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Génétique évolutive > Cours 2 > Flashcards

Cours 2 Flashcards

1
Q

Combien de mitos par cellule?

A

De une à plusieurs centaines

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2
Q

Combien de copies du génome mitochondrial par c?

A

10^3-10^4

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3
Q

Les copies des génomes mitos sont des homoplasies ou hétéroplasies?

A

homo

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4
Q

Génome mito est circulaire ou linéaire?

A

circulaire

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Q

Est-ce que génome mito peut être linéaire?

A

oui

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6
Q

Nombre de gènes en général pour les mitos?

A

1 à >150

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7
Q

Taille du génome en général pour les mitos?

A

1 à >350 kb

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8
Q

À quel mot se rattache cette définition: Les copies de génomes sont (initialement) identiques à l’intérieur d’une cellule et entre les cellules

A

homoplasie

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9
Q

Chez les animaux, le génome est circulaire ou linéaire?

A

circulaire

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10
Q

Quelle lignée d’animaux a un génome linéaire?

A

Cnidaires

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11
Q

Quelle est la taille du génome mito des animaux?

A

16 à 18 kb

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12
Q

Nombre de gènes du génome mito des animaux

A

37

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13
Q

Est-ce que le génome mito des animaux a des introns?

A

non

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14
Q

Qu’est-ce qui change entre le génome mito des animaux?

A

ordre et quelques mutations

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15
Q

Quelle est la taille du génome mito des plantes?

A

entre 15 et >350 kb

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16
Q

Nombre de gènes du génome mito des plantes

A

<10 à >150

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17
Q

Est-ce que le génome mito des plantes a des introns?

A

oui

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18
Q

Quelle est la taille du génome mito des champignons?

A

1,8-100 kb.

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19
Q

Nombre de gènes du génome mito des champignons

A

1 seul gène et 80 gènes

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20
Q

Est-ce que le génome mito des champignons a des introns?

A

oui

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21
Q

Génome mito des champignons est linéaire ou circulaire?

A

les 2

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22
Q

Pourquoi le génome mito d’Amoebidium parasiticum (Ichthyospores) est unique?

A

il est composé de 40 chromosomes linéaires avec télomères pour un total de 161,071 bp et 44 gènes. On y retrouve 3 types de chromosomes : a- sans gènes codants, b- avec un seul gène ou c- avec plusieurs gènes.

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23
Q

Les choanoflagellés et les animaux sont des groupes frères, alors est-ce que leur génome mito se ressemble?

A

non

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24
Q

Quelle est la taille du génome mito des choanoflagellés?

A

76 568 bp

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25
Q

Nombre de gènes du génome mito des choanoflagellés

A

55

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26
Q

Pourquoi le génome mito des choanoflagellés est si grand?

A

de longs intergènes comportant plusieurs séquences répétées représentant plus de la moitié du génome + présence introns

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27
Q

Est-ce que le génome des choanoflagellés a des introns?

A

oui

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28
Q

Est-ce que la condensation du génome mito des animaux s’est fait avant ou après la séparation avec les choano?

A

après

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29
Q

Kinétoplaste =

A

l’unique mitochondrie des Kinétoplastides

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30
Q

Pourquoi les kinétoplastes possèdent plusieurs différences par rapport aux génomes mitochondriaux des autres Eucaryotes?

A

le génome du kinétoplaste (ADNk) consiste en un vaste réseau entremêlé de 2 types de molécules, les maxi-cercles et les mini-cercles.

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31
Q

Pourquoi le génome mito des kinétoplastides fut les premiers génomes extra-nucléaires a avoir été découverts?

A

À cause de la grande quantité d’ADN

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32
Q

Chez les kinétoplastes, combien de maxi cercles?

A

20-50 maxi-cercles

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33
Q

Chez les kinétoplastes, taille des maxi cercles?

A

200 kb

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34
Q

Chez les kinétoplastes, maxi cercles sont homogènes ou hétéro?

A

homogène

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35
Q

Chez les kinétoplastes, combien de mini cercles?

A

10 000 mini-cercles

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36
Q

Chez les kinétoplastes, taille des mini cercles?

A

0,5-2,5 kb

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37
Q

Chez les kinétoplastes, mini cercles sont homogènes ou hétéro?

A

hétérogène

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38
Q

Que font les mini cercles?

A

codent pour les ARN guides (gRNA).

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39
Q

ADN chloro est présent chez qui?

A

presque toutes les plantes, les algues, les Euglenida et certains Alveolata (Dinoflagellés, Apicomplexa) …

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40
Q

Combien de chloros par c?

A

1 à 900 chloroplastes par cellule

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41
Q

Quelle est la taille du génome chloro?

A

30-225 kb

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42
Q

Génome chloro est circulaire ou linéaire?

A

Circulaire

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43
Q

De quoi est formé le génome chloro?

A

2 régions à copies uniques
une courte région : SSC (environ 18 Kb)
une longue région : LSC (environ 82 Kb)
2 régions inversées : IRA et IRB (environ 25 Kb)

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44
Q

Est-ce que le fait d’avoir un chloro permet d,Inférer la proximité évolutive de taxon?

A

non

45
Q

Pourquoi l’ADN chloroplastique du géranium (Pelargonium x hortorum) compte 217 Kb?

A

accroissement en taille des régions inversée (IRA et IRB) qui font environ 76 Kb, soit trois fois la taille moyenne de cette région. Les insertions-délétions survenant dans ces régions sont «copiées» dans l’autre.

46
Q

Comment est organisé le génome chloro des Dinoflagellés?

A

chaque gène est localisé dans son propre génome circulaire (minicercle)

47
Q

Combien de gènes dans le génome chloro possèdent les dinoflagellés?

A

14

48
Q

L’origine de réplication et de transcription des dinoflagellés (chloro) d’environ _____ bp.

A

250-500

49
Q

Chaque minicercle des dinoflagellés (chloro) fait entre _____ kb

A

2,2 et 3,8

50
Q

Le nombre de gènes du génome chloroplastique des dinoflagellés est extrêmement _____ par rapport à celui retrouvé dans les autres organismes

A

réduit

51
Q

L’apicoplaste est un génome circulaire de ___ Kb unique retrouvé chez les Apicomplexa : Plasmodium, Toxoplasma.

A

35

52
Q

À quoi sert le chloro des Apicomplexa?

A

réplication des parasites; L’apicoplaste est impliqué dans la synthèse d’acides gras de la vacuole parasitophore (compartiment délimité par une membrane protégeant le parasite à l’intérieur des globules rouges).

53
Q

Pourquoi rôle du chloro des Apicomplexa est diff?

A

Les Apicomplexa sont tous des parasites endocellulaires obligatoires = pas besoin de faire la photosynthèse

54
Q

Comment on pourrait éliminer l’apicoplaste?

A

réplication arrêtée par l’inhibition de la gyrase avec la ciprofloxanine (antibiotiques)

55
Q

Wolbachia : bactéries présentes dans un grand nombre ____ (environ 60% des espèces connues), et responsables entre autre, des _____ et du _____ …

A
  1. d’Arthropodes
  2. incompatibilités cytoplasmiques
  3. changement de sexe
56
Q

Comment se réplique le génome nucléaire?

A

Sexué : méiose et recombinaison

57
Q

Comment se réplique le génome mito et chloro?

A

Asexué et uniparentale (transmission via les oocytes, destruction des mitochondries mâles)

58
Q

Génome nucléaire se transmet de manière uni ou bi parentale?

A

bi

59
Q

Génome mito et chloro se transmet de manière uni ou bi parentale?

A

uni

60
Q

Nomme une exception du génome nucléaire qui se transmet de manière uni parentale

A

Chromosome Y des mammifères, uniparental et «majoritairement» sans recombinaison

61
Q

Nomme des exceptions du génome mito et chloro qui se transmet de manière bi parentale

A

Fusion chez la levure, héritabilité double uniparentale chez les Bivalves où mâles et femelles transmettent chacun une lignée mitochondriale distincte; transmission paternelle des chloroplastes chez les Gymnospermes

62
Q

Dans la transmission uni parentale, pourquoi choisir la femelle?

A

Question logistique ; les œufs produits sont pus grands que les gamètes males = ds un gamètes femelles, on peut mettre plus de cyto = plus de mitos et plus de chloro

63
Q

Comment on fait pour éliminer les mitos mâles lors de leur transmission?

A

Les mitochondries mâles sont marquées durant la spermatogénèse et détruites à la suite de la fécondation

64
Q

Qui a observé l’Hérédité cytoplasmique des plantes? Et quelles étaient les conclusions?

A
  1. Carl Correns

2. Phénotype couleur dépendait de la partie F

65
Q

Explique la transmission double uniparentale des moules

A

la mitochondrie femelle est transmise comme chez les autres organismes. Cependant, une seconde lignée de mitochondries est exclusive aux mâles et n’est transmise qu’à la descendance mâle.

66
Q

V ou F: La séparation des genre mitochondriaux est antérieure à la spéciation des groupes actuels. Les deux types de mitochondries sont donc moins différents entre eux qu’un type entre les espèces.

A

F: La séparation des genre mitochondriaux est antérieure à la spéciation des groupes actuels. Les deux types de mitochondries sont donc PLUS différents entre eux qu’un type entre les espèces.

67
Q

Chez les moules, les mâles ont combien de génomes mito diff?

A

2

68
Q

La transmission biparentale des mitochondries chez les humains est exceptionnelle et serait dépendante de _____ sur un (ou peu) de gènes ____ (qui empêcheraient la destruction des mitochondries mâles)

A
  1. mutations dominantes

2. nucléaires

69
Q

Lorsque les copies de génomes des mitos sont différentes dans une cellule, quelles sont les 2 causes potentielles?

A
  1. Mutations

2. Fuite paternelle

70
Q

Comment est la transmission des mitos?

A

aléatoire

71
Q

Quelles sont les 2 types de mitos vues chez la levure?

A

normales et petite (anaérobies)

72
Q

La taille des mitochondries et des chloroplastes est très voisine de celle des ___

A

bactéries

73
Q

V ou F: Chaque organelle possède du matériel génétique (ADN) qui lui est propre et code pour une partie de son protéome (cependant, la majorité de leur protéome provient du génome nucléaire)

A

V

74
Q

Majorité du protéome des mitos et chloros vient de…

A

noyau

75
Q

Est-ce que le code génétique des organelles est identique à celui du noyau?

A

légèrement différent

76
Q

L’ADN des mitochondries et des chloroplastes est circulaire ou linéaire?

A

circulaire

77
Q

V ou F: Chaque organelle possède la machinerie nécessaire à la synthèse de protéines à partir de son ADN (ARNt, ribosomes …)

A

V

78
Q

V ou F: Chaque organelle est capable de division après avoir doublé le stock d’ADN

A

V

79
Q

Est-ce que la division des organelles est indépendante de celle du noyau?

A

oui ;

80
Q

Théorie de l’endosymbiose proposée par ____ en 1981 … qui rejoint la théorie de la ___

A
  1. Lynn Margulis

2. fusion

81
Q

Mito vient de quelle bactérie et comment?

A

a-protéobactérie ; fusion

82
Q

Chloro vient de quelle bactérie et comment?

A

cyano ; endocytose

83
Q

Les ribosomes nucléaires des Eucaryotes, des Archaea et des Bactéries forment des groupes ____.

A

monophylétiques

84
Q

les ribosomes mitochondriaux et chloroplastiques des Eucaryotes se joignent au groupe des ___

A

bactéries

85
Q

Est-ce que, comme les mitochondries, les chloroplastes ont tous la même origine?

A

oui

86
Q

Est-ce que, comme les mitochondries, les chloroplastes proviennent d’une endosymbiose unique avec une bactérie?

A

oui

87
Q

Quelle est l’exception de l’origine unique des mitos?

A

Paulinella chromatophora

88
Q

Est-ce que l’acquisition des chloros est plus récentes que celle des mitos?

A

oui

89
Q

Comment des eucaryotes sans relations proches, possèdent des chloroplastes?

A

Ils les ont acquis via une endosymbiose secondaire ou tertiaire.

90
Q

Pourquoi les chloroplastes des algues vertes (et plantes), des algues rouges (Rhodophytes) sont bien différents?

A

en raison de leur temps de divergence

91
Q

Comment s’est fait le Transfert des chloroplastes ?

A

TL

92
Q

Endosymbiose primaire: survenue combien de fois?

A

1 seule fois

93
Q

Endosymbiose primaire: survenue entre…?

A

un eucaryote et une cyanobactérie

94
Q

Endosymbiose primaire: combien de membranes et d’où viennent-elles?

A

une double membrane (interne et externe) de type cyanobactérie.

95
Q

Endosymbiose secondaire: survenue combien de fois

A

plusieurs fois

96
Q

Endosymbiose primaire: combien de membranes et d’où viennent-elles?

A

4 ; une double membrane (interne et externe) de type cyanobactérie + 2 membranes additionnelles : la membrane plasmatique de l’hôte primaire et la membrane de phagocytose de l’hôte secondaire

97
Q

a majorité des gènes bactériens (mitochondrie et chloroplaste) ont donc été transféré dans le ____

A

noyau

98
Q

Protéome des chloroplastes: Seulement ____ gènes ont subsisté dans le chloroplaste d’Arabidopsis.

A

87

99
Q

Protéome des chloroplastes: des ____ gènes nucléaires d’Arabidopsis, ___ proviennent des cyanobactéries.

A
  1. 26 000

2. 4 300

100
Q

Protéome des chloroplastes contient ___ protéines provenant du noyau, dont ___ qui proviendraient de gènes de la cyanobactérie.

A
  1. 3100

2. 1300

101
Q

Le génome de la cyanobactérie Synechococcus WH5701 (proche parent de l’origine des chromatophores) possède ____ gènes codants. Celui des chromatophores de P. chromatophora contient entre _____ gènes codants = ?

A
  1. 2917
  2. 841 and 867
  3. Perte du 2/3 du génome
102
Q

Les mitochondries sont présentes chez tous les Eucaryotes à l’exception des ____ (3)

A

Diplomonadida, des Parabasalia et des Microsporidia

103
Q

La présence du gène mitochondrial ___ d’origine mitochondriale dans le génome nucléaire des Diplomonadida, des Parabasalia et des Microsporidia suggèrent _____

A
  1. RPB1

2. une origine unique, puis la perte indépendante des mitochondries chez ces taxons

104
Q

Nucléomorphes sont quels types d’endosymbiose?

A

Secondaire

105
Q

Nucléomorphes sont linéaires ou circulaires?

A

linéaires

106
Q

Nucléomorphes = ?

A

génome nucléaire de l’algue qui a été phagocyté. Donc un génome extra-nucléaire additionnel

107
Q

Nucléomorphes possèdent donc 4 génomes :

A
  • un génome mitochondrial,
  • un génome chloroplastique
  • un génome nucléaire de la cellule hôte
  • Un génome nucléaire de la cellule phagocytée (le nucléomorphe).
108
Q

Nucléomorphes se retrouvent dans 2 types d’euc:

A
  1. Cryptomonade

2. Chlorarachniophyte

Génétique évolutive (5 decks)

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