Cours 9 : compartiments cellulaires (part 3) Flashcards
Par quoi son liées les compartiments cellulaires entourés par une membrane
Le trafic vésiculaire
À l’aide de quelles structures les vésicules transporte -t-elles les protéines
Les moteurs protéiques et les filaments cytosquelettiques polaires (MT et actine-F)
Par quel mécanisme les vésicules se forment-elles? et se déforment-elles (une fois arrivées à destination)?
Formation : bourgeonnement
Déformation : fusion membranaire
Le transport vésiculaire a combien de directions?
une seule
3 types de vésicules
- Clathrine
- COPI
- COPII
Quel est le point de départ et le point d’arrivée des vésicules COPII
Formées dans le RER et acheminées au Golgi
Étapes de la formation des vésicules COPII (3 étapes)
- Sar1 est activée par GEF de la membrane : insertion de Sar1 dans la membrane grâce à une hélice alpha amphiphile
- Protéines Sec23/24 lient Sar1-GTP et un récepteur de cargaison (intérieur du manteau)
- Protéines Sec13/31 se lient par dessus Sec23/24 (extérieur du manteau)
Quelles protéines sont utilisées pour sélectionner la bonne membrane avec laquelle la vésicule COPII doit fusionner
Rabs (GTPase de type RAS)
SNAREs (protéines de fusion)
Étape de la fusion de COPII sur sa membrane cible (2)
- Rab-GTP dans la membrane de COPII se lie à son récepteur sur la membrane de l’organite cible
- Les SNAREs s’associent fortement
2 types de SNAREs
v-SNARE : membrane de la vésicule
t-SNARE : dans la membrane cible
Que se passe-t-il lors de la liaison v/t-SNAREs
La liaison est tellement forte que l’eau entre les 2 membrane est expulsée, ce qui permet la fusion des 2 membranes
Que faut-il pour dissocier la paire de SNAREs
L’énergie de l’hydrolyse d’un ATP (NSF)
Avec quelle partie du Golgi les COPII fusionnent-elles
Le cis-Golgi
Via quelles vésicules certaines protéines retourneront-elles au RER
Les COPI
Qu’arrive-t-il aux protéines dans la région médiane-Golgi
Ils subissent une maturation de leurs sucres
Qu’arrive-t-il aux protéines dans le trans-Golgi
Elles sont triées et emballées pour leur destination finale (endosome, lysosome ou membrane plasmique)
Avec quelle protéine sont activées les vésicules COPI
ARF1 (GTPase de type Ras)
Avec quelles protéines se forme le manteaux des vésicules COPI (dans le cis-golgi)
Protéines transmembranaires ayant la séquence KKXX en C-terminale (dont les récepteurs KDEL)
Est ce que le retour des protéines/lipides au RE est continuel et de quoi a-t-on besoin pour effectuer ce retour
OUI
Besoin de Rab-snares (appropriés)
2 modèles de transport des vésicules dans le golgi
- Transport des vésicules : citernes sont statiques, les protéines voyagent via des vésicules
- Maturation des citernes : Maturation graduelle des citernes et des protéines qu’elles contiennent (antérograde). Le transport rétrograde se fait par vésicule
À quoi sert la matrice extra-golgienne
Responsable de l’intégralité structurale du Golgi
Aide au transport
Positionne le Golgi dans la cellule
De quoi est composée la matrice extra-golgienne
De protéines, majoritairement des golgines
Quel est le rôle principal des golgines
Lier des protéines d’identité vésiculaire (recrutées à des citernes spécifiques et «pêchent» des vésicules)
Structure des golgines (3 éléments)
- Super hélice
Peut être interrompue par endroit pour permettre plus de flexibilité - Insérées dans le Golgi via leur C-terminal
- L’extrémité N-terminale se retrouve plus loin dans le cytoplasme
Quelle structure formée par les golgines permet d’exclure la majorité des organites
Le filet formé par l’allongement des golgines
Comment a-t-on découvert qu’un type de golgine lie un type de vésicule spécifique
Un type de golgine à la fois a été exprimé à la surface de la mitochondrie et on analyse ce qui se retrouve à la surface qui a été «pêché» par les golgines
Normalement aucune vésicule se lie aux mitochondries
L’attachement d’une vésicule/citerne à la golgine peut provoquer…
- Fusion membranaire (SNAREs)
- Stabilisation de la matrice externe du Golgi (empilement citernes)
De quoi est composé l’unité de sucre des protéines arrivant au Golgi
N-acétylglucosamine et Mannose attaché aux ASNs
La maturation des sucres dans le golgi est simultanée ou séquentielle
Séquentielle
Quelle conclusion a été faite à la suite de la tomographie immunoélectrique (enzyme localisée par des Anti-corps couplés à des particules d’or)
Le golgi est formé de plusieurs compartiments ayant des activités enzymatiques différentes
5 utilité des sucres sur les protéines
- Ciblage (lieu d’appartenance de la protéine)
- Augmente la solubilité de la protéine (aide au repliement)
- Couche protectrice (résistance aux protéases)
- Adhérence intercellulaire
- Signalisation intercellulaire (GB)
Est ce que le golgi participe à la production des glycolipides
OUI
Qu’arrive-t-il aux protéines ayant pour destination finale la membrane plasmique (rendu dans le trans-golgi)
Acheminées par des vésicules COPI ayant des Rabs et SNAREs appropriés
Ciblées par un sucre complexe
Qu’arrive-t-il aux protéines ayant pour destination finale les endosomes/lysosomes (rendu dans le trans-golgi)
Acheminées par des vésicules Clathrine ayant des Rabs et SNAREs appropriés
Ciblées par un sucre riche en mannose phosphaté
Est ce qu’il est possible de concentrer les protéines cargos ayant quitté le golgi en 1 seule vésicule
Oui, si les protéines cargos peuvent être ensemble
Comment se nomme le phénomène de la concentration de plusieurs Clathrines pour former une seule vésicule
Un retrait de membrane
Que se passe-t-il après la fusion des Clathrines en une seule vésicule
Les membranes sont récupérées et retourne au Golgi
2 types de voies pour les vésicules sécrétoires
Constitutive (active en tout temps)
Contrôlée (activé par un signal spécifique)
Que font les vésicules des voies contrôlées si ceux-ci ne sont pas ouvertes
Elles attendent le signal avant de fusionner avec la membrane plasmique
Qu’arrive-t-il lors de la dégranulation d’un mastocyte
Réaction allergique (relâchement de l’histamine)
Comment le golgi fait-il pour se déplacer (chez les vertébrés)
Il s’attache aux microtubules du MTOC et s’accroche à la dynéine
Comment le golgi se déplace-t-il chez les plantes et les mycètes
Grâce à l’interaction de sa matrice avec l’actine-F et la myosine
(Le golgi va chercher les vésicules du RER nouvellement formées)
Que se passe-t-il avec le golgi lors de la mitose (4 étapes)
- Phosphorylation des protéines de la matrice bloque la voie de sécrétion
- Les citernes sont défaites en petites vésicules
- Les vésicules sont distribuées également entre les 2 cellules filles (à l’aide du fuseau mitotique)
- Les vésicules reforment des citernes dans les cellules filles
Que se passe-t-il avec le golgi lors de l’apoptose d’une cellule
- La voie de sécrétion est bloquée
- Le golgi est fragmenté de façon irréversible
- Les capases détachent et dégradent les protéines de la matrice
Qu’est ce que les capases
Enzymes protéolytiques
Qu’est ce qui part du golgi (ou de la membrane plasmique) et est acheminé vers les endosomes
Des vésicules de clathrine contenant des hydrolases acides
Quels processus fait en sorte que l’endosome devient de plus en plus acide (2)
Activité de la pompe ATPase de type V
Accumulation d’hydrolases acides (fusion de vésicules)
Que devient l’endosome lorsqu’il est très acide
Un lysosome
Avec quoi sont étiquetées les protéines destinées aux endosomes/lysosomes
Un mannose-6-phosphate
Quel pH est le plus grand (plus basique) : celui du noyau ou celui du cytoplasme
Celui du noyau parce que les histones ont plusieurs AA basiques
2 réactions pour mettre le mannose-6-phosphate sur les protéines destinées au lysosome/endosome
- Phosphotransférase lie la région signal de la protéine lysosomale et transfère un N-acétylglucosamine phosphatée sur un mannose
- Une hydrolase enlève le N-acétylglucosamine et le mannose conserve le phosphate
Quelle protéine fait le lien entre le récepteur membranaire du mannose-6-phosphate et la clathrine (dans les vésicules de clathrine)
Les adaptines
Comment se nomme une unité de clathrine et de quoi est-elle composée
Une triskèle
3 chaînes lourdes et 3 chaînes légères
Que fait la dynamite (GTPase)
Fait un pincement pour détacher la vésicule de clathrine de la membrane donneuse
(Se tord grâce à l’hydrolyse du GTP)
Pourquoi les vésicules détachées perdent leur manteau de clathrine
Pour recycler la clathrine
Exposer les Rabs et les SNAREs
Le transport des hydrolases acides est unidirectionnel ou bidirectionnel
Unidirectionnel
Qu’arrive-t-il au récepteur de mannose-6-phosphate lorsque la vésicule fusionne avec le lysosome (3 éléments)
Le récepteur ne fonctionne pas à pH acide
Une phosphatase acide retire le phosphate du mannose-6-phosphate
La cargaison perd le signal et le récepteur retourne vers golgi pour être recyclé
Rôle de l’endosome
Fait le tri des molécules reçues à partir des vésicules de clathrine
Recycle les récepteurs avant la digestion
Qu’est ce que la pinocytose
Ingestion de molécules solubles
Utilise les puits recouverts comme intermédiaires
Qu’est-ce que l’endocytose par récepteurs
Profite de la pinocytose grâce à l’utilisation des adaptines (récepteurs spécifique)
Qu’est ce que la phagocytose
Ingestion de grosses particules nécéssitant la formation de pseudopodes
Lors de la phagocytose, quelles structures cellulaire permet à la cellule de se contracter
L’actine et la myosine
Qu’est ce que l’autophagie
Dégrade quelque chose qui provient de la cellule
Qu’est ce qui remplace les lysosomes chez les plantes
La vacuole
Est ce que toute les cellules du corps peuvent faire de la phagocytose
Non, seulement certaines (Ex : macrophage)
Est ce que les cellules des plantes peuvent faire de la phagocytose
NON
Utilité de la vacuole
- Remplace le lysosome
- Entrepôt des molécules anti-microbes et anti-herbivores
- Cellules plus grandes sans plus de cytoplasme
- Source de sucre
- Utilisation pharmaceutique
- Composant du vin (arôme, texture)
7.Excrétion externe - Stockage de protéines (légumineuses)
