cours#2 Flashcards
Outils de Biologie moléculaire (PCR, Southern blot)
Endonucléases de restriction: Pourquoi l’enzyme ne dégrade pas le génome de l’organisme qui
exprime cette enzyme ?
- Il est protégé par des méthylases qui méthyle une base du site de
reconnaissance empêchant ainsi l’enzyme de fonctionner et donc
de dégrader son propre ADN. - Par contre un ADN étranger qui ne
serait pas modifié est dégradé.
=>première ligne de défense des organismes pour éviter l’invasion par de l’ADN étranger.
Lors d’une électrophorèse en gel d’agarose, de quel pôle vers quel pôle va migrer l’ADN? Quelle coloration se fait pour visualiser les bandes d’ADN?
-l’ADN va du - vers le +
-coloration au bromure d’éthidium (fluoresce rouge 20 fois plus intense lorsqu’il s’intercale entre les paires de bases.)
Qu’est-ce qu’un système de restriction?
Système de restric-on = Enzyme + méthylase associée
Hydrolyse du squelette “sucre-phosphate” : les _______1.
Même coupure sur l’autre brin,
le _______2 du lien phosphodiester reste toujours sur l’extrémité 5’, générant des fragments de restriction 5’P et _____3. Les acides nucléiques sont des composés __________4 chargés (-), lors de l’électrophorèse en gel d’agarose ils migrent vers le +
- nucléases
2.phosphate - 3’OH.
- uniformément
Comment reconnaître spécifiquement un fragment d’ADN au sein d’une population hétérogène de fragments ?
Deux étapes:
- Création d’une sonde radioac>ve ou fluorescente
- Hydridation de la sonde sur l’ADN d’intérêt
-Southern Blot
Qu’est-ce que la PCR?
C’est une technique d’amplification génique
De quoi a-t-on besoin pour faire une PCR?
- ADN double brin
- Amorces d’ADN définies
- Polymérase thermophile Taq
- 4 dNTP
- Tampon (Mg2+)
Quelles sont les étapes pour faire une PCR?
- dénaturation: 94 degrés
- hybridation des amorces: 35-55 degrés
- polymérisation: 68-72C
- cycles succesifs …
Comment calculer la température d’hybridation?
Tm=2(A+T)+ 4(G+C)
On prend la valeur la plus baise–>on luis soustrait 4 degrés
De quoi a-t-on besoin pour faire une PCR?
-ADN matrice
-Amorces d’ADN définies
-Polymérase thermophile
-4 dNTP
-Tampon (Mg2+)