Cours 11: Controle de la transcription et maturation de l'ADN Flashcards
Explique comment l’allolactose régule l’expression de l’opéron lac
Quand du lactose est disponible comme source de carbone, une partie de ce lactose se transforme en allolactose; la fixation de ce dernier au répresseur lac I induit alors une transformation qui entraîne la dissociation du répresseur lac de son site de liaison sur l’opérateur.
L’inactivation du répresseur lac permet à l’ARN polymérase de commencer à transcrire l’opéron et d’induire l’expression des gènes.
L’allolactose est un …. du lactose
isomère beta-(1->6) du lactose
Sans présence d’allolactose, les colonies bactériennes sont blanches parce que…
Avec présence d’allolactose les colonies bactériennes sont bleues parce que…
Pas de production de l’enzyme beta-galactosidase codé par l’opéron lac parce quon retire pas le répresseur
Production de l’enzyme beta-galactosidase codé par l’opéron lac qui peut dégrader le lactose parce que l’allolactose retire le répresseur, ce qui fait que l’ARN pol peut transcrire l’opéron lac
L’activité du répresseur lac dépend du gène
lacl
En quoi la betagalactosidase transforme le lactose ?
Allolactose (isomère du lactose) en glucose et en galactose
Pourquoi on dit que le répresseur lac induit la formation dune boucle dans l’ADN
Le répresseur lac se fixe simultanément sur deux sites voisins du promoteur de l’opéron lac (O), induisant la formation d’une boucle dans l’ADN.
Pourquoi si le répresseur s’attache aux sites voisins du promoteur de l’opéron lac et non au promoteur lui-même, la transcription n’a tout de meme pas lieu
Bien que la fixation du répresseur lac n’empêche pas l’ARN polymérase de s ’attacher au promoteur, elle empêche cette enzyme de démarrer la transcription.
Le répresseur de lac est un …
tétramère
Chez les bactéries, il y aussi des activateurs. Nommes-en un et explique son action
La protéine CPR (Cyclic Amp receptor protein) ou CAP (meme chose) se lie à l’Amp cyclique (s’il y en a). Le complexe lie ensuite l’ADN pour aider à accélérer la transcription par l’ARN pol
Qu’est ce qui inhibe la formation de l’Amp cyclique
glucose
Les répresseurs peuvent freiner la transcription de différentes facons : explique les
Une des plus directe est d’empêcher l’ARN polymérase d’atteindre le promoteur; le site de fixation du répresseur est alors tellement proche du promoteur qu’une fois fixé, il ne reste plus assez d’espace pour que l’holoenzyme d’ARN polymérase prenne contact avec le promoteur.
Dans d’autres cas, les répresseurs n’empêchent pas l’attachement de l’ARN polymérase mais inhibent des réactions d’initiation, comme l’isomérisation (Isomérisation = changement conformationnel du complexe de la polymérase et de l’ADN) ou encore empêche l’enzyme de quitter le promoteur (Ex: répresseur lac de E. coli).
Comment prédire le phénotype d’une bactérie mutante de lac I ?
a) Les gènes lac sont seulement bien exprimés en absence de lactose
b) Les gènes lac sont seulement bien exprimés en présence de lactose
c) Les gènes lac ne sont pas bien exprimés
d) Les gènes lac sont exprimés tout le temps
d
Les bactéries mutantes ont une mutation dans le gène lacl qui fait les répresseurs donc jamais de répresseurs (c’est pour ca que les colonies étaient bleues, l’opéron lac est toujours exprimé)
Comment prédire le phénotype d’une bactérie mutante de l’opérateur (site de liaison de lac I) ?
a) Les gènes lac sont seulement bien exprimés en absence de lactose
b) Les gènes lac sont seulement bien exprimés en présence de lactose
c) Les gènes lac ne sont pas bien exprimés
d) Les gènes lac sont exprimés tout le temps
d
Le répresseur ne peut pas lier l’opérateur donc toujours la transcription
Ou se fixe les facteurs de transcription
Du point de vue structural, les FT possèdent un ou plusieurs domaine(s) de fixation à l’ADN qui se fixent à deux domaines fonctionnels
1- le domaine de liaison a l’ADN
2- le domaine de régulation de la transcription.
Nomme les deux types de facteurs de transcription
on peut classifier les FT en facteurs constitutive (pas besoin de régulation) et facteurs régulateurs. Les facteurs régulateurs sont ensuite régulés par le développement ou par des signaux spécifiques: par exemple des hormones pour les récepteurs nucléaires, signaux de stress et des voies de signalisation.
Donne un exemple de facteur de transcription régulateur
p53, un facteur activé par le stress d’un dommage a l’ADN. p53 lie l’ADN dans des séquences palindromiques en forme de tétramère.
QU,est ce qu’un élément de réponse ou enhancer?
Éléments de réponse (response elements) : sites de fixation initiale des FT qui recrutent médiateur, les facteur généraux et l’ARN polymérase.
Chaque Facteur de transcription lie de façon spécifique une séquence consensus qui constitue son ….. . Après cette liaison, le FT peut recruter…
Élément de réponse
les complexes de remodelage de la chromatine, médiateur, les FG et la ARN polymérase.
Vrai ou faux
Chaque facteur de transcription régule l’expression d’un gène
Faux
Chaque facteur de transcription régule l’expression de millier de genes
Ou son situer les éléments de réponse par rapport au promoteur?
Les éléments de réponse sont situés souvent en amont du promoteur et peuvent agir a distance de plusieurs kilobases.
Chez les organismes multicellulaire, comment on différencie les cellules spécialisées à partir des cellules progénitrices
Chaque type cellulaire est régulé par un ou une combinaison spécifiques des FT
Donne des exemples de différenciation cellulaire selon les Facteurs de transcription
le FT MyoD contrôle le tissue musculaire, GATA1 les cellules rouges et une combinaison de FTs les cellules béta pancréatiques qui produisent l’insuline
Parmi ces éléments, que font les facteurs de transcription ?
- Ils se fixent de façon spécifique à des éléments de réponse
- Ils agissent toujours proche du promoteur
- Ils induisent la formation d’une boucle de l’ADN entre les séquences régulatrices et le promoteur
1 et 3
Dessine ou se situe la boite de branchement et son principal constituant important
Cette boîte de branchement comporte une adénosine qui joue un rôle central dans le processus d’épissage.
Dessine et explique les deux étapes de l’épissage
d’abord une attaque nucléophile du 2’-OH du ribose de l’adénosine de la boite de branchement sur le phosphate de la jonction exon-intron en 5’. Le résultat de cette 1ere réaction c’est la libération de l’extrémité 3’ de l’exon en amont et une nouvelle réaction phosphodiester entre le 5’OH du premier nucléotide de l’intron et le 2’OH s de l’adénosine de la boite de branchement
2- Ensuite, le 3’-OH libéré au niveau de l’exon amont attaque le phosphate de la jonction intron-exon en aval. Les produits de cette réaction sont d’une part les deux exons ligaturés correctement et d’autre part, l’intron cyclisé ou lasso au niveau de l’adénosine de la boîte de branchement. L’intron eliminé est souvent dégradé.
