Compléments du cours 10

Question 1

Dit le nom complet de l’ADN et l’ARN

Answer 1

ADN:
acide désoxyribonucléique
ArN :
acide ribonucléique

Question 2

De quoi son formés les nucléotides?

Answer 2

PO4(2-) et de nucléoside (constitués d’une base azoté et de pentose)

Question 3

Explique les liaisons entre les molécules formant un nucléotide

Answer 3

Pentose - liaison phosphoester - phosphate (sucre à 5 c)
Pentose - liaison glycosidique -base azotée (formé d’azote et de carbone)

Question 4

Quelles bases azotés sont:

a) des purines
b) des pyrimidines
c) font la liaison glycosidique à l’aide de l’azote (N) en position 9
d) font la liaison glycosidique à l’aide du N en position 1
e) ont deux cycle carboné
f) ont 1 cycle carboné

Answer 4

a) adénine et guanine
b) cytosine, thymine, uracile
c) les purines
d) les pyrimidines
e) purines
f) pyrimidines

Question 5

Comment on distingue un brin d’ADN d’un brin d’ARN

Answer 5

Deux différnces
1)
ADN : on retrouve de la thymine
ARN : on retrouve de l’uracile a la place de la thymine
2)
ADN: 2-deoxy-beta-D-ribofuranose (c’est le pentose)
ARN: beta-D-ribofuranose
*la différence est qu’en position 2, ADN le pentose a un H et ARN il a un OH

Question 6

Au ph de la cellule, le phosphate des nucléotide est chargé comment

Answer 6

possède deux charges négatives

Question 7

Explique la structure d’un nucléoside

Answer 7

Formé d’une base azotée liée à un pentose

Liaison covalente N-glycosidique entre le C-1’ du sucre et N-1 des pyrimidines ou N-9 des purines

groupement OH

Chez les ribonucléosides: en 2’, 3’ et 5’

Chez les désoxyribonucléosides : en 3’ et 5’

Question 8

Comment se forme les liaisons phosphoester entre le sucre et le phosphate?

Answer 8

OH du sucre est estérifiable par le PO4 (2-)

Question 9

Nomme les nucléosides et explique la logique de la nomenclature

Answer 9

nomenclature : purine=osine, pyrimidine=idine

Adénosine, guanosine, cytidine, uridine

Question 11

À quoi ressemble la structure de la majorité des nucléotides

Answer 11

ribonucléotides phosphorylés en 5’

Question 12

Quelle est la liaison qui lie les 2ieme et 3 ieme phosphate accroché au pentose?

Answer 12

liaison phosphoanhydre

Question 13

Quelle est la principale fonction des nucléotides?

Answer 13

transfert des groupements phosphates au substrat (énergise les substrats)

Question 14

Nomme une autre fonction des nucléotides

Answer 14

transfert d’un groupe adénilyl, guanidilyl, cytidilyl,uridilyl ou thmidilyl

Question 15

Différence entre un nucléoside et nucléotide

Answer 15

Nucléoside n’a pas de groupement phosphate

Question 16

Donne l’abréviation pour l’adénosine 5’-monophosphate, la molécule de sucre qui le compose et si on le retrouve dans l’ADN ou l’ArN

Answer 16

AMP, ribose, ARN

Question 17

Quelle liaison relie les nucléotides entre eux

Answer 17

liaison phosphodiester 3’-5’

Question 18

dans quel sens se synthétise l’adn et l’ArN et dans quel sens on note les nucléotide

Answer 18

5’ à 3’

Question 19

Explique la règle de chargaff

Answer 19

1. Ratio Pu/Py =1
2. A=T et G=C

donc A+G = C+T mais A+T/G+C varie

Question 20

Lors du pairage de l’Adénine avec la tyrosine, comment a lieu la liaison

Answer 20

charge delta+ sur NH2 en pos 6 de l’Adénine rencontre charge delta -de O en pos 4 de la tyrosine

Charge delta - sur N en position 1 de l’adénine rencontre charge delta + de NH en position 3 de la tyrosine

2 liaisons

Question 21

Qu’est ce qui pourrait faire croire que les paires de base n’ont pas le meme diametre?

Answer 21

Parcequ’il y a trois liaisons entre G et C et seulement deux entre A-T et A-U

Question 22

Qui a decouvert l’adN

Answer 22

Watson et crick

Question 23

Explique les différences entre AdN B, A et Z

Answer 23

ADN B

hélice droite, favorisée en milieu aqueux, 10-10,5 base/tour, 0,34nm entre les pb

ADN A

hélice droite, 11 bases/tour, - espace entre les pb, + compacte, sillon égaux (pas de majeur et mineur)

ADN-Z

structure riche en G-C, hélice gauche, pas de sillon

Question 24

Quelles forces stabilisent l’ADN B

Answer 24

Effet hydrophobe (entre les paires de base)

Force de Van der Waals (empilement des bases)

Ponts H (AT et GC on se rappelle que GC plus fort que AT parceque 3 liaisons au lieu de 2)

Ponts salins (groupe phosphodiester neg et cation mg++)

Question 25

Explique les conditions qui font varier la température de fusion TM avec le graphique de l’absorbance

Answer 25

lorsque l’absorbance augmente, on a plus d’ADN simple brin

Lorsque l’absorbance diminue, on a plus d’ADN double brin

Si on a plus de A-T, la température de fusion sera plus faible parce que lien moins fort qu’avec G-C donc plus facile à briser et donc absorbance augmente plus rapidement

Si on a plus de G-C température de fusion plus grande parce que besoin de plus d’énergie pour briser 3 liaison absorbance augmente plus tard

Question 26

Explique la notion de température de fucsion TM

Answer 26

Température a laquelle 50% de l’ADN est simple brin et l’autre 50% est double brin

Question 27

Quelle est la structure quaternaire de l,ADN

Answer 27

la chromatine

Question 28

Qu’est ce que le nucléosome

Answer 28

octamère d’histone autour duquel l’ADN s’enroule

Cela constitue le premier niveau d’enroulement

Question 29

De quelles prot est composé l’histone

Answer 29

H1, H2A, H2B, H3, H4

protéines basiques richez en lysine et arginine

Question 30

Facteur de condensation du premier niveau d’enroulement

Answer 30

10X

Question 31

Quelle structure on peut observer quand on met la chromatine en milieu de faible force ionique

Answer 31

il y a décondensation de la chromatine et on peut voir le collier de perle (ADN double brin qui lie les histones)

Question 32

Combien de pb d’une perle à l’autre dans la structure en collier de perle

Answer 32

200pb

Question 33

Explique le deuxieme niveau de condensation de l’AdN

Answer 33

forme solénoide

6 nucléosomes par tour (1200pb/ tour)

Stabilisation par l’histone H1

facteur de condensation 4X (40X au total avec le premier niveau)

Question 34

Explique le troisième facteur de condensation

Answer 34

Boucles et mini bandes

60 000 à 150 000 pb ancrées à une charpente de protéine NON-HISTONE

enroulement des boucles en minibandes de 18 loupes

facteur d’enroulement 200x

en tout 10X+4X+200X (8000)

Question 35

Explique la structure du chromosome

Answer 35

Empilement de minibandes stabilisé par des complexes de prot et d’ARN

2,4x10*8 pb

longueur 10 um

23 paires de chromo = 46 molécules d’ADN db