Cours 7 Flashcards
Nomme les 3 alternatives thérapeutiques remplaçant les antibiotiques
- Les bactériophages thérapeutiques (phagothérapie)
- La vaccination
- Les probiotiques et la bactériothérapie
Comment on nomme une bactérie infecté par un virus
bactériophages
Nomme la plus grande similitude entre un phage et un virus
La structure des phages partage de nombreuses similitudes avec les virus infectant les eucaryotes.
Le matériel génétique peut être de l’ADN simple ou double brin, de l’ARN simple ou double brin, et
est enfermé dans une capside protéique de forme icosaédrique, allongée, tubulaire, ou sphérique
selon le phage.
De quoi est composé 95% des phages
Plus de 95% des phages connus et caractérisés à ce jour font partie des phages à ADN double brin,
possédant une queue. Certains phages possèdent une membrane lipidique entourant la capside
protéine
C’est quoi le rôle du fait que les phages soient décorés
Les capsides et queues des phages peuvent aussi être « décorées » de spicules et fibres dont la
fonction n’est pas toujours établie, mais qui joueraient un rôle dans la reconnaissance de la cellule
cible et qui pourraient influencer la reconnaissance par le système immunitaire lorsque présents
dans un organisme supérieur
C’est quoi la nouvelle catégorie de phage étudiée
les « jumbo phages » qui ont un
génome plus gros (autour de 200 kb) et une capside plus large (100-160 nm de diamètre) et une
queue plus longue (près de 500 nm).
Où se trouvent les «megaphages»
Or, il semble que l’intestin regorge de phages plus gros encore, les « megaphages », dont le génome
peut dépasser >540 kb. Or ces phages ont été identifiés par des méthodes génomiques et aucune
particule virale n’a été observée au microscope, mais on peut supposer que la taille de leur capside
est plus grande encore que celle des phages jumbo.
Décrit c’est quoi la spécificité de l’hôte
La spécificité d’hôte (host range) d’un phage désigne les cellules susceptibles d’être infectées par
ce phage. La plupart des phages n’infectent qu’une seule espèce de bactéries, et souvent que
certaines souches spécifiques au sein d’une même espèce, mais quelques phages peuvent infecter
plus d’une espèce bactérienne et même plus d’un genre (ex : phages infectant Escherichia, Shigella
et Salmonella).
Ce sont quoi les 3 facteurs qui permettent La capacité d’un phage à infecter une bactérie hôte
des récepteurs à la
surface de la cellule pour l’adsorption (ou l’attachement) du virus,
des facteurs intracellulaires
nécessaires pour la multiplication virale,
et la capacité d’éviter les défenses de l’hôte, comme les
enzymes de restriction et les systèmes CRISPR.
Nommes les étapes de multiplication d’un phage
1.adsorption (sur les récepteurs à la surface de la bactérie),
2.injection de l’ADN,
3.transcription,
4.réplication de
l’ADN,
5. synthèse des protéines structurales,
6.assemblage de la capside et de la queue (le cas
échéant),
7.maturation,
8.et libération des virions.
Décrire l’assemblage de la capside
commence par la liaison des protéines de la capside entres elles pour
former des capsomères,
puis les capsomères s’associent ensuite en capside vide, sans acide
nucléique. Cette capside vide a une structure plus grande que celle du virus mature, ce qui permet
à l’acide nucléique d’entrer grâce à certaines enzymes virales comme les terminases.
Quand l’acide
nucléique est inséré, la maturation s’accomplit par le clivage de certaines protéines de la capside,
ce qui ferme la capside de façon étanche et protège l’acide nucléique viral des nucléases présentes
dans l’espace extracellulaire.
Explique ce que sont des phages de type lytiques
qu’ils s’échappent de leur bactérie hôte
en faisant éclater la cellule (par lyse), suite à l’action d’enzyme qui dégradent la paroi de
peptidoglycane (les endolysines, on y reviendra). Les phages dit virulents ne se propagent que par
ce mécanisme et c’est la raison pour laquelle ils sont utilisés en phagothérapie depuis 100 ans dans
certains pays de l’Europe de l’Est pour traiter toutes sortes d’infections bactériennes.
Explique ce qu’est une infection chronique
Certains phages filamenteux peuvent s’échapper en bourgeonnant de la cellule sans la faire lyser ;
on parle alors d’infection chronique.
Explique la technique du «phage display»
consiste à exprimer à l’extrémité du phage des protéines recombinantes. L’interaction entre ces protéines recombinantes et d’autres protéines ou molécules peut ensuite être étudiée plus facilement.
Qu’est ce qu’un phage tempéré (phase lysogénique)
Ceux-ci ont la capacité de se propager via le cycle lytique
la majorité du temps, mais peuvent aussi s’intégrer dans l’ADN de leur bactérie hôte et demeurer
ainsi sous forme de prophage pendant de longues périodes. Cette phase correspond à la phase
lysogénique.
Qu’est ce que la conversion lysogénique
On parle
de conversion lysogénique lorsqu’un phage convertit une souche avirulente/non-toxinogène en
une souche virulente/toxinogène après lui avoir transmis un gène encodant une toxine ou un
facteur de virulence. Lorsque ces phages se cachent sous forme de prophage dans l’ADN de leur
cellule hôte, ces gènes de virulence sont exprimés (mais pas les gènes du cycle lytique des phages),
rendant ainsi la cellule hôte plus virulente et pathogène.
Quel type de phage doit être absolument utilisé en phagothérapie et pk?
Il est important de se rappeler qu’étant donné le risque de conversion lysogénique avec les phages
tempérés, des phages strictement lytiques (virulents) doivent absolument être utilisés en
phagothérapie.
Qu’est ce que le virobiote?
l’intestin regorge de virus (infectant les
cellules de mammifères ou végétales), mais surtout des phages (environ 90%). On nomme
l’ensemble de ces virus le virobiote
(PAS JUSTE DANS L’INTESTIN)
Quel phénomène peut on voir dans la réactivation d’un phage du à un stress
Suite à divers stress affectant la bactérie lysogène, les prophages peuvent s’induire,
s’exciser, initier un nouveau cycle lytique afin de se répliquer et ultimement quitter la bactérie par
lyse cellulaire. Pendant cette phase de réactivation, certains phages peuvent emporter de l’ADN
provenant de l’hôte, menant ainsi au phénomène de transduction (spécialisée ou généralisée) que
l’on a étudié précédemment.
Que mesure la courbe unicycle de réplication virale
Il est à noter que l’entité infectieuse du virus disparaît dans les premiers moments suivant
l’infection, lors de la pénétration (phase d’éclipse). Elle réapparaît lorsque le virus est assemblé ou
libéré. Puisqu’une seule cellule infectée peut libérer des dizaines, centaines, voire des milliers de
nouveaux virions, le nombre de particules augmente de façon marquée à chaque fin de chaque
cycle. En anglais, ce phénomène s’appelle “ one-step growth curve ” ou courbe unicycle de
réplication virale (figure ci-dessous). Le temps d’un cycle viral varie d’un virus à l’autre mais est
similaire aux temps de doublement des bactéries, i.e. aussi peu que 20 minutes, jusqu’à quelques
heures selon le cas.
Qu’est ce que la phagothérapie
La phagothérapie utilise les phages lytiques pour traiter ou prévenir des infections bactériennes.
Vrai ou faux: la phagothérapie est autorisé dans les pays occidentaux
Faux
L’utilisation de phage est accepté chez:
chez les animaux
d’élevage, en agriculture, et même sur des carcasses de viande dans les usines de transformation des produits de la viande et des produits prêts à la consommation.
Comment peut on administrer des phages?
soit par voie orale, intraveineuse,
intrapéritonéale, par nébulisation (aérosolisation), ou de façon topique (traitement des plaies).
