DNA FORENSE Flashcards
Como funciona o processo de sequenciamento do tipo ilumina ou solexa?
Amplificação por pontes com inserção de adaptadores P5 e P7 , utiliza nucleotídeos marcados , acontece em placas com sucessivas lavagens que após a inserção dos nucleotídeos marcados irá fornecer fluorescência que irá ser detectada e montada a partir de um eletroferograma.
E uma técnica de amplificação com apenas 25 pb que em 4 dias de amplificação pode gerar FRAGMENTOS COM 120 GIGABASES , é muito demorado e uma técnica já ultrapassada.
Como funciona a técnica de sequenciamento SOLID?
-Sequenciamento por ligação PROBES (SONDA).
- Sequenciamento por DNA LIGASE.
PASSOS:
A) Fragmentação - 60 a 90 pb , é usado adaptadores nas extremidades e no meio
B) Ligação dos adaptadores P1 e P2
C) Armazenado em bibliotecas genômicas até serem utilizados.
D) Sequenciamento - PCR por emulsão (microesferas)
E) ligação de adaptadores as microesferas
F) Placa
G) Lavagem com sondas marcadas
* 8 nucleotideos- 3’ fluoróforo
* 7 nucleotideos - 3’ fluoróforo
* 6 nucleotideos - 3’ fluoróforo
H) O sequênciamento se dará por SOBREPOSIÇÃO DAS SONDAS MARCADAS PELO FLUORÓFORO
OBS: NÃO UTILIZA A POLIMERASE ( ENTÃO NÃO É UM SEQUENCIAMENTO POR SÍNTESE), SOMENTE A LIGASE.
O sequenciamento SOLID é um sequenciamneto por sìntese?
ERRADO, é um sequenciamento por sobreposição das sondas marcadas por fluoróforos.
O que é doença monogênica?
São doenças que afetam um único gene , exemplo: Fibrose cística, anemia falciforme e doença de Huntington.
O que é minissatélites (VNTR)?
Sequencia de 6 a 10pares de bases , predominante em regiões não codificantes (TELOMÉRICAS ).
O que é microssatélites (STR)?
Sequência de 1 a 6 ou 10 pares de bases em TANDEM (AGRUPADAS) no qual vai variar o tipo ou a quantidade de repetição. UTILIZADO PARA AMPLIFICAÇÃO . USADO NA TRAGÉDIA DO WORLD TRADE CENTER PARA ENCONTRAR AS VÍTIMAS.
Como ocorre a inativação do X ?
E um processo no qual umas das copias do cromossomo X em fêmeas é inativado. O cromossomo inativado recebe o nome de CORPUSCULO DE BARR e o mecanismo de ação utilizado é o GENE XIST
O que é o STUTTER ou GAGUEJO?
São pequenos picos no eletroferograma que ocorre devido o deslizamento da DNA POLIMERASE que na hora a replicação deixa de colocar algum nucleotídeo.
Quais são as etapas da amplificação por PCR?
- Desnaturação
- Anelamento do primer iniciador
- Extensão
O que é o primer iniciador ?
Par de OLIGONUCLEOTÍDEOS de 8 a 30 pb se anela a uma região do DNA e então inicia na REGIAO 3’ OH LIVRE a complementariedade das bases nitrogenadas para amplificação (REGIAO STR).
Quais são as temperaturas utilizadas para desnaturação na técnica de PCR?
Aos 95° ocorre a separação da dupla fita de DNA.
Aos 52° - 65° ocorre a diminuição da temperatura para o PAREAMENTO DOS INICIADORES.
Aumenta a temperatura para 72° para ocorrer o ALONGAMENTO DA CADEIA
O que é a TAQ POLIMERASE?
Enzima termoestável utilizada para amplificação do DNA através da técnica de PCR.
O que são as enzimas de restrição?
São utilizadas para cortar fragmentos do DNA
O que é sequencoa de bases PALÍNDROMICAS?
É A MESMA COISA SE LER DE TRAS P FRENTE.
O que são os PLAMÍDEOS?
É um tipo de vetor.
Os nucleotídeos que compõem os SNPs (single nucleotide
polymorphisms), ou polimorfismos de nucleotídeo único,
sofrem mutações com menor frequência.
correto