cours 6 Flashcards
tests d'hypothèses
but test d’hypothèse
établir si les données récoltées sont suffisamment convaincantes pour rejeter l’absence de différence
critère de décision
probabilité que le hasard
puisse générer le phénomène observé
hypothèse nulle
Formulée en termes d’absence d’effet
si H0 vrai, variable sera dans la distribution normale
hypothèse alternative
- Correspond typiquement à la relation recherchée/attendue
- Parfaitement complémentaire à H0
test bilatéral
chercher des 2 côtés
test unilatéral
chercher d’un côté seulement
plus grand/ plus petit que
test statistique
rejeter H0 ou non
seuil de signification
Probabilité qu’on « accepte » de se tromper (rejeter H0 à tort). Dans la littérature,
on utilise traditionnellement α = 0.05
valeur p
probabilité d’observer un effet au moins aussi extrême si H0 est vraie
Obtenue en calculant un test statistique
tester une hypothèse
- On choisit un seuil α de risque d’erreur
- On choisit un test approprié pour notre question
- On calcule une statistique
- On compare la statistique à la distribution attendue sous H0
- On rejette (ou non) H0 selon critère de décision
question statistique
Si H0 est vraie, quelle est la probabilité d’observer une valeur au moins aussi extrême que D?
statistique fréquentiste
e test d’hypothèse mesure la
probabilité d’observer une valeur au moins aussi extrême si H0 était vraie
vrai ou faux
Ne pas rejeter H0 n’équivaut pas à accepter qu’elle est raie
vrai
facteurs expliquant le rejet de H0
quand H1 est vraiment vraie
quand H0 est vrai (erreur type 1- faux +)
- modèle inapproprié
- alpha pas assez strict
- p-hacking
- tests multiples
facteurs expliquant le non rejet de H0
H0 est vraiment vraie
* H0 est fausse (erreur type 2- faux -)
- alpha trop strict
- haute variabilité de la pop
- effet réel très petit
- modèle inapproprié
puissance
probabilité de rejeter H0 si elle est fausse
facteurs qui font augmenter la puissance
- le nombre d’échantillons
- la taille minimale de l’effet qu’on désire pouvoir détecter
- la tolérance à l’erreur de type 1
vrai ou faux
Toutes choses égales (𝜶, n, taille d’effet) le test bilatéral est toujours plus puissant.
faux
c’est l’unilatéral
test paramétrique
Calculer une statistique obéissant à une loi de
distribution prédéfinie
variable répond à certains critères dans la population échantillonnée
test non paramétrique
Comparer les données à leur propre distribution
plutôt qu’à une distribution établie
➢ Repose typiquement sur les rangs des données plutôt que les données elles mêmes
➢ Plusieurs tests paramétriques ont un équivalent non-paramétrique
➢ oins contrai nants mais moins puissants qu’un équivalent paramétrique
conditions d’application d’un test
- La variable est distribuée
normalement dans la population; - La variable est homoscédastique, soit la même entre les groupes comparés (ou le long d’une autre variable);
- Les observations comparées sont indépendantes les unes des autres
test de permutation
Générer la distribution de D à partir de nos données par
rééchantillonage multiples aléatoire, puis comparer D à cette distribution
1000 D en tout
test en 9 étapes
Étape 1: Question biologique/scientifique
Étape 2: Déclaration d’hypothèses
Étape 3: Choix du test statistique
Étape 4: Conditions d’application
Étape 5: Distribution de la statistique
Étape 6: Règle de décision
Étape 7: Calcul du test
Étape 8: décision statistique
Étape 9: interprétation biologique/scientifique
Étape 1: Question biologique/scientifique
Énoncer la problématique sous forme de question simple
Étape 2: Déclaration d’hypothèses
Déclarer H0 et H1 en français et en mathématiques
bien tout définir
Étape 3: Choix du test statistique
définir la statistique test (ou variable auxiliaire) utilisée pour évaluer la probabilité d’obtenir nos observations si H0 est vraie. Choisir le type de test à faire
étape 4 : conditions d’application
Énumérer les conditions sous lesquelles le test choisi est valide
Étape 5: Distribution de la statistique
Formuler adéquatement la distribution qui permettra de tester l’hypothèse
Étape 6: Règle de décision
Indiquer le seuil de probabilité 𝛼 choisie pour rejeter H0 et spécifier son calcul
Pcalc = ([per = |obs|] + [per > |obs|]) / Npermutations+ 1
Étape 7: Calcul du test
bien indiquer la démarche (calculs intermédiaires). ans le cas d’un test de permutation les résultats de l’algorithme de permutation seront fournis
Étape 8: décision statistique
Étape 9: interprétation biologique/scientifique
On reformule l’étape 8 en termes biologiques, et on fournit une explication possible du phénomène observé ou non