Cours 4: Réparation et transport Flashcards
Mutations
Causes principales:
- Transposons
- Agents mutagènes
- Erreurs de réplication
2 types:
- Mutations ponctuelles: erreur de réplication, altération de bases (hydrolyse)
- Mutations profondes: Insertion, duplication, délétion, réorganisation chromosomique
Mutation ponctuelle
Transition:
Pyrimidine pour une pyrimidine: T pour C
Purine pour un purine: A pour G
Transversion:
Pyrimidine pour une purine: T pour A ou G
Purine pour une pyrimidine: G pour T ou C
Mutation profonde
Cause:
Transpositions ou recombinaisons aberrantes et microsatellites(motif de 2 à 10 bp hautement répété)
Tautomères
2nd forme d’un nucléotide
différence entre les liens H donneur/receveur
Réparation des mésapariements
Double défi:
- Identifier le site
- Savoir lequel des 2 brins porte l’erreur
Activité exonucléase
- se situe sur ADN polymérase
- instabilité due au mésappariement expose la base au site exonucléase qui clive le lien et retire la base
Activité du MutS
-Glisse sur l’ADN et se fixe sur un mésappariement jusqu’à la réparation (Mésappariement est plus facile à plier)
- MutL est recruté par MutS quand il reconnait une erreur
- MutL active MutH qui clive le brin jusqu’à l’erreur
- Exonucléase élimine les nucléotides du brin
- Rebouché par ADN polymérase 3
- Liaisons crées par ADN ligase
Activité du MutH
- se fixe sur la séquence GATC non méthylée
- ajoute un méthyle sur les A
- le plus proche de MutS s’active et clive le brin
Coupure en 5’
- Exo 7 ou Recj dégrade le brin du MutH jusqu’à l’erreur
- Réparé par ADN polymérase et ligase
Coupure en 3’
- Exo 1 dégrade le brin du MutH jusqu’à l’erreur
- Réparé par ADN polymérase et ligase
Équivalent chez les eucaryotes
- MutS et Mutl -> MSH et MLH
- MutH n’existe pas
- exonucléases utiliserait les césures temporaires des fragments d’okasaki ou le bout 3’ du brin avancé
Altérations des bases
- désamination
- altérations hydrolytiques (base apurique)
- Alkylation
- Oxydation
- Rayons UV (dimère)
Peut être réparé par des enzymes
- UV -> Photoréactivation effectuée par ADN photolyase
- Alkylation -> Méthyltranférase
Système de réparation des bases altérées
Par excision des bases
- base altérée reconnue enlevée par Glycosylase
Par excision des nucléotides
- erreur reconnue
- nucléotides entourant l’erreur sont enlevés avec l’erreur
Excision des bases
- Glycosylase glisse sur l’ADN
- Base altérée pivote hors du brin
- Lien glycosidique est coupé
- Nucléotide apurique (sans base) est enlevé par Endonucléase AP
- Réparé par ADN polymérase et ligase
Excision des nucléotides
- reconnaît les déformations de l’hélice
- complexe UvrA UvrB parcourt ADN
- UvrA quitte le complexe quand erreur détectée
- UvrB sépare les 2 brins et UvrC est recruté
- UvrC clive autour de l’erreur
- UvrD libère le fragment
- ADN pol 1 et ligase réparent
Réparation par recombinaison
- Réparé avec chromosome homologue ou non
homologue - lésion non réparables comblé avec ADN pol Famille Y (synthèse translésionnelle) et réparé au prochain cycle
Transposons
3 types
- Transposons ADN (répétions directes et indirectes)
- Transposons viraux avec LTR (présence LTR)
- Transposons non viraux (répétitions directes seulement)