Dannelse a lymfocyt antigen receptorer Flashcards
Hvordan forekommer der så mange forskellige receptorer?
Gene rearrangement: V regionene er kodet for i forskellige gen segmenter (2-3stk) som sættes sammen af DNA rekombinase
Hvad er somatisk rekombination
Rearrangerings processen af gen segmenter
Hvilke funktionelle gensegmenter findes i immunoglobulin loci
Lætte kæder:
- Kappa loci og lambda loci
Tunge kæder:
- H loci. Modsat lættekæder indeholder denne diversitets segment
Hvordan sættes de rigtige segmenter sammen?
recombinations signal sekvenser (RSS) - (start) heptamer af konserveret sekvens –> spacer (12 eller 23 bp) –> nonamer (mange A’er) (stop)
12/23 reglen
Et gen segment flankeret med 23-bp spacer kan sættes sammen med et med 12bp flankering.
hvilke to måder af rekombination kan forekomme
Forward-oriented V segment (en loop eller cirkel med gener fjernes og V og J bringes sammen)
Reverse-oriented V-segment: (coiled konfiguration bringer V og J sammen og kromosomet inverteres)
Hvilke lyfoide rekombinaser findes der
RAG-1 og RAG-2
Hvilken DNA ligase bruges der
DNA ligase IV
Kombinations diversitet
mange kopier af gen segmenter som er sat sammen på forskellig måde
Junctional diversitet
indsættelse/fjernelse af nucleotider mellem joints under rekombinations processen
Somatisk hypermutation
punkt mutation i den rearrangerede V region af aktiverede B celler => videre diversitet
Hvor sidder de hypervariable regioner
CDR1 og CDR2: V-segmentet
CDR3: joint mellem V og J segmentet
hvilke nucletorider kan inslttes mellem joints
P-nucleotider: pallindromisk sekvens
N-nucleotider: non-template encoded - sættes på af TdT enxymet efter hairpin cleavage
Hvor sker TCR rearrangering
Thymus
Hvad binder de hyper variable regioner af TCR til?
CDR1 og CDR2 er mindre variable og binder til MHC komponenten af liganden. CDR3 er meget variable og binder til peptid komponenten