DNR transkripcija

Question 1

kas yra transkripcija

Answer 1

rnr sintezė, panaudojant dnr šabloną

Question 2

genų raiškai svarbu

Answer 2

1. Specifinės dnr sekos
2. sekas atpažįstantys baltymai
3. mRNR sekos

Question 3

specifinės dnr sekos:

Answer 3

1. promotorius - rnr polimerazės prisijungimo vieta, transkripcijos pradžios signalas
2. koduojantis regionas
3. terminatorius - transkripcijos pabaigos signalas
4. reguliacinės sekos - reguliacinių baltymų prisijungimo vieta, prisijungę baltymai daro įtaką genų ekspresijai, eukariotų ląstelėse reguliacinės sekos randamos įvairiose vietose

Question 4

kokius procesus vykdo sekas atpažįstantys baltymai

Answer 4

-kad genai būtų aktyviai transkribuojami, baltymai turi atpažinti specifines DNR sekas ir su jomis sąveikauti
-Kiti baltymai modifikuoja RNR transkriptus tam, kad jie taptų funkciškai aktyvūs

Question 5

mRNR sekos:

Answer 5

1. ribosomų prisijungimo vieta - Dar vadinama Shine-Dalgarno seka (bakterijose) arba Kozak seka (eukariotuose), transliacijos pradžios sritis, eukariotuose ribosomos skanuoja mRNR ieškodamos pradžios/starto kodono
2. Pradžios/Starto kodonas (dažniausiai AUG) - Nulemia pirmą aminošūgštį polipeptide. Paprastai formilmetioninas (bakterijose) arba
   metioninas (eukariotuose)
3. Kodonai - Atviro skaitymo rėmelis - 3 nukleotidų seka, žyminti tam tikrą aminorūgštį
4. Pabaigos kodonas (dažniausiai UGA, UAA, UAG) - Signalas žymintis baltymų sintezės pabaigą

Question 6

ką reiškia policistroninė mRNR

Answer 6

koduoja daugiau nei vieną polipeptidą

Question 7

matricinė/ anti-sense grnadinė

Answer 7

DNR grandinė, kuri yra transkribuojama

Question 8

koduojanti/reikšminė grandinė

Answer 8

priešinga matricinei grandinė. Jos seka yra identiška RNR transkriptui

Question 9

Molekuliniame lygmenyje genas yra

Answer 9

transkripcijos vienetas

Question 10

Struktūriniai genai yra tie,

Answer 10

kurie koduoja polipeptidą
sudarančias aminorūgštis

Question 11

kaip susidaro iRNR

Answer 11

kai yra transkribuojami struktūriniai genai

Question 12

kad apsprendžia aminorūgščių seką polipeptidinėje
grandinėje

Answer 12

iRNR/mRNR sekos

Question 13

pagrindinės transkripcijos
stadijos:

Answer 13

1. Iniciacija
2. Elongacija
3. Terminacija

Question 14

kas yra promotorius

Answer 14

DNR seka “skatinanti” genų
ekspresiją

Question 15

kur randami promotoriai

Answer 15

regione esančiame prieš
regioną, kuriame prasideda transkripcija

Question 16

promotoriaus regionas

Answer 16

• -35 5’TTGTCA3’ (-35 seka)
• -10 5’TATAAT3’ (Pribnow Box, -10 seka)
• +1 transkripcijos pradžios regionas

Question 17

kas yra RNR polimerazė

Answer 17

fermentas, katalizuojantis RNR sintezę

Question 18

RNR polimerazės holoenzimas

Answer 18

1. Šerdis (a, a (alfa); b, b’ (beta); ω (omega)) - sintetina RNR naudodama DNR kaip matricą
2. sigma subvienetas/ veiksnys - atpažįsta promotoriaus sritį, po iniciacijos disocijuoja nuo RNR pol holoenzimo

Question 19

ką atpažįsta sigma subvnt

Answer 19

abu -35 ir -10 DNR regionus

Question 20

už ką atsakingas sigma subvnto spiralės-posūkio-spiralės motyvas

Answer 20

atsakingas už stipresnį RNR polimerazės holoenzimo prisirišimą prie DNR

Question 21

kas pažymi iniciacijos pabaigą

Answer 21

Sigma faktorius atsiskiria nuo bendro RNR
polimerazės holoenzimo

Question 22

RNR polimerazės holoenzimas geba:

Answer 22

• Išskirti dvi DNR grandines
• Stabilizuoti viengrandininę DNR
• Slopinti DNR superspiralizaciją
• Transkribuoja šabloninę grandinę
• Judėjimo kryptis DNR grandine yra 3’->5’ (Skaito DNR molekulę 3’->5’ kryptmi)
• Sintetina RNR grandinę, kurios kryptis 5’->3’
• Sintetina visas RNR (mRNR, tRNR, rRNR, snRNR ir t.t.)

Question 23

terminacija prokariotuose įvyksta, kai

Answer 23

trumpas RNR-DNR hibridas,
susidarantis atvirame komplekse, yra priverčiamas išsiskirti. Tai
paleidžia tiek naujai susintetintą RNR, tiek ir RNR polimerazę.

Question 24

E. coli terminaciją vykdo dviem būdais:

Answer 24

• Nuo Rho priklausoma terminacija (reikalingas rho baltymas)
• Nuo Rho nepriklausoma terminacija (nereikalingas rho baltymas)

Question 25

nuo rho priklausomos terminacijos elementai:

Answer 25

• rut sritis - RNR sritis, koduojanti rho baltymo prisijungimo
  vietą
• rho baltymas - turi helikazės aktyvumą – geba atskirti DNR-RNR hibridų regionus
• terminacijos vieta -Sritis, kurioje DNR koduoja RNR seką, kurioje gausu GC bazių porų. Formuojama RNR kamieninė kilpa arba plaukų segtuko motyvas.

Question 26

Nuo Rho priklausoma terminacijos eiga

Answer 26

1. RNR molekulėje susintetinama rut sritis
2. Rho baltymas prisijungia prie rut srities
3. Rho baltymas keliauja RNR molekule, RNR
   polimerazės link
4. Formuojama RNR kamieninė kilpa, RNR polimerazė
   sustoja judėti
5. Rho baltymas pasiveja sustojusią RNR polimerazę ir
   nutraukia vandenilines jungtis DNR-RNR hibride
6. Naujai susintetinta RNR molekulė atpalaiduojama.
   Taip pat atsiskiria ir RNR polimerazė

Question 27

Nuo Rho nepriklausoma terminacijos sekos:

Answer 27

• Seka, esanti RNR 3’ gale ir gausi Uracilo
• Seka, skatinanti kamieninės kilpos
  formavimąsi
  CCGGxxxxGGCC, esanti prieš Uracilu
  turtingą regioną

Question 28

Nuo Rho nepriklausoma terminacijos eiga:

Answer 28

1. Formuojama RNR kamieninė kilpa,
   RNR polimerazė priversta sustoti
2. Prie RNR polimerazės prisijungia
   papildomi baltymai (pvz.: baltymas
   NusA), stabilizuojantys šį sustojimą
3. Uracilu turtinga seka RNR
   transkripte prisijungia prie DNR
   matricinės grandinės
4. Ši sąveika yra gana silpna. RNR- DNR
   hibridas spontaniškai
   atsiskiria