cours#2 Flashcards

Outils de Biologie moléculaire (PCR, Southern blot)

1
Q

Endonucléases de restriction: Pourquoi l’enzyme ne dégrade pas le génome de l’organisme qui
exprime cette enzyme ?

A
  • Il est protégé par des méthylases qui méthyle une base du site de
    reconnaissance empêchant ainsi l’enzyme de fonctionner et donc
    de dégrader son propre ADN.
  • Par contre un ADN étranger qui ne
    serait pas modifié est dégradé.
    =>première ligne de défense des organismes pour éviter l’invasion par de l’ADN étranger.
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2
Q

Lors d’une électrophorèse en gel d’agarose, de quel pôle vers quel pôle va migrer l’ADN? Quelle coloration se fait pour visualiser les bandes d’ADN?

A

-l’ADN va du - vers le +
-coloration au bromure d’éthidium (fluoresce rouge 20 fois plus intense lorsqu’il s’intercale entre les paires de bases.)

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3
Q

Qu’est-ce qu’un système de restriction?

A

Système de restric-on = Enzyme + méthylase associée

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4
Q

Hydrolyse du squelette “sucre-phosphate” : les _______1.
Même coupure sur l’autre brin,
le _______2 du lien phosphodiester reste toujours sur l’extrémité 5’, générant des fragments de restriction 5’P et _____3. Les acides nucléiques sont des composés __________4 chargés (-), lors de l’électrophorèse en gel d’agarose ils migrent vers le +

A
  1. nucléases
    2.phosphate
  2. 3’OH.
  3. uniformément
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5
Q

Comment reconnaître spécifiquement un fragment d’ADN au sein d’une population hétérogène de fragments ?

A

Deux étapes:
- Création d’une sonde radioac>ve ou fluorescente
- Hydridation de la sonde sur l’ADN d’intérêt
-Southern Blot

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6
Q

Qu’est-ce que la PCR?

A

C’est une technique d’amplification génique

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7
Q

De quoi a-t-on besoin pour faire une PCR?

A
  1. ADN double brin
  2. Amorces d’ADN définies
  3. Polymérase thermophile Taq
  4. 4 dNTP
  5. Tampon (Mg2+)
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8
Q

Quelles sont les étapes pour faire une PCR?

A
  1. dénaturation: 94 degrés
  2. hybridation des amorces: 35-55 degrés
  3. polymérisation: 68-72C
  4. cycles succesifs …
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9
Q

Comment calculer la température d’hybridation?

A

Tm=2(A+T)+ 4(G+C)
On prend la valeur la plus baise–>on luis soustrait 4 degrés

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10
Q

De quoi a-t-on besoin pour faire une PCR?

A

-ADN matrice
-Amorces d’ADN définies
-Polymérase thermophile
-4 dNTP
-Tampon (Mg2+)

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