Cours 8 - Régulation entre l’ADN et le Phénotype Flashcards
Vrai ou Faux
L’ADN est composé à environ 25% de séquence codante
Faux
Seulement 1.5% du génome code pour des protéines
L’ADN mitochondriale contient combien de gènes
Entre 3 et 67 gènes selon les espèces
Vrai ou Faux
La densité génique augmente avec l’évolution
Faux
C’est l’inverse (plus grand génome mais pas plus de gènes)
Nommer 2 impacts de variabilité dans la régulation de la transcription (région non-codante)
- Pénétrance
- Expressivité
Qu’est-ce qu’un SNP
Il s’agit d’une point de polymorphisme simple (un nucléotide différent)
Quelle est la différence entre un allèle et un variant
- Un allèle est une variation dans un gène
- Un variant est une variation dans l’ADN intergénique
- 95% des SNP sont dans l’ADN intergénique **
Vrai ou Faux
Un individu hétérozygote pour l’allèle mutant démontre une faible expression de l’allèle fonctionnel
Faux
Ça va dépendre de la régulation
À quoi sert un marqueur d’expression
Voir où la protéine est exprimé (Sa régulation)
** On ne voit pas la protéine en soit **
La polydactylie est du à quoi
À un problème de régulation du gène SHH
** La protéine est fonctionnelle (PAS du à un protéine mutée) **
Vrai ou Faux
La zone ZRS est très loin physiquement du gène SHH
Faux
Malgré qu’elle se situe à plus d’un milion de paires de bases, elle est proche physiquement (boucle)
Qu’est-ce que la zone ZRS
- Une région conservé au cours de l’évolution qui régule SHH
- Une mutation dans cette région peut causer la polydactylie ou moins de doigts
Vrai ou Faux
Un SNP dans une région à plus d’un million de paires de base d’un gène peut affecter sa régulation
Vrai
Ex: ZRS et SHH
Qu’est-ce que l’épigénétique
Des changements stables et transmissibles lors de la mitose, causés par l’activation et la désactivation des gènes par une modification de l’accès à l’ADN et aux gènes transcrits.
** Sans altération des séquences de nucléotides **
Comment est influencé l’épigénétique
Par des conditions environnementales interne (Âge, sexe, etc) et externe (Ex: famine, température, etc)
Qu’est-ce que l’épigénétique influence
- La pénétrance
- L’expressivité
- Modifications essentielles pour l’établissement du destin cellulaire **
Expliquer le processus d’extinction des gènes
- L’ajout de groupement de méthyle DIRECTEMENT sur l’ADN (sur les A ou C) marque la région pour la formation d’hétérochromatine
=> Les groupements méthyles sont conservés pendant la mitose
=> Leur présence active la méthylation sur le brin complémentaire
** Pour toujours **
Nommer 2 types d’épigénétique
- Le processus d’extinction (Agit sur l’ADN directement)
- Les complexes remodelant (Agit sur les histones)
Expliquer le processus des complexes remodelants (2)
- Ajout d’un groupement méthyle sur les histones marque la région pour la formation d’hétérochromatine
- Ajout d’un groupement actéyle ou phosphate neutralise la charge des histones => Facilite l’accès à l’ADN => Augmente la transcription
- Modification post-traductionnelle possible => Permet de moduler la condensation **
Nommer un exemple de maladie lié à l’épigénétique
Syndrôme de X-fragile:
- Îlots CpG
- Sur le chromosome X
=> Induit la méthylation du promoteur du gène FMR1
Vrai ou Faux
La méthylation de l’ADN et des modifications post-traductionnelle des histones sont maintenues lors des mitoses
Vrai
Vrai ou Faux
La méthylation de l’ADN et des modifications post-traductionnelle des histones sont maintenues lors de la méïose
Faux
La méthylation est retiré lors de la méïose et de la formation de gamètes
Vrai ou Faux
Il peut y avoir de l’hérédité transgénérationnel des modifications épigénétiques
Faux
- Il y a un effacement massif des marques épigénétiques
- Il y a l’apparence d’hérédité transgénérationnelle du au contact entre les cellules de la F1 avec la F2
Qu’est-ce que le phénomène de l’empreinte génétique
L’empreinte génétique est un phénomène où une des deux copies (soit maternelle ou paternelle) est gardée silencieuse par la méthylation.
** Normalement les mammifères les 2 copies sont exprimées de façon semblable **
Qu’est-ce que les maladies d’empreinte
Une maladie pour laquelle il y a une pénétrance spécifique selon le parent d’origine.
Ex: - La copie paternelle est silencieuse
=> Les enfants d’un père atteint seront porteur mais sains
=> Les enfants d’une mère atteint seront malade
Décrivez le développement des empreintes génomiques
1) Effacées dans les cellules primordiales
2) Établies pendant la gamétogenèse
3) Maintenues dans l’embryon
Quelle est la cause du syndrôme d’Angelman
Causée par la délétion d’une portion du chromosome 15 maternel comprenant un gène important
** Il s’agit d’une maladie d’empreinte transmise seulement par la mère **
Qu’est-ce que la compensation de dosage
Le processus par lequel l’expression des gènes portés par le chromosome X est quantitativement équivalente chez le mâle et la femelle, suite à l’inactivation des chromosomes X supplémentaires.
Pourquoi le processus de compensation de dosage est important
Car l’humain est sensible au dosage chromosomique (Cause généralement la mort précoce du foetus)
Comment nomme-t-on le chromosome X inactivé chez la femelle
Un corpuscule de Barr
Vrai ou Faux
L’inactivation d’un chromosome X chez la femelle est aléatoire
Vrai (Au début)
Après la première inactivation, l’inactivation est maintenue à travers les divisions cellulaires (Toute la descendance d’une cellule portera le mm chromosome X inactivé
À quel stade du développement le deuxième chromosome X des femelles est désactivé
Au stade blastocyte
Qu’est-ce que XIST (1)
Un long ARN non-codant
Quel est le rôle de XIST
Le chromosome qui l’exprime (paternel ou maternel) sera inactivé
Expliquez le mécanisme de XIST
- Il recrute une histone méthyle-transférase (PRC2)
=> Le chromosome devient inaccessible à la machinerie de transcription
=> Il se condense en hétérochromatine
=> Devient le corpuscule de Barr
Nommer 2 similarités entre la souris et l’humain pour l’inactivation du chromosome X
- Doit toujours se faire tôt dans le développement
- Reste aléatoire au final.
Nommer 1 différence entre la souris et l’humain pour l’inactivation du chromosome X
Chez la souris, on observe une première phase où il y a empreinte génétique dans l’inactivation (PAS chez l’humain)
Vrai ou Faux
XIST n’est pas exprimé chez les hommes
Vrai
** Le niveau d’expression de XIST augmente de manière proportionnelle au nombre de X présent (plus de X, plus de XIST!) **
Vrai ou Faux
Le nombre de corpuscule de Barr est égal au nombre de chromosome X chez un individu
Faux
Nombre de corpuscule de Barr = (Nombre de chromosome X) - 1
Expliquer l’exemple du pelage bicolore des chats
- La couleur du pelage est déterminé par un gène sur le chromosome X
=> Seul les femelles hétérozygotes peuvent être bicolore
