Cours 7 - Krebs Flashcards
Vrai ou faux ? Il est possible de commencer le cycle de Krebs à n’importe quel endroit du cycle
Vrai, on peut penser à un rond-point
À quel endroit se produit le cycle de Krebs ?
Dans la mitochondrie
Quel est l’un des synonymes courants du cycle de Krebs ?
Le cycle de l’acide citrique
Définition voie amphibolique
Certains métabolites peuvent être utilisés dans des réactions anaboliques et d’autres pour des réactions cataboliques
Pourquoi y a-t-il deux types de transport pour faire entrer le pyruvate dans la mitochondrie ?
Parce que la mitochondrie possède deux membranes
Jusqu’à quelle couche le pyruvate peut-il se rendre sans avoir besoin de transport actif ?
Jusque dans l’espace intermembranaire
Comment se nomme la section interne (une fois passé les deux membranes) d’une mitochondrie ?
La matrice
Quel est le transporteur qui permet de faire passer le pyruvate de l’espace intermembranaire à la matrice mitochondriale (donc passer la membrane interne) ?
Le MCP 1-2
À quoi servent les crêtes d’une mitochondrie ?
Augmenter la surface de contact (et donc les échanges), un peu à la manière des microvillosités
Quelle partie de la mitochondrie contient les complexes de la chaîne respiratoire ?
La membrane interne
Quelles sont les trois principales fonctions de la mitochondrie ?
- Production d’énergie (Power house of the cell)
- Réactions d’oxydation cellulaire
- Production de protéines (transcription, code génétique)
Expliquer brièvement la théorie du symbiote
Les mitochondries seraient l’issue de l’ingestion de bactéries par des cellules Eucaryotes
Qu’aurait permis l’apport mitochondrial selon la théorie du symbiote ?
Aurait contribué à faire passer la cellule d’une physiologie anaérobie à une physiologie aérobie
Pourquoi l’ATP mitochondrial provient uniquement de la mère ?
Parce que les mitochondries du père sont situées sur les flagelles des spermatozoides et n’entrent donc pas dans l’ovule une fois fécondé.
Quelles sont les principales différences entre l’ADN mitochondrial et l’ADN du noyau (nucléaire) ?
-ADN circulaire
-Distribution plus serrée des gènes
-Utilisation des codons plus simples (nécessitent moins d’ARNm)
-Code génétique différent de l’ADN nucléaire
Qui suis-je ? Je suis une réaction qui ne fait pas partie du cycle de Krebs, mais je suis pourtant essentielle à ce dernier (indice : je commence avec du pyruvate)
La formation d’acétyl-CoA à partir du pyruvate
Quelle enzyme catalyse la formation d’acétyl-CoA à partir du pyruvate ?
Le complexe pyruvate déshydrogénase (il s’agit d’un complexe enzymatique, et non d’une seule enzyme)
Quel est le bilan de la formation d’actétyl-CoA à partir du pyruvate ?
Réactifs : pyruvate + CoA + NAD+
Produits : Acétyl-CoA + CO2 + NADH + H+
Qui suis-je ? Je suis à la fois l’un des premiers substrats du cycle de Krebs et l’un des derniers produits
L’oxaloacétate
Quel type de réaction est la condensation de l’actétyl-CoA et de l’oxaloacétate ?
Une réaction séquentielle ordonnée
Quel est le produit de la condensation de l’acétyl-CoA et de l’oxaloacétate ?
Le citrate
Par quoi est inhibée la citrate synthase ?
Son propre produit, le citrate
Quelle est la deuxième réaction du cycle de Krebs ?
L’isomérisation du citrate en isocitrate
Quelle est l’étape clé du cycle de Krebs, l’étape limitante ?
La troisième étape, soit l’oxydation et la décarboxylation de l’isocitrate
Quelle est l’enzyme impliquée dans l’oxydation et la décarboxylation de l’isocitrate ?
L’isocitrate déshydrogénase
Quelles molécules causent une activation allostérique de l’isocitrate déshydrogénase ?
L’ADP et le Ca2+
Quelles molécules causent une inhibition allostérique de l’isocitrate déshydrogénase ?
ATP et NADH (molécules à haut niveau énergétique)
Quelle est la quatrième réaction du cycle de Krebs ?
La décarboxylation oxydative du alpha-cétoglutarate
Quel est le produit de l’oxydation et de la décarboxylation de l’isocitrate ?
L’alpha-cétoglutarate
Par quel complexe enzymatique est catalysée la décarboxylation oxydative du alpha-cétoglutarate ?
Le complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase (3 enzymes)
Pourquoi l’ion calcium est-il souvent un activateur d’enzymes ?
Parce que c’est l’un des ions qui sera libéré lors de la contraction musculaire, ce qui montre une consommation d’énergie et la nécessité d’en reproduire
Quels sont les inhibiteurs de la décarboxylation oxydative du alpha-cétaglutarate ? Quels sont les activateurs ?
Inhibiteurs : NADH et succinyl-CoA
Activateur : Ca2+
Quelle est la cinquième étape du cycle de Krebs ?
Le clivage du succinyl-CoA
Quelle enzyme catalyse le clivage du succinyl-CoA ?
Succinyl-CoA synthétase
Quel type de lien est clivé lors du clivage du succinyl-CoA ?
Un lien thioesther
À quelle réaction est couplé le clivage du succinyl-CoA ?
La phosphorylation d’un GDP pour former un GTP
Quel est le produit du clivage du succinyl-CoA ?
Le succinate
Quelle est la sixième étape du cycle de Krebs ?
L’oxydation du succinate
Quelle enzyme catalyse l’oxydation du succinate ?
La succinate déshydrogénase
Qui suis-je ? Je suis la seule enzyme du cycle de Krebs qui est intégrée à la membrane interne de la mitochondrie
La succinate déshydrogénase
Quelle est la septième réaction du cycle de Krebs, quel est son produit ?
Réaction : Hydratation du fumarate
Produit : L-Malate
Quelle est la huitième réaction du cycle de Krebs ? Quel est son produit ?
Réaction : Oxydation du malate
Produit : Oxaloacétate
Combien de molécules d’ATP sont formées par un seul glucose avec le cycle de Krebs ?
24 ATP
Combien d’ATP sont équivalents à une molécule de NADH ?
3 ATP
Combien d’ATP sont équivalents à une molécule de FADH2 ?
2 ATP
Pour empêcher les accumulations d’Acétyl-CoA dans la matrice mitochondriale, quelle enzyme est en jeu ?
La pyruvate déshydrogénase
Quels sont les deux types d’enzymes qui sont contenues dans le complexe de la pyruvate déshydrogénase ?
-Kinase
-Phosphatase
Quelles molécules vont inhiber l’action du complexe de la pyruvate déshydorégnase ?
Le NADH et l’acétyl-CoA
Quelles substances vont activer/inhiber la citrate synthase ?
Activer : Oxaloacétate
Inhiber : Citrate
Quelles substances vont activer l’isocitrate déshydrogénase ?
ADP et l’ion Ca2+
Par quelles molécules est activé/inhibé le complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase ?
Activé : ion Ca2+
Inhibé : NADH et Succinyl-CoA
Définition voie cataplérotique
Voie métabolique extérieure du cycle de l’acide citrique qui utilise ses intermédiaires métaboliques
Définition voie anaplérotique
Voie métabolique qui fournit des intermédiaires au cycle de l’acide citrique
Exemples de RXN cataplérotiques
Synthèse de glucose, synthèse d’acides gras, synthèse d’acides aminés
Exemples de réactions anaplérotiques
Oxydation des acides gras, dégradation des acides aminés, transamination de certains AA
Vrai ou faux ? Le cycle de l’acide citrique est la voie oxydative pour tous les métabolites avec un potentiel énergétique (glucides, acides gras, acides aminés)
Vrai
Vrai ou faux ? la majorité des protéines se trouvant dans la mitochondrie sont issues de l’ADN mitochondrial
Faux
Vrai ou faux ? L’ADN mitochondrial est circulaire
Vrai
Vrai ou faux ? La conversion du pyruvate en acétyl-CoA a lieu dans le cytosol
Faux
Vrai ou faux ? La formation d’acétyl-CoA à partir du pyruvate ne fait pas partie du cycle
Vrai
Vrai ou faux ? La réaction clé du cycle de l’acide citrique est catalysée par l’isocitrate déshydrogénase
Vrai
Vrai ou faux ? Les points de contrôle du cycle font intervenir 3 enzymes : la citrate synthase, l’isocitrate déshydrogénase et le complexe alpha céto-glutarate
Vrai
Vrai ou faux ? Les points de contrôle du cycle font intervenir l’ATP, l’AMP, l’ADP, l’acétyl-CoA, le citrate, le succinyl-CoA, le CoA-SH, le NADH, le NAD+ et le Ca2+
Vrai
Vrai ou faux ? Le cycle de l’acide citrique est finement régulé par les besoins en ATP de l’organisme
Vrai
Vrai ou faux ? Le cycle de l’acide citrique est une voie amphibolique
Vrai
Vrai ou faux ? Les voies cataplérotiques sont les voies à l’extérieur du cycle de l’acide citrique qui fournissent des intermédiaires métaboliques
Faux