DNA

Question 1

Hvilke celler har telomeraseaktivitet, og hvad gør telomerase?

Answer 1

Celler i den tidlige embryogenese (senere slukkes det), samt cancerceller.
Telomerase forlænger telomererne, så cellen kan dele sig flere gange, end den ellers ville kunne.
Sikrer uhæmmet deling i cancerceller.

Question 2

Hvad er semikonservativ replikation?

Answer 2

DNA replikeres/syntetiseres ud fra en original streng. Således består det nye DNA af en “gammel” streng og en “ny” streng.

Question 3

Hvilken retning læses DNA-templaten ved DNA replikation?

Answer 3

3’ til 5’-retning

Question 4

Hvilken funktion har topoimeraser?

Answer 4

De er placeret foran replikationsgaflen og sørger for at modvirke supercoiling.

Der findes to typer:
- Type-I, som klipper én fosfodiesterbinding i den ene DNA-streng og lader DNA’et udsno sig selv = ikke energikrævende.

• Type-II, som klipper fosfodiesterbinding i begge strenge og fører den ene helix gennem hullet, så DNA’et udsnos - denne proces kræver ATP.

Question 5

I hvilken retning kopieres template DNA-strengen i forbindelse med RNA syntese?

Answer 5

3’-5’ retning

Question 6

Hvad er forskellen på DNA polymerase og RNA polymerase

Answer 6

Den grundlæggende forskel er, at DNA polymeraser ikke kan starte de novo, dvs. “fra ingenting”, mens RNA polymeraser kan.

DNA polymerase kræver en fri -OH gruppe i 3’ ende for at begynde. RNA polymerase (primase) laver en primer, som DNA polymerase kan starte på. DNA polymerase kan kun syntetisere i 5’-3’-retning.

Question 7

I hvilken retning syntetiseres DNA-strengen i forbindelse med DNA replikation?

Answer 7

5’-3’-retning

Question 8

Hvilken funktion har DNA helicase?

Answer 8

Adskiller/oplukker og udsnor DNA-strengene

Question 9

Hvad er et Okazaki-fragment?

Answer 9

Et nysyntetiseret DNA-fragment, som opstår, fordi DNA polymerase kun kan syntetisere i 5’-3’-retning.
Okazakifragmenter “limes” til sidst på af DNA ligase, der udfylder hullerne mellem Okazakifragmenterne.

Question 10

Hvad betyder lagging og leading strand?

Answer 10

DNA syntetiseres semikonservativt - dvs. det nye DNA-molekyle består af en gammel og én ny streng. Derfor vil der altid være en leading strand, der syntetiseres i 5’-3’-retning uden huller begyndende fra replikationsgaflen,og en lagging strand, der syntetiseres i Okazaki-fragmenter, der bagefter skal sættes sammen.

Question 11

Hvad er sigmafaktoren?

Answer 11

Et protein, der bruges i transkriptionen af DNA i bakterier - dvs. prokaryoter.

Question 12

Hvad vil det sige, at replikationen er bidirektionel?

Answer 12

Den foregår i begge retninger ift. replikationsgaflen

Question 13

Hvor mange hydrogenbindinger er der mellem hhv. A og T og G og C?

Answer 13

A og T holdes sammen af 2 hydrogenbindinger

G og C holdes sammen af 3 hydrogenbindinger

Question 14

Hvor mange nukleotider består primerne af?

Answer 14

cirka 10

Question 15

Hvor foregår translation?

Answer 15

I cellens cytosol

Question 16

Nævn sekvensen for start-codon og stop-codons

Answer 16

Start: AUG
Stop: UAA, UAG, UGA

Question 17

Angiv navnet på den enhed på mRNA, som det lille ribosomale protein-kompleks binder til

Answer 17

eIF4F

Question 18

Forklar Wobble-hypotesen

Answer 18

5’-basen i tRNAs anticodon er løsere end de andre baser, og derfor kan de wobble - lave baseparring, der ikke følger Watson-Crick-baseparringen.

Question 19

Beskriv faserne i translationen

Answer 19

1: Initiering. Her lokaliserer en initiator tRNA startcodon på mRNA strengen
2: Elongering. Her syntetiserer ribosomet en ny polypeptidkæde ud fra mRNA
3: Terminering. Sker når der i A-site på ribosomet optræder et stopcodon

Question 20

Hvad er en frame-shift-mutation?

Answer 20

En mutation, hvor der indsættes eller slettes nukleotider i template DNA eller RNA, så ribosomet læser baserne “skævt” og derved syntetiserer forkerte proteiner.

Question 21

Proteiner, der skal udskilles fra cellen syntetiseres ind i et bestemt cellulært organel - hvilket?

Answer 21

ER - endoplasmatisk retikulum

Question 22

Hvad syntetiserer DNA polymerase epsilon?

Answer 22

Leading strand

Question 23

Redegør for, hvordan cellen kan “rette” en fejl i en enkelt base

Answer 23

Base excision repair

1. DNA glykosylase genkender skaden og kløver N-glykosylase-binding
2. AP endonuclease kløver sukker-fosfat backbone
3. DNA polymerase tilføjer nye nukleotider til 3’-enden af det kløvede DNA (vha. komplementærstreng som template)
4. 5’enden ligeres sammen med resten af DNA-strengen af DNA-ligase

Question 24

Beskriv PCR

Answer 24

Polymerase chain reaction - opformering af DNA

Kan tage udgangspunkt i meget lille mængde DNA

1. DNA oprenses
2. Primere, deoxyribonukleotider og varmestabil DNA-polymerase tilsættes
3. Opvarmes (92 grader) for at skille DNA-strenge
4. Nedkøles (55 grader) for at primere kan hæfte
5. Opvarmes igen (72 grader) for at DNA polymerase kan syntetisere
6. Gentag 3-5

Question 25

Hvordan kan PCR produkt visualiseres i en gel

Answer 25

Med farvning (med ethidium bromid)
Sekvens med specifikt mærket probe

Question 26

Angiv forskelle på DNA og RNA

Answer 26

Forskellige baser: I RNA er Thymin (T) erstattes med Uracil (U)

Forskellige sukkermolekyler i backbone: I RNA er sukkermolekylet ribose med en hydroxylgruppe på 2. carbonatom. DNA indeholder deoxyribose.

RNA er enkeltstrenget
DNA er dobbeltstrenget og har helixstruktur

RNA har sekundær og tertiær struktur, fordi der er intramolekylære baseparringer ved dannelse af loops

Question 27

Angiv typer af RNA

Answer 27

mRNA, tRNA, rRNA

miRNA (sRNA) og ribozymer

Question 28

Beskriv transkription af RNA i bakterier

Answer 28

rRNA produceres som et enkelt langt transkript, som kløves til 16S, 23S og 5S

Question 29

Beskriv translation af RNA i bakterier

Answer 29

Kan foregå samtidig med transkription, fordi bakterier ikke har cellekerne og membraner mellem organeller.

Question 30

Beskriv forskel på transkription i eukaryote og prokaryote celler.

Answer 30

I eukaryote celler er processen de-koblet, mens den er koblet i prokaryote celler.

Question 31

Hvordan igangsættes translation i eukaryote celler?

Answer 31

Met-tRNA aktiveres gennem binding til eIF2-GTP

protein-komplekset

Question 32

Hvilken sekvens har startcodon?

Answer 32

AUG

Question 33

Hvilke sites findes i ribosomet?

Answer 33

A-site, P-site og E-site.

Starter i A (til højre), rykker i P (i midten) og til sidst E (til venstre)