Compléments du cours 11

Question 1

Description Arn messager

Answer 1

inclut toute les informations spécifiant la séquence des acides aminés d’une protéine

Question 2

En terme de masse, quel ARN est le plus abondant?

Answer 2

ARN ribosomal (80/90%)

Question 3

Différencie arn codant de non-codant

Answer 3

Codant : porte l’info pour déterminer la séquence d’une protéine
Non-codant: ne codent pas pour des protéines et leur fonction est directement accomplie par l’ARN

Question 4

nomme deux arn non codant les plus importants

Answer 4

ARN ribosomal
ARN de transfert
Ils jouent un rôle dans la traduction

Question 5

En terme de nombre de molécule, quel ARN est le plus nombreux

Answer 5

ARN t

Question 6

Niomme les caractéristiques de la structure de l’ArN

Answer 6

ribose au lieu de desoxyribose (donc 2’ OH)
U au lieu de T
Monocaténaire
Appariement des bases intramoléculaire (s’attache à lui mm)
Régions appariées plus courtes
Plusieurs bases modifiées

Question 7

Quelle est la forme de l’ARN de transfert

Answer 7

Forme de treffle

Question 8

Quelles modifications on voit fréquemment sur les bases des nucléotides de l’ARNt?

Answer 8

Méthylation des bases (ajout d’un CH3 sur un des N du nucléotide)
Pseudo-uridylation (liaison glycosidique entre ribose et N de la base change passe de N-glycosidique à C-glycosidique) ex: conversion d’uridine en pseudouridine

Question 9

À l’origine, des polymères d’…. formaient les premiers organismes vivants et l’… et les … ont été ajoutés après

Answer 9

ARN
ADN et les protéines

Question 10

Donne exemple de ribozyme et ses caractéristiques

Answer 10

Ribozyme: Rnase P (qui joue un rôle dans la matiration de l’ArNt en catalysant) et ribosome
Les ribozymes sont des ARN doués d’activité enzymatique (spécificité du substrat, non modifié par la rx, accélèrent les rx)

Question 11

Nomme les ARN qui participe au transfert d’info génétique de l’ADN aux protéines

Answer 11

ARN de transfert : apporte les acides aminés à la machinerie de traduction

ARN ribosomique: occupe la plus grande partie du riboseome

ARN messager: séquence complémentaire à un des brins d’ADN qui est traduit au niveau des ribosomes en protéines

Question 12

Qui est ce qui cataluse la synthèse de l’ArN et sous quelle forme est libérée l’ARN nouvellement synthétisé?

Answer 12

ARN polymérase
Libéré sous la forme d’une molécule simple brine excepté une petite hélice ARNADN de 8-9 nucléotides

Question 13

Combien de sous-unités dans l’ARN polymérase bactérienne et a quoi ressemble la structure de l’arn pol?

Answer 13

5, une pince de crabe

Question 14

Explique les étapes de la synthèse d’ARN

Answer 14

3 OH’ attaque le P alpha d’un nucléotide
formation de liaison phosphodiester
Libération de PPi
Par contre pas besoin d’amorce !!!!

Question 15

En quoi consiste le promoteur et qu’est ce qui le reconnait chez les bactérie et chez les eucaryotes

Answer 15

Promoteur=région de l’AdN ou s’amorce la transcription

Chez les bact: l’élément sigma de l’arn polymérase sert à reconnaitre le promoteur

chez les euca: facteurs généraux de transcription reconnaissent le promoteur

Question 16

Def: PLusieurs gènes sont souvent transcrits comme un tout sous la commande d’un promoteur commun

Answer 16

Opéron (chez les bact seulement)

Question 17

Vrai ou faux

Dans la cellule eucaryote, chaque gène possède en général son propre promoteur

Answer 17

vrai

Question 18

Décrit les séquences promotrices chez e.coli

Answer 18

5’—-(-35 région=TTGACA)————–(-10 région=TATAAT)——(+1=N transcription start site)—3’

Question 19

Quelle partie de l’Arn polymérase lie les séquences promotrices -35 et -10?

Answer 19

sous unité sigma

Question 20

Explique pourquoi chez les eucaryotes l’ARN pol ne peut pas directement se lier aux séquences promotrices de l’AdN

Answer 20

1. ADN beaucoup trop abondant
2. ADN condensé en chromatine donc pas accessible

Question 21

Explique les 3 étapes de l’initiation de la transcription chez les eucaryotes

Answer 21

1. Remodelage de la chromatine

(facteurs de transcription spécifiques ne lient pas le promoteur, complexe de remodelage ouvre la chromatine)

2. Recrutement du médiateur
3. Recrutement de facteurs généraux de la transcription et de l’ARN polymérase

Question 22

Comment on appelle les facteurs de transcription et que font-ils?

Answer 22

nommés pionniers recrutent des complexes de remodelage de la chromatine qui vont ouvrir la chromatine et exposer la région du promoteur.

Question 23

Explique l’action du complexe de remodelage

Answer 23

Contient une ATPase de la superfamille SNF2

Catalyse le glissement ou le déroulement de nucléosomes, l’éviction des histones ou l’échange des histones

Question 24

Le remodelage de la chromatine implique la modification des queues … des histones

Answer 24

N-terminales

Question 25

Le code des histones détermine la conformation ouverte ou fermée de la chromatine, explique des types de modification chez les histones

Answer 25

Parmi les modifications qui ferment la chromatine et donc servent à la répression des gènes: méthylation des lysines 9 et 27 de la H3

(H3K9me2)

(H3K27me3)

Parmi les modifications qui servent à l’activation de la chromatine : méthylation de la lysine 4 de la H3, acétylation des lysines 9 de H3 et acétylation de la lysine 16 de H4.

(H3K4me3)

(H3K9ac)

(H4K16ac)

Question 26

Les histone acétyltransférases (HAT) aident à …. la chromatine en ajoutant des groupement …. sur la chaîne latérale des … . Des histones désacétylases (HDAC) … cette modification.

Answer 26

Décondenser

Acétyles

Lysines

Annulent

Question 27

Explique la liaison des différents éléments nécessaires au début de la transcription

Answer 27

Assemblage des amplificateurs(enhancers) avec les activateurs(facteurs de transcription) avec le groupe médiateur avec les facteurs généraux sur le promoteur pour lier l’ARN pol2

Question 28

Quel facteur général de l’ARN pol 2 a un rôle similaire au facteur sigma chez les bact

Answer 28

TFIIB est similaire aux facteurs sigma bactériens.

Question 29

Explique le rôle du médiateur

Answer 29

Médiateur est recruté au promoteur. C’est en fait le Médiateur qui recrute les facteur généraux et l’ARN polymérase. Le Médiateur fait des contacts avec les facteurs de transcription, la chromatine modifiée et les facteurs généraux.

Question 30

Comment on nomme les facteurs généraux de la pol 2

Answer 30

À noter que l’ARN polymérase qui synthétise l’ARN messager est nommé pol II. En conséquence, les facteurs généraux de la pol II portent tous le chiffre romain II.

Les FG son identifiés avec des lettres, alors nous avons TFIIA jusqu’au TFIl-I. Les mieux étudiés sont: TFIID et TFIIH.

Question 31

Quels éléments du promoteur TfIIB lie

Answer 31

les éléments BRE

Question 32

Quelle sous-unité de TFIID lie le TATA box?

Answer 32

TBP (TATAbindingprotein)

Question 33

POurquoi la reconnaissance du promoteur nécessite autant de liaisons avec les facteurs généraux?

Answer 33

Parce que un gène donné peut contenir plusieurs éléments promoteurs mais pas tout (on a donc besoin de tous les facteurs généraux pour etre sure de reconnaitre les éléments promoteurs

Question 34

Quel facteur général est un complexe protéique et quelles sont ses deux sous-unités importantes ?

Answer 34

TFIID (sous-unités = TBP (tata binding protein) et TAF1)

Question 35

Explique les rôles de TAF1 et dit elle fait partie de quel facteur généraux

Answer 35

1- lier TBP, 2- activité HAT, 3- Bromodomaine qui peut lier les lysines acétylées (des histones modifiées par exemple) 4- activité kinase et 5- Activité monoubiquitine ligase de l’histone H1.

Elle fait partie de TFIID

Question 36

À quel moment le facteur TFIIH est recruté?

Answer 36

Une fois la pol II avec quelques facteurs généraux liés au promoteur

Question 37

TFIIH est important pour deux étapes de l’initiation via des activités catalytiques importantes explique les!

Answer 37

a) Formation de la bulle de transcription: TFIIH possède des hélicases qui déroulent l’ADN et permettent la formation de la bulle de transcription et l’activation de l’ARN polymérase: L’activité kinase de la sous-unité CDK7 de TFIIH sur la sérine 5 du domaine C terminal (CTD) de la sous-unité RBP1 génère la forme active de la pol II. Cette forme active fait par contre des transcriptions abortives (tri-nucléotides).
b) Dégagement du promoteur, l’ARN polymérase dégage le promoteur, l’hybride ARN-ADN atteint sa longueur mature (10 ntds) et la bulle de transcription avance (direction 5’-3’ par rapport au brin codant)
c) Mode élongation: Recrutement de la kinase CDK9 pour phosphoryler le CTD en sérine 2 et le recrutement du facteur d’élongation TEFb. La phosphorylation en sérine 2 du CTD change la pol II du mode d’initiation au mode d’élongation.

Question 38

Le domaine …. de mammifères contient 52 pseudorépétitions de la séquence YSPTSPS

Answer 38

C-terminal

Question 39

Résume les différents acteurs de la transcription chez les eubactéries, archea et eucaryotes

Answer 39

Eubactéries : le facteur sigma aide l’ARN polymérase à lier le promoteur. Un élément enhancer est généralement proximal au promoteur de base, et est occupé par un ou quelques activateurs.

Archea: Les facteurs généraux (TBP, TFB et TFE) substituent le facteur sigma. Plusieurs enhancers agissent en amont du promoteur pour recruter l’ARN polymérase et les facteurs généraux.

Eucaryotes: Les facteurs généraux augmentent en nombre. Plusieurs activateurs lient des enhancers qui peuvent être éloignés du promoteur de base. Le complexe médiateur aide les activateurs à recruter l’ARN polymérase et les facteurs généraux.