Cours 8A: Organisation Du Génome

Question 1

Le génome est l’ensemble…

Answer 1

du matériel génétique d’une espece codé dans son ADN

Question 2

le génome d’une espèce est il toujours codé dans de l’ADN ou peut il être codé dans de l’ARN

Answer 2

chez certains virus il peut effectivement être codé dans de l’ARN

Question 3

le génome contient quoi?

Answer 3

tous les genes codant des protéines ou correspondant à des ARN structuraux ainsi que des séquences sans gène

Question 4

quels sont les 2 types de séquences retrouvées dans le génome ainsi que leur transcription et traduction respective

Answer 4

codantes (transcrites en ARN messagers et traduites en protéines)
non-codantes (non-transcrites ou transcrites en ARN, mais non-traduites)

Question 5

le génome fournit

Answer 5

toutes les infos dont organisme a besoin pour fonctionner

Question 6

dans l’organisme vivant, génome est stocké dans

Answer 6

longues molécules d’ADN nommées chromosomes

Question 7

sections d’ADN codant pour les molécules d’ARN et protéines requises par organisme

Answer 7

gène

Question 8

nb de paires de chromosomes humains

Answer 8

23

Question 9

Human Genome Project

Answer 9

entreprise de recherche internationale durant laquelle les 23 paires de chromosomes humains entièrement séquencées (1990-2003)

Question 10

de nos jours, le séquençage du génome humain prend

Answer 10

48-72 heures

Question 11

définition de gène

Answer 11

séquence d’ADN qui contient toute info pour produire un ARN menant habituellement à une protéine

Question 12

le gène est une région du génome portant une ou des caractéristiques ??? de l’organisme

Answer 12

héréditaires

Question 13

type d’ARN produit par un gène

Answer 13

ARNm (ARN messager)

Question 14

combien de gènes dans le génome humain codent pour des protéines

Answer 14

30 000

Question 15

gene qui sont transcrits en ARN mais dont l’ARN n’est pas traduit en protéine

Answer 15

ARN non-codant

Question 16

vrai ou faux, les ARN non-codants ne sont pas fonctionnels et ne sont donc pas impliqués dans les processus cellulaires

Answer 16

faux

Question 17

définition de locus

Answer 17

place spécifique sur un chromosome (endroit physique caractérisé par des coordonnées)

Question 18

le locus est-il variable ou invariable

Answer 18

invariable (endroit physique)

Question 19

définition de allèle

Answer 19

version donnée d’un gène
allèles du meme gene peuvent varier d’un individu à l’autre

Question 20

les allèles permettent d’expliquer la…

Answer 20

diversité

Question 21

chez un individu, chaque gène possède ? allèle

Answer 21

2 allèles (une version de gène par chromosome)

Question 22

vrai ou faux, tout le monde possède les memes locus mais pas tout le monde possede le meme gene

Answer 22

vrai

Question 23

information génétique des procaryotes est continu ou discontinue

Answer 23

continue

Question 24

information génétique des eucaryotes est continu ou discontinue

Answer 24

discontinue

Question 25

chez les eucaryotes dont l'info génétique est discontinue, que retrouve-t-on sur leurs genes

Answer 25

exons et introns

Question 26

exons

Answer 26

séquences du gène qui codent pour des parties des protéines

Question 27

introns

Answer 27

séquences du gène qui ne codent pas pour les parties des protéines

Question 28

les introns seront éliminés lors de quel processus

Answer 28

épissage

Question 29

que se passe-t-il durant l'épissage

Answer 29

introns sont éliminés des pré-ARNm, les exons sont liés ensemble afin de donner un ARNm mature

Question 30

définition de transcription

Answer 30

synthèse d'ARN à partir d'ADN

Question 31

définition de traduction

Answer 31

synthèse de protéine à partir de ARN messager

Question 32

vrai ou faux, en général les exons sont plus grand que les introns

Answer 32

faux, introns plus grand!

Question 33

que peut tu dire par rapport au chromosome 22

Answer 33

un des plus petits du génome humain composé de 48x10^6 paires de bases 1,5% du génome humain

Question 34

qu'est-ce qu'un spacer

Answer 34

région du génome ne contenant pas de gène

Question 35

vrai ou faux, les mouches ont plus de gènes que les humains, mais les humains en ont plus que les levures

Answer 35

faux, les levures et les mouches en ont plus que les humains

Question 36

les exons forment seulement ?% du génome humain

Answer 36

1,5-2%

Question 37

les gènes forment à peu près ?% du génome humain

Answer 37

10-20%

Question 38

proportions de séquences répétées vs séquence uniques dans le génome humain

Answer 38

50-50

Question 39

les séquences utiles du génome correspondent aux...

Answer 39

gènes

Question 40

séquences intergéniques du génome humain

Answer 40

80-90% séquences inutiles

Question 41

une large proportion des séquences intergéniques sont en réalité des séquences ?

Answer 41

répétées

Question 42

les séquences utiles contiennent info pour produire quoi?

Answer 42

protéines et certains petits ARN (ARN de transfert, ARN ribosomique, etc.)

Question 43

3 catégories de gène et caractéristique respective

Answer 43

Solitaires: 1 copie dans tout le génome Dupliqués/Divergents: dérivent d'un gène ancestral (ex. gènes des globines) Répétés en tandem: dupliqués (répétés) sur un meme chromosome (ex. gène d'histone)

Question 44

la majorité des gènes sont de type

Answer 44

solitaire

Question 45

gènes dupliqués divergents sont présent combien de fois dans le génome

Answer 45

2 ou plus

Question 46

comment pense-t-on que la famille des globines a été générées

Answer 46

par des cycles répétés de duplication et de mutation

Question 47

quel est l'avantage d'avoir plusieurs copies d'un meme gène sur un chromosome

Answer 47

permet de produire plus de protéines

Question 48

types de séquences inutiles

Answer 48

répétées en tandem répétées dispersées

Question 49

options de séquences répétées en tandem

Answer 49

STR: short tandem repeats (2-6 nucléotides) VNTR: variable number of tandem repeats (10-100 nucléotides)

Question 50

les éléments transposables sont associés à quel type de séquences inutiles

Answer 50

séquences répétées dispersée

Question 51

types d'éléments transposables/mobiles

Answer 51

LINE: long interspersed nuclear element SINE: short interspersed nuclear element

Question 52

dans un meme locus, les STR peuvent être répétées cmb de fois une apres l'autre

Answer 52

5-200 fois

Question 53

cmb de di-nucléotides répétés y a t'il dans le génome humain le nombre de tri, tétra et pentanucléotides répétés est-il plus ou moins important

Answer 53

50000-100000 moins important

Question 54

le nombre de fois qu'un STR ou qu'un VNRT est répété est-il variable selon les individus

Answer 54

oui

Question 55

les STR et les VNRT sont utiles en médecine légale pour quelle raison

Answer 55

DNA fingerprinting

Question 56

cmb de fois les VNRT peuvent être répétées dans un meme locus

Answer 56

10-1500

Question 57

un élément transposable peut être composé de combien de paires de bases

Answer 57

qq centaines à plusieurs milliers

Question 58

synonyme d'élément transposable

Answer 58

transposon

Question 59

qu'est-ce qu'un élément transposable

Answer 59

séquence d'ADN capable de se déplacer de manière autonome dans un génome

Question 60

mécanisme permettant aux tranposons de se déplacer dans le génome

Answer 60

transposition

Question 61

vrai ou faux, il existe des transposons qui se déplacent en tant qu'ADN par un processus de recombinaison

Answer 61

vrai

Question 62

qu'est-ce qu'un rétrotransposon

Answer 62

vestiges d'anciens rétrovirus, sont d'abord transcrit en ARN et ARN ensuite converti en ADN qui va s'installer dans un autre locus du génome

Question 63

les éléments transposables sont capables de transporter quoi et dans quel but

Answer 63

transporter des gènes afin de les insérer à de nouveaux endroits dans le génome

Question 64

chez les bactéries, les éléments transposables sont responsables de...

Answer 64

transmission de la résistance à certains antibiotiques

Question 65

vrai ou faux, les éléments transposables sont dispersées à quelques centaines de copies dans génome humain, soit sur meme chromosome ou sur différents chromosomes

Answer 65

faux, plusieurs millers de copies

Question 66

?% du génome est fait d'éléments transposables et les plus abondants sont ...

Answer 66

42 SINE et LINE

Question 67

les éléments transposables sont considérés comme le véritable moteur de...

Answer 67

évolution et biodiversité

Question 68

concrètement les transposons (en mobilisant avec eux des exons ou des gènes d'une partie du génome à une autre) participent à

Answer 68

créer de nouveaux gènes ou à affecter la régulation du gène

Question 69

les séquences LINE font environ ?% du génome

Answer 69

21%

Question 70

SINE le plus répandu

Answer 70

ALU

Question 71

ALU représente ?% du génome avec ces ? copies

Answer 71

11% 1 500 000 copies

Question 72

seul élément encore actif de facon autonome dans le génome humain (sans besoin de protéines encodées par d'autres transposons pour se déplacer)

Answer 72

LINE-1/L1

Question 73

les séquences LINE sont des

Answer 73

rétrotransposons

Question 74

un nombre élevé de copies de L1 ont été observées chez quels types de patients

Answer 74

schizophrènes

Question 75

L1 peut mener à quelle type de pathologie

Answer 75

carcinomes des cellules épithéliales

Question 76

explique le "shift work sleep disorder"

Answer 76

augmentation du risque de cancer car exposition à la lumière réduite si l'on travaille le shift de nuit ce qui réduit les niveaux de mélatonine (hormone qui réduit instabilité génomique liée à L1)

Question 77

les SINE dépendent de quoi pour leur réplication

Answer 77

rétrotransposons LINE

Question 78

les séquences ALU ont jouées un role important dans évolution du génome humain pour quelle raison

Answer 78

associées à plusieurs maladies humaines (cancer colorectal, cancer du sein, cancer du poumon, cancer d'estomac, hémophilie, neurofibromatose, diabète de type II, alzheimer)

Question 79

qu'est-ce qu'un ORF

Answer 79

open reading frame un cadre ouvert de lecture: séquence qui code pour une protéine

Question 80

CONCEPT À RETENIR qu'est-ce qu'une séquence codante et une séquence non-codante

Answer 80

codante: transcrite en ARN et traduite en protéines non-codante: transcrite ou non en ARN et non-traduite en protéines

Question 81

CONCEPT À RETENIR Quels sont les pourcentages de séquences codantes et non-codantes dans le génome humain

Answer 81

codantes "utiles": 10-20% non-codantes "inutiles": 80-90%

Question 82

CONCEPT À RETENIR Quelles sont les différences entre les génomes bactériens et le génome humain

Answer 82

génome bactérien = continu génome humain = discontinu

Question 83

CONCEPT À RETENIR Qu'est-ce qu'un intron et qu'est-ce qu'un exon

Answer 83

intron: séquence du gène qui ne code pas pour des protéines et qui sera éliminé lors de l'épissage exon: séquence du gène qui code pour une protéine

Question 84

CONCEPT À RETENIR Quelles sont les séquences répétées en tandem

Answer 84

STR et VNRT

Question 85

CONCEPT À RETENIR Quelles sont les séquences répétées dispersées

Answer 85

SINE et LINE

Question 86

CONCEPT À RETENIR Qu'est-ce qu'un élément transposable (transposon)

Answer 86

séquence d'ADN capable de se déplacer de manière autonome dans un génome par transposition

Question 87

CONCEPT À RETENIR Quelles sont les conséquences de transposons dans l'évolution et le fonctionnement cellulaire

Answer 87

plusieurs maladies: schizophrénie, carcinomes sur cellules épithéliales, shift work sleep disorder, cancer colorectal, cancer du sein, cancer des poumons, cancer d'estomac, hémophilie, neurofibromatose, diabète type II, alzheimer résistance des bactéries aux antibiotiques