Cours 3 - SAB-D Protéines Flashcards
Nom donné à la forme prédominante d’un AA à pH 7
Zwiterion
Nommer les 2 AA négatifs (à pH 7)
Acide aspartique
Acide Glutamique
Nommer les 3 AA basiques (à pH 7)
Histidine
Arginine
Lysine
(HAL)
Nommer les 5 AA polaires non-chargés (à pH 7)
Serine Asparagine Glutamine Threonine Tyrosine
(SAG TT)
Nommer les 4 AA aromatiques
H: Histidine
F: Phenylalanine
Y: Tyrosine
W: Tryptophane
(HP TT)
Nommer l’AA iminé
PROLINE
Nommer tous les AA aliphatiques
Tous ceux que tas pas appris :)
Quel AA est le premier dans la synthèse de toutes les protéines
Méthionine
Nommer les 2 AA non-polaire et hydrophile?
La glycine et la cystéine
GC
Nommer l’AA polaire non-chargée et hydrophobe?
Tyrosine
Nommer les AA essentiels (10)
Histidine Isoleucine Leucine Lysine métionine phénylalanine tryptophane thréonine valine Arginine (converti en urée rapidement)
HILLMPTTVA
Nommer les 2 AA semi-essentiels ainsi que le AA qu’ils pourraient remplacer
Cystéine –> méthionine
Tyrosine –> phénylalanine
CM
TP
Quel est l’AA essentiel pour l’enfant
Histidine
Quel AA essentiel est produit par l’humain, mais converti rapidement en urée
Arginine
Quel est le seul AA nonchiral
Glycine
Un AA qui dévie la lumière vers la droite est:
Un AA qui dévie la lumière vers la gauche est:
Un AA qui dévie la lumière vers la droite est: dextrogyre
Un AA qui dévie la lumière vers la gauche est: levrogyre
Chiralité de TOUS les AA dans la nature
Levrogyres
Nombre d’isomère du même AA qui peut être obtenu en laboratoire
4
2 molécules pouvant être utilisées pour synthétiser de l’arginine
Citrulline + ornithine
Décrire pK1 et pK2 (pour un AA simple comme la glycine)
pK1: point tampon où le groupement COOH commence à donner son H
pK2: point tampon où le groupement amine commence à donner son H
Donner le pI si pK1=3 et pK2=9
pI=6
Décrire pKR
Pour quel type d’AA peut on calculer le pKr
Point tampon où le groupement R commence à donner son hydrogène; peut être calculé pour un AA basique/acide comme l’histidine
Nommer les 5 facteurs qui déterminent l’architecture 3-D des protéines
La rigidité du lien peptidique Liaisons électrostatiques Interactions de Van der Waals Ponts disulfures Liaisons hydrogènes
PÉV DiH
Quel est le lien principal pour former les protéines?
Le lien peptidique
À quel endroit d’un AA commence une protéine?
Au point N-terminal
Une liaison entre 2 AA occasionne une perte de…
Eau
2 cystéines ensemble forment…
Une cystine
Quel lien est plus stable: lien peptidique ou disulfure?
Peptidique
Pourquoi l’éthanol bout plus vite que l’eau, malgré son poids moléculaire beaucoup plus élevé que l’eau
L’eau possède beaucoup de ponts-H, ce qui augmente grandement son point d’ébullition
Nombre de résidus (AA) par tour dans une hélice alpha
3,6
Où se situent les groupement R des AA d’une hélice alpha?
À l’Extérieur de l’hélice
Myoglobine contient seulement des…
hélices alpha
Quel feuillet plissé béta est le plus stable et pk?
Antiparallèle, car il y a possibilité de formation de ponts H entre les protéines
Qu’est-ce qui relie les feuillets bétas antiparallèle entre eux?
Des coudes bétas
Quelle est l’utilité de coudes béta?
Permettent aux chaîne polypeptidiques de changer de direction
Concanavaline A ne contient aucun de…
Hélices alpha
Enzyme contenant tous les 3 motifs structuraux:
Anhydrase carbonique
Quel AA se trouvent TRÈS SOUVENT dans les coudes bétas?
Et pk?
La proline
Car c’est un AA imminé et cela donne beaucoup de rigidité au coude
Quelle protéine est essentielle à la vision?
La rhodopsine
Dans le noir, les bâtonnets (yeux) sont…
Dépolarisés
Donc cela ouvre les canaux Na et beaucoup de transmetteurs sont relâchés pour nous permettre de voir
Une molécule de rhodopsine peut absorber combien de photons?
Un photon
Décrire la cascade causés par l’absorption de photons par les rhodopsines
Un photon cause
500 transductines 500 phosphodiestérases 10^5 GMPc SONT DÉGRADÉS 250 canaux sodiques SE FERMENT Bâton est hyperpolarisé de 1 mV
are you Really TRully Perfectly Good? Nah.. but im HYPE
La rhodopsine est le résultat de la liaison de:
opsine et rétinal (vit A)
Quelle molécule garde les canaux sodiques ouverts dans les bâtonnets?
Le GMPc
Quel est l’effet du photon sur la rodhopsine?
Fait basculer sa position de cis à TRANS
C’est quoi une thalassémie?
Déficit QUANTITATIF d’une chaîne d’hémoglobine (alpha ou béta)
C’est quoi une hémoglobinose?
Déficit QUALITATIF d’une chaîne d’hémoglobine
La drépanocytose est…
Une hémoglobinose
aka anémie falciforme
La drépanocytose est causée par:
L’acide glutamique en position 6 est remplacé par une valine
Quel type de sujets de drépanocytose observent une mort prématurée?
les sujets homozygotes
Quelle est la protéine qui cause une dégénérescence du système nerveux central?
Prion
Comment agit un prion?
Change la conformation de la protéine PrPc, ce qui lui donne un résistance accrue aux protéases
V ou F
Un prion est dégradé à l’autoclave
Faux
