Cours 11 : Virologie Flashcards
V/F : la majorité des virus sont plus gros que les bactéries
Faux , la majorité des virus
connus sont effectivement plus petits que les bactéries, à la fois en taille de la particule virale et
en taille du génome
V/F : Les virus sont considérés comme un organisme vivant
Faux : Les virus sont situés à la barrière entre le vivant et l’inerte (non-vivant)
Expliqué la particularité de l’organisation cellulaire des virus
Organisation acellulaire ( absence de cellule virale ) :
-pas d’échange avec l’extérieur
-pas de croissance
-pas de division
Si l’organisation est acellulaire de quelle manière les virus se multiplie
Parasitisme (multiplication) intracellulaire
-inerte (pas de multiplication) hors de la cellule
-pas les seuls para. Intracellulaire ( pas suffisante pour décrire un virus )
Comparer le mode de multiplication des cellules et des virus
Cellules : division binaire
Virus : désassemblage et ré-assemblage
Expliquez de quelle manière les virus évolue
l’accumulation de changements génétiques (mutations ou délétions) et la sélection
naturelle permettant aux virus de s’adapter
Les virus possède quel type de molécule
Les virus possèdent les deux grandes classes de molécules du
monde vivant : les acides nucléiques et les protéines
Indiquez la structure des virus
*Génome viral
-ARN, ADN, linéaire, circulaire….
*Capside protéique
-cubique, hélicoïdale, etc….
*Enveloppe lipidique
Quels sont les caractéristique moléculaire des virus
-pas de génération d’ATP, pas de métabolisme ( utilise les voies de la cell. hote )
-pas de machinerie de traduction (codent leurs protéines mais ne synthétisent pas leurs protéines)
Donnez une définition des virus
Agents infectieux, possédant une
organisation acellulaire et composés au minimum d’un génome d’acide nucléique et d’une
capside protéique, mais dépourvus de métabolisme et de machinerie de synthèse protéique.
Est ce que la déf. des virus inclu les viroides et les prions
Non , Ces agents infectieux « sous-viraux » sont eux composés uniquement d’une molécule
d’acide nucléique (viroïdes) ou d’une protéine sans acide nucléique (prions)
Où retrouve t’on les viroides et les prions
Les viroïdes sont principalement retrouvés chez les plantes alors que les prions sont responsables de quelques maladies, comme l’encéphalite spongiforme bovine dite « maladie de la vache folle »
Quels sont les critères pour regrouper les virus en famille et sous-famille
- la nature du génome (ADN ou ARN) et sa structure (monocaténaire ou bicaténaire, linéaire ou circulaire, etc.),
- la structure de la capside
- la présence ou l’absence d’enveloppe lipidique
- Autres critère : hote , pathologie, transmission
Qu’est ce que les particules virales
virions, sont donc toujours composées d’acides nucléiques et de protéines
Qu’est ce que le nucléocapside du génome viral
acides nucléiques qui se retrouvent au cœur de la particule virale, et qui sont directement
associés à des protéines,
V/F : le génome des virus est seulement composé de ARN
Faux :le génome des virus peut être composé d’ADN ou d’ARN selon les familles de virus
=>Certains virus possèdent un génome composé d’ARN monocaténaire (un seul brin)
linéaire, ARN monocaténaire circulaire, ARN bicaténaire, ADN
linéaire monocaténaire, ADN linéaire bicaténaire, ADN circulaire bicaténaire
L’enveloppe lipidique que possède certains virus est composé de quoi
Formée d’une double couche lipidique dans laquelle se retrouvent insérées des protéines (généralement « glycoprotéines ») dites d’enveloppe, protéines codées par le génome viral
=> protéines qui jouent un rôle dans la fixation du virus aux cellules
La spécificité de l’infection virale d’un virus dépends de quel critère
- Spécificité de l’hote : tous les virus n’infecte pas toutes les espèces ( ex: virus SIDA juste chez les humains et les grand singe )
=>espèce animale
=>divergence évolutive - Antirécepteur et récepteur cellulaire
- Spécificité tissulaire-différenciation cellulaire : récepteur pour les virus se retrouve seulement sur certains type cellulaire d’un organisme pluricellulaire ( ex; virus lymphotrope )
Quelle est la première étape du cycle de multiplication de tous les virus
la fixation (ou adsorption) à la surface de la cellule-hôte.
=> Cette fixation est médiée par l’interaction entre le récepteur situé à la surface cellulaire et l’antirécepteur (ou contre-récepteur) à la surface de la particule virale
Quel est un des principaux facteurs déterminant la spécificité
d’hôte du virus, soit le type de cellules pouvant être infectées
Antirécepteur (contre-récepteur) viral et récepteur cellulaire :
- Dans le cas des virus possédant une enveloppe lipidique, les protéines de l’enveloppe permettront la fixation au récepteur cellulaire.
- Dans le cas des virus sans enveloppe, dits à « capside nue », ce sera évidemment une protéine de la capside exposée à l’extérieur de la particule virale
=> si la structure de la région du récepteur reconnue par le virus a été très conservée dans
l’évolution chez de nombreuses espèces, le virus pourra infecter toutes ces espèces
V/F ; Les récepteurs de la cell. sur lesquels se fixent les virus sont présentes pour répondre au besoin du virus
Faux : Il s’agit plutôt de molécules cellulaires ayant une fonction au sein de la cellule ou de l’organisme, et exploitées par le virus.
Qu’à t’on besoin pour étudier les virus
l’utilisation de cellules-hôtes adéquates à chaque virus
=> la découverte d’un système permettant la multiplication
d’un virus est souvent la première étape lorsqu’un nouvel agent infectieux est découvert
Quelle sont les deux méthodes pour la multiplication virale (étude )
l’utilisation de cellules isolées en culture, ou l’utilisation de l’organisme complet.
=> Sauf dans le cas des virus qui infectent des organismes
unicellulaires
Quelles sont les limites de cultures cellulaires
pas nécessairement possible
avec tous les virus. La diversité de types cellulaires pouvant être utilisés est également très
variable d’un virus à l’autre.
Quelle autre méthode d’étude peut on utiliser que le culture cellulaire
L’utilisation d’animaux de laboratoire peut aussi servir de solution de remplacement.
=>On peut aussi inclure dans cette catégorie l’œuf de poule embryonné, où l’embryon sert d’animal simple pour la multiplication de certains virus.
=> leurs tissus infectés d’échantillon de départ sert pour la purification du virus
Indiquez les principales étapes de la multiplication virale
1) Fixation
2) Entrée
3) Décapsidation
4) Réplication
5) Transcription
6) Traduction
7) assemblage
8) Sortie
La fixation du virus à la cellule se fait grace à quoi
à une interaction très spécifique avec un récepteur présent à la
surface cellulaire
Quels sont les deux modes d’entrée pour les virus portant une enveloppe lipidique
La fusion et l’endocytose
Qu’est ce qui détermine le mode d’entrée d’un virus avec une enveloppe lipidique
La nature de la glycoprotéine virale et de la surface cellulaire détermine le mode d’entrée, selon que le changement de conformation nécessaire peut se faire à la surface cellulaire ( fusion ) ou à l’intérieur de l’endosome ( endocytose )
Expliquez les étapes de l’entrée du virus dans la cellule par fusion
l’interaction entre le récepteur cellulaire et la glycoprotéine d’enveloppe virale (contre-récepteur) entraîne un changement de conformation de la protéine virale et le rapprochement des membranes lipidiques virales (enveloppe) et cellulaires (membrane cytoplasmique).
=> Après cette fusion, la capside se
retrouve à l’intérieur de la cellule.
Expliquez les étapes de l’entrée du virus dans la cellule par endocytose
l’interaction entre le récepteur cellulaire et le contre-récepteur viral n’est pas suffisante pour déclencher le processus de fusion:
1) L’acidification de l’endosome ou d’autres changements à l’intérieur de celui-ci, entraînent alors
le changement de conformation nécessaire à la fusion de l’enveloppe virale et de la membrane de l’endosome;
2) le résultat final étant donc la sortie de la capside qui se retrouve alors dans le cytoplasme.
Dans le cas des virus ne possédant pas d’enveloppe lipidique, l’interaction avec le récepteur
cellulaire entraîne quoi
L’endocytose
Expliquez l’étape de transcription (multiplication virale )
Chez certains virus, le génome viral composé d’ARN peut servir directement d’ARN messager sans transcription préalable.
=> Cependant, dans les autres cas, pour permettre la synthèse des protéines virales, on doit assister à la transcription du génome viral pour produire diverses molécules d’ARN messagers.
=> Cette transcription peut s’effectuer grâce à des enzymes virales ou cellulaires selon les virus.
Expliquez l’étape de traduction ( multiplication virale )
les protéines virales sont toujours synthétisées grâce à la machinerie de synthèse protéique cellulaire, mais évidemment à partir de l’information contenue dans l’ARN messager viral.
Expliquez l’étape de la réplication ( multiplication virale )
La multiplication virale nécessite évidemment la synthèse de multiples copies du génome viral.
=> peut faire appel à des protéines virales, cellulaires, ou les deux.
Expliquez l’étape de l’assemblage ( multiplication virale )
Après la synthèse de multiples exemplaires du génome viral,
ceux-ci doivent être encapsidés par les protéines virales nouvellement synthétisées.
Cette étape appelée assemblage nécessite une interaction entre les protéines virales et diverses séquences nucléotidiques présentes au niveau du génome viral
Expliquez l’étape des mécanismes de sortie ( multiplication virale )
1) La lyse cellulaire est observée chez de nombreux virus et est la méthode la plus directe.
2) Chez plusieurs virus enveloppés, on observe plutôt un phénomène de bourgeonnement viral lorsque la capside virale est relâchée de la cellule en entraînant avec elle une portion de la membrane cytoplasmique qui devient ainsi l’enveloppe lipidique virale.
Indiquez les différents types de multiplication de virus
*Virus à génome d’ARN (grippe, coronavirus….)
*Virus à génome d’ADN (herpes, papillomes….)
*Rétrovirus (VIH)
Expliquez la réplication des virus à ARN
1) Les virus ARN se multiplient au niveau du cytoplasme des cellules infectées ( possèdent pas d’enzymes nucléaires pouvant
utiliser l’ARN comme matrice)
2) Les virus à génome d’ARN doivent donc coder pour leur propre ARN polymérase, « dépendante » de l’ARN
3) L’ARN génomique du virus peut être traduit directement ou être
transcrit avant d’être traduit, selon les virus.
4) Les protéines synthétisées permettent la réplication
du génome viral
5) un ARN complémentaire au génome viral est
synthétisé
6) celui-ci est copié pour former plusieurs molécules du génome viral.
7) Les protéines de la capside sont finalement synthétisées et permettent l’encapsidation du génome répliqué
Expliquez la réplication des virus à ADN
se répliquent au moins en partie au niveau du noyau des
cellules.
=> Cette localisation nucléaire permet l’utilisation d’enzymes cellulaires (ARN polymérase
par exemple) pour la transcription produisant les ARN messagers viraux. (reconnaissance des séquences virales par les enzymes cellulaires)
1) Les ARN messagers seront traduits pour générer les enzymes virales permettant la réplication du génome viral qui implique souvent également la participation de
protéines cellulaires
2) Les protéines de la capside seront aussi synthétisées pour permettre l’encapsidation des génomes nouvellement répliqués
Quelle est la particularité des rétrovirus
Le génome viral est composé d’ARN; toutefois, la multiplication du virus implique une phase sous forme d’ADN.
Expliquez la réplication des rétrovirus
1) une transcriptase inverse (ADN polymérase dépendante de l’ARN) fait une première copie ADN du génome viral.
2) Ce premier brin d’ADN sert à son tour de matrice pour former un ADN bicaténaire grâce à une seconde activité de la transcriptase inverse, qui agit aussi comme ADN polymérase dépendante de l’ADN.
3) Cette copie ADN bicaténaire du génome viral est intégrée au génome de la cellule. Cette intégration se fait grâce à l’intégrase virale.
4) Le provirus peut alors être transcrit par l’ARN polymérase cellulaire comme s’il s’agissait de gènes de la cellule.
5) le génome viral sera aussi synthétisé de la même manière.
6) L’encapsidation suivra grâce à la synthèse des protéines virales par traduction des ARN messagers.
7) La transcriptase inverse et l’intégrase font également partie des nouveaux virions afin de permettre d’amorcer le cycle lors de l’infection de nouvelles cellules.