Cours 8B: Structure De la Chromatine Et Épigénétique Flashcards

1
Q

les chromosomes deviennent visibles durant…

A

mitose/cytodiérèse (division de la cellule durant télophase)

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2
Q

cellule germinale humaine vs cellule somatique humaine

A

germinale:
22 autosomes + 1 génosome (X ou Y)

somatique
22 paires d’autosomes + 1 pair de génosome (XX ou XY)

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3
Q

Caryotype

A

organisation des chromosomes homologues placés en ordre et numérotés selon une entente internationale

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4
Q

chromosome est formé de

A

1 seule tres longue molécule linéaire d’ADN (double-hélice) fortement condensée

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5
Q

centromère

A

région qui unit les 2 chromatides soeurs
utilisé pour la ségrégation vers les poles opposés

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6
Q

est-ce qu’on retrouve des gènes sur les centromères

A

non

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7
Q

télomère

A

portion distale des chromosomes contenant des séquences nucléotidiques répétées qui empechent la perte de matériel génétique

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8
Q

chromosome homologue

A

une des 2 copies d’un chromosome dans une cellule diploide (un provient de la mère et l’autre du père)

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9
Q

chromatide

A

copie d’un chromosome ayant été répliqué et qui est encore attaché à sa chromatide soeur

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10
Q

la chromatine est composée de

A

ADN, histones et protéines non-histones

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11
Q

si on déplie chaque chromosome humain, il mesure à lui seul environ…

A

5 cm

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12
Q

tout adn humain déplié mesure environ

A

3 metres

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13
Q

nucléosome

A

unité d’organisation de base de la chromatine qui contient un segment d’ADN et un complexe protéique d’histones

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14
Q

fibres de 11 nm de chromatine

A

présentent dans enroulement de l’ADN autour des histones

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15
Q

fibres de 30 nm de chromatide

A

état naturel de ADN, entourée de protéines lors de l’interphase

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16
Q

combien de paires de base dans un nucléosome et d’histones

A

147
8

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17
Q

les histones sont chargées ?

A

positivement

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18
Q

noyau protéique

A

octamère formé de 2 copies de chacune des protéines H2A, H2B, H3 et H4 autour duquel 147 pb d’ADN effectuent environ 2 tours

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19
Q

Histone H1

A

lie ADN au niveau ou celui-ci rentre et sort de la particule de coeur
compacte ADN (force rapprochement de ADN en entrant et sortant sur une trentaine de pb limitant ainsi leurs mouvements et scellant le complexe nucléoprotéique)

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20
Q

hétérochromatine

A

zone contenant chromatine fortement condensée et peu accessible
contient peu de genes

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21
Q

euchromatine

A

zones plus laches qui rendent segments ADN fréquemment utilisés plus accessibles pour la cellule

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22
Q

les télomères et les centromères sont des exemples de quel type de chromatine

A

hétérochromatine

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23
Q

type de chromatine ou l’expression des genes est possible

A

euchromatine

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24
Q

type de chromatine ou l’expression des genes est réprimée

A

hétérochromatine

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25
Q

quels sont les 2 moyens que la cellule possède pour modifier la structure et l’état de la chromatine

A

Complexes de remodelage
modifications chimiques réversibles

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26
Q

que font les complexes de remodelage

A

modifient la position de l’ADN enroulé autour des nucléosomes
permet de donner lieu à une condensation ou à une décondensation de l’ADN après le glissement des nucléosomes

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27
Q

les complexes de remodelage de la chromatine utilisent

A

énergie de l’ATP

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28
Q

pour faire un déplacement plusieurs ??? sont nécessaires

A

cycles d’hydrolyse

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29
Q

les modifications chimiques réversibles affectent

A

histones (acétylation, méthylation, phosphorylation) ou ADN (méthylation)

30
Q

certaines de ces modifications sont

A

héritables/épigénétiques

31
Q

la modification des histones détermine

A

l’état de la chromatine

32
Q

nom des modifications des histones

A

modifications post-traductionnelles

33
Q

effet des modifications post-traductionnelles

A

condense/décondense la chromatine

34
Q

les modifications chimiques réversibles affectent quelle partie des histones

A

la queue N-terminale

35
Q

conséquence de l’Acétylation d’histones

A

neutralise les charges positives à la surface des histones sur les résidus Lysine (K) et Arginine (R)
ca décondense la chromatine

36
Q

est-ce que l’Acétylation des histones est réversible

A

oui, si les groupes acétylés sont enlevés, la chromatine peut reprendre sa forme condensée

37
Q

molécule responsable de l’Acétylation des histones

A

HAT: histone acétyle transferase

38
Q

Molécule responsable de la désacétylation des histones

A

HD: histone déacétylases

39
Q

qu’est-ce que la phosphorylation des histones

A

ajout de groupement phosphate (chargé négativement) à des résidus contenant OH (sérine, tyrosine, thréonine)

40
Q

conséquence de la phosphorylation d’histones

A

groupement phosphate (charge -) intéragit moins fortement avec l’histone (charge +)
phosphorylation ajoute des charges négatives à l’histone ce qui empeche l’enroulement de ADN autour des octamères d’histones
DONC décondensation

41
Q

est-ce que la phosphorylation est réversible

A

oui, quand les groupements phosphates sont retirés la chromatine peut reprendre sa forme condensée

42
Q

la méthylation de lysine est effectuée par

A

enzymes arginine transférase PKMT

43
Q

la méthylation de lysine cause…

A

perte de charge positive et une augmentation de l’hydrophobicité

44
Q

est-ce que la méthylation d’arginine est différente de la méthylation de lysine

A

non, elles sont effectués par le meme enzyme PKMT et donnent le meme résultat

45
Q

la méthylation des histones est uniquement associée avec la répression de la transcription, vrai ou faux

A

faux, avec l’Activation et la répression de la transcription

46
Q

exemple de marque activant la transcription

A

triméthylation de l’histone H3 à la lysine 4 (H3K4me3)

47
Q

exemple de signal pour le silencing transcriptionnel et à quel moment ce signal est augmenté

A

diméthylation de l’histone 3 à la lysine 9 (H3K9me2)
augmenté peu apres un conditionnement de la peur

48
Q

est-ce que la méthylation est réversible

A

oui, lorsque les groupes méthyles sont enlevés la chromatine reprend sa forme (condensée ou non condensée)

49
Q

méthylation de ADN = méthylation de

A

cytosines

50
Q

méthylation de cytosines entraine…

A

toujours une augmentation de la condensation ADN
donc une diminution de l’Accessibilité aux gènes codés par la portion d’ADN méthylé

51
Q

conséquence de la méthylation d’ADN

A

toujours une répression de la transcription

52
Q

est-ce que la méthylation de ADN est réversible

A

oui, lorsque les méthyles sont enlevés la chromatine reprend sa forme moins condensée

53
Q

qu’est-ce qu’un CpG Island

A

région riche en C eet G en amont de promoteurs

54
Q

que ce passe-t-il avec les promoteurs si les C sont méthylés

A

promoteurs sont réprimés

55
Q

épigénétique

A

changements héritables dans expression génétique de gènes ou phénotypes sans changements dans la séquence d’ADN

56
Q

les mécanismes génétiques ont un role important dans…

A

établissement et maintien des types cellulaires

57
Q

la méthylation de l’ADN est transmise aux cellules filles par ?

A

méthylases de maintien

58
Q

que font les méthylases de maintien

A

apres la réplication, elles vont copier le patron de méthylation du vieux brin sur le nouveau brin

59
Q

est-ce que la modification des histones peut etre héritée et retenue chez les cellules filles

A

oui

60
Q

environnement et histoire individuelle influent …

A

expression des gènes via des modifications réversibles ou transmissibles d’une génération à l’autre sans altération de l’info dans ADN

61
Q

épigénétique étudie…

A

comment environnement et histoire individuelle influent sur expression des gènes

62
Q

marques épigénétiques jouent un role dans

A

développement de maladies dont le cancer ou dans développement des traits (comportement, vieillissement, longévité)

63
Q

des études épigénétiques suggèrent que les modifications épigénétiques acquises pendant existence pourraient être…

A

transmises aux descendants

64
Q

le style de vie (en particulier l’exercice physique) peut modifier l’épigénome des cellules reproductrices humaines et donc

A

avoir un effet sur la santé des générations futures

65
Q

CONCEPT À RETENIR
Quelle est la différence entre chromosome et chromatide

A

chromatide est une des copies d’un chromosome lorsqu’elle est encore rattachée à sa chromatide soeur

66
Q

CONCEPT À RETENIR
Quelles sont les différentes parties du chromosome

A

centromère
télomère
origine de réplication

67
Q

CONCEPT À RETENIR
Qu’est-ce que la poidie et comment le nombre de chromosomes varie dans les cellules

A

cellule germinale = haploide
cellule somatique = diploide

ploidie = nb de réplication d’un jeu de 23 chromosomes dans une cellule

68
Q

CONCEPT À RETENIR
Quels sont les degrés d’enroulement des chromosomes eucaryotes

A

hétérochromatine = fortement condensée
euchromatine = bcp moins condensée

69
Q

CONCEPT À RETENIR
Définition et composition des nucléosomes

A

unité d’organisation de base de la chromatine
8 histones: 2x H2A H2B H3 et H4
147 pb d’ADN

70
Q

CONCEPT À RETENIR
Comment la condensation de la chromatine est affectée

A

complexes de remodelage et modifications chimiques réversibles

71
Q

CONCEPT À RETENIR
Modification de la chromatine et son effet dans expression des gènes

A

acétylation d’histones: décondense chromatine = augmente expression de gènes
phosphorylation d’histones: décondense chromatine = augmente expression des gènes
méthylation d’histones: condense ou décondense chromatine = augmente ou répresse l’expression de gènes
méthylation de ADN: condense chromatine = répresse l’expression de gènes

72
Q

CONCEPT À RETENIR
Épigénétique: définition, causes et effets

A

changements héritables dans expression de gènes ou phénotypes sans changements dans séquence ADN
marques épigénétiques transmises aux cellules filles
role dans le développement des maladies (cancer) et traits (comportement, vieillissement, longévité)