Cytogénétique Flashcards
Que permet un caryotype ?
Analyser la structure des chromosomes
Comparer les 2 homologues
Que sont les gonosomes’
23 paires de chromosomes
Qu’est-ce qui détermine la morphologie des chromosomes?
Position du centromère
Forme constante pour une paire de chromosomes (varie d’une paire à l’autre)
Métacentrique : 2 bras symétriques (centromère au centre)
Submetacentrique : 2 bras asymétriques
Acrocentrique : un très petit bras court (centromère au une extrémité)
Comment est l’anatomie d’un chromosome?
Telomeres
Région p
Centromère
Région q
Telomeres
Qu’est-ce qui est nécessaire pour l’obtention des chromosomes?
Cellules doivent si diviser parce que chromosome = métaphase de la mitose (la où on arrête le cycle pour les récupérer)
Quelles sont les différentes constitutions chromosomiques ?
Normale : 46,XX ou 46,XY
Anormale : 47,XX,+13 (trisomie 13) ou 45,X (un seul chromosome X)
Analyse d’un minimum de 10 cellules différentes
Quelles sont les 2 types de constitution chromosomique ?
Homogène : toutes les cellules ont la même formule chromosomique
Non homogène ou mosaïque : 2 types ou plus de cellules chez le meme individu, anomalies dans la ségrégation mitotique des chromosomes
Si 2 types cellulaires proviennent du même zygote c’est du mosaicisme
Quel type d’anomalie chromosomique a un effet sur le phénotype ?
Une qui modifie la quantité d’euchromatine
Si touche Hétérochromatine, pas d’effet
Quels sont les 2 grands types d’anomalies chromosomiques?
De nombre
De structure
Quelles sont les anomalies de nombre?
Polyploïdie: addition d’un ou plusieurs complément haploïde (n)
Aneuploidie : paire d’homologie dont le nombre est augmente ou diminue
Comment peut se faire une triploïdies ?
69,XXX ou 69,XXY
Digyny: ovocyte a 46 chromosome et spermatozoides a 23
Diandry (cause la plus fréquente) : ovocyte a 23 chromosome et spermatozoides a 46 ou 2 spermatozoides a 23 (dispermie)
Quelles sont les caractéristiques de l’aneuploïdie ?
Anomalie du nombre d’une seule paire de chromosome
Erreur dans la répartition des chromosomes lors de la division cellulaire (homogène = méiose, mosaicisme = non disjonction en mitose)
Monosomie d’un chromosome complet (sauf le X) pas viable
Âge maternel avance : facteur de risque
Quel est le type d’aneuploidie le plus fréquent?
Non-dysjonction en méiose 1
Pas de séparation des 2 homologues donc demeurent dans le même gamète
Quelle est l’autre possibilité de cause pour l’a eu ploïdie?
Non-dysjonction en méiose 2
Pas de séparation des chromatides sœurs (division équationnelle) donc ils restent dans le même gamète
Vrai ou faux. Plus de 90 des trisomies origine de la méiose paternelle ?
Faux, de la méiose maternelle (effet de l’age maternelle)
Voir diapo 25
Quelle est la maladie liée au 45,X?
Syndrome de Turner
90% des conceptions résultent en avortements spontanés
Cause majorité : non-disjonction dans les gamètes paternels (perte du Y)
Atteinte tjrs filles à la naissance
Comment se décrit le phénotype du syndrome de Turner?
Féminin
Intelligence normale
Courte taille proportionnée (pas de nanisme)
Insuffisance ovarienne (pas fertile)
Autres phénotypes variables
Quelle est l’étiologie cytogénétique du syndrome de Turner?
55% : homogène
20% : mosaïque
25% : anomalie de structure d’un chromosome X (ex: 2 bras courts ou longs)
Quelle est la maladie associée à 47,XXY?
Syndrome de Klinefelter
Phénotype masculin (même si XX):
Intelligence normale mais légèrement diminuée par rapport à la fratrie
Grande taille (3 copies des gènes)
Hypogonadisme (petits testicules non fonctionnels) donc infertilité, pas de testostérone
Quel syndrome est associé au 47,XXX?
Triple X
Phénotype féminin :
Intelligence normale légèrement diminuée par rapport à la fratrie
Grande taille (3 copies des gènes)
Pas de malformations
Fertilité normale
Quel est le phénotype du 47,XYY?
Phénotype masculin normal
Intelligence normale (légèrement diminuée par rapport à la fratrie)
Impulsivité
Fertilité normale
Qu’est-ce que le syndrome de Down?
Trisomie 21 : 47,XX,+21 ou 47,XY,+21
Incidence augmente ++ avec âge maternel
95% causée par non disjonction méiotique lors de la méiose maternelle
Comment est le phénotype du syndrome de down?
Déficience intellectuelle
Bon tempérament
Hypotonie (mauvais tonus musculaire)
Traits physiques caractéristiques
Malformation cardiaque 40% (communication G-D)
Malformation GI
Leucemie
Qu’est-ce que le syndrome de Patau?
Trisomie 13 : 47,XX,+13 ou 47,XY,+13
Phénotype : retard mental sévère, fente labio-palatine, polydactylie
Malformation cérébrale sévère (pas de séparation des hémisphères)
Malformations cardiaques, rénales et autres
Anomalie létale
Qu’est-ce que le syndrome d’Edward?
Trisomie 18 : 47,XX,+18 ou 47,XY,+18
Phénotype : retard mental sévère, retard de croissance mains fermées
Malformations cardiaques digestives, rénales
Anomalie létale
Comment se définit une anomalie de structure ?
Presque tjrs due à des cassures
Chromosome peut avoir une ou des cassures transversales
Plus dun chromosome peut subir des cassures en même temps
Points de cassure ont tendance à se recoller entre eux
Vrai ou faux. Fragment chromosomique pas recollé reste dans les cellules filles au cours des divisions seulement s’il a un centromère ?
Vrai
Que devient un fragment chromosomique suite à une cassure?
Peut se perdre
Se recoller exactement comme il était
Se récollet différemment (au même endroit ou ailleurs)
Qu’est-ce que la délétion terminale ?
Une cassure qui génère un fragment sans centromère et qui ne se recolle pas
Fragment sera alors perdu lors des divisions cellulaires
Cellules filles conservent chromosome cassé (avec centromère)
Donc perte de matériel sur un chromosome
Ex: syndrome du cri-du-chat
Qu’est-ce que la délétion interstitielle ?
2 cassures dans le même chromosome
Perte du matériel entre les 2 points de cassure
Fusion aux 2 points de cassure
Qu’est-ce que l’inversion paracentrique?
2 cassures dans meme bras chromosomique chromosome (court ou long)
Pas de perte du segment
Segment se recolle à l’envers
Position centromère pas changée (patron de bandes à changé)
Qu’est-ce qu’une inversion pericentrique?
Une cassure sur chacun des bras d’un chromosome (de part et d’autre du centromère)
Segment peut se recoller à l’envers
Canberra position du centromère
Pas de perte de matériel
Qu’est-ce que la translocation?
2 cassures sur 2 chromosomes différents
Échange de matériel chromosomique
Recollage des segments
Quelles sont les 2 sortes de translocation?
Réciproque : entre chromosomes non-homologues le long des bras chromosomiques
Robertsonienne
Peuvent être équilibrée ou déséquilibrés
Qu’est-ce qu’une translocation réciproque équilibrée ?
Ne fait pas varier nombre de chromosomes
Aucune perte de matériel chromosomique
Pas d’effet sur le phénotype
Risque de ségrégation non-équilibrée dans divisions méiose : phénotype anormal chez les descendants, fausse couche, infertilité
Comment survient une translocation non-équilibrée ?
Porteur d’une translocation réciproque équilibrée contient dans ses gamètes un chromosome transloque et un normal donc ségrégation non-équilibrée et zygotes ont monosomie ou trisomies partielles combinées
Si enfant vit son phénotype sera anormal
Quelles sont les 3 types de ségrégations d’une translocation équilibrée durant la méiose?
Alterne : individu phénotype normal (porteur ou non porteur de la translocation)
Adjacent-1 et -2 : individu phénotype anormal (trisomie ou monosomie partielles)
Diapo 49
Quels sont les chromosomes acrocentriques?
13
14
14
21
22
Qu’est-ce qu’une translocation robertsonienne?
Cassures et recollement au niveau des centromères des chromosomes acrocentriques
Fusion centrique des chromosomes
Fait varier nombre de chromosome (45)
Petite perte de matériel (petits bras courts des 2 chromosomes acrocentriques constitués d’heterochromatine)
Pas de phénotype chez les porteurs
Risque de ségrégation non-équilibrée dans divisions méiose : phénotype anormal chez les descendants, fausse couche, infertilité
Diapo 56
Quel est le lien entre la translocation robertsonienne et la trisomie 21´
Translocation robertsonienne est en cause dans 2,5% des cas de trisomie 21
Caryotype détermine risque de récidive pour parents :
aneuploidie ~1%
translocation robertsonienne non-équilibrée selon statut de porteur des parents <1%
Parent porteur risque récurrence: femme 15% vs homme 1%
Quelles autres anomalies de structures peut avoir chromosomes e?
Duplication (dun segment contigu)
Insertion
Etc
Quelles sont les méthodes de détection des anomalies chromosomiques?
Caryotype
Techniques de cytogénétique moléculaire : fish et micropuces (hybridation dans les 2 cas)
Comment se fait la technique FISH?
Appariement du e séquence d’ADN connue et marquée d’une molécule fluorescente a une ou de séquences complémentaires
Qu’est-ce que l’hybridation?
Alternance des processus de dénaturation et de dénaturation de l’ADN
Pour que fragment d’ADN simple brin à séquence connue (sonde) se lie a l’ADN simple brin complémentaire qu’on veut étudier
Quels sont les étapes de la FISH ?
1 : dénaturation d ela sonde (marquée d’une molécule fluo) et de l’ADN génomique à étudier
2 : hybridation des 2 adn simple brin et renaturation
3 : visualisation au microscope à fluorescence
Quelle est l’application de la FISH en cytogénétique?
Préciser une anomalie vue en cytogénétique classique (qui n’avait pas pu être identifiée)
Diagnostic de micro-remaniements chromosomiques (non visibles au caryotype)
Fish interphasique pour diagnostic rapide
Choix de la sonde se fait grâce aux informations cliniques
Dans quels cas l’utilisation de sondes est nécessaire pour mettre en évidence ce que le caryotype ne montre pas?
Anomalies infra microscopiques ou cryptique
Micro-remaniement : microdeletion ou micro duplication chromosomique récurrente
Quand est-ce qu’il est nécessaire de faire la FISH en interphase?
Quand détection anomalies :
Index mitotique peu élevé
Résultat rapide est nécessaire
Diagnostic mosaïque/clone faible
Qu’est-ce que la fish interphasique?
Tout type de sonde peut être utilisé
Pas besoin de mitose
Gand nombre de cellule peut être analyse en même temps
Qu’est-ce que l’hybridation génomique comparative ?
Comparaison adn patient avec adn contrôle grâce à hybridation des ces adn marques en fluorescence
Mesure intensité de la fluorescence pour détecter : duplication ou délétion dans adn du patient
Quels sont les types de micro puce?
BACs
Oligonucleotide
Quel est le but de l’analyse de micro puce?
Détection de CNV (variants du nombre de copies donc délétion ou duplication) pathogénique expliquant le phénotype du patient
Quels sont les avantages de l’hybridation génomique sur micro puce?
Meilleure sensibilité pour la détection de duplication que la fish
Nécessite pas de savoir ou cibler dans le génome au préalable
Ne nécessite pas de cellules en division
Sauf que : Permet pas de détecter les remaniements déséquilibrés
Quelle est la corrélation génotype phénotype d’une délétion ou d’une duplication ?
Taille du remaniement (plus gros, plus impact)
Survenu de novo
Type de gènes impliqués et lien avec le phénotype
Comparaison avec littérature ou bases de données
Région polymorphique
Qu’indique un caryotype?
Recherches de remaniements chromosomiques équilibrés : couples avec avorté entre spontanés répétés, infertilité, histoire familiale
Recherche de mosaicisme chromosomique
Recherche clinique clair d’une anomalie chromosomique détectable par caryotype
