DNR replikacija Flashcards
centrinė genetikos dogma
dnr replikacija > transkripcija > transliacija
DNr replikacija -
procesas, kurio metu iš vienos originalios dnr molekulės susidaro dvi identiškos dnr kopijos
dvigrandininės dnr komplementarumo pagrindas
AT/GC taisyklė. bazes jungia vandeniliniai ryšiai
DNR polimerazė katalizuoja
fosfoddiesterinės jungties susidarymą tarp prijungiamo dezoksinukleozidtrifosfato
vidinio fosfato ir ankstesniojo
dezoksinukleotido pentozės 3’-OH grupės
vykstant dnr polimerazės reakcijai, du paskutinieji nukleotido fosfatai yra
atpalaiduojami pirofosfato forma PPi
kurprasideda bakterijų dnr sintezė
replikacijos pradžioje (ori sritis)
kaip vyksta dvikryptė sintezė
dnr sintezė vyksta į priešingas chromosomos puses nuo replikacijos pradžios
kada baigiasi bakterijų dnr sintezė
kai replikacinės šakutės susitikinka priešingoje bakterinės chromosomos pusėje
kas yra oriC
dnr replikacijos pradžia E.coli bakterijose
trys sekos, randamos oriC srityje, reikalingos jos funkcionavimui:
- AT turtingas regionas
- DnaA dėžutės sekos
- GATC metilinmo regionas
ką skatina dnaA baltymų prisijungimas prie dnaA dėžutės regiono
skatina didelio dnaA baltymų komplekso formavimąsi (20-40 dnaA baltymo molekulių)
ką skatina HU ir IHF baltymų prisijungimas
skatina DNR regiono apsivyniojimą aplink dnaA baltymų kompleksą; dėl šios priežasties atsiskiria komplementariosios grandinės ties AT turtingu regionu
kaip dnaB baltymas prijungiamas prie AT regiono?
dnaA ir dnaC baltymų pagalba
dnaB sudaryta iš //// ir naudoja ////
šešių subvienetų ir naudoja ATP energiją
ką daro praimazė
sintetina trumpus RNR pradmenis, kurie inicijuoja dnr sintezę
dnr helikazė + praimazė =
praimosoma
ką daro ssb baltymas
jungiasi prie viengrandininės dnr ir laiko svi grandines išsiskyrusias
ką daro dnr polimerazė I
pašalina rnr pradmenis ir užpildo susidariusius tarpus dnr
kokį aktyvumą turi dnr polimerazė I
5’-3’ egzonukleazinį aktyvumą
ką daro dnr ligazė
katalizuoja fosfodiesterinės jungties susidarymą, tokiu būdu sujungdama dnr fragmentus
ką daro topoizomerazė
keliauja prieš helikazę ir atpalaiduoja superpiralizuotą dnr
dnr polimerazės I sandara ir funkcija
sudaryta iš vieno polipeptido.
pašalina RNR pradmenis ir pakeičia juos DNR
dnr polimerazės III sandara ir funkcija
sudaryta iš 10 skirtingų subvienetų. Jų kompleksas vadinamas DNR pol III holoenzimu.
alfa subvienetas sintetina DNR
DNR pol II, IV, V funkcija
dnr reparacija ir pažeistos dnr replikacija
dnr pol III beta subvienetas yra
žiedo formos ir vadinamas prisitvirtinančiu baltymu
y subvnt reikia
beta subvnt prisikabinti prie dnr, vadinamas pritvirtinančio baltymo pakrovėju
δ, δʹ, ψ subvienetų reikia
optimaliai alfa ir beta subvnt funkcijai palaikyti
jei trūksta beta subvieneto, tai
DNR pol III nukrenta nuo DNR šabloninės grandinės po to, kai polimerizuojama keliasdešimt nukleotidų. Polimerizacijos greitis ~ 20 nukleotidų per sekundę
jei yra beta subvienetas, tai:
DNR pol III išsilaiko ant šabloninės grandinės tol, kol yra polimerizuojama iki 50,000 nukleotidų. Reakcijos greitis yra ~ 750 nukleotidų per sekundę
ką daro baltymas tus
jungiasi prie ter sekų ir gali sustabdyti replikacijos šakučių judėjimą
kas yra katenanai
po dnr replikacijos gaunamos dvi persipynusios žiedinės molekulės. tai trumpalaikė dnr replikacijos struktūra
kas atskirias katenanus
dnr topoizomerazės II
ką daro DAM metilazė
atpažįsta5’-GATC-3’ sekas ir prijungia metilo grupę
prie adenino bazės
kas yra ARS
dnr replikacijos pradžia mielėse
kas lemia dnr replikacijos pradžią gyvūnuose
chromatino struktūra ir baltymų modifikacijos
kas vyksta G1 fazės metu
formuojasi prereplikacinis kompleksas preRC
kas yra preRC susirinkimo ir dnr replikacijos inciatorius
pradžios atpažinimo kompleksas ORC
kokių baltymų prisijungimą skatina ORC
Cdc6, Cdt1, MCM helikazės
kas vyksta S fazės metu
preRC tampa aktyvia replikacijos sritimi dėl preRC fosforilinimo
kas vyksta dėl preRC fosforilinimo
- iš komplekso atsipalaiduoja Cdc6, Cdt1 ir ORC
-inicijuojamas papildomų replikacijos veiksnių bei DNR polimerazių susirinkimas - MCM helikazė pradeda judėti dviem kryptymis, vyksta dvikryptė DNR replikacija
ką daro eukariotų y dnr polimerazė
dalyvauja mitochondrijų dnr replikacijoje
ką daro alfa, e, delta dnr polimerazės
dalyvauja branduolio dnr replikacijoje
alfa dnr polimerazės funkcija
sintetinti trumpą RNR-DNR pradmenį (10 RNR nukleotidų ir 20-30 DNR nukleotidų)
ε (epsilon) DNR polimerazė atsakinga už
pirmaujančios DNR grandinės sintezę
δ (delta) DNR polimerazė atsakinga už
vėluojančios DNR grandinės sintezę
Eukariotuose RNR pradmenys pašalinami
su flap endonukleaze