Cours 3: ADN: Structure, Réplication Et Réparation Flashcards
Que signifie ADN
Acide désoxyribonucléique
De manière générale, qu’est-ce que l’ADN
Polymère de désoxynucléotides bicaténaire (double brin) avec une structure de double hélice
Unité de base des acides nucléiques (ARN et ADN)
Nucléotides
Que contient chaque nucléotide
Base azotée
Sucre à 5 carbone (pentose)
1 ou plusieurs groupements phosphate
Comment sont numérotés les carbones du pentose des nucleotides
Voir image dans résumé: à partir du O dans le cycle, commmence à 1 à droite et va dans le sens horaire (5 étant le carbone à l’extérieur du cycle)
Différence entre nucléoside et nucléotide
Nucléoside=base+sucre
Nucléotide=base+sucre+phosphate
Donne la base et le nucléoside associé à l’abréviation A
Adénine
Adénosine
Donne la base et le nucléoside associé à l’abréviation G
Guanine
Guanosine
Donne la base et le nucléoside associé à l’abréviation C
Cytosine
Cytidine
Donne la base et le nucléoside associé à l’abréviation U
Uracil
Uridine
Donne la base et le nucléoside associé à l’abréviation T
Thymine
Thymidine
Que signifie ATP
Adenosine triphosphate
Que signifie ADP
Adenosine diphosphate
Pyrimidine vs purine
Pyrimidine: 1 cycle à 6 atomes qui correspond aux bases azotées T, U et C
Purine: 1 cycle à 5 atomes collés à un cycle à 6 atomes qui correspond aux bases azotées À et G
Bases retrouvées dans ADN
A T G C
Bases retrouvées dans ARN
A U G C
Quel est le sucre présent dans l’ARN et sa particularité
Bêta-D-ribose
Le carbone 2’ possède un OH
Quel est le sucre présent dans l’ADN et sa particularité
Bêta-D-2-deoxyribose
Le carbone 2’ n’a pas de OH seulement un H
Parmi l’ARN et l’ADN, lequel est le plus instable et pourquoi
ARN puisque le C-OH est très réactif et que l’ARN se dégrade donc plus facilement
Vrai ou faux, l’ADN est chargé positivement
Faux, elle est chargée négativement
Qu’est-ce qui confère sa charge négative aux nucléotides? À l’ADN?
Les groupements phosphates rendent le nucléotide négatif
L’ADN est négative à cause des phosphates impliquées dans les liens phosphodiester
Dans les formes les plus communes de nucléotides, combien y a t’il de phosphates et quelle est la nomenclature associée
1,2 ou 3
Mono-, di- ou triphosphate
Qu’est-ce qui lie les nucléotides ensemble dans ADN/ARN
Liens phosphodiester
Où se trouvent les liens phosphodiester
Entre les carbones 5’ et 3’ des sucres
Quelle est la structure de l’ADN
Double hélice
Polarité des brins d’ADN
5’ -> 3’
Caractéristiques des brins d’ADN
Antiparallèles et complémentaires
Quel est l’appariement des bases de l’ADN
A-T et G-C
Quel est l’appariement des bases dans l’ARN
A-U et G-C
De quoi est composé le squelette de l’ADN
Sucres et phosphates
Différence entre l’appariement des bases A-T et des bases G-C
A-T a 2 ponts H
G-C a 3 ponts H
Quelle paire de base de l’ADN est plus forte
G-C puisqu’elle possède 3 ponts H (vs 2 pour A-T)
Pourquoi dit-on que l’ADN est hétérogène
Parce que certaines zones sont plus stables que d’autres puisqu’elles contiennent plus de bases G-C
Décrit la double hélice d’ADN
Bases à l’intérieur et sucres+phosphates à l’extérieur
Présence de sillons mineurs et majeurs
Combien y a t’il de bases dans le génome haploïde humain
Comment cela se compare à la taille d’un noyau
3 x 10^9 paires de bases => 1-3 mètres
Noyau = 10 um (micromètre)
Quelle est la charge des protéines qui se lient à l’ADN? Sont elles basiques ou acides?
Positive (puisque l’ADN est négatif) et basiques
1 tour d’hélice est équivalent à ? Paires de nucleotides
10
Comment peut-on dénaturer de l’ADN
Par changement de pH ou avec de la chaleur puisque cela permet de rompre les ponts H qui unissent les 2 brins d’ADN
CONCEPT À RETENIR
Quelles sont les bases qui composent l’ADN et les bases qui composent l’ARN?
ADN: ATGC
ARN: AUGC
CONCEPT À RETENIR
Quels sont les appariements de bases dans l’ADN et dans l’ARN?
ADN: A-T et G-C
ARN: A-U et G-C
CONCEPT À RETENIR
Quels sont les sucres dans l’ADN et dans l’ARN?
ADN: bêta-D-2-deoxyribose
ARN: bêta-D-ribose
CONCEPT À RETENIR
Qu’est-ce qu’un lien phosphodiester?
Lien qui unissent les nucleotides dans les acides nucléiques
Entre les carbones 5’ et 3’ des sucres des nucleotides
O—P—O
CONCEPT À RETENIR
Qu’est-ce que la polarité des brins de l’ADN
5’ —> 3’
C’est le sens de la synthèse de l’ADN donc on ajoute des nucleotides à l’extrémité 3’
CONCEPT À RETENIR
Comment les brins d’ADN sont orientés dans la double hélice
antiparallèles et complémentaires
CONCEPT À RETENIR
Combien de paires de bases par tour d’hélice
10
Caractéristique primordiale de la réplication d’ADN
Réplication semi-conservative donc ADN est doublée
La réplication de l’ADN se passe pendant…
Interphase (phase S)
Chaque ADN fille est composé de 2 brins: un ? Et un ?
Brin vieux
Brin nouveau
Éléments des chromosomes importants à la réplication (3)
Origines de réplications multiples
Centromere qui s’attache au fuseau mitotique
Télomères requis pour préserver intégrité des extrémités des chromosomes
Ou débute la réplication
Aux origines de réplication
La synthèse d’ADN est unidirectionnel, vrai ou faux
Faux, elle est bidirectionnelle
A chaque origine de réplication, ??? Sont formées
2 fourches de réplication
Que font les fourches de réplication durant la réplication de l’ADN
Elles s’éloignent dans des directions opposées à partir de multiples origines de réplication
ADN est ouvert par…
Protéines d’initiation
Qu’est-ce qui sert de matrice dans la réplication de l’ADN
ADN simple brin
Entre les 2 fourches de réplication, ??? Se forme
Une bulle de réplication
Qu’est-ce qu’une origine de réplication
Région riche en appariement A-T (- stable, 2 ponts H)
Vrai ou faux, chaque chromosome ne contient qu’une seule origine de réplication
Faux, chaque chromosome en contient plusieurs
Près de 10000 origines sur 46 chromosomes
Quelles sont les étapes du début de la réplication de l’ADN (4)
1- origine reconnue par des protéines d’initiation qui ouvrent l’hélice en séparant les brins
2- liaison de l’hélicase (brise les ponts H et dézipe ADN)
3- liaison de la primase (fait de petites amorces en ARN)
4- formation du complexe primase-helicase