Cours 2 Flashcards
Combien de mitos par cellule?
De une à plusieurs centaines
Combien de copies du génome mitochondrial par c?
10^3-10^4
Les copies des génomes mitos sont des homoplasies ou hétéroplasies?
homo
Génome mito est circulaire ou linéaire?
circulaire
Est-ce que génome mito peut être linéaire?
oui
Nombre de gènes en général pour les mitos?
1 à >150
Taille du génome en général pour les mitos?
1 à >350 kb
À quel mot se rattache cette définition: Les copies de génomes sont (initialement) identiques à l’intérieur d’une cellule et entre les cellules
homoplasie
Chez les animaux, le génome est circulaire ou linéaire?
circulaire
Quelle lignée d’animaux a un génome linéaire?
Cnidaires
Quelle est la taille du génome mito des animaux?
16 à 18 kb
Nombre de gènes du génome mito des animaux
37
Est-ce que le génome mito des animaux a des introns?
non
Qu’est-ce qui change entre le génome mito des animaux?
ordre et quelques mutations
Quelle est la taille du génome mito des plantes?
entre 15 et >350 kb
Nombre de gènes du génome mito des plantes
<10 à >150
Est-ce que le génome mito des plantes a des introns?
oui
Quelle est la taille du génome mito des champignons?
1,8-100 kb.
Nombre de gènes du génome mito des champignons
1 seul gène et 80 gènes
Est-ce que le génome mito des champignons a des introns?
oui
Génome mito des champignons est linéaire ou circulaire?
les 2
Pourquoi le génome mito d’Amoebidium parasiticum (Ichthyospores) est unique?
il est composé de 40 chromosomes linéaires avec télomères pour un total de 161,071 bp et 44 gènes. On y retrouve 3 types de chromosomes : a- sans gènes codants, b- avec un seul gène ou c- avec plusieurs gènes.
Les choanoflagellés et les animaux sont des groupes frères, alors est-ce que leur génome mito se ressemble?
non
Quelle est la taille du génome mito des choanoflagellés?
76 568 bp
Nombre de gènes du génome mito des choanoflagellés
55
Pourquoi le génome mito des choanoflagellés est si grand?
de longs intergènes comportant plusieurs séquences répétées représentant plus de la moitié du génome + présence introns
Est-ce que le génome des choanoflagellés a des introns?
oui
Est-ce que la condensation du génome mito des animaux s’est fait avant ou après la séparation avec les choano?
après
Kinétoplaste =
l’unique mitochondrie des Kinétoplastides
Pourquoi les kinétoplastes possèdent plusieurs différences par rapport aux génomes mitochondriaux des autres Eucaryotes?
le génome du kinétoplaste (ADNk) consiste en un vaste réseau entremêlé de 2 types de molécules, les maxi-cercles et les mini-cercles.
Pourquoi le génome mito des kinétoplastides fut les premiers génomes extra-nucléaires a avoir été découverts?
À cause de la grande quantité d’ADN
Chez les kinétoplastes, combien de maxi cercles?
20-50 maxi-cercles
Chez les kinétoplastes, taille des maxi cercles?
200 kb
Chez les kinétoplastes, maxi cercles sont homogènes ou hétéro?
homogène
Chez les kinétoplastes, combien de mini cercles?
10 000 mini-cercles
Chez les kinétoplastes, taille des mini cercles?
0,5-2,5 kb
Chez les kinétoplastes, mini cercles sont homogènes ou hétéro?
hétérogène
Que font les mini cercles?
codent pour les ARN guides (gRNA).
ADN chloro est présent chez qui?
presque toutes les plantes, les algues, les Euglenida et certains Alveolata (Dinoflagellés, Apicomplexa) …
Combien de chloros par c?
1 à 900 chloroplastes par cellule
Quelle est la taille du génome chloro?
30-225 kb
Génome chloro est circulaire ou linéaire?
Circulaire
De quoi est formé le génome chloro?
2 régions à copies uniques
une courte région : SSC (environ 18 Kb)
une longue région : LSC (environ 82 Kb)
2 régions inversées : IRA et IRB (environ 25 Kb)
Est-ce que le fait d’avoir un chloro permet d,Inférer la proximité évolutive de taxon?
non
Pourquoi l’ADN chloroplastique du géranium (Pelargonium x hortorum) compte 217 Kb?
accroissement en taille des régions inversée (IRA et IRB) qui font environ 76 Kb, soit trois fois la taille moyenne de cette région. Les insertions-délétions survenant dans ces régions sont «copiées» dans l’autre.
Comment est organisé le génome chloro des Dinoflagellés?
chaque gène est localisé dans son propre génome circulaire (minicercle)
Combien de gènes dans le génome chloro possèdent les dinoflagellés?
14
L’origine de réplication et de transcription des dinoflagellés (chloro) d’environ _____ bp.
250-500
Chaque minicercle des dinoflagellés (chloro) fait entre _____ kb
2,2 et 3,8
Le nombre de gènes du génome chloroplastique des dinoflagellés est extrêmement _____ par rapport à celui retrouvé dans les autres organismes
réduit
L’apicoplaste est un génome circulaire de ___ Kb unique retrouvé chez les Apicomplexa : Plasmodium, Toxoplasma.
35
À quoi sert le chloro des Apicomplexa?
réplication des parasites; L’apicoplaste est impliqué dans la synthèse d’acides gras de la vacuole parasitophore (compartiment délimité par une membrane protégeant le parasite à l’intérieur des globules rouges).
Pourquoi rôle du chloro des Apicomplexa est diff?
Les Apicomplexa sont tous des parasites endocellulaires obligatoires = pas besoin de faire la photosynthèse
Comment on pourrait éliminer l’apicoplaste?
réplication arrêtée par l’inhibition de la gyrase avec la ciprofloxanine (antibiotiques)
Wolbachia : bactéries présentes dans un grand nombre ____ (environ 60% des espèces connues), et responsables entre autre, des _____ et du _____ …
- d’Arthropodes
- incompatibilités cytoplasmiques
- changement de sexe
Comment se réplique le génome nucléaire?
Sexué : méiose et recombinaison
Comment se réplique le génome mito et chloro?
Asexué et uniparentale (transmission via les oocytes, destruction des mitochondries mâles)
Génome nucléaire se transmet de manière uni ou bi parentale?
bi
Génome mito et chloro se transmet de manière uni ou bi parentale?
uni
Nomme une exception du génome nucléaire qui se transmet de manière uni parentale
Chromosome Y des mammifères, uniparental et «majoritairement» sans recombinaison
Nomme des exceptions du génome mito et chloro qui se transmet de manière bi parentale
Fusion chez la levure, héritabilité double uniparentale chez les Bivalves où mâles et femelles transmettent chacun une lignée mitochondriale distincte; transmission paternelle des chloroplastes chez les Gymnospermes
Dans la transmission uni parentale, pourquoi choisir la femelle?
Question logistique ; les œufs produits sont pus grands que les gamètes males = ds un gamètes femelles, on peut mettre plus de cyto = plus de mitos et plus de chloro
Comment on fait pour éliminer les mitos mâles lors de leur transmission?
Les mitochondries mâles sont marquées durant la spermatogénèse et détruites à la suite de la fécondation
Qui a observé l’Hérédité cytoplasmique des plantes? Et quelles étaient les conclusions?
- Carl Correns
2. Phénotype couleur dépendait de la partie F
Explique la transmission double uniparentale des moules
la mitochondrie femelle est transmise comme chez les autres organismes. Cependant, une seconde lignée de mitochondries est exclusive aux mâles et n’est transmise qu’à la descendance mâle.
V ou F: La séparation des genre mitochondriaux est antérieure à la spéciation des groupes actuels. Les deux types de mitochondries sont donc moins différents entre eux qu’un type entre les espèces.
F: La séparation des genre mitochondriaux est antérieure à la spéciation des groupes actuels. Les deux types de mitochondries sont donc PLUS différents entre eux qu’un type entre les espèces.
Chez les moules, les mâles ont combien de génomes mito diff?
2
La transmission biparentale des mitochondries chez les humains est exceptionnelle et serait dépendante de _____ sur un (ou peu) de gènes ____ (qui empêcheraient la destruction des mitochondries mâles)
- mutations dominantes
2. nucléaires
Lorsque les copies de génomes des mitos sont différentes dans une cellule, quelles sont les 2 causes potentielles?
- Mutations
2. Fuite paternelle
Comment est la transmission des mitos?
aléatoire
Quelles sont les 2 types de mitos vues chez la levure?
normales et petite (anaérobies)
La taille des mitochondries et des chloroplastes est très voisine de celle des ___
bactéries
V ou F: Chaque organelle possède du matériel génétique (ADN) qui lui est propre et code pour une partie de son protéome (cependant, la majorité de leur protéome provient du génome nucléaire)
V
Majorité du protéome des mitos et chloros vient de…
noyau
Est-ce que le code génétique des organelles est identique à celui du noyau?
légèrement différent
L’ADN des mitochondries et des chloroplastes est circulaire ou linéaire?
circulaire
V ou F: Chaque organelle possède la machinerie nécessaire à la synthèse de protéines à partir de son ADN (ARNt, ribosomes …)
V
V ou F: Chaque organelle est capable de division après avoir doublé le stock d’ADN
V
Est-ce que la division des organelles est indépendante de celle du noyau?
oui ;
Théorie de l’endosymbiose proposée par ____ en 1981 … qui rejoint la théorie de la ___
- Lynn Margulis
2. fusion
Mito vient de quelle bactérie et comment?
a-protéobactérie ; fusion
Chloro vient de quelle bactérie et comment?
cyano ; endocytose
Les ribosomes nucléaires des Eucaryotes, des Archaea et des Bactéries forment des groupes ____.
monophylétiques
les ribosomes mitochondriaux et chloroplastiques des Eucaryotes se joignent au groupe des ___
bactéries
Est-ce que, comme les mitochondries, les chloroplastes ont tous la même origine?
oui
Est-ce que, comme les mitochondries, les chloroplastes proviennent d’une endosymbiose unique avec une bactérie?
oui
Quelle est l’exception de l’origine unique des mitos?
Paulinella chromatophora
Est-ce que l’acquisition des chloros est plus récentes que celle des mitos?
oui
Comment des eucaryotes sans relations proches, possèdent des chloroplastes?
Ils les ont acquis via une endosymbiose secondaire ou tertiaire.
Pourquoi les chloroplastes des algues vertes (et plantes), des algues rouges (Rhodophytes) sont bien différents?
en raison de leur temps de divergence
Comment s’est fait le Transfert des chloroplastes ?
TL
Endosymbiose primaire: survenue combien de fois?
1 seule fois
Endosymbiose primaire: survenue entre…?
un eucaryote et une cyanobactérie
Endosymbiose primaire: combien de membranes et d’où viennent-elles?
une double membrane (interne et externe) de type cyanobactérie.
Endosymbiose secondaire: survenue combien de fois
plusieurs fois
Endosymbiose primaire: combien de membranes et d’où viennent-elles?
4 ; une double membrane (interne et externe) de type cyanobactérie + 2 membranes additionnelles : la membrane plasmatique de l’hôte primaire et la membrane de phagocytose de l’hôte secondaire
a majorité des gènes bactériens (mitochondrie et chloroplaste) ont donc été transféré dans le ____
noyau
Protéome des chloroplastes: Seulement ____ gènes ont subsisté dans le chloroplaste d’Arabidopsis.
87
Protéome des chloroplastes: des ____ gènes nucléaires d’Arabidopsis, ___ proviennent des cyanobactéries.
- 26 000
2. 4 300
Protéome des chloroplastes contient ___ protéines provenant du noyau, dont ___ qui proviendraient de gènes de la cyanobactérie.
- 3100
2. 1300
Le génome de la cyanobactérie Synechococcus WH5701 (proche parent de l’origine des chromatophores) possède ____ gènes codants. Celui des chromatophores de P. chromatophora contient entre _____ gènes codants = ?
- 2917
- 841 and 867
- Perte du 2/3 du génome
Les mitochondries sont présentes chez tous les Eucaryotes à l’exception des ____ (3)
Diplomonadida, des Parabasalia et des Microsporidia
La présence du gène mitochondrial ___ d’origine mitochondriale dans le génome nucléaire des Diplomonadida, des Parabasalia et des Microsporidia suggèrent _____
- RPB1
2. une origine unique, puis la perte indépendante des mitochondries chez ces taxons
Nucléomorphes sont quels types d’endosymbiose?
Secondaire
Nucléomorphes sont linéaires ou circulaires?
linéaires
Nucléomorphes = ?
génome nucléaire de l’algue qui a été phagocyté. Donc un génome extra-nucléaire additionnel
Nucléomorphes possèdent donc 4 génomes :
- un génome mitochondrial,
- un génome chloroplastique
- un génome nucléaire de la cellule hôte
- Un génome nucléaire de la cellule phagocytée (le nucléomorphe).
Nucléomorphes se retrouvent dans 2 types d’euc:
- Cryptomonade
2. Chlorarachniophyte
