Cours 7: Modifications post transcriptionnelles Flashcards
Modification des transcrits arn
- fait pour qu’ils puissent jouer leur rôle
- on lieu pendant ou après la transcription
Modification chez procaryotes
- ARNm: peu de modification, traduction cotranscriptionelle
- ARNt: clivage extrémités, modifications des bases
- ARNr: clivage précurseur, modification des bases
Modification chez eucaryotes
- doivent être exportés
- ARNm: coiffe en 5’, queue polyA en 3’, épissage des exons
- ARNt: clivage extrémités, modification des bases
- ARNr: clivage précurseur, modification des bases
Elongation et préparation des arn pour modifications
Effectué par Queue C-terminale de ARN pol
- phosphorylation de sérine 5 par TFIIH
- recrutement enzyme de coiffe
- phosphorylation de sérine 2 par P-TEFb
- recrutement complexe d’épissage+facteurs de terminaisons
Modification des extrémités des ARN
- ajout coiffe en 5’
- clive extrémité 3’ et ajour queue polyA
- élimination introns + épissage exons
Ajout coiffe
- ajouté lorsque arnm atteint 25 nicléotides
- réaction catalysée par enzyme de coiffe associé au domaine CTD phosphorilé de la queue c-terminale
- phosphatase retire premier phosphate du premier nucléotide
- guanyl-transférase ajoute GMP en liaison inverse
- méthyl transférase ajoute CH3 sur GMP
Clivage et queue poly A
- recrutement de CPSF par séquence AAUAAA
- recrutement CStF par séquence riche en G/U ou U
- CPSF réagit avec CStF et courbe le transcrit
- CFI et CFII arrive et stabilisent le complexe
- enzyme PAP arrive et stimule clivage 10 à 35 nucléotides avant site poly A
- PAP ajoute 10 adénine à 3’
- queue poly A recrute PAB II qui stimule réaction queue poly A par PAP
- queue poly A atteint 200-250 adénines
Dégradation
- enzyme enlève coiffe
- arnm exposés à exonucléases sont dégradés
Épissage des exons
- 30-40 nucléotides sont nécessaires aux extrémités de chaque intron pour épissage
- attaque lien phosphodiester entre exons et introns (formation structure lasso)
- snRNP s’associent à ARNm pour monter complexe épissage
u1: site épissage 5’ intron
u2: site de branchement
u6: 5’ intron et u2
u5: exons à épisser
Assemblage du complexe d’épissage
- u1 se lie à liaison intron exon à intron 5’
- u2af65 se lie à la série de pyrimidines
- u2af35 se lie à intron 3’
- BBP se lie au site de branchement puis est délogé par u2
- triparticule u4-u5-u6 arrive et reconfigure complexe
- 5’ intron et site de branchement sont réunis
- u1 quitte
- u6 se lie à exon1 3’
- u4 quitte
- u6 se lie à u2
- intron libéré et exons soudés
Reconnaissance jonctions intron/exons
définies et délimitées par protéines SR (intéraction inter-protéiques sur tout les exons)
ARNm mature et régions non codantes
- régions UTR 5’ et 3’
- peuvent être régulatrices
- délimitées par codon initiateur et codon stop
Épissage alternatif
normal: 1-2-3
skipped:1-3
étendu: 1-morceau intron 1-2-3
retenu: 1-intron 1-2-3
alternatif: 1-2 + 1-3
Arrangement des exons selon différents patrons
Progéria de Hutchinson-Gilford (HGPS)
- très rare
- vieillissement accéléré
- substitution sur gène Lmna codant pour lamines A et C
- 2 types de mutation:
GGC(Gly) pour GGt(Gly)
GGC(Gly) pour AGC(Ser) - rapproche séquence de 1 vers séquence site épissage
- épissage alternatif à plus de chance de survenir et retirer 150nt (50aa)
Édition des ARNm
modification des bases par désamination
- cytidine désaminase C en U
- ADAR (adenosine desaminase acting on rna) A en I
- Inosine peut s’appareiller à C, change interprétation
Répresseurs/Activateurs
répresseur: empêche épissage exon
activateur: stimule épissage exon
Maturation des ARNr et ARNt
cellule en croissance: 80% ARNr et 15% ARNt
ARNr E coli
- codés par 7 opérons rrnA à G
- précurseur 30s contien 3ARN
- clivé par RNase III
ARNr Eucaryotes
- inclus dans un pré ARNr: 45S transcrit par pol I
- contient 18S, 5.8S et 28S
- importantes réactions chimiques de méthylation, d’isomérisation d’uridine en pseudouridine à des positions précises pour la maturation
ARNsno
- servent de guide pour les réaction de méthylation est d’isomérisation
- intron excisés d’autres gènes de protéines ribosomales
ARNt
- 75-80 nucléotides
- matures par clivage du bout 5’ par RNase P
- 10% sont édités:
U en 3’ -> CAA
méthylation en carbone 2’
conversiont des U spécifiques en pseudouridine ou dihydrouridine
