Cours 10: Microbiome du colon humain

Question 1

Quels sont les synonymes de microbiome ?

Answer 1

Microflore ou microflore microbienne.

Question 2

Qu’est ce qu’un microbiome ?

Answer 2

C’est l’ensemble des micro-organismes du corps humain (pas seulement les bactéries)

Question 3

Quel est le rôle principal du microbiome ?

Answer 3

C’est la protection par la défense immunitaire car empêche les pathogènes de venir s’installer en occupant l’espace et par assimilation des nutriments. C’est la 1ère ligne de défense non-spécifique.
L’autre rôle est la maturation du système immunitaire.

Question 4

Un humain est constitué approximativement de 90% de cellules humaines et 10% de cellules bactériennes. V ou F ?

Answer 4

C’est faux, c’est l’inverse. La majeure partie de ces bactéries colonise le gros intestin (colon).

Question 5

Qu’est ce que la microflore bactérienne normale ?

Answer 5

Ce sont les microbes qui colonisent divers sites anatomiques pendant et suivant la naissance. Elle est dynamique et fluctue toute la vie.

Question 6

Combien de microbiome existe t’il pour chacun des sites anatomiques ?

Answer 6

1 pour chaque niche écologique.

Question 7

Quel est la composition du microbiome ?

Answer 7

C’est difficile à déterminer car trop liée aux changements environnementaux.

Question 8

à quoi correspondent les techniques métagénomiques et quelles sont-elles ? (2)

Answer 8

Techniques métagénomiques = mise en évidence des espèces sans les cultiver

• Analyses génomiques des selles (25% du contenu du colon)
• aérobie et anaérobie

Question 9

Quelles sont les bactéries les plus communes et les plus présentes du microbiome intestinal ?

Answer 9

• Firmicutes (60-80%) –> clostridium et lactobacillus
• Bacteriodetes (20-40%)
• Actinobacteria
• Proteobacteria

Question 10

Comment est-ce que les bactéries qui résident dans l’intestin grêle finissent par se retrouver dans les matières fécales ?

Answer 10

Lors du renouvellement cellulaire, elles se décrochent de la paroi intestinale et finissent dans les selles.

Question 11

Quelle est la quantité de bactéries présentes dans l’intestin grêle ?

Answer 11

< 10^6/mL 9c’est rien comparé au colon)

Question 12

Quelles sont les 3 régions anatomiques de l’‘intestin grêle ?

Answer 12

• Duodénum: peu de microbes à cause des sucs acides, bile et sécrétions pancréatiques. Cocci et bâtonnet Gram+
• Jéjunum: enterococus faecsalis, lactobacillus, candida albicans
• Iléon: pH devient + alcalin, anaérobie Gram -, enterobacteriaceae

Question 13

Où se trouve la plus grande population et diversité microbienne ?

Answer 13

Dans le colon, + de 1000 espèces différentes.

La plupart des bactéries sont anaérobies strictes. (95-99%)

Question 14

Quelles sont les bactéries retrouvées dans le colon ? (6)

Answer 14

• Bacteroides (surtout B.fragilis) –> batonnet Gram - 25%
• Peptostreptococcus –> cocci Gram +
• Clostridium –> batonnet Gram +
• Fusobacterium
• Enterococcus –> cocci Gram +
• E.coli (0,1%)

Question 15

Comment peut-on restaurer la flore ?

Answer 15

À l’aide de probiotiques composés de lactobacillus et/ou bifidobacterium

Question 16

Quels sont les autres micro-organismes retrouvés dans le colon ?

Answer 16

• Mycètes: candida albicans

- Protozoaires: Trichomonas hominis, Entamoeba hartmanii et Endolimax nana

Question 17

Est-ce que l’adhérence est nécessaire comme dans l’intestin grêle ?

Answer 17

Non car le flot est + lent.

Question 18

Qu’est ce qui permet une concentration de bactéries très élevée ?

Answer 18

L’abondance de nutriments (milieu riche en polysaccharides et en protéines).
Les bactéries prennent 1/4.

Question 19

Quel est le mécanisme de défense contre l’adhérence des bactéries à la paroi ?

Answer 19

• Le taux de régénérescence élevé (taux de division).

- Épaisse couche de mucus

Question 20

Pourquoi l’hôte produit du mucus ?

Answer 20

C’est en réponse à des composés bactériens provenant du microbiome.

Question 21

Quels sont les rôles du microbiome du colon ? (5)

Answer 21

• Digestion des aliments par des enzymes (1er rôle) en succinate, lactate, AG courtes chaînes, acétate, propinate et butyrate.
• Production d’agents antibactériens (bactériocines et colicines) empêchant la colonisation par des pathogènes
• Protection de l’épithélium en y adhérant (transitoire)
• Production de vitamines B et K
• Stimulation antigénique du SI

Question 22

Qui sont les 1er résidents du colon des nourrissons allaités et des nourrissons non allaités ?

Answer 22

Nourrissions allaités: bifidobacterium.

Nourrissons non allaités: lactobacillus

Question 23

Lors de l’ingestion de nourriture solide, par qui sont remplacés les colonisateurs initiaux ?

Answer 23

Par une microflore gram - (entererobacteriaceae dont E.coli) qui provoquent une diminution de l’O2 ==> apaprition des bacteroides qui peuvent coloniser que en condition anaérobie.

Question 24

Quelle est la durée de l’établissement de la flore mature ?

Answer 24

2 ans.

Question 25

Quelles sont les sources des bactéries colonisantes ? (3)

Answer 25

• Parents et autres proches
• Environnement
• Mode de vie de l’enfant

Question 26

Que possèdent les consommateurs de viande dans leurs selles ?

Answer 26

Plus de bacteroides et autres anaérobies que les consommateurs de poissons et légumes.

Question 27

Qu’est ce que les bactéries commensales ?

Answer 27

Ce sont des bactéries de la flore non considérées comme étrangères par le SI et qui renforcent la réponse immune en le gardant en alerte.

Question 28

Que provoquent une inflammation légère induite par le microbiome ? (2)

Answer 28

-Sécrétion de peptides antibiotiques
-Stimulation des cellules productrices d’anticorps
Ce qui empêche les bactéries de pénétrer la membrane muqueuse.

Question 29

Donnez 2 exemples de maladies causées par un microbiome du colon incomplet ou perturbé.

Answer 29

1. Botulisme infantile chez l’enfant (0-2 ans) par des spores de Clostridium botulinum trouvé dans le miel ==> germination des spores ==> production de neurotoxines ==> paralysie et mort.
2. Colite pseudomembraneuse par clostridium difficile ==> sécrétion de toxines ==> détérioration de la muqueuse

Question 30

Donnez quelques exemples du rôle bénéfique du microbiome du colon ?

Answer 30

• Contrôle de l’appétit
• Production de butyrate par Lactobacillus rhamnosus (nutriment important pour les colonocytes, propriétés anti-inflammatoires)
• Inducteurs de production de sérotonine sécrétés par des espèces sporulantes (clostridium).

Question 31

Quels sont les rôles de la sérotonine ? (3)

Answer 31

• Dans la dépression
• Dans la santé cardiaque
• Dans la santé des os et gastro-intestinale

Question 32

Une baisse de la diversité du microbiome peut entraîner une baisse de la fonctionnalité . V ou F ?

Answer 32

C’est vrai.

Question 33

Pourrait-il y avoir un lien entre une antibiothérapie et une maladie non infectieuse ?

Answer 33

Oui, de manière indirecte.