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Biopathologie > Cours 4 (Introduction génétique et cytogénétique médicales) > Flashcards

Cours 4 (Introduction génétique et cytogénétique médicales) Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la génétique?

A
  • La science de l’hérédité
  • Elle étudie la transmission des caractères normaux et pathologiques d’une génération à l’autre
  • Si l’étude de la génétique inclut les aspects pathologiques de l’hérédité, on l’appelle génétique médicale
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2
Q

Quelles sont les 2 grandes catégories qui permettent de diviser les pathologies de l’hérédité?

A
  1. L’anomalie est due à une mutation génique et est identifiée par la biochimie et la biologie moléculaire, svt suspectée à l’histologie (maladies de surcharge)
  2. L’anomalie est visible morphologiquement et est identifiée par la cytogénétique
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3
Q

On considère actuellement qu’entre le tiers et la moitié des enfants hospitalisés le sont pour…

A

Pour des problèmes génétiques

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4
Q

Quelles sont les caractéristiques de la découverte des SNPs (single nucleotide polymorphisms)?

A
  • Plus on avance, plus on a une résolution qui va jusqu’à un polymorphisme (qui touche un seul nucléotide)
  • Résolution qui a une énorme puissance jusqu’au polymorphisme d’un seul nucléotide
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5
Q

Quelles sont les surprises lors de la fin du séquençage du génome humain en 2000-2004?

A
  • Le génome ne comporte pas 100 000 gènes comme on le croyait mais seulement de 20 000 à 25 000.
  • Les gènes humains n’occuperaient qu’environ 2% de tout notre ADN
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6
Q

Qu’est-ce qu’un gène?

A

Un segment d’ADN contenant une information particulière

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7
Q

Qu’est-ce qu’un génotype?

A
  • Un ensemble des gènes d’un individu (génome)
  • La constitution génétique d’un individu
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8
Q

Qu’est-ce qu’un caractère?

A

Une particularité observable chez un individu, représente l’expression d’un gène particulier, la manifestation de ce gène

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9
Q

Qu’est-ce qu’un phénotype?

A
  • Un ensemble des caractéristiques observables chez un individu
  • Représente l’ensemble des caractères apparents d’un individu, caractères constatés à l’examen de cet individu sans l’aide de son histoire familiale
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10
Q

Un gène n’égale pas nécessairement un caractère…

A

Un caractère phénotypique
- Entre un gène et son expression dans un caractère donné, il existe généralement de nombreuses étapes de développement, sans compter les interactions éventuelles de ce gène avec d’autres gènes et avec le milieu

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11
Q

Qu’est-ce qu’un locus?

A
  • L’endroit occupé physiquement par une fonction génique (un gène) sur un chromosome et son homologue
  • Au même endroit (locus) sur les deux chromosomes d’une même paire, on peut retrouver la même forme de cette fonction génique ou une forme différente (allèle)
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12
Q

Qu’est-ce qu’un allèle?

A

L’une ou l’autre forme d’un gène occupant un locus défini sur une paire chromosomique déterminée

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13
Q

Quelles sont les distinctions entre les mots «gène» et «allèle»?

A
  • Ces mots n’ont pas exactement la même signification
  • Pour une fonction génique, il peut y avoir plusieurs allèles dans une population, on parle ici de polyallélie
  • Un individu normal ne peut posséder plus de deux allèles à la fois pour un locus donné
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14
Q

Qu’est-ce qu’un syndrome?

A

Une condition clinique dans laquelle on peut reconnaître un nombre important de modifications phénotypiques constantes chez plusieurs individus

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15
Q

une personne porteuse d’un gène anormal peut être phénotypiquement normale pendant…

A

Pendant une bonne partie de sa vie

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16
Q

Le phénotype n’est pas toujours une indication fidèle du…

A

Une indication fidèle du génotype
- Les étapes du développement peuvent produire des effets différents pour un même gène

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17
Q

Quelles sont les 3 catégories de lien entre les gènes et les effets?

A
  • Pléiotropisme : Un même gène peut avoir plusieurs effets
  • Hétérogénéité génique : Plusieurs gènes peuvent avoir le même effet
  • Phénocopie : Des agents du milieu peuvent simuler les effets d’un gène
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18
Q

Qu’est-ce qu’une maladie congénitale?

A

Une maladie est dite congénitale lorsqu’elle est présente à la naissance

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19
Q

Une maladie héréditaire peut ne pas être congénitale si elle…

A

Si elle n’apparaît que plus tard dans la vie

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20
Q

De quel type de maladie est le syndrome d’alcoolisation fœtale et quelles sont les caractéristiques de ce syndrome?

A
  • Maladie congénitale non héréditaire
  • Retard mental, microcéphalie, anomalies cardiaques, insuffisance rénale et retard de croissance
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21
Q

Quels sont les 3 types de relation entre l’hérédité et l’environnement?

A
  • Certaines différences entre les individus dépendent uniquement de la constitution génétique
  • D’autres différences dépendent à la fois de la constitution génétique et de l’environnement
  • Il existe des différences qui ne dépendent que de l’environnement et dans lesquelles la constitution génétique ne joue aucun rôle
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22
Q

Quelles sont le caractéristiques et le rôle du nucléosome?

A
  • Unité de base d’organisation de la chromatine
  • Segment d’ADN+complexe d’histones en octamère
  • Permet la condensation de l’ADN en chromatine, elle-même repliée, plus l’ADN est condensé, moins les gènes pourront être transcrits
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23
Q

Quels sont les 2 types de nucléosomes?

A
  1. Euchromatine : Moins condensée, contient les gènes transcrits
  2. Hétérochromatine (hyper compact) : Toujours condensée, contient les gènes non transcrits, contient peu de gènes : télomères et centromères
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24
Q

De quoi est composé le corps protéique du nucléosome?

A

2 copies de H2A, H2B, H3, H4

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25
Q

Quels sont les rôles du complexe de remodelage des nucléosomes?

A
  • Protéines utilisant de l’ATP qui induit des changements de conformation du nucléosome
  • Permet de condenser ou décondenser la structure et exerce donc un certain contrôle sur l’accessibilité des gènes au mécanisme de transcription
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26
Q

Quelles sont les différentes modifications chimiques des histones ou épigénétiques? Quelles sont les caractéristiques de l’acétylation et de la méthylation?

A
  • Acétylation, méthylation, phosphorylation, ubiquitinylation
  • Acétylation : Mise en place par les histones-acétyltransférases, ajout d’un groupe acétyl qui modifie l’empaquetage des gènes par les histones, augmente l’accessibilité à ces gènes, réversible
  • Méthylation : Ajout de groupements méthyles sur les histones, modifie la condensation, gènes plus ou moins accessibles
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27
Q

Dans quel sens se produit la réplication de l’ADN?

A

5’ vers 3’

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28
Q

Quelles sont les caractéristiques du processus de transcription de l’ADN?

A
  • Gène est accessible, comporte exons et introns
  • Seulement exons peuvent être transcrits, il faut enlever les introns, on va pré-ARN messager)
  • Épissage pour faire sauter ce qui ne peut pas après être traduit pour garder un ARN messager (1 seul brin de l’ADN sans les introns)
  • On peut traduire les exons en protéine dans le ribosome dans le cytoplasme de la cellule
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29
Q

Quelles sont les caractéristiques du processus de transformation des gènes en protéines?

A
  1. Arrive à ARNm
  2. Prend un triplet
  3. Chaque triplet correspond à un acide aminé (20 en tout)
  • Chaque codon correspond à un acide aminé
  • Chaque acide aminé à plusieurs codons associés
  • Construction d’un collier de perle dans les ribosomes
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30
Q

Quelles sont les caractéristiques des mutations : délétion ou insertion de multiples de 3 nucléotides?

A
  • Respect du cadre de lecture (absence de décalage du cadre de lecture)
  • Mutation génique ponctuelle
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31
Q

Quelles sont les caractéristiques des mutations frameshift : délétion ou insertion de non multiples de 3 nucléotides?

A
  • Pas de respect du cadre de lecture
  • Insertion ou perte de nucléotides qui ne représente pas un multiple de 3 –> Troncation
  • Protéine tronquée : Instable et dégradée (perte de fonction) ou effet d’un gain de fonction
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32
Q

Quelles sont les caractéristiques des mutations stop?

A
  • Arrêt de lecture > Troncation
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33
Q

Quelles sont les conséquences d’une mutation génique de type « single gene defect »?

A
  • Anomalie du développement
  • Anomalie biochimique : Maladie métabolique/mitochondriale
  • Accumulation excessive de protéines anormales : Maladies de surcharge/maladies métaboliques 
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34
Q

Les types de protéines mènent à quels types de maladies?

A
  • Maladies enzymatiques : Maladies métaboliques et maladies des anti-enzymes
  • Malformations
  • Maladies immunologiques
  • Protéinopathies
  • Maladies neurodégénératives
  • Prédisposition au cancer
  • Canalopathie
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35
Q

Quelles sont les caractéristiques des mutations ponctuelles : substitution d’un nucléotide par un autre?

A
  • Petite anomalie peut avoir de grosses conséquences
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36
Q

Quelles sont les caractéristiques des mutations ponctuelles : substitution d’un nucléotide par un autre?

A
  • Petite anomalie peut avoir de grosses conséquences
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37
Q

Quels sont les effets d’une protéine anormale?

A

À des effets sur tous, tous est altéré, si la cellule ne fonctionne pas, le tissu ne fonctionne pas aussi

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38
Q

Quelles sont les caractéristiques des maladies enzymatiques (maladie de surcharge)?

A
  • Normalement, noyau au centre de la cellule
  • Ici, noyau à la périphérie de la cellule
  • Cytoplasme gorgé de quelque chose
  • Enzyme déficitaire, mal formé, n’arrive plus à dégrader A en B
39
Q

Quelles sont les caractéristiques du déficit en alpha-1-antitrypsine?

A
  • Perte de fonction
  • Noyau central
  • Points rouges : Alpha-antitrypsine resté coincé dans le réticulum endoplasmique, devrait partir dans le plasma pour aller faire son action, mutation d’un gène elle reste coincée
40
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’information de la microscopie électronique de l’alpha-1-antitrypsine?

A
  • Dépôts homogènes de matériel électro-dense dilatant le réticulum endoplasmique
  • Réticulum endoplasmique : Lâche, gros, floconneux, gonfler, gorgé de ces alpha-antitrypsine
41
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’accumulation de la protéine d’amylose?

A
  • Donne une surcharge en amylose, cellules sont séparées, puisque amylose entre les cellules
  • Lumière du vaisseau rétrécit, amylose dans la paroi
42
Q

Qu’est-ce qu’un individu dit homozygote pour un gène donné?

A
  • Il est porteur du même allèle à l’état double (AA ou aa), c’est-à-dire s’il possède une paire d’allèles identiques situés à un locus donné sur une paire de chromosomes homologues
43
Q

Qu’est-ce qu’un individu dit hétérozygote pour un gène donné?

A
  • Il est porteur de deux allèles différents (Aa)
44
Q

Qu’est-ce qu’un individu dit hémizygote pour un gène donné?

A

Il est porteur d’un seul exemplaire de la paire d’allèles

45
Q

Qu’est-ce qu’un gène de type dominant?

A

Il s’exprime à l’état hétérozygote (Aa : un seul des deux allèles suffit pour que le caractère apparaisse)

46
Q

Qu’est-ce qu’un gène récessif?

A

Pour se manifester, il faut qu’il existe à l’état double ou homozygote (aa), ou encore qu’il soit seul (hémizygote)

47
Q

Qu’est-ce que la codominance?

A
  • Parfois, chacun des deux allèles différents d’une même paire s’exprime de façon complète chez l’hétérozygote
  • C’est le cas des personnes du groupe sanguin AB, sur les globules rouges desquelles on peut détecter les antigènes A
48
Q

Quelles sont les caractérisitques des maladies génétiques résultant d’une mutation génique?

A
  • Concerne la grande majorité des maladies génétiques
  • Les 3 lois fondamentales de la génétique de Mendel sont applicables à tout être vivant (hérédité mendélienne)
  • L’analyse génétique ne se limite pas à la transmission de maladies rares.
  • La transmission de la plupart des traits physiques et mentaux (taille, poids, intelligence, etc.) ne peut pas être expliquée seulement par l’hérédité mendélienne
  • Les variations rencontrées sont explicables seulement par l’action combinée de plusieurs gènes et du milieu (hérédité multifactorielle) et aussi par l’existence de la polyallélie (plusieurs allèles dans une population)
49
Q

Qu’est-ce que l’albinisme oculo-cutané type 1 (transmission autosomale récessive)?

A

Maladie autosomique récessive rare caractérisée par un défaut de synthèse de la mélanine, le pigment de la peau, des poils et de la rétine

50
Q

Quelles sont les caractéristiques de la famille Prospère avec l’albinisme (transmission autosomale récessive)? (Voir diapo pour schéma)

A
  • Le caractère peut apparaître uniquement dans la fratrie, les ascendants et les descendants d’une personne atteinte sont généralement normaux
  • Les parents d’un enfant atteint sont souvent consanguins
  • Hommes et femmes ont autant de chances d’être atteints parce que l’allèle anormal est situé sur un autosome (dans ce cas sur le chromosome 11)
51
Q

Qu’est-ce que le nanisme achondroplasique (transmission autosomale dominante)?

A
  • Forme héréditaire de nanisme due à une mutation génique qui engendre une croissance et un développement anormal des os longs
  • Hérédité mendélienne dominante autosomique
  • Locus : 4p16.3
  • Mutation du gène FGFR3 récepteur du facteur de croissance fibroblastique 3
  • Sporadique (nouvelle mutation) pour la majorité des cas (78%)
52
Q

Quelles sont les caractéristiques de la famille Boutin avec le nanisme achondroplasique (transmission autosomale dominante)? (Voir diapo pour schéma)

A
  • Le caractère est présent à toutes les générations, sans en sauter une
  • Chaque individu atteint possède un parent atteint
  • Les individus normaux ne transmettent pas le caractère à leurs enfants
  • Le caractère est transmis par une personne atteinte (homme ou femme) à la moitié de ses enfant
  • Hommes et femmes ont autant de chances d’être atteints parce que l’allèle anormal est situé sur un autosome (dans ce cas sur le chromosome 4)
53
Q

Quelles sont les caractéristiques de la famille Gagnon avec la dystrophie musculaire de Duchenne (mutation liée à l’X)? (Voir diapo pour schéma)

A
  • Sauf de très rares exceptions, seuls les hommes sont atteints, le gène muté s’exprime toujours puisqu’il n’y a pas de locus correspondant sur le chromosome Y (hémizygote)
  • Les femmes transmettent l’affection sans en être atteintes (porteuses car hétérozygotes)
  • De rares femmes hétérozygotes sont atteintes - rôle de l’inactivation du X
  • La moitié des garçons sont atteints et la moitié des filles sont porteuses
  • La majorité des gènes situés sur le chromosome X sont récessifs
54
Q

Qu’est-ce que la dystrophie musculaire de Duchenne?

A
  • C’est une maladie causée par une mutation du gène de la dystrophine (Xp21.1)
  • Un tiers des enfants atteints est porteur d’une nouvelle mutation.
  • Décrite en 1860 par le docteur Duchenne de Boulogne, c’est la plus répandue des myopathies de l’enfant
55
Q

Quelles sont les caractéristiques de la famille Caron avec le rachitisme vitamino-résistant (hérédité dominante liée à l’X)? (Voir diapo pour schéma)

A
  • Le caractère est présent à toutes les générations
  • Chaque individu atteint possède un parent atteint
  • Les individus normaux ne transmettent pas le caractère à leurs enfants
  • Les femmes transmettent l’affection à la moitié de leurs garçons et la moitié de leurs filles
  • Les hommes transmettent l’affection à toutes leurs filles et à aucun de leurs garçons, ceci est la caractéristique qui distingue l’hérédité dominante liée à l’ X de l’hérédité dominante autosomique
  • Il existe très peu d’affections chez l’humain où un allèle anormal est transmis suivant le mode dominant lié au X
56
Q

Quelles sont les caractéristiques de la famille Haram avec l’hypertrichose des oreilles (hérédité liée à l’Y)?

A
  • En dehors de la détermination du sexe, on ne connaît pratiquement pas de caractères anormaux qui, chez l’humain, sont liés au Y
  • Dans cette transmission, il y a absence de dominance ou de récessivité, le gène muté s’exprime toujours
  • Seuls les hommes sont atteints, de père en fils
  • Aucune fille n’est atteinte
57
Q

Qu’est-ce que l’empreinte parentale?

A
  • Lorsqu’un gène est soumis à empreinte, une seule des deux copies du gène est active (expression monoallélique)
  • Les maladies rencontrées en pathologie humaine seront la conséquence de la perte d’expression de l’allèle actif OU de l’expression anormale de l’allèle normalement silencieux (“relaxation d’empreinte”)
  • Une cinquantaine de gènes soumis à empreinte (phénomène épigénétique: faisant intervenir méthylation de l’ADN et ou acétylation/désacétylation des histones à proximité des gènes)
  • En fonction de son origine paternelle ou maternelle, le gène s’exprime, agit comme si haploïde
  • Présence dans les régions flanquantes de ce type de gène d’une boîte d’empreinte qui régule l’expression du gène
58
Q

Qu’est-ce qu’un avantage sélectif?

A
  • Caractère héréditaire ou acquis secondaire à une mutation Initialement pour « échapper » au prédateur
  • Ex. Anomalie monogénique offre une protection contre la malaria en Afrique (hétérozygote)
59
Q

Qu’est-ce que la cytogénétique?

A
  • Une anomalie chromosomique implique un grand nombre de gènes et produit plusieurs malformations ou malfonctionnements
  • Partie de la génétique qui s’occupe de l’hérédité au niveau cellulaire et plus particulièrement au niveau des chromosomes
  • Chaque espèce possède une formule chromosomique caractéristique (le caryotype) par le nombre et la morphologie
  • Les anomalies chromosomiques sont une cause majeure d’échec de la reproduction (50% des cas) et d’anomalies congénitales et elles sont extrêmement fréquentes dans les cancers
60
Q

Qu’est-ce que la chromatine?

A
  • ADN et histones
  • Hétérochromatine et euchromatine
61
Q

Qu’est-ce qu’un chromosome?

A

ADN linéaire fortement condensé

62
Q

Qu’est-ce qu’un chromatide?

A

Une copie d’un chromosome répliqué, attaché à sa soeur par le centromère (un des deux nucléofilaments qui constituent le chromosome)

63
Q

Qu’est-ce qu’un caryotype?

A

Un arrangement des chromosomes homologues ou apparentés, suivant sa taille et sa forme; dans un caryotype les chromosomes sont numérotés d’après une classification internationale

64
Q

Qu’est-ce qu’un centromère et un télomère?

A
  • Centromère : Région qui unit les chromatides soeurs
  • Télomère : Extrémité du chromosome
65
Q

Qu’est-ce que la mitose et la méiose?

A
  • Mitose : Phase de division cellulaire en deux cellules filles diploïdes à l’identique Interphase: phase du cycle sans division cellulaire
  • Méiose : Division cellulaire en 2 temps aboutissant à 4 cellules filles haploïde
66
Q

Quelles sont les caractéristiques morphologiques des chromosomes?

A
  1. Métacentrique (Bras long et court)
  2. Submétacentrique (Bras long et court)
  3. Acrocentrique (Satellite et tige)
  • Chromatides, télomères, centromères
67
Q

Qu’est-ce que la constitution chromosomique et quelle est sa formule?

A
  • Composition en chromosomes des cellules d’un individu
  • Formule chromosomique constituée par :
    1. Nombre de chromosomes
    2. Gonosomes
    3. Indication d’une anomalie chromosomique s’il y a lieu
68
Q

Que signifie les chiffres et lettres : 17p13.1?

A
  • 17 : Numéro du chromosome
  • p : Petit bras
  • 13.1 : Localisation internationale
69
Q

Quelles sont les caractéristiques des gamètes, des cellules germinales?

A
  • Possèdent un nombre haploïde de chromosomes (23 chromosomes dans l’espèce humaine)
70
Q

Quelles sont les caractéristiques des cellules somatiques?

A
  • Ont un nombre diploïde de chromosomes (46)
  • 22 paires de chromosomes sont des autosomes
  • 1 paire de chromosomes sexuels sont des gonosomes
71
Q

Qu’est-ce que la polyploidie?

A

Comporte l’addition anormale d’un ou de plusieurs compléments haploïdes

72
Q

Qu’est-ce que l’aneuploidie?

A
  • Porte sur une seule paire de chromosomes homologues dont le nombre est augmenté ou diminué (anomalie de nombre).
  • Monosomie : 1 seul chromosome au lieu de 2
  • Trisomie : 3 chromosomes au lieu 1 paire
  • Sauf pour le chromosome X, les monosomies d’un chromosome complet ne sont pas compatibles avec la vie
73
Q

Quels sont les types d’anomalies structurales?

A
  • Translocation (équilibrée ou non avec une perte)
  • Isochomosome
  • Délétion
  • Insertion
  • Ring chromosome
74
Q

Qu’est-ce qu’un caryotype classique?

A
  • Analyse morphologique des chromosomes qui permet leur classement selon un ordre établi par entente internationale
  • Les 46 chromosomes de l’espèce humaine se répartissent en 23 paires : 22 paires d’autosomes et 1 paire de chromosomes sexuels (gonosomes)
  • Les 46 chromosomes ont 23 formes différentes (24 chez l’homme) et chacune des formes se retrouve pour deux chromosomes sauf pour le chromosome Y
  • Les paires sont placées par ordre de grandeur (les plus grandes d’abord), selon la position des centromères (index centromérique) et selon leur forme
  • On doit compter les chromosomes pour rechercher les anomalies de nombre et analyser la forme de chaque chromosome afin d’identifier les anomalies de structure
75
Q

Quel est le premier pré-requis à l’analyse cytogénétique caryolytique?

A

D’obtenir des cellules en division

76
Q

Quelles sont les 3 grandes catégories de cellules?

A
  1. Cellules en division spontanée et fréquente : Cellules de la moelle osseuse, cellules tumorales
  2. Cellules en division spontanée mais moins fréquente : Cellules fibroblastiques (peau), cellules embryonnaires et cellules tumorales
  3. Cellules qui normalement ne se divisent pas dans l’organisme : Lymphocytes sanguins, substances comme la phytohémagglutinine (PHA)
77
Q

Quelles sont les limites du caryotype?

A
  • Résolution : 5 (millions de paire de bases) Mb
  • Caractérisation des anomalies est difficile : les bandes de différents chromosomes peuvent se ressembler
  • Nécessité d’obtenir des mitoses
78
Q

Qu’est-ce que la cytogénétique moléculaire?

A
  • De plus en plus utilisée dans les laboratoires de cytogénétique diagnostique
  • Permet de détecter les anomalies chromosomiques de nombre ou de structure dans les cas où l’index mitotique des cellules à étudier est trop faibleou lorsque les anomalies elles-mêmes sont infra microscopiques
  • FISH, CGH et SNParray
79
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’hybridation in situ fluorescente ou FISH?

A
  • Repose sur les propriétés de dénaturation et renaturation de la molécule d’ADN
  • Sonde moléculaire (ou petite séquence d’ADN) marquée, qui s’hybride sur la séquence du génome correspondant (séquence complémentaire) soit sur chromosomes d’une mitose (métaphase) ou sur noyaux interphasiques
  • Lecture et visualisation au microscope à fluorescence de la sonde
80
Q

Quels sont les types de sondes marquées avec un fluorochrome dans l’hybridation in situ fluorescente ou FISH?

A
  • Spécifique de loci : Pour identifier une région très précise du génome, utile pour rechercher remaniements impliquant une région précise (translocations, microdélétions, inversions)
  • Peinture : Constituée d’un ensemble de petites sondes qui couvrent tout le génome, utile pour les translocations
  • Break-apart ou sonde de dysjonction : Utile pour les translocations
  • Centromérique : S’hybride au niveau des centromères, utile pour dénombrer des chromosomes
81
Q

Comment fonctionne la détection d’une trisomie 21 en prénatal FISH?

A
  • Utilise des sondes spécifiques des chromosomes 13, 18, 21, X et Y
  • Ce cocktail de sondes permet de détecter les aneuploïdies, on l’utilise lors d’un test de diagnostic prénatal, après une amniocentèse
82
Q

Comment fonctionne la détection de la translocation équilibrée t(1;2) FISH en utilisant des peintures chromosomiques?

A
  • ## Coloration spécifique de chaque paire de chromosomes
83
Q

Quelles sont les limites de FISH?

A

-Sondes spécifiques (break apart) : Étude ciblée
- Peintures : Résolution de 1.5Mb pour détecter des translocations télomériques, si insertion, ne peuvent déterminer quelle est la région chromosomique impliquée

84
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’hybridation génomique comparative sur métaphase?

A
  • Étude du contenu global de l’ADN
  • Comparaison du nombre de molécules d’ADN d’un patient par rapport à un témoin avec établissement d’un ratio ou rapport entre les deux
  • Le ratio d’intensité a une valeur théorique de 1 si nombre identique de molécules, valeur de 0.5 si délétion(perte) ou de 1.5 si gain (trisomie)
85
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’hybridation génomique comparative sur réseau d’ADNCGH array?

A
  • Technique de CGH sur des lames où sont fixés des fragments d’ADN/séquences génomiques ou sondes
  • La résolution de la puce dépend du nombre et de la localisation des sondes.
86
Q

Quelles sont les limites de la CGH?

A

-Mutations géniques
- Ne détecte pas les anomalies équilibrées comme les translocations ou inversions équilibrées
- Ne détecte pas les anomalies déséquilibrées présentes dans moins de 10-20% des cellules

87
Q

Quand faire de la cytogénétique?

A
  • Conseil génétique et le diagnostic prénatal : Pour des parents porteurs d’une translocation équilibrée, pour des parents ayant déjà eu un enfant anormal ou ayant un enfant anormal dans la famille, mère âgée…
  • Retards mentaux familiaux : Recherche d’anomalies fines chez les parents et les enfants
  • Problèmes d’avortements répétés : Recherche d’anomalies chromosomiques dans les produits d’avortements (50% de ceux-ci sont dus à une anomalie chromosomique)
  • Problèmes d’infertilité : Recherche d’anomalies impliquant les chromosomes sexuels
88
Q

Que permet l’analyse chromosomique dans les cancers?

A
  • Les cancers sont caractérisés par l’apparition d’anomalies chromosomiques spécifiques
  • L’analyse chromosomique dans les cancers aide :
    1. Confirmation du diagnostic
    2. Classification du type de la tumeur
    3. Pronostic
    4. Orientation de la thérapie
89
Q

Quelles sont les applications cliniques des différentes techniques de cytogénétique?

A
  • Caryotype : Très utilisé mais…
  • FISH : Complément du caryotype pour détecter des microdélétions avec pertes de fragments entre 500 000 et 4 Mb
  • Anomalies constitutionnelles
  • Translocations en oncologie : Gènes de fusion
  • Caractérisation d’une anomalie détectée sur le caryotype classique
  • Détection de translocations télomériques cryptiques où les chromosomes dérivés ressemblent au chromosomes normaux en bande sur le caryotype
90
Q

Quelles sont les applications cliniques des différentes techniques de cytogénétique, FISH interphasique?

A
  • Pas besoin de culture cellulaire, signaux mis en évidence sur les noyaux.
  • Diagnostic des trisomies 13, 18 et 21 sur amniocytes des ponctions de liquide amniotiques
  • Translocations en oncologie sur empreintes et/ou sur coupes tissulaires
91
Q

Quelles sont les applications cliniques des différentes techniques de cytogénétique, CGH array?

A
  • Pour les pathologies acquises, en onco
  • Par exemple : Souvent pas de première intention
  • Technique de référence pour les anomalies constitutionnelles de type déséquilibres génomiques
92
Q

Quelles sont les caractéristiques de la trisomie 21 (47,XX,+21 ou 47,XY,+21)?

A
  • 1/350 grossesse, 1/800 naissances aux US
  • Incidence augmente avec l’âge maternelle
  • Fentes palpébrales obliques en haut et en dehors
  • Grosse langue
  • Pli palmaire médian unique
  • Hypotonie générale (diminution de tonus musculaire)
  • Retard de développement physique et mental
  • Malformations cardiaques fréquentes
93
Q

Quelles sont les caractéristiques du syndrome de Turner (45,X)?

A
  • 1/2500 naissances
  • Phénotype féminin
  • Quotient intellectuel normal ou légèrement abaissé
  • Taille plus petite que la moyenne
  • Faible développement des caractères sexuels secondaires
  • Infertilité
  • Autres signes : Cou palmé, raccourcissement du 4e métacarpien…
  • Coarctation de l’aorte
94
Q

Quelles sont les caractéristiques du syndrome de Klinefelter (47,XXY)?

A
  • 1/500 garçons
  • Phénotype masculin
  • Grande taille
  • Développement au dessous de la moyenne des caractères sexuels secondaires (barbe, musculature, etc)
  • Gynécomastie (variable)
  • Hypogonadisme plus ou moins marqué, testicules toujours petits et absence de lignée germinale, infertilité
    Chez les personnes présentant une formule en mosaïque incluant la formule normale, il peut y avoir une prolifération germinale discrète

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