Effet fondateur Flashcards
Qu’est-ce qui peut influencer la génétique des pops?
- Loi de Mendel
- Mutations
- Migrations
- Sélections
- Hasard
Donner la loi de l’équilibre Hardy Weinberg
f(AA)=p^2 f(aa)=q^2 et f(Aa)=2pq*
*si pour un locus autosome on retrouve 2 allèles A et a
Quelles sont les conditions pour que l’équilibre de Hardy Weinberg soit respecté? Est-ce que ces conditions sont toutes respectées pour le cas de l’effet fondateur?
- Population infiniment nombreuse
- Pas de migration
- Pas de sélection naturelle
- Pas de nouvelle mutations
- Unions aléatoires
Les conditions 1., 2. et 5. ne sont pas respectées dans l’effet fondateur
À quoi sert l’équilibre de Hardy-Weinberg?
Permet de prédire à partir de la fréquence des allèles la présence d’un phénotype
Qu’est-ce que l’effet fondateur?
Création d’une nouvelle population à partir d’un nb relativement restreint d’individus appartenant à une pop. mère. Mène parfois à doubler ou quadrupler le taux d’indivus porteurs d’une maladie génétique si l’échantillon de pop. qui migre est non-représentatif en fct du nb de personne hétérozygote par rapport à la population mère (ex; dans la pop. mère 1 personne sur 100 était porteur et dans le nouveau groupe de 10 personne on a 1 personne porteuse)
Y a t-il effet fondateur au Qc? Pk?
Oui, car la pop. canadienne-française descend des mêmes 8500 colons français et en plus il y a eu par la suite des mvts migratoires successifs entrainant des effets fondateurs locaux dans certaines régions
Quelle a été la migration qui a mené au SLSJ?
Beaupré->Charlevoix->Saguenay
Qu’est-ce que la dérive génétique?
Modification des fréquences géniques dans une population attribuable au hasard de la transmission
V ou F: La dérive génétique est attribuable au phénomène de l’effet fondateur et non à d’autre cause
F: N’Importe quelle petite population peut vivre de la dérive génétique
Est-il vrai de dire qu’il y a de la consanguinité au SLSJ? Si non, que devrait-on dire?
Non, il y a plutôt de l’endogamie
Qu’est-ce que l’endogamie?
Unions au sein desquelles les deux partenaires proviennent de la même population (dans les pop. isolées à cause de la langue, religion, géographie ou culture)
Qu’est-ce qu’on considère comme de la cosanguinité étroite? Était-elle fréquente en nouvelle-france?
Cosanguinité étroite= moins que 5 générations proches
Rare en N-F
v ou f: Les unions cosanguines étaient aussi fréquente en N-F qu’en Europe
V, car les population étaient juxtaposées (peu de mobilité sociale ou géographique)
Quel est l’effet de l’endogamie sur l’équilibre de Weinberg-Hardy?
Le maintien toujours au départ, constant
Quel pourcentage de la population actuelle du Qc descend des immigrants français?
80%
Quelle population a particulièrement bcp immigrée au Qc entre 1846 et 1851 (10 à 15% des québecois en 1871)
Irlandais
V ou F: La population du SLSJ n’est plus isolée géographiquement de nos jours
F
Combien y a t-il d’habitants au SLSJ
285 000
Quelle est la solution qu’on trouvé des parents, chercheurs et professionels de la santé pour diminuer le fardeau actuellement présent de conditions génétiques au SLSJ?
Projet pilote de programme de dépistage de porteurs de maladies récessives (CORAMH) fondé en 1980
Quelle est la mission de CORAMH?
Prévenir les maladies héréditaires en misant sur la sensibilisation, l’information et l’éducation
Au départ de CORAMH, quelles maladies avait-on ciblées? Quel type de maladie génétiques était-ce?
5 maladies génétiques de type autosomiques récessive:
- Tyrosinémie de type 1
- Ataxie spastique de Charlevoix-Saguenay (ARSACS)
- Neuropathie préiphérique avec ou sans agénésie du corps calleux (NSMH+/-ACC)
- Syndrome de Leigh type canadien français (acidose lactique par déficit en cytochrome oxydase)
- Fibrose kystique
Est-ce que ces 5 maladies ont été retenue? Pk?
Non, pas la fibrose kystique, car le risque d’une personne au SLSJ est environ égal à celui d’un québécois caucasien, donc ça serait injuste de seulement tester au SLSJ
Les taux de porteurs de ces maladies tourne autour de combien au SLSJ?
Entre 1/23 (Leigh et neuropathie) et 1/19 (tyrosénémie de type 1 )
En quel année à débuté le projet pilote?
2010
V ou F: Le projet de dépistage de porteur offre des tests élargie partout au Québec pour tous les québecois depuis janvier 2018 disponible en ligne
F: partout au QC, mais seulement pour adultes qui planifient une grossesse vivant au SLSJ ou qui ont au moins un grand-parent venant du SLSJ ou Charlevoix
Donner les principales caractéristiques de la tyrosinémie de type 1:
- Gène
- Mutation
- Phénotype/conséquences sur la santé
- Traitement
Gène FAH muté à 95% sur IVS12+5G
-Insuffisance hépatique -> cirrhose du foie
et carcinome hépatoçR
-Tubulopathie rénale
-Crises neurologique, douleur aigüe
Traitement: NTBC prévient la maldie si débuté avant symptômes (on dépiste aussi néonatal pour cette maladie)
Donner les principales caractéristiques de l’ARSACS:
- Gène
- Mutation
- Phénotype/conséquences sur la santé
Gène SACS délété (94%) ou muté ilot cpg (C->T) (3%)
- Début symptômes = adolescence
- Ataxie et spasticité des membres inférieurs
- Aucune atteinte intelectuelle
- Pes cavus, polyneuropathie, dysfonction sphincterienne
Donner les principales caractéristiques de neuropathie sensitivomotrice héréditaire avec ou sans agénésie du corps calleux:
- Gène
- Mutation
- Phénotype/conséquences sur la santé
gène KCC3, délétion (99%)
- Hypotonie et hyporéflexie en bas âge
- Retard de développement et intellectuel
- 2/3 ont agénésie partielle ou complète du corps calleux
- Certains cas ont une présentation tardive, moins sévère
Donner les principales caractéristiques de l’acidose lactique (Leigh):
- Gène
- Mutation
- Phénotype/conséquences sur la santé
- Mortalité
Gène LRPPRCavec mutation A354V (98%)
- Retard de développement
- Hypotonie
- Lactate élevée dans le sang et le LCR
Mortalité élevée lors des crises acidotiques ou épisodes neurologiques à l’âge médian de 1.6 ans (46 décès sur 56)
Quelles sont les deux enjeux qui ont été rencontré par le projet de dépistage au SLSJ?
- Besoin de résultats rapidement (laboratoires)
- Décision de ne pas dépister pour fibrose kystique
V ou F: La distribution des maladies génétiques au Québec est plutôt homogène; elle se retrouve au SLSJ
F: la distribution géographique est hétérogène
V ou F: Les maladies génétiques ont Québec sont en majorité des maladies de type autosomiques récessive
V, mais on retrouve pas mal tous les autre modes de transmission aussi (AD, lié à l’X, mitochondrial)
V ou F: Certaines maladies génétiques sont uniques aux canadiens français
V
Quelles sont les trois type de maladies chez les canadiens français
- Uniques aux CF (ex: ARSACS ou Leigh de CF)
- Plus fréquentes chez CF (ex: Cystinosis)
- Particulières chez CF (ex: Ataxie de Friedreich ou X fragile)
V ou F: Il n’y a pas de maladie génétiques spécifiques aux premières nations du qc
F: par exemple l’encéphalopathie des Cries, l’encéphalite crie, la cirrhose amérindienne et l’ostéogénèse imparfaite type VII
V ou F: l’effet fondateur a uniquement un effet sur la prévalence (taux de porteurs) des conditions récessives
F: sur les modes de transmissions de ces conditions également
L’hétérogénéité peut-elle etre présente même dans une population issue d’un effet fondateur?
Oui
Comment peut on identifier des gènes de maladies sévères
Via apparentés ou cas de décès
ex: Atrésie intestinale multiple héréditaire (obstruction néonatale avec calcification intra-abdominale)
Donner les principales caractéristiques de l’atrésie intestinale multiple héréditaire:
- Gène
- Mutation
- Phénotype/conséquences sur la santé
- Transmission
Gène TTC7A délétion 4pb exon 7 (p.L823P)
-obstruction néonatale avec calcification intra-abdominale
Transmission: autosomique récessive suggérée par
- Récidives familiales
- Présence d’ancêtres communs
- Cosanguinité de certains parents
Quelle maladie serait un bon exemple d’hétérogénité génétique malgré la pop. issue d’un effet fondateur?
Donnez :
- Gène et mutation
- Où on en retrouve le plus au QC
- Phénotype/conséquences sur la santé
Syndrome de Joubert
-Condition hétérogène impliquant 17 gènes:
Toutes sortes de mutations identifiées sur 17 différents gènes dans 11 familles (si gène TMEM231 touché = atteinte neurologique sévère)
-Fréquence plus élevée au bas saint-laurent
-Malformation SNC, apraxie oculomtrice, apnée centrale, retard de développement
Quelle maladie serait un bon exemple de mutation témoignant du lien vers populations d’origine et/ou descendantes?
Donnez :
- Mutation ici vs dans le reste du monde
- Phénotype/conséquences sur la santé
- Autre
Neuropathie optique héréditaire de Leber
-3 mutations majeures dans l’ADN mitochondrial T14484C-> mutation principale pour les CF
G11778-> mutation principale ailleurs dans le monde
-Perte de vision centrale, suivie d’une atrophie optique
les cas de CF sont plus susceptibles de récupérer une acuité visuelle partielle ou complète
-Analyse d’haplotype suggère une fondatrice (fille du roy) unique et commune à tous les cas de CF (mm mutation retrouvée chez patients hollandais)
Quelle maladie serait un bon exemple de l’effet fondateur sur taux de maladies recessives?
Donnez:
- Mutation
- Phénotype/conséquences sur la santé
Neuropathie héréditaire sensitivo-autonome de type II?
- Deux mutations par perte de fct identifiées chez cas de Lanaudière; plus que la moitié des cas décrits sont d’origine CF
- Perte de sensibilité profonde des extrêmités et dysfonction du système nerveux autonome, menant à l’automutilation accidentelle
V ou f: Souvent la maladie génétique est plus fréquente chez les CF que autres pop.
f; elle n’est pas plus fréq. mais peut être plus homogène génétiquement
Que devrait prendre en considértion l’utilisation de tests génétiques pour mieux évaluer le taux de détection du test?
L’origine ethnique
Qu’est-il important qu’un clinicien connaisse en observant un tableau clinique donné? Pk?
Les maladies monogéniques fréquentes dans la pop. traitée, car cela permet de prioriser les investigations selon la probabilité de chaque diagnostic
En quoi est-ce qu’une connaissance de la structure génétique d’une population est utile à la pratique clinique?
- Elle permet de cibler les investigations
- Elle permet l’élaboration de tests appropriés
- Permet aussi interprétation juste des résultats du test
V ou F: Ce qui est vrai pour une population est tjr applicacle a n’importe quel individu de cette pop
F: ne vaut pas tjr pour un individu
