Cours 9 - Mutations et variabilité génomique Flashcards
Qu’est-ce qu’une mutation
- Elles englobent tous les changements inimaginables de séquence de l’ADN.
- Elles peuvent être néfastes, bénéfiques ou nulles.
Nommer 2 effets généraux d’une mutation sur les protéines
- Peut affecter la structure de la protéine
- Peut affecter la régulation de la transcription
Qu’est-ce qui est à la base du polymorphisme
les mutations
Nommer 2 types de mutation ponctuelles
- Substitution de nucléotides
- Indels (insertion ou déletion)
Nommer 4 types de modifications profondes
- Large insertion ou délétion
- Réarragement chromosomique
- Amplification génétique
- Anomalies chromosomiques
Qu’est-ce qu’une substitution
Il s’agit du remplacement d’un nucléotide qui implique les mécanismes de réplication de l’ADN:
- Erreur pendant la réplication - Mauvaise association de base azotée
Qu’est-ce qu’une transversion
Changement d’une purine pour un pyrimidine ou vis-vers
Qu’est-ce qu’une transition
Changement entre 2 purines ou 2 pyrimidines
Nommer une conséquence des indels
Ils induisent un changement du cadre de lecture
Nommer une cause fréquente des indels
Un glissement de la polymérase lors de la réplication:
- Insertion si le brin polymérisé glisse (amorce) - Délétion si le brin matrice glisse * * Ils apparaisent lorsque des boucles sont stabilisé par des appariements décalés
Vrai ou Faux
Si une mutation ponctuelle n’est pas réparée, elle sera intégrée au génome de manière permanente dès la réplication suivante
Vrai
** Si la mutation à lieu au niveau des cellules germinales ou des cellules germinales primordiales (CGP), elle sera transmise aux prochaines générations **
Nommer 3 effets différents d’une mutation en fonction de sa position
- Mutation dans la séquence codante (traduction)
- Mutation dans la région régulatrice de l’expression génique (transcription)
- Mutation dans la stucture de l’ADN
Qu’est-ce qu’un mutant complet
Les mutations qui touchent le site actif de la protéine ou en sont proches
=> Probablement perte de la fonction de cette protéine
Qu’est-ce qu’un mutant partiel
Les mutations touchant des zones moins essentielles d’une protéine
=> Effet probablement moins néfaste
Nommer 2 types d’erreurs dans la réplication de l’ADN
- Tautomérie
- Glissement de la machinerie de réplication
Nommer 3 types de lésions spontanées
- Dépurination
- Désamination
- Endommagement des bases par oxydation ou alkylation
Qu’est-ce qu’un tautomère
Ce sont des isomères qui diffèrent par la position de leur atomes/liaisons
Nommer une conséquence possible de l’insertion d’un mauvais tautomère
Cela peut mener à un mésappariement
=> Susceptible de créer une mutation pendant la réplication (Mutation par transition)
Vrai ou Faux
Le mécanisme de glissement réplicatif ajoute n’importe quelle paire de base
Faux
Il augmente/ diminue le nombre de répétitions DÉJÀ PRÉSENTES
Dans quelle région retrouve-t-on souvent des mutations causées par un glissement de la polymérase
Dans les microsatellites
Nommer 2 types de modifications chimiques des bases peuvent entraîner des altérations dans la séquence
- Facteurs environnementaux (Radiation, agents mutagènes, agents chimiques)
- L’action de l’eau (altération hydrolytique)
Nommer 2 types d’altérations hydrolytiques
- Désamination
- Dépurination
Qu’est-ce qu’une désamination
Perte d’un NH3
- Cytosine => Uracile
- Cytosine-CH3 (méthylé) => Thymine
Quelle est la mutation la plus fréquente dans les lignées germinales et cancéreuses
Transition C -> T
- On les sait grâce au séquençage du génome **
- Suggère que le taux de désamination de la cytosine est un déterminant important de la vitesse à laquelle le génome perd l’information **
Nommer 4 mécanismes d’agents mutagènes
- Alkylation
- Oxydation
- Analogue de base
- Agent intercalant
Nommer 2 facteurs environnementaux
- Les substances mutagènes
- Les radiations
Qu’est-ce que l’alkylation
Ajout d’un groupement chimique sur les bases
=> Mésappariement
Ou
=> PAS d’appariement
Qu’est-ce que l’oxydation
Ajout d’un O
Ou
Perte d’un H
=> Mésappariement
Qu’est-ce qu’un analogue de base
Une molécule qui remplace une base
=>L’appariement se fait selon la molécule ajoutée
Qu’est-ce qu’un agent intercalant
Une molécule qui s’insère entre les bases
=> Intervient dans la réplication/transcription
Quelle est la conséquence possible d’un exposition à des rayons UV
Comme la lumière de 260nm est fortement absorbé par les bases
=> Fusion photochimique de 2 pyrimidines adjacentes
=> Impossible à apparier
=> Arrêt de la polymérase
Quelle est la conséquence possible d’un exposition à des radiations ionisantes
Directement:
- S’attaque au sucre et provoque une cassure double-brin de l’ADN
Indirectement:
- Favorise l’apparition des radicaux libres
Nommer 3 types de réparation qui profite du brin complémentaire
- L’inversion directe ou ligase
- La réparation par excision d’une base (BER)
- La réparation par excision d’un nucléotide (NER)
Nommer 2 types de réparation qui profite d’une séquence homologue (Chromatide soeur)
- Recombinaison homologue
- Ligature directe des extrémités (NHEJ)
Qu’est-ce qu’un patient mozaïque
Porteur de la mutation que dans certaines cellules ou une région de l’organisme
De quoi dépend la zone touchée chez un patient mosaïque
Du moment dans le développement où la mutation survient
Vrai ou Faux
Les mutations chez les cellules somatiques ne seront jamais héréditaire
Vrai
Car elles ne touchent pas les cellules destinées à la reproduction
Comment se transmet une mutation des cellules germinales
Transmission de la mutation par les gamètes
=>Mutations héréditaire
Quelles sont les 3 types de conséquence d’une mutation
- Nuisible (Réduit la probabilité de survie / de reproduction)
- Neutre (Aucun effet)
- Bénéfique (Accroit la valeur adaptative)
Nommer 1 phénomène à la base de l’évolution
Le polymorphisme / Les mutations
Nommer un facteurs nécessaire à la sélection naturelle
La présence d’une variabilité génétique déjà presente pour permettre la sélection
** Il n’y a pas de création à partir de zéro **
