Cours 8B: Structure De la Chromatine Et Épigénétique Flashcards
les chromosomes deviennent visibles durant…
mitose/cytodiérèse (division de la cellule durant télophase)
cellule germinale humaine vs cellule somatique humaine
germinale:
22 autosomes + 1 génosome (X ou Y)
somatique
22 paires d’autosomes + 1 pair de génosome (XX ou XY)
Caryotype
organisation des chromosomes homologues placés en ordre et numérotés selon une entente internationale
chromosome est formé de
1 seule tres longue molécule linéaire d’ADN (double-hélice) fortement condensée
centromère
région qui unit les 2 chromatides soeurs
utilisé pour la ségrégation vers les poles opposés
est-ce qu’on retrouve des gènes sur les centromères
non
télomère
portion distale des chromosomes contenant des séquences nucléotidiques répétées qui empechent la perte de matériel génétique
chromosome homologue
une des 2 copies d’un chromosome dans une cellule diploide (un provient de la mère et l’autre du père)
chromatide
copie d’un chromosome ayant été répliqué et qui est encore attaché à sa chromatide soeur
la chromatine est composée de
ADN, histones et protéines non-histones
si on déplie chaque chromosome humain, il mesure à lui seul environ…
5 cm
tout adn humain déplié mesure environ
3 metres
nucléosome
unité d’organisation de base de la chromatine qui contient un segment d’ADN et un complexe protéique d’histones
fibres de 11 nm de chromatine
présentent dans enroulement de l’ADN autour des histones
fibres de 30 nm de chromatide
état naturel de ADN, entourée de protéines lors de l’interphase
combien de paires de base dans un nucléosome et d’histones
147
8
les histones sont chargées ?
positivement
noyau protéique
octamère formé de 2 copies de chacune des protéines H2A, H2B, H3 et H4 autour duquel 147 pb d’ADN effectuent environ 2 tours
Histone H1
lie ADN au niveau ou celui-ci rentre et sort de la particule de coeur
compacte ADN (force rapprochement de ADN en entrant et sortant sur une trentaine de pb limitant ainsi leurs mouvements et scellant le complexe nucléoprotéique)
hétérochromatine
zone contenant chromatine fortement condensée et peu accessible
contient peu de genes
euchromatine
zones plus laches qui rendent segments ADN fréquemment utilisés plus accessibles pour la cellule
les télomères et les centromères sont des exemples de quel type de chromatine
hétérochromatine
type de chromatine ou l’expression des genes est possible
euchromatine
type de chromatine ou l’expression des genes est réprimée
hétérochromatine
quels sont les 2 moyens que la cellule possède pour modifier la structure et l’état de la chromatine
Complexes de remodelage
modifications chimiques réversibles
que font les complexes de remodelage
modifient la position de l’ADN enroulé autour des nucléosomes
permet de donner lieu à une condensation ou à une décondensation de l’ADN après le glissement des nucléosomes
les complexes de remodelage de la chromatine utilisent
énergie de l’ATP
pour faire un déplacement plusieurs ??? sont nécessaires
cycles d’hydrolyse
les modifications chimiques réversibles affectent
histones (acétylation, méthylation, phosphorylation) ou ADN (méthylation)
certaines de ces modifications sont
héritables/épigénétiques
la modification des histones détermine
l’état de la chromatine
nom des modifications des histones
modifications post-traductionnelles
effet des modifications post-traductionnelles
condense/décondense la chromatine
les modifications chimiques réversibles affectent quelle partie des histones
la queue N-terminale
conséquence de l’Acétylation d’histones
neutralise les charges positives à la surface des histones sur les résidus Lysine (K) et Arginine (R)
ca décondense la chromatine
est-ce que l’Acétylation des histones est réversible
oui, si les groupes acétylés sont enlevés, la chromatine peut reprendre sa forme condensée
molécule responsable de l’Acétylation des histones
HAT: histone acétyle transferase
Molécule responsable de la désacétylation des histones
HD: histone déacétylases
qu’est-ce que la phosphorylation des histones
ajout de groupement phosphate (chargé négativement) à des résidus contenant OH (sérine, tyrosine, thréonine)
conséquence de la phosphorylation d’histones
groupement phosphate (charge -) intéragit moins fortement avec l’histone (charge +)
phosphorylation ajoute des charges négatives à l’histone ce qui empeche l’enroulement de ADN autour des octamères d’histones
DONC décondensation
est-ce que la phosphorylation est réversible
oui, quand les groupements phosphates sont retirés la chromatine peut reprendre sa forme condensée
la méthylation de lysine est effectuée par
enzymes arginine transférase PKMT
la méthylation de lysine cause…
perte de charge positive et une augmentation de l’hydrophobicité
est-ce que la méthylation d’arginine est différente de la méthylation de lysine
non, elles sont effectués par le meme enzyme PKMT et donnent le meme résultat
la méthylation des histones est uniquement associée avec la répression de la transcription, vrai ou faux
faux, avec l’Activation et la répression de la transcription
exemple de marque activant la transcription
triméthylation de l’histone H3 à la lysine 4 (H3K4me3)
exemple de signal pour le silencing transcriptionnel et à quel moment ce signal est augmenté
diméthylation de l’histone 3 à la lysine 9 (H3K9me2)
augmenté peu apres un conditionnement de la peur
est-ce que la méthylation est réversible
oui, lorsque les groupes méthyles sont enlevés la chromatine reprend sa forme (condensée ou non condensée)
méthylation de ADN = méthylation de
cytosines
méthylation de cytosines entraine…
toujours une augmentation de la condensation ADN
donc une diminution de l’Accessibilité aux gènes codés par la portion d’ADN méthylé
conséquence de la méthylation d’ADN
toujours une répression de la transcription
est-ce que la méthylation de ADN est réversible
oui, lorsque les méthyles sont enlevés la chromatine reprend sa forme moins condensée
qu’est-ce qu’un CpG Island
région riche en C eet G en amont de promoteurs
que ce passe-t-il avec les promoteurs si les C sont méthylés
promoteurs sont réprimés
épigénétique
changements héritables dans expression génétique de gènes ou phénotypes sans changements dans la séquence d’ADN
les mécanismes génétiques ont un role important dans…
établissement et maintien des types cellulaires
la méthylation de l’ADN est transmise aux cellules filles par ?
méthylases de maintien
que font les méthylases de maintien
apres la réplication, elles vont copier le patron de méthylation du vieux brin sur le nouveau brin
est-ce que la modification des histones peut etre héritée et retenue chez les cellules filles
oui
environnement et histoire individuelle influent …
expression des gènes via des modifications réversibles ou transmissibles d’une génération à l’autre sans altération de l’info dans ADN
épigénétique étudie…
comment environnement et histoire individuelle influent sur expression des gènes
marques épigénétiques jouent un role dans
développement de maladies dont le cancer ou dans développement des traits (comportement, vieillissement, longévité)
des études épigénétiques suggèrent que les modifications épigénétiques acquises pendant existence pourraient être…
transmises aux descendants
le style de vie (en particulier l’exercice physique) peut modifier l’épigénome des cellules reproductrices humaines et donc
avoir un effet sur la santé des générations futures
CONCEPT À RETENIR
Quelle est la différence entre chromosome et chromatide
chromatide est une des copies d’un chromosome lorsqu’elle est encore rattachée à sa chromatide soeur
CONCEPT À RETENIR
Quelles sont les différentes parties du chromosome
centromère
télomère
origine de réplication
CONCEPT À RETENIR
Qu’est-ce que la poidie et comment le nombre de chromosomes varie dans les cellules
cellule germinale = haploide
cellule somatique = diploide
ploidie = nb de réplication d’un jeu de 23 chromosomes dans une cellule
CONCEPT À RETENIR
Quels sont les degrés d’enroulement des chromosomes eucaryotes
hétérochromatine = fortement condensée
euchromatine = bcp moins condensée
CONCEPT À RETENIR
Définition et composition des nucléosomes
unité d’organisation de base de la chromatine
8 histones: 2x H2A H2B H3 et H4
147 pb d’ADN
CONCEPT À RETENIR
Comment la condensation de la chromatine est affectée
complexes de remodelage et modifications chimiques réversibles
CONCEPT À RETENIR
Modification de la chromatine et son effet dans expression des gènes
acétylation d’histones: décondense chromatine = augmente expression de gènes
phosphorylation d’histones: décondense chromatine = augmente expression des gènes
méthylation d’histones: condense ou décondense chromatine = augmente ou répresse l’expression de gènes
méthylation de ADN: condense chromatine = répresse l’expression de gènes
CONCEPT À RETENIR
Épigénétique: définition, causes et effets
changements héritables dans expression de gènes ou phénotypes sans changements dans séquence ADN
marques épigénétiques transmises aux cellules filles
role dans le développement des maladies (cancer) et traits (comportement, vieillissement, longévité)
