Cours 3 - Classification et taxonomie

Question 1

Qu’est-ce que la taxonomie?

Answer 1

Science de la classification des formes de vie. Se base sur des caractéristiques communes partagées entre les organismes pour les définir et les regrouper en taxons.

Question 2

À quoi sert la classification taxonomique des organismes?

Answer 2

• Regrouper les organismes qui sont similaires
• Identifier des organismes déjà classés
• Établir des critères d’identification de nouvelles espèces et les nommer
• Obtenir de l’information sur la proximité évolutive des organismes

Question 3

Qu’est-ce que le système de Woese?

Answer 3

• Suggère les domaines (supérieurs aux règnes)
• Étudie les archées; conclut que les eucaryotes sont évolutivement éloignés des procaryotes et que les archées sont plus près évolutivement des eucaryotes.
• Système fondé sur l’hypothèse que les êtres vivants descendent d’un ancêtre commun qui a vu le jour il y a 3,5 milliards d’années.

Question 4

Que sont les 3 domaines de Woese?

Answer 4

• Archées (pas de peptidoglycanes dans sa paroi cellulaire)
• Bactéries (contient du peptidoglycane dans sa paroi cellulaire)
• Eucaryotes (paroi cellulaire contient des glucides)
  [Virus sont exclus des domaines]

Question 5

Quelles sont les observations pouvant infirmer la théorie de l’évolution par endosymbiose?

Answer 5

• Mitochondries et chloroplastes ont la même taille que les bactéries
• Ils ont de l’ADN circulaire qui code pour des protéines suivant un processus comme chez les bactéries
• Leurs séquences d’ARNr sont semblables au domaine des bactéries
• Ils ont des ribosomes 70s (vs 80s pour les eucaryotes)
• Leur synthèse protéique est inhibée par la streptomycine (antibiotique)
• Ils se divisent par fission binaire indépendamment de la cellule
• Ils ont une double membrane comme les bactéries à Gram négatif
• Les chloroplastes ressemblent particulièrement aux cyanobactéries qui font de la photosynthèse

Question 6

Comment bien écrire le nom d’un organisme?

Answer 6

Genre et espèce (nomenclature binomiale)
- Genre prend toujours une majuscule
- Espèce est toujours toute en minuscule
- Écrit en italique ou souligné

Question 7

Quelle est la différence entre classification et identification?

Answer 7

• Classification = plusieurs caractéristiques à déterminer (source/habitat, composition paroi, besoins en O2, épreuves biochimiques, etc.). Modèle de classification préétabli
• Identification = technique la plus rapide possible

Question 8

Quelles sont les différentes méthodes de classification et d’identification? (8)

Answer 8

1. Caractères morphologiques (étude des bactéries individuelles d’une culture pure. Utilisation de la microscopie pour trouver forme, taille, groupements, structure, etc. Pas suffisant pour une identification formelle)
2. Caractères tinctoriaux (utilisation de colorants pour faire ressortir des particularités. Colorations différentielles de Gram ou d’acido-alcoolo-résistance. Résultats en fonction de la composition chimique dans la paroi)
3. Épreuves biochimiques (tests faisant ressortir la présence d’enzymes spécifiques chez les bactéries. Ex; test de fermentation des sucre, de l’oxydase, de la catalase, etc.)
4. Épreuves sérologiques (permet de différencier des souches. Sérologie = étudie le sérum sanguin et les réponses immunitaires (présence d’anticorps). Met en évidence les antigènes bactériens comme flagelles, lipopolysaccharides, capsules, etc.)
5. Lysotypie (analyse des bactériophages capables d’infecter une bactérie. Bactériophages sont très spécifiques. Utilisé principalement en épidémiologie)
6. Méthodes traditionnelles (1 à 5) en combinaison
7. Composition des bases de l’ADN (méthode moléculaire. Évaluation de la teneur en G+C de l’ADN. Proximité d’évolution en fonction de la différence entre les %. Cette donnée ne peut être interprétée seule)
8. Séquençage de l’ARNr (méthode moléculaire. Présent dans toutes les cellules de microorganismes. Peu de variation temporelle. Analyse possible sans faire croître les microorganismes)