Cours 3 - SAB-D Protéines Flashcards

1
Q

Nom donné à la forme prédominante d’un AA à pH 7

A

Zwiterion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Nommer les 2 AA négatifs (à pH 7)

A

Acide aspartique

Acide Glutamique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Nommer les 3 AA basiques (à pH 7)

A

Histidine
Arginine
Lysine

(HAL)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Nommer les 5 AA polaires non-chargés (à pH 7)

A
Serine
Asparagine
Glutamine
Threonine
Tyrosine

(SAG TT)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Nommer les 4 AA aromatiques

A

H: Histidine
F: Phenylalanine
Y: Tyrosine
W: Tryptophane

(HP TT)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Nommer l’AA iminé

A

PROLINE

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Nommer tous les AA aliphatiques

A

Tous ceux que tas pas appris :)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quel AA est le premier dans la synthèse de toutes les protéines

A

Méthionine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Nommer les 2 AA non-polaire et hydrophile?

A

La glycine et la cystéine

GC

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Nommer l’AA polaire non-chargée et hydrophobe?

A

Tyrosine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Nommer les AA essentiels (10)

A
Histidine
Isoleucine
Leucine
Lysine
métionine
phénylalanine
tryptophane
thréonine
valine
Arginine (converti en urée rapidement)

HILLMPTTVA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Nommer les 2 AA semi-essentiels ainsi que le AA qu’ils pourraient remplacer

A

Cystéine –> méthionine

Tyrosine –> phénylalanine

CM
TP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quel est l’AA essentiel pour l’enfant

A

Histidine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Quel AA essentiel est produit par l’humain, mais converti rapidement en urée

A

Arginine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Quel est le seul AA nonchiral

A

Glycine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Un AA qui dévie la lumière vers la droite est:

Un AA qui dévie la lumière vers la gauche est:

A

Un AA qui dévie la lumière vers la droite est: dextrogyre

Un AA qui dévie la lumière vers la gauche est: levrogyre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Chiralité de TOUS les AA dans la nature

A

Levrogyres

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Nombre d’isomère du même AA qui peut être obtenu en laboratoire

A

4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

2 molécules pouvant être utilisées pour synthétiser de l’arginine

A

Citrulline + ornithine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Décrire pK1 et pK2 (pour un AA simple comme la glycine)

A

pK1: point tampon où le groupement COOH commence à donner son H

pK2: point tampon où le groupement amine commence à donner son H

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Donner le pI si pK1=3 et pK2=9

A

pI=6

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Décrire pKR

Pour quel type d’AA peut on calculer le pKr

A

Point tampon où le groupement R commence à donner son hydrogène; peut être calculé pour un AA basique/acide comme l’histidine

23
Q

Nommer les 5 facteurs qui déterminent l’architecture 3-D des protéines

A
La rigidité du lien peptidique
Liaisons électrostatiques
Interactions de Van der Waals
Ponts disulfures
Liaisons hydrogènes

PÉV DiH

24
Q

Quel est le lien principal pour former les protéines?

A

Le lien peptidique

25
Q

À quel endroit d’un AA commence une protéine?

A

Au point N-terminal

26
Q

Une liaison entre 2 AA occasionne une perte de…

A

Eau

27
Q

2 cystéines ensemble forment…

A

Une cystine

28
Q

Quel lien est plus stable: lien peptidique ou disulfure?

A

Peptidique

29
Q

Pourquoi l’éthanol bout plus vite que l’eau, malgré son poids moléculaire beaucoup plus élevé que l’eau

A

L’eau possède beaucoup de ponts-H, ce qui augmente grandement son point d’ébullition

30
Q

Nombre de résidus (AA) par tour dans une hélice alpha

A

3,6

31
Q

Où se situent les groupement R des AA d’une hélice alpha?

A

À l’Extérieur de l’hélice

32
Q

Myoglobine contient seulement des…

A

hélices alpha

33
Q

Quel feuillet plissé béta est le plus stable et pk?

A

Antiparallèle, car il y a possibilité de formation de ponts H entre les protéines

34
Q

Qu’est-ce qui relie les feuillets bétas antiparallèle entre eux?

A

Des coudes bétas

35
Q

Quelle est l’utilité de coudes béta?

A

Permettent aux chaîne polypeptidiques de changer de direction

36
Q

Concanavaline A ne contient aucun de…

A

Hélices alpha

37
Q

Enzyme contenant tous les 3 motifs structuraux:

A

Anhydrase carbonique

38
Q

Quel AA se trouvent TRÈS SOUVENT dans les coudes bétas?

Et pk?

A

La proline

Car c’est un AA imminé et cela donne beaucoup de rigidité au coude

39
Q

Quelle protéine est essentielle à la vision?

A

La rhodopsine

40
Q

Dans le noir, les bâtonnets (yeux) sont…

A

Dépolarisés

Donc cela ouvre les canaux Na et beaucoup de transmetteurs sont relâchés pour nous permettre de voir

41
Q

Une molécule de rhodopsine peut absorber combien de photons?

A

Un photon

42
Q

Décrire la cascade causés par l’absorption de photons par les rhodopsines

A

Un photon cause

500 transductines
500 phosphodiestérases
10^5 GMPc SONT DÉGRADÉS
250 canaux sodiques SE FERMENT
Bâton est hyperpolarisé de 1 mV

are you Really TRully Perfectly Good? Nah.. but im HYPE

43
Q

La rhodopsine est le résultat de la liaison de:

A

opsine et rétinal (vit A)

44
Q

Quelle molécule garde les canaux sodiques ouverts dans les bâtonnets?

A

Le GMPc

45
Q

Quel est l’effet du photon sur la rodhopsine?

A

Fait basculer sa position de cis à TRANS

46
Q

C’est quoi une thalassémie?

A

Déficit QUANTITATIF d’une chaîne d’hémoglobine (alpha ou béta)

47
Q

C’est quoi une hémoglobinose?

A

Déficit QUALITATIF d’une chaîne d’hémoglobine

48
Q

La drépanocytose est…

A

Une hémoglobinose

aka anémie falciforme

49
Q

La drépanocytose est causée par:

A

L’acide glutamique en position 6 est remplacé par une valine

50
Q

Quel type de sujets de drépanocytose observent une mort prématurée?

A

les sujets homozygotes

51
Q

Quelle est la protéine qui cause une dégénérescence du système nerveux central?

A

Prion

52
Q

Comment agit un prion?

A

Change la conformation de la protéine PrPc, ce qui lui donne un résistance accrue aux protéases

53
Q

V ou F

Un prion est dégradé à l’autoclave

A

Faux