Cours 4- Chapitres 10 et 11 Flashcards
Où se répliquent la majorité des virus ARN?
Dans le cytoplasme, mais il existe des exceptions.
Qu’est ce qui est particulier à propos des polymérases des virus ARN?
Ils devront coder leur propre polymérase, parce que les cellules eucaryotes ne possèdent pas les activités nécessaire à la transcription ou la réplication du génome viral. Ces dernières sont spécifiques, et reconnaissent des séquences nucléotidiques propre à chaque virus, ce qui empêche leur fixation sur des séquences d’ARN cellulaires.
Quelles sont les deux propriété importante des polymérases ARN?
- Ils n’ont habituellement pas besoin d’amorces.
- Absence d’activité de correction. Il y a donc un grand taux de mutations comparativement aux virus ADN.
Vrai ou faux. Tous les virus ARN n’ont aucune activité de correction liée à leur polymérase ARN.
Faux. Les coronavirus, dû à leur taille, en ont.
Nommez les 3 virus étudiés dans ce cours en détail qui ont un génome ARN de polarité +.
Picornaviridae, Togaviridae, Coronaviridae
Nommez 3 caractéristiques communes des virus à génomes ARN polarité positive.
- Leur génome monocaténaire est de la même polarité que les ARNm (déduction de la séquence en aa des protéines virales)
- L’ARN génomique peut être lu directement par les ribosomes de la cellule sans synthèse préalable de protéine ou acide nucléiques viraux.
- On peut introduire directement les acide nucléiques par extraction de la capside virale ou par transcription in vitro et initier directement le cycle de multiplication viral.
Résumez le cycle de multiplication des Picornaviridae.
C’est un génome monocaténaire linéaire, de polarité +.
1- Décapsidation et entrée du génome
2- Traduction par les ribosomes de la cellules. Formation d’un long polypeptide qui sera clivé par des protéases virales pour former toutes les protéines nécessaires à la multiplication virale.
3- Le génome (brin +) est copié pour fabriquer l’anti-génome complémentaire de polarité négative.
4- L’antigénome (-) est copié dans le but de faire beaucoup de copies du génome (+)
5- Le génome est encapsidé avec des protéines de structure de la capside, pour fabriquer des nouveaux virions qui seront relâchés lors de la lyse cellulaire.
Quelle est l’étape déterminante qui permet au Togaviridae d’entrer en phase tardive lors de son cycle de multiplication?
Apparition de génomes néo-synthétisés du virus.
Pourquoi certains virus ARN comme le Togaviridae ont 2 phases à leur cycle de multiplication?
Cela permet de décaler la synthèse des protéines structurales vers la fin du cycle. Certaines protéines sont souvent toxiques pour la cellule, et donc tuent la cellule précocement, ce qui empêche la formation du nombre voulu de virions.
Expliquez le cycle de multiplication des Togaviridae.
1- Génome décapsidée, entrée du génome et lecture par des ribosomes.
2- Phase précoce : Synthèse de protéines non structurales qui permettent la continuité du cycle de multiplication.
3- Synthèse du brin -.
4- Le brin - est transcrit en brin + pour 2 raisons :
- Nouveaux génomes viraux de pleines longueur produits, ce qui marque le début de la phase tardive.
- Formation d’un deuxième ARN plus court à partir de la deuxième séquence de reconnaissance. Cet ARN comprend la même séquence 3’ terminale que le génome. Il y aura traduction et production de protéines structurales nécessaires pour l’encapsidation.
Le cycle de multiplication des coronavirus ressemble beaucoup à celui d’une autre famille de virus. Quel est-il, et quelles sont les différences?
Togaviridae.
La différence est en termes de complexité.
Togaviridae; 2 cadres de lectures, permettant la production de 2 séries de protéines.
Conaviridae; Plusieurs cadres de lectures, Production de plusieurs séries de protéines.
La polymérase peut aussi allonger une courte séquence d’ARN leader produite dès le début du cycle qui peut s’attacher à différentes régions du génome par complémentarité de base.
Nommez quelques particularités du cycle de multiplication du génome viral ARN négatif.
- Le génome est une séquence complémentaire à l’ARNm pour coder les protéines virales.
- Doivent absolument transporter avec eux des enzymes virales dans leur capside pour amorcer le cycle de multiplication, pour produire les ARNm nécessaires.
Vous êtes en labo, et vous voulez infecter une cellule avec un Paramyxoviridae. Vous décidez donc de décapsider manuellement le génome, et de l’injecter nu dans la cellule. Est-ce que l’infection va fonctionner?
Non! Les paramyxoviridae ont un génome ARN de polarité négative, et ont absolument besoin de transporter avec eux des enzymes viraux pour amorcer la multiplication.
Expliquez le cycle de multiplication général des virus à génome ARN polarité négative.
1- Il y a la transcription du génome par la polymérase virale apportée.
2- Les ARNm + sont alors traduits et transcrits, permettant la synthèse de différentes protéines virales, en plus d’une copie complète du génome. Cette copie complète du génome va servir à produire de nouveaux exemplaires du génome encapsidés par des protéines structurales, pour générer de nouveau virions. Lors de l’encapsidation, la polymérase virale nouvellement synthétisée durant le cycle sera aussi encapsidée pour permettre le cycle de multiplication des prochains virions qui vont infecter.
Quelles sont les ressemblances entre les Orthomyxoviridae et les paramyxoviridae?
- Génome ARN de polarité négative
- Capside hélicoïdale
- Virus enveloppé
- ARN polymérase dans la capside virale
Discutez des différences entre les Paramyxoviridae et les Orthomyxoviridae concernant la segmentation
Le génome orthomyxoviridae est segmenté, et chaque segment est copié séparément et code un ARNm distinct
Paramyxo : pas segmenté, mais peut faire plusieurs ARNm à partir de plusieurs points d’initiation sur son génome pour faire les diverses protéines.
Discutez des différences entre les Paramyxoviridae et les Orthomyxoviridae concernant le lieu de leur réplication, et la raison pour laquelle ils le font à cet endroit.
Ortho : Partiellement nucléaire, parce qu’ils ne peuvent pas amorcer directement leur synthèse et ont besoin d’amorces. Les amorces qu’ils utilisent sont de courts segments d’ARNm cellulaires contenant la séquence coiffe en 5’.
Paramyxo : exclusivement cytoplasmique, pas besoin d’amorces!
Vrai ou faux. Bunyaviridae a besoin d’amorces et a donc absolument besoin d’une partie de sa réplication dans le noyau.
Faux! Seulement les Orthomyxoviridae utilisent ce mécanisme. Les Bunya ont une enzyme qui leur permet de faire un clivage de ces amorces dans le cytoplasme.
Discutez des différences entre les Paramyxoviridae et les Orthomyxoviridae concernant l’épissage de l’ARNm.
Ortho; épissage
Paramyxo: Pas d’épissage
Quelle est l’importance du génome segmenté d’orthomyxoviridae?
Grande importance dans l’évolution du virus, dans le taux d’évolution. Il y a possibilité d’échanges de segments entre les virus qui co-infectent et cela favorise une évolution rapide du virus et un grand brassage génétique.
Expliquez le mécanisme de réplicition des virus à génome ARN ambisense.
1- La portion négative est transcrite en ARNm + par une polymérase qui était encapsidée avec le génome.
2- Synthèse des protéines virales de la portion négative du départ
3- Le génome peut être répliqué grâce aux protéines virales.
4- Transcription de l’autre partie du génome.
Nommez la famille de virus qui possède un génome d’ARN bicaténaire, et le prototype utilisé pour étudier le mécanisme de réplication.
Réoviridae; orthoreovirus.
