Den Mikrobielle Celle (Forelæsning 1 og 2) Flashcards
Hvad er phytanyl?
Phytanyl er en del af cellemembranen i archaea. Det er pendant til fedtsyrer i bakterier.
Phytanyl består af fire isoprenmoduler, som samlet indeholder 20 Carbonatomer
Hvilken binding er der mellem glycerol og fedtsyrerne i et phospholipid?
Ester binding (prokaryote bakterier og eukaryote mikroorganismer)
Hvilken binding er der mellem glycerofosfat og phytanyl?
Æter (archaea)
Hvilket stabiliserende element findes hos bakterier?
Hopanoider
Mycoplasma spp. og enkelte andre prokaryoter har steroler
Hvilket stabiliserende element findes hos eukaryote mikroorganismer?
Steroler (Kolesterol)
Hvilke funktioner har cytoplasmamembranen?
- Permeabilitetsbarriere
- Opretholder elektrokemisk gradient (Proton Motive Force)
- Forankrer proteiner
- Adskiller cytoplasma fra omverdenen
Nævn tre typer af Import over cytoplasmamembranen
- Simpel transport, udnytter gradienter opretholdt af aktiv transport (Symport, Antiport og Uniport)
- Gruppe translokation (modifikation af det transporterede molekyle, f.eks. glucose, for at opretholde en gradient over membranen)
- ABC-transporter, drevet af ATP. (Omfatter 3 proteiner; 1 substratbindende protein, 2 transportprotein, 3 ATP-hydrolyserende protein.
Nævn tre typer Eksport over membranen, og hos hvilke bakterier de er vigtigst.
- Multidrug efflux pumper, der fjerner affaldsstoffer og uønskede stoffer.
- Translokaser, vigtige hos Gram Positive, Eksporterer proteiner og indsætter proteiner i cytoplasmamembranen.
- Sekretionssystemer, især hos Gram Negative, eksporterer enzymer, toksiner, effektorproteiner, DNA
Beskriv Type II til IV sekretionssystemerne hos de Gram Negative bakterier
Type IV = Pilus
Type II = Sekretion
Type III = Sekretion (Molekylær nål)
Hvad er funktionen af cellevæggen?
Beskytter mod fysisk stress - forhindrer cellen i at briste.
Den sidder uden for cellen og har store porer der tillader passage af mange stoffer.
Hvordan fungerer en Gram-farvning?
- Du farver alle celler med krystalviolet og iod, som danner komplekser.
- Alkohol dehydrerer og lukker porer i peptidoglycanlaget
- Krystalviolet-iod-komplekserne kan passere igennem det tynde peptidoglycanlag hos Gram Negative, men ikke det tykke lag hos Gram Positive.
- Kontrafarvning med f.eks. safranin, som farver de Gram Negative.
Hvilke mikroorganismer har ingen cellevæg?
Mycoplasma (Bakterie)
- Stabiliserer membranen med steroler, lever i habitater med passende og ensartet ionstyrke, f.eks. menneskeceller
Thermoplasma (Archaea)
Hvad er peptidoglycan opbygget af?
N-acetylglukosamin (G), N-acetylmuramin (M), Aminosyrer (alanin, glutaminsyre), Aminosyreanalogen diaminopimelin (Kun i bakterer)
Hvad hedder byggestenen i peptidoglycan?
Glycan tetrapeptid
Består af 1 G, 1 M og fire aminosyrer (Ala, Glu, Lys+/DAP-, Ala)
Hvilken gruppe af bakterier har direkte krydsbinding imellem deres glycan tetrapeptider?
Gram Negative
Hvilken gruppe af bakterier har en peptid bro imellem deres glycan tetrapeptider?
Gram Positive
Hvilket enzym danner peptidbroerne i de Gram Positive bakteriers cellevæg?
Transpeptidase
Er target for penicillin
Hvad består peptidbroen i Gram Positive bakteriers cellevæg af?
5 glyciner.
Hvad gør lysozym ved cellevæggen?
Nedbryder bindingen mellem G og M
Hvad indeholder Gram Positive bakteriers cellevæg?
- Peptidoglycan
- Proteiner
- Teichonsyre og lipoteichonsyre (Negativt ladet overflade, hjælper måske med transport af stoffer)
Hvordan er Gram Negative bakteriers cellevæg opbygget?
Cellevæggen består af periplasma, der indeholder et tyndt lag peptidoglycan, og en ydre membran, der består af lipopolysaccharider (LPS), phospholipider og membranproteiner.
Hvad består lipopolysacchariderne i Gram Negative bakteriers cellemembran af?
Lipid A; endotoksin.
Kernepolysaccharid
O-polysaccharid
LOS: Lipooligosaccharid, består af Lipid A og Kernepolysaccharid
LPS:
Lipid A, kerne og O-polysaccharid. Kaldes også O-antigen.
Hvordan er cellevæggen hos archaea?
Intet peptidoglykanlag.
De fleste har S-lag, der består af protein eller glykoprotein i hexagonalt lag.
Nogle har pseudomurein, der ligner peptidoglycan.
Nævn mulige overflade strukturer.
Slim, kapsel, flageller, fimbrier, pili.
Beskriv slim og kapsel. (Hvad består de af, hvad gør de godt for?)
Geleagtig slim, Hård kapsel.
Består af polysaccharid eller polypeptid.
Øger fasthæftning (Virulens faktor)
Beskytter mod
- Udtørring, protzoer og phagocytter og antibakterielle stoffer.
Beskriv en flagel
Bevægeapparat
Meget lang (op til 10 mikrometer, ca. det dobbelte af den største prokaryot)
Kompleks, opbygget af mange proteiner.
Roterer vha. energi fra en protonturbine der sidder i cytoplasmamembranen, den anvender 1000 protoner på en rotation. (Måske anvendes ATP og ikke protoner hos archaea)
Placering af flageller
Polær: Én flagel i den ene ende af bakterien
Lophotrikøs: God hårdag, flere flageller i en ende af bakterien
Peritrikøs: Dårlig hårdag, flere flageller sidder fordelt over cellen.
Bevægelse med polær flagel
Counterclockwise: Fremad med cellen forrest
Clockwise: Bagud med cellen bagerst.
Bevægelse med peritrikøse flageller
CCW bundled flagella (Run): Fremad med cellen først
CW Tumble: Panoreringsbevægelser
God til kemotaksi
Nævn 4 forskellige former for taksi
Kemotaksi: Respons på kemisk gradient
Fototaksi: Respons på lys
Aerotaksi: Respons på ilt
Osmotaksi: Respons på ionstyrke
Hvad er fimbrier?
Korte proteinstrukturer
Øger fasthæftning
Hvad er pili?
Proteinstrukur, længere end fimbrier.
Øger fasthæftning
Medvirker til overførsel af DNA mellem bakterier (Conjugation)
Nogle involveret i bevægelse.
Hvor ses endosporer
Kun i Gram Positiv Firmicutes række. F.eks. Bacillus og Clostridium
Hvad er pointen med endosporer?
De er meget modstandsdygtige over for f.eks. varme, kemikalier og UV-stråler.
Dannelse af endosporer induceres af stress, og øger sandsynligheden for overlevelse og spredning.
Hvad indeholder en endospore?
Dipicolinsyre og forhøjet Calcium 2+ koncentration. Disse bliver til kompleks der binder sig til frit vand i endosporen, der dehydreres.
Komplekserne sætter sig omkring DNA, hvilket stabiliserer det og forhindrer denaturering.
Dehydrering stopper enzymaktivitet og gør dem mere modstandsdygtige overfor kemikalier
SASPs (small acid-soluble proteins) binder til DNA og besksytter mod UV, varme og udtørring.
De fungerer som substrat ved spiring.
