Cours #4: transcription procaryote

Question 1

Qu’est-ce qu’un gène?

Answer 1

C’est un segment d’ADN codant pour:
-une protéine (par l’intermediaire d’ARNm mature)
-ARNm: instable et minoritaire
-un ARNt
-un ARNr
autres ARNs

Question 2

Commenr sont les ARN polymérases chez les procaryotes?

Answer 2

• 2 grandes sous-unités formant une fente et entourées d’autres sous-unités plus petites.
• Catalyse la formation de liaisons phosphodiester entre les ribonucléotides
  -Ne nécessite pas d’amorce

Question 3

Quelle est la définition de la transcription?

Answer 3

Processus de copie d’un segment d’ADN, appelé unité de transcription, en une molécule d’ARN par l’ARNmpolymérase.

Un seul brin du gène est converti en ARNm, qui porte l’info génétique

Question 4

Quelle est l’unité de la transcription chez les procaryotes?
Combien de polymérases transcrivent tous les gènes?

Answer 4

La region comprise entre le site où:
-debute la transcription: nucléotide +1
-le site ou s’arrete la trasncription: terminateur

Chez les procaryotes : une seule ARN
polymérase transcrivant tous les gènes

Question 5

Quels sont les noms des sous-unités de l’ARN pol bactérienne?

Answer 5

L’ARN polymérase bactérienne : α2ββ’ω + σ

Question 6

Quel est le rôle de chaque sous-unité de l’ARN polymérase?

Answer 6

alpha: rpoA: assembly, regulation, …
beta: rpoB: catalytic activity
beta’: rpoC: DNA interaction
omega: rpoZ: assembly of the core
sigma : rpoD: interaction with promoter–>cible l’ARN pol sur les promoteurs–>spécifique de l’étape de demarrage

Question 7

Comment est organisé un promoteur? Quels sont les “core promoter elements”? Où vas se fixer la sous unité sigma?

Answer 7

Boite GACA -35 puis -10 boite TATA (pribnow) jusqu’au site de demarrage

sigma:
-35 region (GACA)-spacer-10 region-spacer-+1

Question 8

Les niveaux de transcription:
-Le niveau de transcription d’un promoteur reflète la _______1 de démarrage de l’ARN polymérase
-La séquence en base du promoteur détermine le niveau “basal” ou “_______“2 de transcription de l’unité considérée.
Un niveau basal de transcription est un niveau de transcription en _______3 de toute regulation.

Answer 8

1.fréquence
2. constitutif
3.absence

Question 9

Quelle est la cascade de régulation des promoteurs viraux dans le temps?

Answer 9

ADN viral+ facteur sigma 70 de l’hote
–>gènes précoces du virus –>sigma viral –> …–>genes inetmediaires–>….>genes viraux tardifs–>lyse cellulaire

Question 10

Definir une termination
Quels sont les deux types de termination chez les bactéries?

Answer 10

La termnation est la dissociation de l’ARN polymérase de la matrice d’ADN aisni que l’ARN coté 3’ des gènes
1) Rho-independent = sequence signal intrinsèque: decrochage de l’ARN pol
2) Rho-dependent = nécessite le facteur Rho: region riche en GC et apres AT–>structure ARN tige/boucle

Question 11

Exemple d’antibiotique ciblant la ARN polymérase procaryote

Answer 11

La rifampicine

Question 12

Spécificités des mécanismes de transcription chez les procaryotes

Answer 12

-Opéron
- Couplage transcription-traduction

Question 13

Chez les procaryotes, une unité de transcription peut contenir un ou plusieurs ______1, l’ARN m est polycistronique= 1 transcrit et plusieurs _____1

Answer 13

1. gènes

Question 14

Comment faire un northern blot? (ARN)

Answer 14

1. ARN p32 –> électrophorèse–>transfert sur éponge–>membrane de nitrocellulose –>papier
   –>transfert autre gel–>hynridation sonde sur seq–>x-ray–>autoradiogramme