Cours 9 - Pathos infectieuses Flashcards
Définition pathologie infectieuse :
maladie causée par un agent infectieux .
Comment éviter la contamination ?
Agent antiseptique, notamment l’alcool (rapide et très efficace), Gants (changer).
Quelles sont les 5 catégories d’agents infectieux humains ?
Bactérie, levure et moisissure, vers, virus et prions, protozoaire.
V/ F : la pluspart des agents infectieux sont zoonotiques (transmissible entre humains et animaux).
Vrai, 61%
Placer en ordre croissant de taille les bactéries, les protozoaires, et les virus
virus, bactéries, protozoaire.
Grâce à quelle technologie sont visibles les bactéries ? Les protozoaires ? Les virus ?
Les bactéries et les protozoaires sont visibles par microscopie optique, les virus sont visibles par microscopie électronique.
Caractéristiques : Virus (4)
- Sans compartiment membranaire interne
- Génome d’ARN ou ADN
- Géométrie de la capside
- Avec ou sans enveloppe externe d’origine cellulaire
Caract bactéries (5)
- Sans membrane interne (pas de noyau ni mitochondrie)
- Unicellulaires (individuels, en chaînettes ou en amas)
- Forme et motilité
- Formation de spores possibles
- Tests enzymatiques, milieux de croissance
Caract protozoaires (4)
- Unicellulaires
- Morphologie
- Mode de locomotion (e.g. flagelles, cils, pseudopodes)
- Formation de spores
Qu’est ce que la capside ?
Petite « maison », qui contient le génome du virus .
Laquelle ou lesquels des 3 formes des spores : virus, bactéries, protozoaire?
Protozoaire et bactéries (parfois)
A quoi ressemblent les membranes internes des bactéries?
Il n’y en a pas, tout « flotte» dans le cytoplasme.
Quelles sont les 5 techniques moléculaires utilisables?
Séquençage, FISH (fluorescence in situ hybridization), PCR (polymerase chain reaction), mRNA arrays (cDNA arrays ?), ELISA.
Les 5 techniques de détection sont capables de trouver différentes choses. associer chaque item à sa/ses méthode(s) de détection: Génome (3), ARN messager (1), Protéine (1).
Génome : Séquençage, FISH ou PCR ;
ARNm: cDNA arrays ;
Protéines : ELISA
Qu’est-ce qu’un nucléotide ? Comment sont ils agencées dans l’ADN ?
A, T, C, G, parfois coloré par les techniques vu précédemment. Ils sont organisés par paire.
Quelle est l’enzyme utilisée dans la PCR ?
La polymérase.
Expliquer brièvement le fonctionnement de la PCR
Polymérase (?) vient se lier à l’autre côté de l’ADN et crée un nouveau brin (processus répété ++), pour détecter un virus (identifier séquences de gènes, qui sont spécifiques aux virus en question).
Expliquer brièvement le fonctionnement de cDNA arrays
On va hybridiser (« coller ») le bout d’ADN qu’on connaît pas avec des bouts d’ADN qui sont sur une petite plaque. On sait ce qu’il y a à chaque endroit et donc celui avec lequel L’ADN inconnu se sera hybridisé est l’ADN de l’agent qu’on recherche.
Expliquer brièvement le concept de l’ELISA :
elle détecte un antigène avec l’aide d’anticorps.
Pourquoi utilise-t-on assez peu les 5 techniques moléculaires vues précédemment ?
Elles sont efficaces et rapides, mais coûtent cher.
Quelle est la particularité des virus, en comparaison notamment avec bactéries ?
Ils sont des parasites intracellulaires obligatoires. On ne peut donc pas simplement les mettre dans un pétri, elles ont besoin de cellules haute pour survivre et se multiplier.
Comment les virus entrent ils dans l’organisme ?
Plusieurs voies sont possibles, comme la peau et les muqueuses.
Comment se fixent les virus sur les cellules (tropisme, stoechiométrie) ?
Il y a reconnaissance des récepteurs naturels des cellules.
Plusieurs options :
- 1 type de récepteur/virus (il peut y avoir plusieurs types sur une seule cellule);
- récepteur alternatif (2 types de récepteurs/virus, un pour chaque bout, p.ex.);
- plusieurs récepteurs coopératifs, se liant a plusieurs protéines virales (par exemple l’herpès).
Quels sont les 4 types de récepteurs viraux? Lequel est lié au système immunitaire?
glycoprotéine, glycolipides, glucides, récepteur FC (SI).
Quels sont les 2 grands types de virus ?
Enveloppé et non-enveloppé.
Adénovirus (rhume), enveloppé ou pas ?
Non-enveloppé
Mécanisme d’entrée des virus non enveloppés :
entrée par endocytose, le virus est activé avec le pH plus acide des endosomes.
Une protéine de la capside changera de conformation.
V/F : Tous les virus non-enveloppés entrent de la même façon dans la cellule.
Il existe plusieurs sortes d’endocytose.
Comment le adénovirus fait-il pour se retrouver dans le cytoplasme ?
Il désintègre la paroi de l’endosome.
Comment le rhinovirus entre-t-il dans la cellule A partir de l’endosome ?
Il perce des pores dans l’endosome pour libérer le matériel génétique dans le cytoplasme de la cellule.
Vrai ou faux : le pH a un effet important sur la capacité du cmv à envoyer son matériel génétique dans la cellule.
Faux le pH n’a aucun impact dans ce type de mécanisme , c’est important (enveloppé).
Mécanisme d’entrée des virus enveloppés?
- Fusion de l’enveloppe virale avec une membrane cellulaire
(surface et/ou endosomes) :
- Liaison de la particule virale avec son récepteur
- Peut nécessiter l’aide d’un corécepteur - Changement de conformation de la glycoprotéine virale de
l’enveloppe, du récepteur ou des deux
- Amène le domaine de fusion à proximité de la membrane cellulaire
- Parfois accompagné d’un clivage protéolytique
NB : Dans les endosomes, le pH acide est souvent un facteur d’activation, mais jamais à la surface de la cellule
Comment l’influenza rejette son matériel génétique dans le cytoplasme ?
Elle fait une fusion interne avec les endosomes (avec maglutinine).
Vrai ou faux : tous les virus enveloppés font la fusion avec la membrane cellulaire.
Faux
Vrai ou faux : le virus herpès simplex possède plusieurs manières d’entrer dans la cellule.
Vrai, fusion plasmatique ou endocytose.
Quelles sont les 5 explications des tropismes variables des différents virus?
(c’est probablement la question la moins claire du deck, mais tout cela est fait après l’entrée dans la cellule)
- Expression des gènes viraux,
- réplication du génome viral,
- assemblage,
- transport intra cellulaire,
- réponse immunitaire.
Vrai ou faux : Tous les virus sont lytiques.
Faux.
Comment se manifeste l’atteinte du cytosquelette (4)?
Modification de la forme des cellules infectées, condensation péri-nucléaire suivi de dégénérescence, clivage de plusieurs composantes du cytosquelette , réorganisation des microtubules et de l’actine.
À quoi servent les comètes d’actine ?
Elle propulse le virus en s’allongeant
Quels sont les mécanismes de destruction cellulaire (4) ?
- Syncitia,
- Cytolyse (présentation antigènes viraux),
- Cytolyse (bourgeonnement du virus),
- Modulation de l’apoptose par le virus (négative ou positive).
Expliquer la modulation de l’apoptose, négative et positive :
Négative (Acheter du temps avant la mort de la cellule)
Virus codant pour des protéines anti-apoptotiques (ex: imite BCL-2)
Inactivation des molécules pro-apoptotiques (ex: bloquant p53)
Positive ( Relâche des virions)
Activation des molécules pro-apoptotiques (ex: p53)
Activation de protéines ciblant les inhibiteurs de l’apoptose (ex: Bcl-2)
Quels sont les impacts moléculaires du virus sur la cellule hôte (7)?
- Inhibition de la transcription cellulaire par le virus,
- modulation de l’épissage,
- transport sélectif d’ARN viraux,
- traduction préférentielle,
- prévention de la présentation antigénique,
- signalisation cellulaire,
- dérèglement du cycle cellulaire.
Quel est le but général des impacts moléculaire du virus ?
Pouvoir grandir, se multiplier et éviter la réponse immunitaire.
Définition de l’immortalisation de la cellule:
processus par lequel une cellule acquiert une durée de vie illimitée , par exemple les cancers
Donner un exemple d’infection lente et progressive.
Le VIH .
V/ F : un virus peut suivre divers patrons selon l’hôte et le type cellulaire.
Vrai.
VPH : nom complet ? Enveloppé ? Quantité de sérotypes ?
Virus du papillome humain, non enveloppé, plus de 200 sérotypes (certains sont cancérigènes, par exemple 16 et 18).
Pourquoi dit-on que le VPH a un tropisme strict ?
Réplication exclusive dans les kératinocytes (cellule épithéliale), spécificité d’espèce, spécificité de tissu (pour chaque sérotype).
Comment le VPH se transforme et s’immortalise, allant jusqu’au cancer, possiblement ?
- La protéine E5 active le facteur de croissance, il s’ensuit une cascade et une multiplication (pas de changement de protéine sur CMH : résiste au SI).
- E6 = dégrade p53 (pas capable de réparer l’ADN/apoptose) et enlève un inhibiteur de la télomérase (donc immortelle)
- E7 : Inactive le Rb (normalement, il bloque la transcription, donc son blocage fait qu’on continue à produire des prots)
- E6 + E7 : Prévention apoptose, stimule cycle cell (mitose)
Quelles sont les 3 possibilités de dissémination dans le corps par les virus?
Dissémination localisée (infection de cellule à cellule), virémie (le virus va atteindre le milieu sanguin et donc tous les organes), dissémination neuronale (propagation d’un neurone au suivant).
Quels sont les 7 mécanismes de dissémination localisée ?
Apoptose, lyse cellulaire, relâche sans mort de la cellule, exocytose, transcytose, syncytia, passage direct d’une cellule à l’autre.
Quels sont les 4 patrons différents de l’infection virale?
Infection aiguë suivie par l’élimination du virus, infection aiguë suivie par une infection latente avec des épisodes de réactivation, infection aiguë suivie par une infection chronique persistante , infection lente et progressive.