Cours 5: MÉTABOLISMES DES PROTÉINES ET DES ACIDES AMINÉS Flashcards
RAPPEL:
les protéines sont composées de ??? qui ont tous une structure similaire qui comprend ??? (4)
acide aminés
structure similaire:
- carbone central (carbone alpha)
- groupement carboxylique (COOH)
- groupement amine (NH2)
- chaine latérale variable (R)
RAPPEL:
qu’est-ce qui différencie les acides aminés entre eux
chaine latérale variable R
quelles sont les particularités (3) qui différencient les acides aminés des glucides et des lipides
- utilisation des acides aminés comme source d’énergie est très secondaire
- acides aminés ne peuvent pas être mis en réserve
- l’azote est le constituant chimique caractéristique des acides aminés et des protéines
quel produit de la désamination du groupement amine (NH2) est extrêmement toxique pour l’organisme
NH4+ ammonium
RAPPEL
quels sont les polymères des acides aminés et par quoi les acides aminés sont-ils reliés
peptides et protéines
reliés par liens peptidiques
RAPPEL
décrit le lien peptidique
liaison covalente entre le groupement carboxylique (COO-) d’un acide aminé et le groupement amine (NH3+) d’un autre acide aminé
en fonction du pH, les groupements COOH et NH2 peuvent être…
ionisés
au pH physiologique (7,4), les acides aminés portent quelle charge
simultanément une charge positive et une charge négative
comment appelle-t-on une molécule portant à la fois une charge positive et négative et qui est donc neutre même si ionisée
zwitterion
les propriétés acido-basiques des acides aminés dépendent de quoi
- groupements COOH et NH2
- présence ou non d’une fonction acidique ou basique sur la chaine latérale R
- environnement local (si liés en peptides ou en protéines)
vrai ou faux, le meme acide aminé sur la meme protéine peut être ionisé à un endroit et non ionisé à un autre
vrai
qu’est-ce que le pK
pH auquel une molécule ionisable existe à 50% sous forme ionisée et à 50% sous forme non-ionisée
COOH = COO-
NH2 = NH3+
vrai ou faux, les acides aminés n’ont qu’un seul pK
faux, ils en ont toujours au moins 2
quels sont les pK d’un acide aminé
un pour le COOH
un pour le NH2
un pour la chaine latérale R (si celle-ci est ionisable)
le pH auquel la charge nette de l’acide aminé est zéro (zwitterion) correspond au…
point isoélectrique
vrai ou faux, les acides aminés ont un seul PI
vrai
quelle est la chaine latérale de l’acide aminé glycine
H
quelle est la chaine latérale de l’acide aminé glutamate
CH2 – CH2 – COO-
quelle est la chaine latérale de l’acide aminé glutamine
CH2 – CH2 – C = O
– NH2
quels sont les 8 acides aminés essentiels
Isoleucine
Leucine
Lysine
Méthionine
Phénylalanine
Thréonine
Tryptophane
Valine
qu’est-ce qui fait qu’un acide aminé est essentiel
ils doivent provenir d’une source alimentaire et doivent donc être ingérés
pourquoi certains acides aminés sont considérés non-essentiels
parce que notre organisme est capable de les synthétiser (synthèse endrogène)
quels sont les acides aminés semi-essentiels et pourquoi se trouvent-ils dans cette catégorie
arginine
histidine
notre corps est capable de les synthétiser mais peut-être pas en assez grande quantité alors ils doivent également être ingérés
quels sont les roles des acides aminés
1- synthèse des protéines
2- rôle énergétique beaucoup moins important que les glucides
3- précurseurs des molécules contenant de l’azote
les acides aminés sont la porte d’entrée de ??? dans le métabolisme
l’azote
RAPPEL
les protéines de notre corps sont synthétisées à partir d’un répertoire de ??? acides aminés qu’on nomme ???
20
acides aminés élémentaires ou protéinogènes
RAPPEL
La structure primaire d’une protéine ou d’un peptide dépend de ???
sa séquence en acides aminés
RAPPEL
Décrit la structure secondaire des protéines
acides aminés d’une chaine peptidique peuvent interagir ensemble (liens hydrogènes) et former des structures particulières (hélice alpha et feuillet bêta)
RAPPEL
Décrit la structure tertiaire des protéines
conformation tridimensionnelle globale d’une protéine
RAPPEL
Décrit la structure quaternaire des protéines
interaction entre plusieurs polypeptides (dimères, trimères, etc.)
d’ou proviennent les acides aminés
- synthèse (à partir d’acides organiques et d’azote NH2 et NH4+ pour les acides aminés non-essentiels seulement)
- alimentation (protéines ingérées sont digérées en acides aminés)
- catabolisme des protéines de l’organisme
vrai ou faux, le pool des acides aminés (réservoir corporel) a une fonction d’entreposage
faux, contrairement aux glucides et aux lipides, il n’y a pas d’entreposage corporel en acides aminés
les acides aminés du pool qui ne sont pas utilisés pour la synthèse des protéines (ou autres produits) est…
dégradé et éliminé (désamination/transamination + décarboxylation)
vrai ou faux, le catabolisme est la synthèse de protéines à partir d’acides aminés alors que l’anabolisme est la dégradation des protéines en anabolisme
faux, c’est l’inverse
taux d’anabolisme et de catabolisme quotidien des protéines
400 g/j
d’ou proviennent les protéines digérées et en quelles quantités
provenance alimentaire (environ 100 g/j): protéines végétales ou animales
provenance autre (environ 30-50 g/j):
- protéines enzymatiques sécrétées dans le tube digestif
- protéines provenant des cellules muqueuses mortes
vrai ou faux, les protéines végétales sont dites complètes alors que les protéines animales sont dites incomplètes
faux, c’est l’inverse
la digestion des protéines débute…
dans l’estomac
comment sont digérées les protéines dans l’estomac
par acide gastrique (sécrété par les cellules pariétales)
par pepsine (sécrété sous forme inactive par les cellules principales de l’estomac)
sous quelle forme est sécrétée la pepsine
sous forme inactive: pepsinogène
le pepsinogène est clivé et produit la pepsine active dans quel type de milieu
en milieu acide (pH sous 5)
la pepsine est en mesure de cliver ??? ce qu’on appelle ???
pepsinogène
auto-activation
la pepsine dégrade quel pourcentage d’une protéine ingérée et que produit-elle
10-15% d’une protéine ingérée
dégradation partielle = formation de gros polypeptides
dans le duodénum, qu’arrive-t-il à l’acide gastrique
il est neutralisé par le bicarbonate des sécrétions pancréatiques
la pepsine perd son activité
que ce passe-t-il lorsque la pepsine perd son activité
d’autres protéases sécrétées par le pancréas prennent le relais : trypsine (+ importante), chymotrypsine, élastase, carboxypeptidase
vrai ou faux, les peptidases (trypsine, chymotrypsine, élastase, carboxypeptidase) sont sécrétées sous forme active
faux, sous forme inactive comme la pepsine
les protéases pancréatiques comportent un petit fragment d’acides aminés qui bloque le site actif de l’enzyme pour quelle raison
éviter l’autodigestion
pour que l’action des protéases débute, que doit-il se passer
fragment qui bloque le site actif de l’enzyme doit être clivé
quelle est la forme inactive de la trypsine
trypsinogène
quelle est la forme inactive de la chymotrypsine
chymotrypsinogène
quelle est la forme inactive de l’élastine
proélastine
quelle est la forme inactive de la carboxypeptidase
procarboxypeptidase
comment se fait l’activation de la trypsine
trypsinogène est clivé par l’entérokinase (sécrétée par la muqueuse intestinale)
la chymotrypsine, l’élastase et la carboxypeptidase sont activées par…
la trypsine
que font la trypsine et la chymotrypsine dans la dégradation des protéines
clivent les fragments de protéines en petits peptides (clivent au milieu)
les petits peptides qui ont été clivées par la trypsine et la chymotrypsine sont ensuite clivés par…
carboxypeptidase (clivé juste du côté carboxy-terminal)
l’élastase clive…
les fibres d’élastine
la digestion des protéines est complétée par l’action de…
enzymes de la muqueuse intestinale (dipeptidase, aminopeptidase, carboxypeptidase)
au final les protéines sont dégradées en…
tripeptides, dipeptides et acides aminés libres
pour passer les membranes, les acides aminés et les dipeptides/tripeptides utilisent…
transporteurs actifs
le transport des acides aminés et des dipeptides/tripeptides est couplé au…
transfert de sodium
que ce passe-t-il avec les dipeptides et les tripeptides absorbées
ils sont dégradées en acides aminés libres dans les cellules épithéliales avant d’entrer dans la circulation sanguine
au final, dans le sang, on absorbe uniquement…
des acides aminés libres
vrai ou faux, les protéines entières ne sont jamais absorbées
faux, il peut y avoir certaines exceptions où les protéines entières sont captées par endocytose et relâchée dans la circulation par exocytose
l’absorption de protéines entières peut être observées chez le nouveau-né pour quelle raison
immaturité de la muqueuse intestinale (et de l’estomac)
l’absorption de protéines entières chez le nouveau-né pourrait être la cause de…
allergies alimentaires précoces et souvent réversibles
l’absorption des protéines entières chez le nouveau-né permet quoi
transmission des anticorps de la mère
l’azote atmosphérique est sous quelle forme
N2
l’azote atmosphérique représente quel pourcentage de l’air
78%
l’azote atmosphérique est chimiquement…
inerte
vrai ou faux, l’azote atmosphérique est utilisable par la majorité des organismes vivants
faux, inutilisable pour la plupart
quel est le role des microorganismes dans le cycle de l’azote
transformation de N2 en ammoniac (NH3)
nitrification en nitrites NO2 et nitrates NO3