Cours 2 partie I: La MEC et la composition des membranes Flashcards
Qu’est-ce que la microscopie photonique et comment peut-on la reconnaitre?
Utilise la lumière visible et la diffraction afin de produire une image grossie d’un échantillon.
Les limites de la résolution sont dues à la lumière
Qu’est-ce que la microscopie électronique et comment peut-on la reconnaitre?
MET (à transmission): des images en 2D et on peut voir les organelles.
MEB (à balayage); on peut voir les structures 3D.
Qu’est-ce que la MEC permet?
Fournit un apport structurel et biochimique aux cellules
environnantes.
Elle diffère chez les bactéries, cells végétales et animales et les achées.
Qu’est-ce qui compose la MEC des bactéries?
Peptidoglycane: longues chaînes de disaccharides aminés (NAM et NAG) et de tetrapeptide.
Comment sont les NAM et NAG det les tetrapeptides reliés dans la mec des bactéries?
directement: liaison covalent
indirectement pont de 5 glycines
Comment différencie-t-on les parois gram + et -?
Gram+: membrane plasmique et peptidoglycan very thick
Gram -: membrane plasmique, peptidoglycan et membrane externe
Sachant que le violet cristal est retenu par le peptidoglycane (suite à la déshydratation), sauriez-vous reconnaître la couleur des bactéries gram +?
Le colorant se loge dans les peptidoglycans. alors, chez les bactéries gram +, vu qu’il y en a bcp plus, le colorant reste mauve.
Les gram -, la paroi peptidoglycan est super mince alors le colorant se fait décolorer à l’alcool.
De quoi est composée la MEC des cellules végétales?
la MEC est une paroi composée de cellulose, pectine et lignine.
Quelles sont les 2 paroi de la mec des végétaux?
PRIMAIRE: composée de fibres de cellulose liées de façon covalente avec de la pectine
SECONDAIRE: idem primaire mais avec de la lignine aussi qui renforce la paroi et permet aux végétaux de résister auc condition environmentales difficiles.
Qu’est-ce que le cellulose moléculairement? Comment forme-t-elle les fibres?
polysaccharide de glucose rigide.
Forme des microfibrilles puis des fibres. Celles-ci sont déposées perpendiculairement des unes des autres formant le squelette de la paroi.
Quelles molécules retrouve-t-on autour des fibres des cells végé?
- pectine
- hemicellulose
- glycoprotéines
- composés phénoliques
La pectine, l’hémicellulose, les glycoprotéines et les composés phénoliques sont hautement hydrophiles. Quel est l’avantage pour la plante ?
Permet de conserver bien l’eau!
Comment la MEC des cellules végétales permet la gestion de l’eau?
Elles empêchent à la cellule d’exploser lorsqu’elle a trop d’eau: la turgescence.
Elles empêchent à la cellule de s’écraser lorsqu’elle a pas assez d’eau: la plasmolyse.
Qu’est-ce que la lignine (dans les paroi secondaire) au niveau moléculaire? Quelles caractéristiques leur sont alors données?
polymère de phenylpropanol.
Donne les propriétés caractéristiques du bois retrouvé dans les tissus vasculaires = les cellules lignifiées sont mortes
Dans une cellule végétale,
à quoi se lie la safranine et à quoi se lie le « fast green »? En quoi les colore-t-il?
La safranine se lie à l’ADN et à la lignine et les colore en rouge.
Le « fast green » colore le cytoplasme et la cellulose en vert
Pourquoi dans une coupe transversale du gazon on voit des cellules rouges vides après coloration à la safranine et au fast green?
Fast green colore le cytoplasme en vert; les cellules qui l’ont sont vivantes et c’est pour ça qu’on y voit l’ADN.
Les cells au contour rouge et vides sont mortes mais la lignine qui reste leur donne cette apparence.
De quoi est composée la MEC chez les cellules animales?
Liqui interstitiel, GAG (gel de glycosaminoglycanes) et de fibres élastiques et de collagène
Les proportions varient beaucoup d’un tissu à un autre.
La MEC n’est donc pas composée d’une paroi
Qu’est-ce qui permet la turgence des cellules animales au niveau de la MEC?
Le fait que le gel de GAG est chargé négativement. Il attire alors les ions Na+ et l’eau.
Que sont les protéoglycane et quelle est leur utilité?
Lorsqu’un GAG s’associe de façon covalente avec des protéine (ressemble à une plume).
Fais partie de la MEC/liquide intersticiel:
Attire et conserve l’eau.
Qu’est-ce qui arrive lorsque les chondrocytes arrêtent de renouveler/détrisent la MEC contenue dans les articulation?
l’ARTHROSE, le cartilage s’éffrite alors avec le temps à cause que l’acide hyaluronique devient moins abondant.
Comment l’acide hyaluronique peut améliorer la mobilité et soulager la douleur ?
On remplace des GAG usés naturels par des GAG synthétiques.
L’éponge rétablie soulagera la douleur jusqu’à temps que la MEC soit redégénérée.
Quel pourcentage de la masse protéique totale des animaux est utilisée par les collagène? Combien de types en retrouve-t-on?
25-30%
28 types produite par 46+ gènes.
Où trouve-t-on majoritairement les collagènes de type 1 et 2 dans le corps?
1: dans le tissus conjonctif de soutien et dans les os
2: les cartillages
Quelle est la structure du collagène?
Structure longue, rigide et hélicoïdale à 3 brins.
Chaque brin de la structure hélicoïdale est formé de trois polypeptides à structure secondaire unique.
Quels sont les trois acides aminés dans dont l’hélice du collagène tourne autout?
X - Y - Glycine.
Proline permet de stabiliser la structure.
Pourquoi y a-t-il beaucoup de Pro et de Gly dans le collagène?
Pro est cyclique, ce qui permet de faire le reverse-turn donnant la rotation à l’hélice.
Les collagènes permettent le acides aminés plus petits to be packed: gly est le plus petit a.a!
Quel niveau de structure (primaire,
secondaire, tertiaire ou quaternaire) est le collagène?
Quartenaire!
Quelles sont les anomalies associées au Ehlers-Danlos? why do they happen?
Mutations dans les gènes codant pour les collagènes (structure ou repliement) ou dans les gènes codant pour les gag.
fibres de collagène peuvent être désorganisées ou en formes étranges.
Qu’est-ce que l’élastine… complète la phrase:
protéine ____, aussi riche en ____ et ____ (forme ____), qui permet l’____ du tissu.
protéine hydrophobe, aussi riche en proline et glycine (forme hélicoïdale), qui permet l’élasticité du tissu
Pourquoi l’élastine est la protéine dominante de la MEC des artères, du cœur et de la vessie
Parce qu’elles s’étirent et doivent revenir à la taille normale assez rapidement sans causer des déchirures!
Qu’est-ce que la fibronectine?
« colle » liant le collagène et les GAGs avec les cellules via leur membrane plasmique.
Quelle est la séquence nécessaire et suffisante d’acide aminés pour lier les cells/fibronectines et pourquoi?
R D G (arg-gly-asp) puisqu’ils sont assez pour lier les intégrines des cellules à la fibronectine juste les trois et ce sont les 3 seuls pouvant le faire.
qu’est-ce que les intégrines?
protéines de la membrane plasmique qui lient de façon réversible la séquence RGD de la fibronectine.
Elles ont un domaine extra et intra cellulaire puis un transmembranaire.
Quelles sont les fonctions de l’intégrine?
récepteurs et adhérence.
est-ce que les couches de la bicouche sont interchangeables?
NAURRRRRR ils sont chacun leur propre composition protéique et lipidique.
Quelles sont les molécules composant les membranes plasmiques?
phosphoglycérolipides (plus ambondants),
glycolipides ( groupement phosphate hydrophile et de deux chaînes d’acide gras, hydrophobes),
cholestérol
Comment reconnait-on une chîne d’acides gras saturées/insturée?
saturée: de h alors SANS DOUBLE BOND
insaturée: avec double bond!
Quels sont les 4 types de phosphoglycérolipides en ordre de grandeur? Qu’est-ce qui les cause?
Phosphatidyl éthano lamine
Phosphatidyl serine
Phosphatidyl choline
Sphyngo myeline
modification au glycérol
Quel phosphoglycérolipides est associé au neurones
sphyngomyelin
Qu’est-ce qui différencie les phosphoglycérolipides des glycholipides? où retrouve-t-on les glycolipides?
À la place du groupement phosphate, on ajoute divers sucres.
Dans le glycocalyx
Si les phospholipides avaient une seule queue, orions nous toujours une bicouche?
Non, la nouvelle forme conique (et non cylindrique) donnerait forme à une micelle.
Ce, puisque les queues hydrophiles veulent tout le temps être seules à cause que c’est moins énergivore.
Comment as-t-on pu prouver 2 couches?
Bain de Langmuir :
un bras compresse des molécules amphiphiles déposées SUR l’eay afin de déterminer leur superficie.
Celle-ci double puisque il y a 2 membranes!
Quels sont les mouvements des phospholipides?
Diffusion latérale, flexion, rotation
Flip flop demande bco d’énergie et la flipase (enzyme)
Que contient la bicouche des achées et pourquoi?
diéthers et des tétraéthers de
glycérol (à la place d’un simple éther).
Les chaines de carbone liées au glycérol sont ramifiées.
permet une plus grande stabilité à température élevée.
Qu’est-ce qui caractérise le cholestérol?
présent uniquement dans les membranes plasmiques dans cellules animales.
- Absent des membranes intracellulaires
- Représente ≈ ¼ des lipides des membranes plasmiques
- S’insère entre les chaînes d’a. gras des que son groupe hydroxyle interagit avec les têtes polaires
- Il est transporté dans le sang sous forme de lipoprotéines de haute ou faible densité
à quoi sert le colestérol?
- Empêche la cristallisation des a. gras
- Rigidifie les membranes
- Diminue la perméabilité aux molécules hydrophiles
- Permet la formation des radeaux lipidiques (ancrage des protéines)
Il y a t il du cholesterol dans les cellules végétales?
NAURRRRRRRRR mais il y a des stérols autres :)
Que sont les glycoprotéines?
Quelle est leur fonction
protéines enchâssées dans la membrane et généralement modifiées de façon post-traductionnelle
- Ajout de sucres sur la partie extracellulaire
- Participent à la formation du glycocalyx
- Jouent un rôle dans la reconnaissance cellulaire (et l’immunité : la reconnaissance du soi et du non-soi)
est-ce qu’une glycoprotéines et un protéoglycane?
NAURRRR.
Les protéoglycane sont un noyeau de protéine avec bcp de gag.
Les glycoprotéines contiennent de 1 a 60% de sucres. Signalisation + immunologie. ex: fibronectine
Quelles sont les 3 types de protéines membranaires
TRANSMEMBRA: traversent complètement la membrane 1 ou plusieurs fois
(hélice a ou feuille)
ANCRÉES: enchassée sur un seul feuillet de la membrane. sont intra ou extracell
(helice a ou chaine lipidique)
PÉRIPHÉRIQUES: intéragissent avec des composantes de la membrane ou des prots transmembranaires.
Nomme moi des fonction des prots membranaires
canal ionique
transporteur
amarre
recepteur
marque d’id cell
enzyme
qu’est-ce que la cryofracture?
observation une coupe cellulaire au microscope, généralement MEB, faite à partir d’un échantillon congelé.
L’orbservation est d’une réplique sur métal et la congélation est faire dans l’azote liquide.#
Qu’a-t-on découvert de la membrane par la cryofracture?
les deux côtés de la membrane plasmique ne sont pas identiques ! Extra est plus lisse que l’intra