Cours 6 : TCR Flashcards

1
Q

Qu’est ce que la sélection clonale

A

Le fait de faire répondre une cellule avec un récepteur spécifique à l’antigène (clone spécifique à l’Ag)

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Q

Vrai ou faux : les polynucléaires neutrophiles reconnaissent les DAMP et les PAMP via leur PRR pour la phagocytose

A

Vrai

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3
Q

À quel lymphocyte T le CMH1 est-il présenté? Et le CMH2?

A

1 : CD8
2: CD4

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4
Q

Est ce que les lymphocytes T peuvent lier les virus ou les antigènes de virus sous leur forme natives

A

Non, ils doivent être liés et présentés par un CMH1-2

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Q

Vrai ou faux : le TCR reconnait seulement les antigènes viraux liés CMH

A

Faux, ils peuvent aussi reconnaitre les antigènes du soi

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6
Q

Quels sont les 2 modèles proposés pour la reconnaissance des antigènes par les lymphocytes T

A
  1. Deux récepteurs séparés : un qui reconnait le CMH et l’autre qui reconnait l’Ag
  2. Un seul récepteur : reconnait l’Ag complexé à une molécule du CMH
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7
Q

Quelle expérience permet de démontrer que la reconnaissance des Ag par le TCR n’est fait que par 1 seul récepteur

A
  1. fusion de 2 clones T spécifique différentes : 1 clone spécifique à OVA avec CMH2-IAk et 1 clone spécifique KLH avec CMH2-IAf
  2. La cellule modifié ne reconnait que L’OVA sur une CPA porteuse du CMH2-IAk et KLH sur une CPA porteuse du CMH2-IAf
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8
Q

Quelles sont les difficultés rencontrées par rapport à l’identification du TCR

A
  1. Les cellules T devraient posséder un récepteur antigène spécifique et clonotypique
  2. Récepteur membranaire (pas de forme soluble)
  3. Interaction plus faible avec l’Ag que les Ac
  4. Spécifique pour l’Ag et le CMH
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9
Q

Comment faire pour identifier/isoler le TCR

A

Production d’Ac qui reconnaissent un type spécifique de TCR et utiliser ces Ac pour caractériser biochimiquement le TCR

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10
Q

Comment générer plusieurs cellules T spécifiques pour un Ag donné (avoir une grande population de ce clone)

A
  1. Immunisation de souris avec un Ag (ex : OVA) afin de faire proliférer les cellules T réactives spécifiques envers l’Ag OVA
  2. Récolte des ganglions lymphatiques 7 jours plus tard
  3. Expansion des cellules T spécifiques à l’Ag OVA in vitro en cultivant les cellules des ganglions lymphatiques avec l’Ag
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11
Q

Quelles sont les étapes de la création d’un hybridome T spécifique à un Ag donné

A
  1. Fusion des cellules T spécifique à l’Ag OVA avec une lignée de cellules T cancéreuses
  2. Clonage par dilution limite afin d’avoir un hybridome T qui possède une séquence unique de TCR reconnaissant l’Ag OVA
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12
Q

Quelles cytokines seront produites lors de la réponse d’un hybridome à son Ag spécifique

A

IL-2

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13
Q

Comment obtenir des Ac qui vont se fixer aux hybridomes T spécifiques

A
  1. On utilise l’hybridome T comme source d’Ag pour obtenir des Ac monoclonaux dirigés contre le TCR
  2. Quelques jours après l’immunisation, on prélève la rate
  3. Fusion des lymphocytes B de la rate avec des cellules B cancéreuses
  4. Clonage par dilution afin d’obtenir des Ac monoclonaux qui reconnaissent l’hybridome T utilisé lors de l’immunisation
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14
Q

Comment identifie-t-on l’ac qui lie un TCR spécifique

A

Si l’ajout de l’Ac inhibe la reconnaissance antigénique (pas de production d’IL-2), cet Ac est spécifique au TCR

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15
Q

Quelles est la structure du TCR

A

1 chaine Alpha
1 chaine Bêta
1 passage transmembranaire positif/chaine
1 queue cytoplasmique/chaine

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16
Q

Vrai ou faux : le TCR fait partie de la superfamille des immunoglobulines

A

Vrai

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17
Q

Combien de domaines possède chaque chaine du TCR et quels sont-ils

A

2 domaines contenant un pont disulfure
V : domaine variable
C : domaine constant

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18
Q

Comment créer une grande diversité de TCR afin d’assurer une réponse envers tous les Ag possibles

A

Grâce à la recombinaison de segments de gènes (Alpha : V et J, Bêta :V, J et D)

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19
Q

Qu’est ce que les SSR

A

Séquences signal de recombinaison qui dictent quels segments peuvent être réarrangés

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20
Q

De quoi sont constitués les séquences SSR

A
  1. Heptamère et nonamère dont la séquence nucléotidique est conservée dans tous les SSR
  2. D’un spacer de 12 ou 23 paires de bases
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21
Q

Vrai ou faux : lors du réarrangement, on associe toujours un SSR ayant un spacer de 12 pb avec SSR ayant aussi un spacer de 12 pb

A

Faux, on associe un SSR ayant un spacer de 12 pb avec un SSR ayant un spacer de 23 pb

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22
Q

Quel est le rôle de Rag1/2

A

Spécifiques aux lymphocytes et assure la recombinaison des séquences V, J et D : cassure du double brin d’ADN

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23
Q

Quel est le rôle de TdT

A

Spécifique aux lymphocytes : ajoute des nucléotides à la jonction des gènes V, D et J du TCR

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24
Q

Quel est le rôle d’Artémis

A

Ouverture des extrémités codantes et des boucles en épingle lors de la recombinaison V, D et J du TCR

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25
Q

Rôle Ligase IV

A

Joint les 2 bouts d’ADN (soudure) lors de la recombinaison V, D et J du TCR

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26
Q

Quelle sont les grandes étapes du mécanisme de recombinaison du TCR

A
  1. Formation d’une synapse
  2. Clivage
  3. Trans-estérification
  4. Ouverture de l’épingle à cheveu par Artémis
  5. Aujout des P nucléotides
  6. Action des exonucléases
  7. Ajout de N-nucléotides par Tdt
  8. Ligation
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27
Q

Que se passe-t-il lors de la formation d’une synapse dans la recombinaison du TCR

A

1.Rag1/2 se lient au RSS = initiation
2. Rag1/2 catalysent la formation de la synapse entre le segment de gène V et J = rapprochement des 2 segments
3. Protéines HMG aide le repliement de l’ADN afin de rapprocher les segments de gènes

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28
Q

Que se passe-t-il lors du clivage dans la recombinaison du TCR

A

Rag1/2 introduisent une cassure simple dans 1 des brins d’ADN en 5’ de l’heptamère du SSR des segments V et J

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29
Q

Que se passe-t-il lors de la trans-estérification dans la recombinaison du TCR

A
  1. Groupement 3’OH généré par le clivage de Rag1/2 attaque le groupement phosphate de l’autre brin d’ADN
  2. Création une extrémité en épingle au niveau de l’extrémité codante et une extrémité franche au niveau du bout signal
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30
Q

Que se passe-t-il avec l’extrémité franche de la jonction signal (recombinaison TCR)

A

Liguée pour former un cercle de recombinaison qui sera éventuellement perdu

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31
Q

Que se passe-t-il lors de l’ouverture de l’épingle à cheveu par Artémis dans la recombinaison du TCR

A

L’ouverture peut avoir lieu à divers endroit dans l’épingle à cheveu : selon l’endroit de l’ouverture, cela créera différentes extrémités

32
Q

Que se passe-t-il lors de l’ajout des P-nucléotides dans la recombinaison du TCR

A

Les extrémités cohésives sont remplies par une polymérase en utilisant l’information du brin complémentaire

33
Q

Que se passe-t-il lors de l’action des exonucléases dans la recombinaison du TCR

A

À l’occasion, avant que les extrémités soient remplies par la polymérase, il arrive que des exonucléases enlèvent des nucléotides

34
Q

Que se passe-t-il lors de l’ajout de N-nucléotides par Tdt dans la recombinaison du TCR

A

Ajout de nucléotide de façon aléatoire et indépendante de la matrice d’ADN par l’enzyme Tdt

35
Q

Que se passe-t-il lors de la ligation dans la recombinaison du TCR

A

Ligation des extrémités pour former la jonction codante

36
Q

Vrai ou faux : pour faire la ligation des extrémités pour former la jonction codante, on utilise les enzymes classiques de la réparation des cassures d’ADN double brin

A

Vrai

37
Q

Qu’est ce qui permet la génération de la diversité jonctionnelle des TCR lors de la recombinaison V, J et D

A
  1. P-nucléotides et N-nucléotides
  2. Activité exonucléases
38
Q

Combien de séquence nucléotiques possibles de TCR

A

10^15

39
Q

Qu’est ce que l’exclusion allélique (concernant le TCR)

A

Lorsqu’un réarrangement est productif pour la chaine alpha ou bêta, ceci mène à l’arrêt du réarrangement du locus respectif

Assure que chaque cellule T exprime 1 seul TCR

40
Q

Vrai ou faux : le TCR se lie parallèle au complexe peptide-CMH

A

Faux, il se lie en diagonale

41
Q

Avec quoi interagissent CDR1/2 vs CDR3

A

CDR1/2 : les hélices alpha du CMH
CDR3 : peptide

42
Q

Est ce que le CD3 participe à la reconnaissance d’Ag

A

Non, il permet la transmission des signaux d’activation lors de la reconnaissance antigénique

43
Q

Est ce que CD3 est requis pour l’expression du complexe à la surface cellulaire et la transmission des signaux

A

OUI

44
Q

Structure CDR3

A

Complexe de 6 polypeptides invariables formés de 3 dimères :
1. Gamma-epsilon
2. Delta-epsilon
3. Zeta-zeta

45
Q

Vrai ou faux : CD3 ge et de sont des membres de la superfamille des immunoglobulines

A

Vrai, ils ont un domaine extracellulaire (domaine immunoglobuline) et une région cytoplasmique

46
Q

Structure de CD3 zeta

A

Très courte région extracellulaire et longue queue cytoplasmique contenant des motifs ITAM

47
Q

Utilité des motifs ITAM sur les queues cytoplasmiques des CDR3 zeta

A

Sites de recrutement à des protéines adaptatrices suite à leur phosphorylation induite par l’activation

48
Q

Vrai ou faux : pour assembler le complexe du TCR, l’interaction des charges est d’une importance majeure

A

Vrai, les régions transmembranaires des molécules CD3 sont chargées négativement = stabilisation de la chaine positive du TCR

49
Q

Vrai ou faux : l’affinité du RTC pour le complexe Ag-CMH est plutôt faible

A

Vrai (lien avec la sélection thymique)

50
Q

Quelles sont les molécules accessoires utilisées pour augmenter les interactions entre la cellule T et les CPA

A
  1. Adhésine
  2. Co-récepteurs
51
Q

Est ce que les co-récepteurs de la cellule T participe à la signalisation intra-cellulaire

A

Oui, dans la liaison de la tyrosine kinase Lck

52
Q

Quel est le rôle des molécules accessoires des cellules T

A

Renforcement du contact TCR-CMH (augmentation de l’affinité) et aide à la signalisation

53
Q

Qu’est ce que l’éducation thymique

A

Maturation de cellules T restreintes au CMH qui sont utiles et non-autoréactives

54
Q

Qu’est ce que la sélection positive (éducation thymique)

A

Survie des cellules T dont les TCR reconnaissent les molécules du CMH du soi

55
Q

Qu’est ce que la sélection négative (éducation thymique)

A

Élimination des cellules T qui réagissent trop fortement avec le CMH du soi

56
Q

Quel est le site du développement des lymphocytes T

A

Le thymus

57
Q

Que se passe-t-il chez l’humain et la souris s’ils n’ont pas de thymus

A

Humain = syndrome de DiGeorge
Souris = mutation nude

Pas de cellules T

58
Q

Vrai ou faux : le thymus doit être constamment colonisé par des précurseurs hématopoïétiques provenant de la moelle osseuse

A

Vrai

59
Q

Comment se nomment les cellules T en cours de différenciation dans le thymus

A

Thymocytes

60
Q

Vrai ou faux : les cellules épithéliales du cortex et de la médulla du thymus expriment les molécules CMH1 et CMH2

A

Vrai

61
Q

Où se retrouvent les cellules dendritiques et les macrophages dans le thymus

A

Dendritiques : jonction cortico-médullaire et médulla
Macrophage : répartis dans tout le thymus

62
Q

À quelle endroit dans le thymus se fait l’entrée des cellules précurseurs hématopoïétiques

A

À la jonction cortico-médullaire

63
Q

Qu’est ce qui provoque l’engagement des cellules précurseurs hématopoïétiques vers la différenciation en lymphocyte T

A

Leur liaison au récepteur Notch (par les ligands Notch exprimées par les cellules épithéliales)

64
Q

Grâce à quelle molécule de surface peut-on suivre le développement des thymocytes

A

CD4
CD8
CD3

65
Q

Quelles sont les 4 sous populations de thymocytes et quelle est leur expression de CD4, CD8 et CD3

A
  1. Double négatif : CD4-, CD8-, CD3-
  2. Double positif : CD4+, CD8+, CD3 (faible ou fort)
  3. CD4 simple positif : CD4+, CD8-, CD3+
  4. CD8 simple positif : CD4-, CD8+, CD3+
66
Q

Par quelle molécules de surface peut-on identifier les 4 sous populations de thymocytes double négatif

A

CD44 (molécule d’adhésion)
CD25 (chaine alpha du récepteur IL-2)

67
Q

Que se passe-t-il au stade DN1 et comment est l’expression de CD44 et CD25

A

DN1 prolifèrent afin d’augmenter le nombre de précurseurs des cellules T

CD44+
CD25-

68
Q

Que se passe-t-il au stade DN2 et comment est l’expression de CD44 et CD25

A
  1. DN2 prolifèrent afin d’augmenter le nombre de précurseurs des cellules T
  2. début du réarrangement de la chaine bêta du TCR et des locus gamma/delta

CD44+
CD25+

69
Q

Que se passe-t-il au stade DN3 et comment est l’expression de CD44 et CD25

A

Arrêt de la prolifération afin d’effectuer le réarrangement complet de la chaine bêta du TCR = expression du pré-TCR

CD44 low
CD25+

70
Q

Que permet l’expression du pré-TCR sur les DN3 (bêta-sélection)

A
  1. Survie du thymocyte DN3
  2. Prolifération massive de DN3
  3. différenciation en cellule DP
  4. Exclusion allélique de la chaîne bêta du TCR
71
Q

Vrai ou faux : la prolifération massive des DN3 suite à la bêta sélection permet de créer un clone avec le même réarrangement bêta et d’y associer différentes chaines alpha

A

Vrai

72
Q

À quels stades sont transcrites les protéines Rag1/2

A

DN2, DN3, DN4, DP

73
Q

Qu’est ce qui indique au thymocyte qu’il y a eu un réarrangement productif de la chaine bêta

A

L’expression du Pré-TCR à la surface cellulaire (bêta-sélection)

74
Q

Par quoi est provoquée l’exclusion allélique lorsqu’il y a réarrangement productif de la chaine bêta

A

La dégradation de RAG2 pendant la phase de prolifération

75
Q

Pourquoi la phase de prolifération après le réarrangement productif de la chaine bêta est-elle importante

A

Pour créer des clones de thymocytes avec la chaine bêta réarrangée, ce qui permet à plusieurs thymocytes de tenter de faire une chaine alpha

76
Q

Vrai ou faux : l’expression de la chaine pré-Talpha est perdue lors de la différenciation en thymocytes DP

A

Vrai

77
Q

Pourquoi doit ont apparier les SSR 12-23

A

Pour que les SSR soient du même côté de la double hélice d’ADN afin de les rendre accessibles à une même enzyme