Cours 4 Flashcards
Qu’est-ce qu’une protéine?
Une chaîne polypeptidique (=assemble d’acide aminés, qui sont l’unité de base = monomère)
De quoi sont composés des acides aminés?
5 parties donc 4 communes à tous les a.a
- un atome de carbone au cœur lié à quatre différents groupes qui rendent la molécule asymétrique :
- un grpement amine NH2
- un groupement carboxyle COOH opposé à l’amine
- un atome d’hydrogène H
- une chaîne latérale ou radicale R opposé à l’hydrogène. Différents pour chaque a.a = propriétés différentes
Quels sont les principaux a.a composant les protéines?
Il en existe environ 500 mais 20 utilisés pour les prot :
- alanine
- arginine
- asparagine
- cystéine (+ 1 variante)
- glutamate
- glutamine
- glycine
- histidine
- isoleucine
- leucine
- lysine
- méthionine
- phénylalanine
- proline
- sérine
- thréonine
- tryptophane
- tyrosine
- valine
Que sont les a.a essentiels?
9 a.a qui ne sont pas synthétisés suffisamment par l’organisme.
- histidine
- isoleucine
- leucine
- lysine
- méthionine
- phénylalanine
- thréonine
- tryptophane
- valine
Quels sont les a.a peuvent être acides?
= chargés négativement COO-
- aspartate
- glutamate
En quoi les a.a peuvent être basiques?
= chargés positivement avec NH3+
Comment les chaînes polypeptidiques se forment-elles?
par condensation :
-COOH perd le OH
- NH2 perd un H
Donc une molécule H2O de libérée
donc liaison covalente entre CO et N = liaison peptidique
catalysée par peptidyltransférase
La chaîne est forcément polaire avec un NH2 à l’extrémité gauche et un COOH à droite
Qu’est-ce qu’une structure quaternaire?
Une protéine composée de plus d’une chaîne polypeptidique (domaines)
Donnez un exemple de pathologie liée à une substitution d’a.a?
substitution du 6e a.a glutamate remplacé par valine (polaire à non polaire)
cause la dépranocytose
Comment sont formées les conformations secondaires?
Par des liaisons hydrogène entre le H du NH2(qui a perdu un H) et le résidu O du carboxyle COOH (qui a perdu un OH)
Sont très nombreuses et apportent de la stabilité à la protéine.
Forment des structures hélicoïdales et des feuillets
Comment se font les hélices alpha? leurs caractéristiques?
Liaison H tous les 4 résidus d’a.a
Structure résistance, insoluble, dureté et flexibilité variable
ex: alpha-kératine des cheveux vs ongles
Comment se font les feuillets plissés beta et leurs caractéristiques?
séquences d’a.a disposés côte à côte de façon parallèle ou anti-parallèle.
Liaisons H, donne une forme d’accordéon
stabilise la molécule
filaments mous et flexibles
ex: beta-kératine des toiles d’araignées
Comment se font les structures tertiaires?
Liaisons H, liaisons ioniques, liaisons covalentes entre les chaines latérales de deux résidus.
Liaisons covalentes se font par des ponts disulfides S-S entres deux cystéines
Qu’est-ce que la dénaturation?
Perte + ou - réversible de la structure tertiaire d’une protéine.
causé par
- chaleur
- urée
- métaux lourds
- fixateurs…
V/F la structure quaternaire se fait par des liaisons covalentes
faux, par des liaisons H