Compléments du cours 10 Flashcards
Dit le nom complet de l’ADN et l’ARN
ADN:
acide désoxyribonucléique
ArN :
acide ribonucléique
De quoi son formés les nucléotides?
PO4(2-) et de nucléoside (constitués d’une base azoté et de pentose)
Explique les liaisons entre les molécules formant un nucléotide
Pentose - liaison phosphoester - phosphate (sucre à 5 c)
Pentose - liaison glycosidique -base azotée (formé d’azote et de carbone)
Quelles bases azotés sont:
a) des purines
b) des pyrimidines
c) font la liaison glycosidique à l’aide de l’azote (N) en position 9
d) font la liaison glycosidique à l’aide du N en position 1
e) ont deux cycle carboné
f) ont 1 cycle carboné
a) adénine et guanine
b) cytosine, thymine, uracile
c) les purines
d) les pyrimidines
e) purines
f) pyrimidines
Comment on distingue un brin d’ADN d’un brin d’ARN
Deux différnces
1)
ADN : on retrouve de la thymine
ARN : on retrouve de l’uracile a la place de la thymine
2)
ADN: 2-deoxy-beta-D-ribofuranose (c’est le pentose)
ARN: beta-D-ribofuranose
*la différence est qu’en position 2, ADN le pentose a un H et ARN il a un OH
Au ph de la cellule, le phosphate des nucléotide est chargé comment
possède deux charges négatives
Explique la structure d’un nucléoside
Formé d’une base azotée liée à un pentose
Liaison covalente N-glycosidique entre le C-1’ du sucre et N-1 des pyrimidines ou N-9 des purines
groupement OH
Chez les ribonucléosides: en 2’, 3’ et 5’
Chez les désoxyribonucléosides : en 3’ et 5’
Comment se forme les liaisons phosphoester entre le sucre et le phosphate?
OH du sucre est estérifiable par le PO4 (2-)
Nomme les nucléosides et explique la logique de la nomenclature
nomenclature : purine=osine, pyrimidine=idine
Adénosine, guanosine, cytidine, uridine
À quoi ressemble la structure de la majorité des nucléotides
ribonucléotides phosphorylés en 5’
Quelle est la liaison qui lie les 2ieme et 3 ieme phosphate accroché au pentose?
liaison phosphoanhydre
Quelle est la principale fonction des nucléotides?
transfert des groupements phosphates au substrat (énergise les substrats)
Nomme une autre fonction des nucléotides
transfert d’un groupe adénilyl, guanidilyl, cytidilyl,uridilyl ou thmidilyl
Différence entre un nucléoside et nucléotide
Nucléoside n’a pas de groupement phosphate
Donne l’abréviation pour l’adénosine 5’-monophosphate, la molécule de sucre qui le compose et si on le retrouve dans l’ADN ou l’ArN
AMP, ribose, ARN
Quelle liaison relie les nucléotides entre eux
liaison phosphodiester 3’-5’
dans quel sens se synthétise l’adn et l’ArN et dans quel sens on note les nucléotide
5’ à 3’
Explique la règle de chargaff
- Ratio Pu/Py =1
- A=T et G=C
donc A+G = C+T mais A+T/G+C varie
Lors du pairage de l’Adénine avec la tyrosine, comment a lieu la liaison
charge delta+ sur NH2 en pos 6 de l’Adénine rencontre charge delta -de O en pos 4 de la tyrosine
Charge delta - sur N en position 1 de l’adénine rencontre charge delta + de NH en position 3 de la tyrosine
2 liaisons
Qu’est ce qui pourrait faire croire que les paires de base n’ont pas le meme diametre?
Parcequ’il y a trois liaisons entre G et C et seulement deux entre A-T et A-U
Qui a decouvert l’adN
Watson et crick
Explique les différences entre AdN B, A et Z
ADN B
hélice droite, favorisée en milieu aqueux, 10-10,5 base/tour, 0,34nm entre les pb
ADN A
hélice droite, 11 bases/tour, - espace entre les pb, + compacte, sillon égaux (pas de majeur et mineur)
ADN-Z
structure riche en G-C, hélice gauche, pas de sillon
Quelles forces stabilisent l’ADN B
Effet hydrophobe (entre les paires de base)
Force de Van der Waals (empilement des bases)
Ponts H (AT et GC on se rappelle que GC plus fort que AT parceque 3 liaisons au lieu de 2)
Ponts salins (groupe phosphodiester neg et cation mg++)
Explique les conditions qui font varier la température de fusion TM avec le graphique de l’absorbance
lorsque l’absorbance augmente, on a plus d’ADN simple brin
Lorsque l’absorbance diminue, on a plus d’ADN double brin
Si on a plus de A-T, la température de fusion sera plus faible parce que lien moins fort qu’avec G-C donc plus facile à briser et donc absorbance augmente plus rapidement
Si on a plus de G-C température de fusion plus grande parce que besoin de plus d’énergie pour briser 3 liaison absorbance augmente plus tard
Explique la notion de température de fucsion TM
Température a laquelle 50% de l’ADN est simple brin et l’autre 50% est double brin
Quelle est la structure quaternaire de l,ADN
la chromatine
Qu’est ce que le nucléosome
octamère d’histone autour duquel l’ADN s’enroule
Cela constitue le premier niveau d’enroulement
De quelles prot est composé l’histone
H1, H2A, H2B, H3, H4
protéines basiques richez en lysine et arginine
Facteur de condensation du premier niveau d’enroulement
10X
Quelle structure on peut observer quand on met la chromatine en milieu de faible force ionique
il y a décondensation de la chromatine et on peut voir le collier de perle (ADN double brin qui lie les histones)
Combien de pb d’une perle à l’autre dans la structure en collier de perle
200pb
Explique le deuxieme niveau de condensation de l’AdN
forme solénoide
6 nucléosomes par tour (1200pb/ tour)
Stabilisation par l’histone H1
facteur de condensation 4X (40X au total avec le premier niveau)
Explique le troisième facteur de condensation
Boucles et mini bandes
60 000 à 150 000 pb ancrées à une charpente de protéine NON-HISTONE
enroulement des boucles en minibandes de 18 loupes
facteur d’enroulement 200x
en tout 10X+4X+200X (8000)
Explique la structure du chromosome
Empilement de minibandes stabilisé par des complexes de prot et d’ARN
2,4x10*8 pb
longueur 10 um
23 paires de chromo = 46 molécules d’ADN db
