Cours 3

Question 1

qu,est ce qu’a pu démontrer l’étude des jumeaux

comment on démontre variabilité interindividuelle

comment on démontre variabilité intraindividuelle

Answer 1

1) preuve la plus convaincante que les facteurs génétiques joue un role dans le metabolisme du med

2) meme dose de med donné à différents intervalles à un groupe de patient

3)réponse observée sur une meme personne suite à la prise du meme med à des temps différents
INDIQUE INFLUENCE DE L’ENVIRONNEMENT SUR LA VARIABILITÉ DE LA REP THERAPEUTIQUE

Question 2

COMMENT calculer la magnitude de l’effet de la composante génétique sur la réponse

Answer 2

comparaison stat des variations intraindividuelles et des variations interindividuelles

Question 3

CYP2D6, NAT2 et TPMT sont des enzymes qui sont exprimées ou?

Answer 3

principalement le foie

Question 4

ou est ce quon peut avoir expression de dautres DME (drug metabolising enzyme)

Answer 4

intestin, rein, hématoencéphale

Question 5

Gènes candidats:

est ce que le transport du med est un processus qui influence l’effet du med

Est ce que les gènes qui codent pour les recepteurs cibles du med ont un influence sur son effet

est ce que les gènes codant les DME ont un influence sur l’effet du med

Answer 5

oui

oui

oui

Question 6

quels gènes influencent l’abso, la distri, le métabolisme et l’excrétion (pharmacocinétique)

Answer 6

les gènes codant des DME des transporteurs

Question 7

lors de l’admin de MTX (metotrexate) explique les voies importantes et le concept général a en retenir

Answer 7

MTX inhibe directement la DHFR (dihydrofolate réductase) permettant la synthèse du 5-10 méthylène THF

MTX inhibe indirectement (après métabolisation par dautres enzymes) la TS (thymidilate synthase)

le role de la TS est de changer le 5-10-methylene-THF en purines

des facteurs de transcription controle également la formation de DHFR et de TS

À retenir: un med peut agir sur plusieurs cibles qui controles plusieurs voies, bref complexité +++

Question 8

les génes codant pour la cible (récepteurs) du med controle les propriété pharmacocinétique ou pharmacodynamique

Answer 8

pharmacodynamique

Question 9

donne des exemples de génes codants pour les enzymes métabolisantes ou des transporteurs (influence donc la pharmacocinétique)

Answer 9

CYP2C19 (E)
CyP2D6 (E)
NAT2 (E)
TPMT (E)
ABCB1(T)

Question 10

le gène ABCB1 code pour une prot membranaire impliquée dans le … de nombreux med de … de la cellule vers … de la cellule.

OU est-il exprimé
qu’est ce que ca influence

Answer 10

le gène ABCA1 code pour une prot membranaire impliquée dans le transport de nombreux med de l’intérieur de la cellule vers l’extérieur de la cellule

exprimé dans différents tissus: cell intestinales, lymphocytes, foie, et autres

dans différents tissus ca influence différement la réponse thérapeutique

Question 11

donne des exemples de génes codants pour les cibles des med (enzymes ou récepteurs) (influence donc la pharmacodynamique)

Answer 11

ADRB1 (recepteurs)
ADRB2 (recepteurs)
TYMS (enzyme inhibé par MTX)
DHFR (mm chose)
TS (mmchose indirectement )

Question 12

les gènes qui codent pour des recepteurs adrenergiques (ADRB1,ADRB2) ont des polymorphisme qui ont été associés avec la reponse des … dans le traitement de …

Answer 12

agonistes adrénergiques b2

asthme

Question 13

un polymorphisme de quel gène pourrait influencer la susceptibilité au développement de la maladie d’Alzheimer

Answer 13

APOE (apolipoprotéine E)

Question 14

types de mutation possibles

Answer 14

Question 15

défini mutation de:
transition
transversion
faux sens
non sens
neutre
mutation silencieuse
mutation du cadre de lecture

Answer 15

1) purine reste purine pyrimidine reste pyri
2)purine devient pyrimidine ou inverse
3)acide aminé change
4)acide aminé codon stop
5) acide aminè change mais reste similaire
6)acide aminé change pas
7)insertion ou délétion qui cause un changement du cadre de lecture

Question 16

interactions possible avec facteur de transcription si mutation sur le promoteur (zone régulatrice) d’un gène

Answer 16

aucun changement
augmentation de la liason= plus de prot
diminution de la liaiosn = moins de prot
aucune liaison=pas de prot
Liaison par un autre promoteur = pas de prot

Question 17

Les SNPs fonctionnels sont particulièrement importants parce qu’ils modifient …. des produits du gène et peuvent ainsi affecter …. la réponse au traitement.

Autrement dit, s’il y a une association entre un SNP fonctionnels donné et la réponse au médicament, il y a une grande probabilité que cette variante génétique soit la …. .

Answer 17

la qualité ou la qté

directement

variante causale

Question 18

explique ce qu’est un haplotype

explique ce la notion de déséquilibre de liaison allélique

Answer 18

Un groupe d’allèles de plusieurs SNP rapprochés dans une région d’un chromosome se nomme haplotype

Les SNPs rapprochés ont tendance à être hérités ensemble.
(déséquilibre de liaison-l’association entre deux allèles)

les haplotypes sont donc des SNP d’un meme chromo hérité ensemble

le nombre de combinaison des allèles des SNPs observés est bcp plus petit que le nombre théorique

Question 19

S’il n’existe pas d’information sur la fonctionnalité des variantes dans le gène étudié, deux approches basées sur l’analyse des gènes CANDIDATS pourraient être utilisées pour représenter des variations (choix des polymorphismes à l’étude) :

Answer 19

méthode 1)
l’approche basé sur la séquence du gène candidat :

Les SNPs potentiellement fonctionnels (localisés dans la région de signification fonctionnelle potentielle)

Méthode 2) l’approche se basant sur la cartographie :
Le modèle de déséquilibre de liaison (en regardant les tagSNps on peut savoir ce qu’il y a dans la région)

Question 20

pour le choix du polymorphisme étudié de notre étude pharmacogénétique, on peut utiliser une technique Afin d’obtenir un aperçu beaucoup plus large de l’implication des différents gènes dans la réponse thérapeutique, laquelle

Answer 20

dépistage génomique (GWAS)
dépistage du génome entier

Question 21

si on est capable de déterminer des groupes d’haplotypes populationnels grace au déséquilibre de liaison, quest ce quon va venir analyser plus en détail apres

Answer 21

on analyse l’intervalle associé et les variants causales potentiels (ex: on analyse et on voit que l’haplotype des gens malade n’ont pas le meme allèle précis que les gens de leur haplotype, ca pourrait etre un snp mutant causal)

Question 22

les données phénotypiques utilisées dans les études pharmacogen

Answer 22

données pharmacologiques ( dose du med, niveau du med, métabolites dans utine, plasma et dans cell cibles )

données cliniques

ex: efficacité du med pour variété de paramètres spécifiques pour une maladie donnée (atténuation de symptomes)
toxicité du med pour variété de paramètres spécifiques pour le med donné (effets secondaires)

Question 23

Étude d’association vs étude fonctionnelles

Answer 23

association:
compare fréquence des génotypes/haplotypes chez les
-sujets répondants vs non-répondants
-patient avec toxicité vs non toxicité
-paramètres pharmacocinétiques

fonctionnelle:
comparer les génotypes vs l’impact sur fonction de l’enzyme, les niveaux d’ARNm ou des prot)

Question 24

donne un exemple de l’interaction entre les genes qui donne une reponse polygenique au med

Answer 24

ex: un metaboliseur utlra lent du medicament mais ayant gène qui fait quil a peu de recepteurs aura une faible efficacité et une toxicité élevé vs un métaboliseur rapide qui a peu de recepteurs qui n’aura presque pas d’Efficacité et peu de toxicité

Question 25

def polymorphisme génétique

Answer 25

variation D’ADN existant sous forme de deux allèles ou sous forme de multiples allèles dans la population (allèles répétés )

Question 26

l’haplotype *1 veut dire quoi en nomenclature

Answer 26

possède les allèles dominant seulement

Question 27

les polymorphismes pourraient ils agir ensemble et avoir un effet combiné plus important par rapport à l’effet de chaque variant individuel en ce qui concerne leur influence sur l’effet des med

Answer 27

oui