + R2OH

Question 27

تیواستراز ها از چه کلاس آنزیمی هستند و چه واکنشی انجام می‌دهند

Answer 27

هیدرولاز هستند و با اضافه‌کردن آب به تیواستر یک اسید و یک تیول (تیو الکل) آزاد می‌کنند
شکستن پیوند تیواستری بین کربوکسیل و پیوند سولفیدی
R-CO ̴ SCoA + H2O →R-cOOH + HSCoA

Question 28

تفاوت فسفریلاز با فسفاتاز و تیولاز با تیواستراز چیست

Answer 28

فسفاتاز و تیولاز جزو کلاس ترانسفرازها و تیواستراز و فسفریلاز جزو هیدرولازها هستند.
فسفاتاز با انتقال گروه فسفات مثلا گلوکز ۶ فسفات تولید می‌کند اما فسفریلاز با شکستن پیوند فسفات و ترکیب آن با آب یک فسفات و یک الکل تولید می‌کند

تیولاز گروه تیول را از کوآنزیم آ به استواستیل کوآ منتقل کرده و دو استیل کوآ تولید می‌کند اما تیواستراز با شکستن پیوند تیول و ترکیب مولکول آب تولید تیول و اسید می‌کند

Question 29

گلیکوزیدازها چه کلاس آنزیمی هستند و انواع آنها را نام ببرید

Answer 29

هیدرولاز پیوند گلیکوزیدی را می‌شکنند . اندوگلیکوزیداز مثل آمیلاز و ااگزوگلیکوزیداز
سوکرا ، لاکتاز و مالتاز مثال‌های دیگر

Question 30

پپتیدازها چه کلاس آنزیمی و انواع

Answer 30

هیدرولاز . اگزوپپتیداز و آندوپپتیداز
پپسین، تریپسین و کیموتریپسین آندوپپتیداز هستند
دی‌پپتیداز تولید اسیدآمینه

Question 31

لیازها چه نوع آنزیم‌هایی هستند و گروه‌هایشان را نام ببرید

Answer 31

با مکانیسمی غیر از هیدرولیز پیوندها را می‌شکنند معملا برداشت آب یا کربن‌در‌اکسید و سبب شکستن پیوند دوگانه
هیدراتاز یا دهیدراتاز ، آلدولاز و دکربوکسیلاز

Question 32

هیدراتاز یا دهیدراتاز متعلق به کدام کلاس آنزیمی بوده و با مثال کار آن را توضیح دهید

Answer 32

از لیازها هستند با افزودن یا برداشتن مولکول آب منجر به تولید یا شکستن پیوند دوگانه
مثل هوماراز یا فومارات هیدراتاز که در چرخه‌ی کربس تبدیل دو طرفه‌ی مالات به فومارات و آب را انجام می‌دهد

Question 33

آلدولاز ها جزو کدام کلاس آنزیمی مثال بزنید

Answer 33

لیازها که تولید گروه آلدئیدی می‌کنند مثلا فروکتوز ۱و۶ بیس‌فسفات آلدولاز با شکستن پیوند کربن کربن در فروکتوز ۱و۶ بیس فسفات تولید دی‌هیدروکسی استن فسفات و گلیسرآلدهید ۳ فسفات می‌کند این واکنش در گلیکولیز است

Question 34

دکربوکسیلازها از کدام کلاس آنزیمی هستند مثال بزنید

Answer 34

از لیازها هستند که با برداشتن پیوند کربوکسیل از اسیدهای کربوکسیلیک تولید کربن دی‌اکسید می‌کنند اکثر سوبسترا ها آمینواسید و درنتیجه تولید آمین فعال می‌کنند که به عنوان نوروترانسمیتر استفاده می‌شود. مثال

گامابوتیریک‌اسید (گابا) از گلوتامیک اسید
سروتونین از هیدروکسی تزیپتوفان
دوپامین از هیدروکسی تیروزین
هیستامین از هیستیدین

R-CHCOO ̅-NH3+ → R-CH2-NH3+ + CO2

Question 35

ایزومرازها و ۲ زیرگروه داخل‌مولکولی آن‌ها را توضیح دهید

Answer 35

آنزیم‌هایی که تبدیل داخل مولکولی ایزومرهای نوری،هندسی و فضایی و برخی واکنش‌های اکسیداسیون احیا را کاتالیز می‌کنند
اول: اکسیدوردوکتازهای داخل موکولی که هیدروژن را در داخل مولکول جابه‌جا کرده و سبب اکسیداسیون و احیا می‌شوند مثل فسفوهگزوزایزومراز که تبدیل گلوکز ۶ فسفات به فروکتوز ۶ فسفات
دوم: انتقال گروهی غیر از هیدروژن مثل آمینو،فسفو یا متیل ترانسفرازداخل‌مولکولی یا موتاز مثل فسفوگلوکوموتاز انتقال فسفات از یک هیدروکسیل به دیگری و تبدیل گلوکز ۶ فسفات به گلوکز ۱ فسفات

Question 36

سه گروه غیر داخل مولکولی ایزومرازها را نام ببرید با مثال

Answer 36

• *اپیمراز** که ایزومرهایی که شکل فضایی حول یک کربن نامتقارن تغییر می‌کند. تبدیل گلوکز به گالاکتوز با ۴اپیمراز
• *راسماز** تبدیل انانتیومر دی و ال مثل متیل‌مالونیل‌کوآ‌اپیمراز
• *سیس و ترانس ایزومراز** که کاتالیز ترکیب حاوی پیوند دوگانه مهم در کاتابولیسم تیروزین و اسیدهای‌چرب غیراشباع

Question 37

کلاس ۶ آنزیم‌ها را توضیح دهید

Answer 37

• *لیگازها** با استفاده از انرژین آزادشده از آدنوزین‌تری فسفات یا گوانوزین‌تری‌فسفات پیوند برقرار می‌کنند
• *سنتتازها** با سنتاز گروه ۲ یا ۴ فرق دارد
• *تیوکیناز** وقتی تولید پیوند تیواستری بین کربوکسیل سوبسترا و تیول‌کوآنزیم‌آ مثلا سوکسینات تیوکیناز
• *کربوکسیلاز** با اضافه کردن کربن‌دی‌اکسید به سوبسترا مثل پیرووات کربوکسیلاز که پیرووات را به اگزالواستات تبدیل می‌کند