Cours 3- Chapitre 7 à 9 Flashcards

1
Q

Comment nomme-t-on un phage qui lyse toujours la bactérie dans une infection productive qui génère de nouveaux phages?

A

Un phage virulent

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Q

Nommez les 3 types de phages.

A

1- Phage virulent : lyse toujours la cellule dans une infection productive qui lyse la cellule
2- Phage filamenteux : ne lyse pas les cellules ; infection chronique
3- Phages tempérés. Ils établissent un équilibre avec l’hôte et produisent ainsi la lysogénie.

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3
Q

Qu’est ce que la lysogénie?

A

C’est un phénomène par lequel un phage ayant infecté une bactérie ne se multiplie pas immédiatement. Le génome viral est maintenu dans chaque bactérie fille lors de la division cellulaire.

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4
Q

Expliquez ce qui se passe lorsqu’une bactérie sort de son cycle lysogénique.

A

Il arrive dans une certaine proportion de bactérie en culture lysogénique de briser l’état de lysogénie. L’équilibre est brisé, et le cycle lytique est enclenché, ce qui cause la destruction de la bactérie et la relâche des nouveaux virions.

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5
Q

Tu fais une infection avec un phage inconnu sur une bactérie x. Tu obtiens des plages de lyse troubles. Es-tu juste poche, ou que pourraient vouloir dire tes résultats?

A

2 possibilités, par deux mécanismes complètement différents!
1- Ton phage est tempéré, et seulement une parte des bactéries ont lysé et se multiplient.
2- Ton phage est filamenteux, et il ne fait que ralentir la croissance bactérienne, sans toutefois les tuer.

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6
Q

Tu fais une infection avec un phage lytique sur une bactérie x. Tu observes une plage claire, mais autour un petit halo trouble et mal défini. Es-tu sur la drogue dure ou est-ce un phénomène normal? Si c’est normal, expliquez ce qui pourrait expliquer ce phénomène.

A

2 causes possibles :

1- Pourrait être dû à l’infection par plus d’une particule infectieuse non simultanément. Le temps requis pour l’infection par le phénomène d’interférence virale est augmenté.
2- Le phage code pour une grande quantité d’Enzyme codées par le phage et lytique pour l’hôte lorsque synthétisés, comme du lysozyme. La libération et la diffusion de ces enzymes dans la gélose peuvent entraîner la lyse des cellules bactériennes non infectées en périphérie de la plage claire.

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7
Q

Discutez du mécanisme de contrôle de la lyse/lysogénie par la densité de bactéries infectées.

A

Quand la bactérie est infectée par le phage, ce dernier peut traduire certaines protéines de son génome, qui seront sécrétées à l’Extérieur par la bactérie, et capté par les bactéries voisines.
Si la concentration de ce peptide est faible : veux dire que peu de bactéries infectées, et le phage continue à se propager et infecter en lysant des bactéries.
Si la concentration est grande : veut dire que la majorité des cellules bactériennes sont déjà infectées, et la lysogénie sera favorisée. Évite d’épuiser la population bactérienne.

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8
Q

Discutez du mécanisme de contrôle de la lyse/lysogénie par le densité de bactéries.

A

C’est une exploitation du quorum sensing bactérien.
Quand faible concentration de bactéries : Phage reste latent, et produit un répresseur qui l’empêche d’entrer dans son cycle lytique. Protège la population bactérienne peu abondante.
Grande concentration de bactéries : Sécrétion de peptides du quorum par les bactéries permettent de transcrire une protéine anti-répresseur du phage qui bloque le répresseur, et favorise l’entrée en cycle lytique.

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9
Q

Qu’est ce que la transduction?

A

Un phage peut transporter avec lui une partie d’ADN bactérien et permettre à la bactérie infectée d’acquérir un nouveau phénotype.

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10
Q

Expliquez le phénomène de transduction spécialisée

A

C’est observé chez les phages tempérés, qui s’introduisent toujours au même endroit dans le génome. Quand le cycle lytique est engendré, il peut arriver une erreur d’excision du génome et les gènes adjacents peuvent être excisés et transférés à une autre bactérie.

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11
Q

Qu’est ce que la conversion phagique?

A

c’est une forme de transduction, mais on ne connait pas l’origine du gène transduit. Il est différent en composition (% de G-C).

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12
Q

Vrai ou faux. Le gène transporté lors de la conversion phagique a un rôle important à jouer dans le cycle de multiplication du phage.

A

Faux. Il peut avoir des fonctions de pathogénicité pour la bactérie par contre!

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13
Q

Quel type de phage est surtout utilisé pour fabriquer une librairie d’épitope?

A

Phages filamenteux

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14
Q

Nommez les avantages de la thérapie par les phages.

A
  • Très spécifiques
  • Se multiplient
  • Évolution (s’adaptent). Possibilité d’évolution du traitement au fur et à mesure que les bactéries évoluent.
  • Actifs sur les biofilms ; peuvent les traverser au contraire des antibiotiques.
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15
Q

Nommez les désavantages de la thérapie par les phages.

A
  • Spécifiques; il faut savoir la bactérie qui nous infecte, pas de large spectre possible. Si les bactéries résistent, on peut administrer un cocktail de bactériophage.
  • Réponse immunitaire peut réduire l’efficacité du phage à la première utilisation, et bloquer la réponse lors de la deuxième utilisation : Donc ils sont antigéniques/immunogéniques
  • Relâche d’endotoxine possible; la lyse des bactéries peut induire une toxicité chez l’hôte par la libération d’endotoxines bactériennes.
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16
Q

Nommez 3 maladies humaines causées par le Picornaviridae.

A

Poliomyélite, Hépatite A, Rhinovirus (rhume commun).

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17
Q

Nommez une maladie vétérinaire causée par le Picornaviridae. Chez quel animal peut-on la retrouver?

A

Fièvre aphteuse, retrouvée chez les bovins.

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18
Q

Comment peut-on attraper la poliomyélite?

Quels sont les conséquences?

A

Contamination oro-fécale.

Paralysie généralisée ou spécifiques, qui pourraient même nécessiter l’utilisation de respirateurs.

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19
Q

Comment peut-on attraper l’Hépatite A?

A

Contamination oro-fécale.

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20
Q

Vrai ou faux. Si on attrape un rhinovirus avec un certain sérotype, on peut être protégé contre un virus avec un autre sérotype.

A

Faux! Il n’y a pas d’immunité croisée entre les différents sérotypes de ce virus.

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21
Q

Vrai ou faux. Des virus de même famille provoquent des maladies similaires, peut importe l’espèce animale.

A

Faux.

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22
Q

Vrai ou faux. Les Picornaviridae et les Caliciviridae sont apparentés.

A

Vrai.

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23
Q

Nommez un virus humain de la famille des Caliciviridae et la maladie engendrée.

A

Virus de Norwalk : gastroentérites sévères.

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24
Q

Quel effet certains Caliciviridae peuvent avoir chez les chats?

A

Certaines maladies respiratoires; déclencement de réactions inflammatoires qui déclenchent des stomatites chroniques.

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25
Q

Quel est le représentant le plus connu de la famille des Togaviridae?

A

Rubéole.

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26
Q

Nommez les différents virus de la famille des Flaviviridae

A
  • Hépatite C
  • Fièvre jaune
  • Dengue
  • Virus du Nil
  • Virus Zika
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27
Q

De quelle maladie est responsable la fièvre jaune?

A

Infection hépatique souvent mortelle

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28
Q

Comment est transmise l’hépatite C?

A

Par du sang contaminé

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29
Q

De quelles maladies sont responsables les Coronaviridae?

A

Ils sont responsables d’infections respiratoire, et de 20 à 30% des rhumes seraient des infections à Coronavirus.

Elle serait aussi responsable de pneumonies virales, comme le SRAS. La maladie est grave et peut entraîner la mort par l’obstruction des voies respiratoires à cause d’une grosse réaction inflammatoire.

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30
Q

Simon ne peut pas faire….

A

UNE ÉRECTION

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31
Q

Nommez un virus de la famille des Orthomyxoviridae.

A

Le virus de la grippe.

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32
Q

Comment se transmet le virus de la grippe?

A

Par des contacts indirecte avec les individus infectés; notamment par contact avec les microgouttelettes qui viennent de la toux, ou part le contact des mains avec un objet récemment contaminé et contact subséquent des mains avec les muqueuses.

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33
Q

Expliquez l’épidémiologie particulière du virus de la grippe.

A

Le virus se propage des oiseaux sauvages à certains animaux d’élevage, et ensuite à l’humain. L’échange de gènes entre les souches virales entraîne des variations importantes du virus, ce qui mène à des épidémies ou pandémies.

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34
Q

Nommez deux virus de la famille des Paramyxoviridae.

A

Rougeole et Oreillons.

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35
Q

À quel virus ressemble le mode de transmission des paramyxoviridae?

A

Au virus de la grippe

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36
Q

Vrai ou faux. La rougeole et les oreillons sont des maladies bénignes.

A

Faux. Ces maladies causent des séquelles importantes, notamment des séquelles neurologiques dans le cas de la rougeole. Dans les pays en voie de développement, la rougeole tue plusieurs centaines de milliers de personnes chaque année, la majorité étant des enfants.

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37
Q

Vrai ou faux. Aucune maladie vétérinaire n’est causée par les paramyxoviridae.

A

Faux. Il existe des maladies neurologiques causées par ce virus chez les animaux.

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38
Q

La rage fait partie de quelle famille de virus?

A

Les Rhabdoviridae.

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39
Q

Qu’est-ce-que la rage? Comment se contracte-t-elle?

A

Elle se contracte par la morsure d’un animal infecté. C’est une infection du système nerveux qui entraîne la mort lorsque les symptômes se développent.

40
Q

Vrai ou faux. Le temps d’incubation de la rage peut être long.

A

Vrai, surtout si la morsure est mineure et loin du cerveau.

41
Q

Une fois mordu par un animal infecté par la rage, comment peut-on prévenir la mort?

A
  • Vaccin antirabique; doit être administré tôt après la morsure pour éviter l’apparition des symptômes.
  • Dans les cas plus sérieux, injection d’immunoglobulines antivirales.
42
Q

Quel virus fait parte de la famille des Bunyaviridae?

A

Les Hantavirus, ou virus Sin Hombre (sans nom)

43
Q

Quels peuvent être les effets d’une infection par les Bunyaviridae?

A

Elles peuvent attaquer plusieurs organes (multisystémiques) et être mortelles.

44
Q

Nommez un virus de la famille des Filoviridae, ainsi que ses effets.

A

Ebola. C’est une fièvre hémorragique qui s’attaque à plusieurs organes.

45
Q

Quels virus font partie de la familles des Reoviridae, et de quoi sont-ils responsables (quelle pathologie), chez quelle population?

A

Les rotavirus, responsables de la diarrhée sévères principalement chez les jeunes enfants et les jeunes animaux

46
Q

Nommez des virus de la famille des Retroviridae.

A

HTLV-1 (leucémie de type T) et virus de l’immunodéficience humaine (SIDA).

47
Q

Vrai ou faux. Les Retrovirus sont responsables d’immunodéficiences chez plusieurs espèces animales.

A

Vrai.

48
Q

Nommez un virus de la famille de l’Hepadnaviridae, ainsi que son mode de transmission.

A

Hépatite B, transmission sexuelle ou par le sang contaminé.

49
Q

Quelle est la plus sérieuse des Hépatites?

A

Hépatite B.

50
Q

Vrai ou faux. L’infection par le virus de l’hépatite B est seulement aigue.

A

Faux!! Après guérison de l’infection aigue, le virus continue à faire des ravages, puisqu’il serait responsable en grande partie du développement de cirrhose et des cancer du foie.

51
Q

Vrai ou faux. Après avoir contracté l’Hépatite B, le risque d’avoir un cancer du foie augmente de 10x.

A

Vrai.

52
Q

Vrai ou faux. Les papillomes sont dans la familles des Papovaviridae.

A

Faux. Dans la famille des Papilloma viridae.

53
Q

Que cause une infection par les Papilloma viridae?

A

Verrues communes, verrues génitales et verrues plantaires.

54
Q

Les infections génitales chez la femme sont bénignes. Vrai ou faux.

A

Généralement vrai, mais elles peuvent aussi être un facteur impliqué dans le développement du cancer de l’utérus, d’où la vaccination contres certaines souches du virus particulièrement indiquées.

55
Q

Vrai ou faux. Il pourrait exister un lien entre les Papillomaviridae et le cancer du sein.

A

Vrai, encore à l’étude.

56
Q

Que causent les Adenoviridae?

A

ils peuvent causer des infections respiratoires et intestinales de sévérité variables; beaucoup d’humain ont des Ac contre ces virus qui indiquent une exposition précédente au virus.
Ils peuvent aussi être la cause de conjonctivites très contagieuses localisées au niveau des deux yeux à la fois.

57
Q

Nommez différents virus de la famille des Herpesviridae.

A
  • Herpès génital
  • Herpès labial (feux sauvages)
  • Varicelle/zona
  • Roséole
  • Sarcome de Kaposi
58
Q

Vrai ou faux. La varicelle et le zona sont produites par 2 virus différents.

A

Faux! C’est le même virus qui s’est réactivé, étant resté latent chez l’individu en question au niveau des terminaisons nerveuses.

59
Q

Quel type d’individus sont souvent atteint par le cancer du sarcome de Kaposi?

A

Les individus étaient atteints par le VIH

60
Q

Nommez 3 virus de la famille des Poxviridae

A
  • Variole
  • Vaccine
  • Myxomatose
61
Q

Vrai ou faux. Au courant de l’évolution, c’est la capacité de rendre les humains malades qui a été sélectionné pour l’évolution des virus.

A

Faux! C’est la capacité à se transmettre et se multiplier.

62
Q

Nommez des symptômes qui peuvent encourager la propagation des virus et qui ont un plan avantageux sur le plan évolutif.

A

Toux, diarrhée, même le changement comportemental des animaux atteints de la rage qui pousse l’animal a mordre.

63
Q

Dans quelles situations peut-on parler de virus émergents?

A

1) Apparition d’un virus apparemment nouveau
2) Réapparition d’un virus au sein d’une population où il n’était plus observé
3) Apparition d’un virus connu, mais dans une nouvelle distribution géographique.

64
Q

D’où peuvent provenir les virus émergents?

A

1) D’un virus totalement nouveau chez l’humain, mais qui existait chez une espèces animale, souvent sans qu’il soit connu
2) Virus modifié (mutation, recombinaison, échange de gènes)
3) Combinaison de ces deux situations, donc un virus ayant muté et étant devenu infectieux et pathogène chez l’humain.

65
Q

Nommez deux raisons pourquoi un virus pourrait traverser la barrière d’espèces

A
  • Adaptation du virus à infecter grâce à un récepteur cellulaire présent chez une autre espèce que son hôte habituel
  • Adaptation du virus à se multiplier dans un environnement cellulaire différent.
66
Q

Vrai ou faux. Une certaine densité de population est nécessaire à l’apparition et au maintien dans la population de certaines maladies.

A

Vrai. 1 personne infectée doit le transmettre à au moins 1 autre humain pour le maintien du virus dans la population.

67
Q

Expliquez le cycle épidémiologique de la transmission interhumaine stricte, et donnez un exemple.

A

C’est de la transmission virale entre individus de la même espèce, sans autre intermédiaire. Il n’y a pas de réservoir animal.
Exemple ; variole.

68
Q

Qu’est ce qu’un arbovirus?

A

C’est un virus qui a l’arthropode comme vecteur.

69
Q

Expliquez brièvement le cycle épidémiologique de la fièvre jaune.

A

Le virus circule chez un réservoir animal (primates) par l’intermédiaire d’un arthropode, et peut être transmis à l’humain par ce même vecteur. La transmission d’humain à humain par le vecteur est aussi possible.

70
Q

Vrai ou faux. Dans un réservoir animal, les animaux infectées développent automatiquement la maladie.

A

Faux.

71
Q

Pourquoi les chauves-souris sont-ils de bons réservoir de virus?

A
  • Se tiennent en coloniies; favoriisent la transmission
  • Mammifères; proche de l’humain
  • Se déplacent sur de grandes distances
  • Résistantes à de nombreux virus.
72
Q

Vrai ou faux. Les Phages filamenteux sont incapables de faire une infection productives puisqu’ils ne produisent pas la lyse de la bactérie.

A

C’est faux. Malgré cela, ils peuvent tout de même produire des virions infectieux et ainsi produire une infection productive et même chronique.

73
Q

Vrai ou faux. Lors de la lysogénie, si la bactérie se divise, le génome viral sera retiré du génome bactérien et sera alors perdu.

A

Faux . Il est retenu dans chaque bactérie fille.

74
Q

Qu’est ce qui pourrait enclencher le cycle lytique chez un phage lysogénique incorporé dans le génome bactérien?

A
  • Les UV
  • L’appauvrissement du milieu de culture
  • Agents chimiques
75
Q

Le phage Mu (Myoviridae) peut-il faire de la transduction généralisée ou spécialisée?

A

Généralisée. L’ADN bactérien flanqué de chaque côté de son génome peut provenir de différentes régions du génome bactérien.

76
Q

Donnez un exemple de transduction spécialisée et expliquez le.

A

Dans le cas d’un phage tempéré comme Lambda, il peut s’intégrer à un endroit spécifique dans le génome bactérien. Dans le cas où il s’exciserait d’une manière non-précise, il pourrait éventuellement apporter avec lui des gènes voisins. Le nombre de gènes transduit est alors restreint.

77
Q

Qu’est ce que des séquences phagiques endogènes?

A

Certains phages se sont intégrés de manière permanente aux génomes de certaines bactéries au fil de l’évolution, et ne peuvent plus faire d’excision. Ça pourrait contribuer à la résistance bactérienne à certains phages.

78
Q

Vrai ou faux. Les phages sont essentiels au maintien de l’équilibre écologique de la biosphère.

A

Vrai.

79
Q

Expliquez le processus de clonage avec le phage lambda.

A

La partie du génome non-essentielle à la multiplication virale dans un cycle lytique, soit les gènes de lysogénie, sont retirés et remplacés par des séquences exogènes qui seront propagés avec le génome viral. Ces vecteurs lambda sont donc strictement lytique, et produisent des plages claires.
L’encapsidation se fait par un mécanisme spécifique dans lequel les concatémères sont reconnus par une protéine virale.

80
Q

Expliquez les deux méthodes de criblage faites à partir du phage lambda.

A

1- Identification de clones par leur homologie à une séquence nucléotidique. Réplique sur membrane de nitrocellulose, et transfert de matériel contenu sur la plage. Hybridation moléculaire d’un fragment d’ADN marqué, et reconnaissance des plages qui ont la séquence complémentaires. Les plages positives sont récupérés et les phages multipliés.

2- Dans le deuxième cas, on peut identifier les clones par production de protéines contre laquelle on dispose d’un Ac. Il y a aussi réplication sur membrane de nitrocellulose. On peut coupler l’Ac à un enzyme détectable par son activité et détecter les plages positives, exprimées uniquement chez les patients atteints d’une maladie par exemple.

81
Q

Quelle caractéristique du phage T7 est utilisée en biologie moléculaire? De quelles manières peut-on l’utiliser?

A

Le génome du phage T7 possède une pol ARN très active et très spécifique pour la reconnaissance du promoteur viral tardive.

On peut l’utiliser avec transcription in vitro et vecteurs d’expression

82
Q

Expliquez comment on peut utiliser la polymérase ARN du phage T7 pour faire de la transcription in vitro.

A

En utilisant le promoteur et la polymérase ARN puissante du phage T7, qui est en plus très spécifique, on peut transcrire un gène cloné placé après le promoteur induit dans un plasmide et ainsi produire beaucoup d’ADN. La transcription se termine par un clivage du plasmide par une enzyme de restriction.

83
Q

Expliquez comment on peut utiliser le phage T7 pour faire des vecteurs d’expression?

A

Dans ce cas, on veut produire in vivo des protéines en grande quantité, à partir d’un gène cloné correspondant.
On met alors le gène codant pour la polymérase ARN de T7 sous le contrôle d’un promoteur inductible, comme lac. En présence de lactose, la polymérase sera traduite, et pourra aller transcrire également le gène du vecteur sous le contrôle du promoteur T7, avec une séquence de termination T7. Il y a alors régulation de l’expression de protéines, et facilitation de l’expression de protéines toxiques pouvant nuire à la croissance bactérienne.

84
Q

Expliquez l’évolution in vitro, qui a valu le prix Nobel de Chimie en 2018.

A

On peut faire évolution une séquence dans un tube à essai.
L’information génétique codant pour un Ac et sa région de fixation à un Ag est introduit dans une collection de phages filamenteux. On sélectionne ensuite les phages qui interagissent avec la molécule d’intérêt. On peut faire plusieurs rondes et introduire des mutations aléatoires pour augmenter l’affinité.

Au bout du compte, utilisation thérapeutiques!

85
Q

Qu’est ce qu’une maladie virale aigue?

A

Elle se développe rapidement suite à l’infection, mais se résorbe ensuite, à moins de la mort de l’individu.

86
Q

Vrai ou faux. Certaines maladies chroniques pourraient avoir une composante virale.

A

Vrai.

87
Q

Qu’arrive-t-il si la réponse du système est mal contrôlée durant l’infection virale?

A

Il peut y avoir de l’inflammation ou même de l’auto-immunité.

88
Q

Vrai ou faux. La rubéole est une maladie relativement peu sérieuse.

A

Vrai et faux. C’est vrai chez les enfants, mais chez les femmes enceinte, s’il y a infection intra-utérine, ça pourrait mener à des malformations congénitales et des avortements.

89
Q

Vrai ou faux. Un vaccin a contribué a diminuer les risques de transmission du virus de l’Hépatite C.

A

Faux, on a pas de vaccin. C’est plutôt le dépistage dans les stocks sanguins.

90
Q

Vrai ou faux. Un virus émergent est un nouveau virus.

A

Faux! Ça peut être l’apparition d’un virus apparemment nouveau, mais aussi la réapparition d’un virus où il n’était plus observé, ou l’apparition d’un virus connu dans une nouvelle distribution géographique.

91
Q

Pourquoi la déforestation et la colonisation de nouveaux milieux géographiques pourraient contribuer à l’apparition de nouvelles maladies?

A

Car on pourrait entrer en contact avec de nouvelles espèces animales, ou insectes. Si ces derniers ont des virus qui possèdent un récepteur chez l’humain, il pourrait y avoir transmission et développement d’un nouveau virus chez l’humain.

92
Q

Vrai ou faux. Les virus les plus anciens sont souvent les plus pathogènes. Expliquez pourquoi.

A

Vrai! Surement à cause d’une co-évolution entre le virus et son hôte. Il y a souvent un avantage pour le virus que l’hôte survive, car il peut se propager d’un individu à l’autre.

93
Q

J’ai une maladie qui se transmet par l’intermédiaire d’un arbovirus (Ex; Zika). Je tousse dans la face de mon ami par erreur. Est-ce qu’il va l’attraper?

A

Non! Mais plz fait attention t crissement pas propre

94
Q

Quel virus nécessite la présence d’un hôte amplificateur? Pourquoi?

A

Le virus du Nil. Il peut se propager à l’humain par piqures d’insectes, mais difficilement transmissible d’un humain à l’autre à cause de la faible quantité de virus. Les oiseaux eux peuvent porter beaucoup de virus, et sont donc des hôtes amplificateurs.

95
Q

Discutez du cycle épidémiologie de l’Hantavirus.

A

Il circule chez la souris de manière intraspécifique, mais il peut arriver occasionnellement qu’il se transmette à l’humain et cause l’apparition de nouveaux virus. Une transmission d’humain à humain pourrait être possible si le virus s’adapte adéquatement.