Cours 9 Flashcards
Vrai ou faux, la génomique comparative révèle une corrélation positive entre la taille du génome et la complexité des organismes
Faux, il y a une absence de corrélation entre la taille du génome et la complexité des organismes
Vrai ou faux, la génomique comparative révèle une absence de corrélation entre le nombre de gène et la complexité des organismes
Vrai, elle révèle une absence de corrélation entre le nombre de gène et la complexité des organismes
Nommer 2 façons dont une duplication peut se produire
- Lors de la réplication de l’ADN, lorsque des segments d’ADN sont copiés de manière incorrecte
- Les erreurs lors de la recombinaison méiotique
Qui suis-je, après la duplication, l’une des deux copies d’un gène peut subir des mutations. Ça peut conduire au développement d’une nouvelle fonction
Néofonctionnalisation
Qui suis-je, après la duplication, les deux copies d’un gène peuvent conserver leur fonction
Conservation
Qui suis-je, après la duplication, l’une des copies peut devenir non fonctionnelle
Pseudogénisation
Qui suis-je, ils appartiennent à la fraction non-codante du génome
Pseudogènes
Qu’est-ce qu’un pseudogène
Désigne un gène inactif du fait d’altérations génétiques le rendant non-fonctionnel et donc incapable de conduire à l’expression d’une protéine
Qui suis-je, on les appelle parfois «gènes fossiles»
Pseudogènes
Nommer 2 types de transposons
- Transposons à ADN
- Rétrotransposons
Qui suis-je, segments d’ADN dits «égoïstes» qui codent pour des protéines permettant à ces segments de se copier ou de se déplacer à l’intérieur d’un génome
Éléments transposables
Capacité des Transposons à ADN
Capables de s’extirper du génome et d’être insérés ailleurs
Capacité des rétrotransposons
Ils se copient eux-mêmes par l’intermédiaire d’un ARN
Un génome peut acquérir de nouveaux gènes en recrutant des gènes codant des protéines d’éléments transposables et en les utilisant comme protéines cellulaires. Comment se nomme ces événements?
«Domestications des protéines de l’élément transposable»
Vrai ou faux, les transposons peuvent créer de nouveaux gènes en s’installant dans d’autres gènes
Vrai
Définition transfert horizontal de gène
Cas où un gène n’a pas une origine verticale (càd une transmission directe des parents à la descendance) mais provient d’un génome non apparenté
Qui suis-je, ce type de transfert se produit souvent entre bactéries, et entre les génomes des organites cellulaires et les génomes nucléaires
Transfert horizontal de gène
Nommer un exemple connu de transfert horizontal de gènes
Entre une plante et un animal: un ravageur sous le nom d’aleurode a acquis un gène (via l’intermédiaire d’un virus) de l’une des diverses plantes dont il se nourrit
Vrai ou faux, de nouveaux gènes peuvent provenir de novo de régions non codantes de l’ADN
Vrai
Qu’est-ce que les gènes de novo comprennent
Ils comprennent à la fois des gènes codants pour des protéines et des «gènes non codants» (qui jouent un rôle fonctionnel, par exemple en régulant l’expression d’autres gènes)
Qui suis-je, pour ces gênes, il n’y a pas d’homologues dans d’autres espèces
Gènes de novo
Qui suis-je, L’évolution est formée de l’accumulation de petits changements survenant de façon +/- régulière dans le temps
Gradualisme
Qui suis-je, l’évolution est formée de longues périodes sans changements, ponctués de courtes périodes où surviennent des changements importants
Évolution saltatoire (équilibrés ponctués)
Vrai ou faux, l’homme et le chimpanzé partagent environ 50% d’identité de séquence ADN
Faux, ils partagent 96%
À quoi sont dues les différences morphologiques entre l’homme et le chimpanzé
Elles sont dues à des différences de régulation
D’où vient la variation de nouveaux gènes entre les espèces
Elle vient de la façon dont les gènes sont régulés
Vrai ou faux, les mutations dans les gènes de régulation ou leurs sites de liaison peuvent avoir des conséquence majeures sur le développement d’un phénotype
Vrai
Qui suis-je, elles sont des éléments régulateurs majeurs du développement embryonnaire et sont responsables de la détermination de l’identité des segments le long de l’axe antéropostérieur
Les protéines des gènes Hox
Vrai ou faux, les gènes Hox ne sont pas conservés
Faux
Qu’est-ce que ça prend pour qu’une mutation qui induit un changement majeur persiste
Les mutants doivent pouvoir exceller dans leur niche écologique ou trouver une niche écologique pour exceller
Vrai ou faux, les changements abruptes sont plus importants dans l’histoire
Faux, ce sont les changements graduels qui sont plus importants
Vrai ou faux, les changements abruptes sont souvent très avantageux
Faux, ils sont souvent des effets désastreux plutôt qu’avantageux
L’ADNmt code pour combien de protéines
13 protéines impliquées dans la production d’énergie
Vrai ou faux, la nature extrêmement compacte de l’ADNmt suggère qu’il y a peu de place pour des innovations évolutives
Vrai
Qui suis-je, une des plus petites protéines décrites à ce jour, à un rôle dans le développement chez la drosophile
TAL
Qui suis-je, gènes qui modulent la physiologie mitochondriale, la prolifération et la survie cellulaire
Humanin et SHLPs
Rôle de MOTs-C
Régulation métabolique
Qu’est-ce que mtaltnd4
Gène alternatif dans la mitochondrial alternative (cadre de lecture alternatif) dans le gène nd4
3 effets de mtaltnd4 et conséquence
- Diminution du métabolisme aérobie
- Impact sur la prolifération cellulaire en fonction de la dose
- Peu ou pas d’impact sur la viabilité cellulaire
MTALTND4 induit un dépression bioénergétique
Vrai ou faux, mtaltnd4 pourrait contribuer à réduire la demande bioénergétique dans des conditions de stress
Vrai
De quelle façon a-t-on identifier les partenaires d’interaction de mtaltnd4
Par co-immunoprécipitations et essaies de pull down
Nommer un partenaire d’interaction de mtaltnd4, où elle est localisée et son rôle
C1QBP est localisée dans la matrice mitochondriale et régule le métabolisme énergétique cellulaire par la modulation de la traduction mitochondriale ou de la concentration en Ca2+, ou par des interactions protéine-protéine
Conséquence de knock-down de C1QBP
Diminution du métabolisme mitochondrial
Vrai ou faux, mtaltnd4 est bien conservée chez les primates
Vrai
Qui suis-je, sa séquence codante réside dans le gène nd4
Mtaltnd4
Vrai ou faux, mtaltnd4 est retrouvée dans le cytoplasme (mitochondrie) et le plasma
Vrai
Quelle autre protéine autre que mtaltnd4 a été découverte
Mtaltco1
Vrai ou faux, avec un protéome alternatif, le répertoire fonctionnel est énorme
Vrai