Cours 1 Flashcards
Eucaryotes : organismes caractérisés par la présence d’un ____ et de ____ dans leur(s) cellule(s)
- noyau
2. mitochondries
ADN des Pro est de quelle forme?
circulaire
Nomme une différence majeure entre Pro et Euc
archées et bact: trans et traduction se font presque en même temps
Noyau
Organite contenant un ADN sous forme de ____, délimité par une double membrane ___ le processus de transcription (à l’intérieur du noyau) de celui de la traduction (à l’extérieur du noyau, dans le cytoplasme)
- chromosomes
2. isolant
Mitochondrie
Organite contenant un ADN sous forme ____ (ou plus rarement ____) ainsi que la machinerie pour ______, délimité par une double membrane et responsable du processus de ___ (entre autre rôle)
- circulaire
- linéaire
- la transcription et la traduction
- phosphorylation oxydative
La vie actuelle se présente en trois lignées majeures :
les bactéries, les archées et les eucaryotes.
On présume que les 3 lignées majeures proviennent d’un ancêtre commun car
- composés organiques semblables à base de carbone
- informations génétiques sous forme d’ADN, transcrit en ARNs
- universalité (ou presque) du code génétique
- protéines formées des mêmes acides aminés
Quelles sont les 3 hypothèses qui expliquent l’existence des Euc?
- Spéciations dichotomiques
- Transferts latéraux
- Fusion
Décris le principe derrière les Spéciations dichotomiques
Les éléments du génome des Eucaryotes sont plus près des Archées que des Bactéries = bactéries se seraient séparer en 1er des euc et archées, puis ensuite euc et archées se sont séparés
Décris le principe derrière les Transferts latéraux
Spéciations dichotomiques, mais certains éléments du génome sont plus près des Bactéries en raison du transfert latéral
Décris le principe derrière la Fusion
Fusion spontanée d’une archée et d’une bactérie, les éléments du génome proviennent des 2 lignées évolutives différentes = alors seraient les seuls 2 groupes qui auraient évolué normalement
Les Eucaryotes proposés comme le ______ des Archées
groupe frère
Pourquoi il semble faux de dire que les organismes basaux semblent être des hyperthermophiles?
1- Le génome des premières cellules était sans doute constitué par des molécules d’ARN. L’ARN est une molécule extrêmement fragile à haute température.
2- Les hyperthermophiles sont tout sauf primitives : par exemple, la structure complexe de la reverse gyrase (association d’un module hélicase et d’un module ADN topoisomérase)
Qu’ont en commun les Archaea et des Bactéries hyperthermophiles?
génome riche en CG pour résister à la chaleur, ce qui les fait se ressembler juste par hasard
Qu’est-ce qui provoque le regroupement des taxons selon leur habitat?
grand nombre d’homoplasie par rapport aux synapomorphies
substitutions dues à la température sont souvent des ___
homoplasies
V ou F: Parce que les Euc et les Archées sont des groupes-frère, TOUS leurs gènes sont plus semblables entre eux qu’avec les Bactéries
F ; plus de la moitié des gènes Eucaryotes sont plus près des Bactéries que des Archées
V ou F: le principe de transferts latéraux s’oppose au principe de l’hérédité
V: survient lorsqu’un organisme intègre le matériel génétique d’un autre organisme MAIS sans en être le descendant
V ou F: Selon le principe des transferts latéraux, des espèces différentes peuvent ainsi partager la même copie de gènes
V
Qu’est-ce qui est responsable de la diversifications des groupes des archées, ainsi que l’acquisition de nouvelles fonctions métaboliques?
TL
Où vit la bactérie Wolbachia?
ne peut vivre que dans les cellules de son hôte.
Quelle supposition est faite sur l’ancêtre de Wolbachia?
une bactérie pathogène des arthropodes
La co-existence entre Wolbachia et une une bactérie pathogène des arthropodes aurait entrainée…
ne diminution de la virulence de la bactérie au profit d’une plus grande transmissibilité
Dans quels organismes retrouve-t-on la bactérie Wolbachia?
Arthro et nématode
Combien existe-t-il de domaines monophylétiques selon Woese (1977)? Et quels sont-ils?
- 3 domaines monophylétiques
2. Bactéries, Archées et Eucaryotes.
Combien existe-t-il de domaines monophylétiques selon Lake (1988)? Et quels sont-ils?
- 2 domaines monophylétiques
2. Bactéries et Eucaryotes.
Qu’est-ce qu’un Groupe monophylétique?
Groupe où tous les membres proviennent d’un même ancêtre commun et qui contient tous les descendants de cet ancêtre commun
Donne 2 exemples de groupes para
- Reptiles
2. Archée
La classification de Lake s’est faite à partir de quelle structure?
Ribosomes
Quelles sont les pistes utilisées pour expliquer l’origine des Eucaryotes?
Fusion, TL et virus
Comment expliquer l’isolement de la transcription et de la traduction chez les Euc?
Aide d’un virus
Caractéristiques hypothétiques des virus à l’origine du noyau:
- un génome de grande taille sous forme d’ADN double brin. Cet ADN est linéaire et possède des télomères
- la machinerie pour modifier les ARNs (coiffe et queue polyA) en vue de l’exportation vers le cytoplasme pour la traduction
Est-ce que normalement le génome bactérien a des télomères?
non
Pourquoi les virus géants sont appelés ainsi?
plus gros et génétiquement plus complexes que plusieurs Bactéries et Archées
Donne des carac partagées entre les euc et les virus géants
- souvent des génomes double brins et linéaires
- Possèdent leurs propres enzymes pour modifier la partie 5’ des ARNs (coiffe) pour assurer la traduction de leurs transcrits par les ribosomes de l’hôte.
- possèdent une ADN polymérase semblable
- délimités par une membrane
Caractéristiques qui séparent les pro et euc proviendrait des…
virus géants
virus géants est un groupe mono ou para?
mono
Comment les virus géants sont-ils reliés aux Euc?
Groupe-frère
Quels sont les sujets ouverts en débats sur les virus géants?
- Si ces virus sont vraiment à l’origine du noyau chez les Euc
- Si ils seraient pas plutôt d’origine d’organismes déjà formés, alors auraient des caractéristiques des Euc
- pickpockets ; acquis certains gènes eucaryotes par transfert latéraux
V ou F: Les gènes ont une grande capacité de résilience p/r au phénotype
V
Selon la Théorie du gène égoïste, Les êtres vivants se caractérisent par leur capacité à ____.
se reproduire
Selon la Théorie du gène égoïste, Le point crucial réside dans _____ qu’ils transmettent à leur descendance : seul ___ est héritable.
- la réplication de l’information
2. l’ADN
Selon la Théorie du gène égoïste, est-ce que les individus se reproduisent?
non ; les individus, les populations, les espèces ne se reproduisent pas, mais reproduisent seulement l’ADN qu’ils portent
Dans quelle mesure les gènes sont qualifiés d’égoïstes?
qd ils travaillent non pas pour le bien de l’organisme, mais uniquement pour eux mêmes.
V ou F: L’« intérêt » d’un gène peut ne pas coïncider avec une meilleure survie de l’individu qui le porte
V
Qu’est-ce qui tend à être optimiser par la sélection nat?
la capacité des gènes à produire des copies d’eux mêmes.
L’altruisme se définit par…
l’ensemble des actes/réactions d’un individu permettant de favoriser la survie ou la reproduction des autres individus apparentés (de sa lignée ou de son espèce).
V ou F: l’altruisme est compatible avec l’intérêt des individus
F: pas compatible avec l’intérêt des individus, mais aide à la persistance de leurs propres gènes (mais portés par d’autres individus)
Donne un exemple d’altruisme dans le monde du vivant
Insectes sociaux: Reine se reproduit, alors que les autres ind ne se reproduisent pas ; aide la Reine à se reproduire
Donne un exemple d’altruisme observé dans le principe de reproduction dans le monde du vivant
organismes multicellulaires sont composés de plusieurs cellules oeuvrant collectivement pour une seule entité, mais où seules quelques unes peuvent transmettre leur matériel génétique aux générations suivantes
Donne un exemple d’altruisme observé chez certaines bactéries
Lorsque certaines bactéries sont infectées par un virus, elles se suicident. Ceci empêche la prolifération du virus et protège ainsi les autres membres de sa lignée.
Comment se produit le suicide involontaire de certaines bactéries lorsque celles-ci sont infectées par un virus?
Ces bactéries ont un gène (cascade de gènes) qui produit une toxine, mais qui ne sera relâché que si la bactérie est infectée.
Les éléments transposables occupent environ __ % de l’espace du génome humain !!!
45
V ou F: l’ADN parasite n’est pas favorable à notre survie ou reproduction
V
V ou F: le gène pour la transcriptase inverse sert (pratiquement) à rien pour les humains, mais il est indispensable aux rétrovirus et autres rétro-éléments.
V
Un des gènes les plus communs du génome humain est le gène qui code pour _____
la transcriptase inverse
Que font les transcriptases inverses?
Les transcriptases inverses sont des polymérases qui peuvent synthétiser un brin d’ADN complémentaire (ADNc) à partir d’un ARN, pour former un hybride ADN:ARN.
les transcriptases inverses sont produites grâce aux…
c infectées par des virus à ARN
Quelle est l’origine des tumeurs CTVT?
loup
Quelle est la seule différence entre le génome du loup et celui de la tumeur CTVT?
présence d’un élément transposable (gène égoiste) à un endroit précis du génome (devant le gène myc)
Donne 4 caractéristiques du chromo B:
- petits chromosomes
- non essentiels
- supplémentaire au caryotype régulier d’un organisme 4. Généralement transmis de façon non mendélienne.
Que porte le chromo B chez les guêpes?
le gène psr pour «paternal sex ratio»
Explique l’impact du gène psr dans une pop de guêptes
- Normalement, plus de F que M
- F: diplo et issu d’une fécondation, alors que les M: haplo et issu d’un oeuf non fécondé
- Qd spermato avec psr féconde oeuf (devrait normalement donner F), matériel M est condensé = oeuf fécondé de vient haplo = M
- Changement du ratio F/M dans la pop en augmentant le nbre de M
Pourquoi la probabilité de transmission des chromosomes B est plus élevée chez les mâles?
car tous les chromosomes sont transmis par le sexe haploïde (pas de méiose).
Dans quelle mesure un gène est égoïste (dans le cas du gène psr)?
Dans la mesure où il modifie le rapport des sexes en faveur des mâles, favorisant ainsi sa transmission aux générations suivantes.
Pourquoi le gène psr est également dit ultra égoiste?
car les mâles porteurs du gène psr ne transmettent pas tout leur matériel génétique à la génération suivante, mais seulement le chromosome B.
V ou F: Tout les mâles produits suite à une intrusion du gène psr auront du matériel génétique provenant de la mère
V
