Cours 10: Microbiome du colon humain Flashcards
Quels sont les synonymes de microbiome ?
Microflore ou microflore microbienne.
Qu’est ce qu’un microbiome ?
C’est l’ensemble des micro-organismes du corps humain (pas seulement les bactéries)
Quel est le rôle principal du microbiome ?
C’est la protection par la défense immunitaire car empêche les pathogènes de venir s’installer en occupant l’espace et par assimilation des nutriments. C’est la 1ère ligne de défense non-spécifique.
L’autre rôle est la maturation du système immunitaire.
Un humain est constitué approximativement de 90% de cellules humaines et 10% de cellules bactériennes. V ou F ?
C’est faux, c’est l’inverse. La majeure partie de ces bactéries colonise le gros intestin (colon).
Qu’est ce que la microflore bactérienne normale ?
Ce sont les microbes qui colonisent divers sites anatomiques pendant et suivant la naissance. Elle est dynamique et fluctue toute la vie.
Combien de microbiome existe t’il pour chacun des sites anatomiques ?
1 pour chaque niche écologique.
Quel est la composition du microbiome ?
C’est difficile à déterminer car trop liée aux changements environnementaux.
à quoi correspondent les techniques métagénomiques et quelles sont-elles ? (2)
Techniques métagénomiques = mise en évidence des espèces sans les cultiver
- Analyses génomiques des selles (25% du contenu du colon)
- aérobie et anaérobie
Quelles sont les bactéries les plus communes et les plus présentes du microbiome intestinal ?
- Firmicutes (60-80%) –> clostridium et lactobacillus
- Bacteriodetes (20-40%)
- Actinobacteria
- Proteobacteria
Comment est-ce que les bactéries qui résident dans l’intestin grêle finissent par se retrouver dans les matières fécales ?
Lors du renouvellement cellulaire, elles se décrochent de la paroi intestinale et finissent dans les selles.
Quelle est la quantité de bactéries présentes dans l’intestin grêle ?
< 10^6/mL 9c’est rien comparé au colon)
Quelles sont les 3 régions anatomiques de l’‘intestin grêle ?
- Duodénum: peu de microbes à cause des sucs acides, bile et sécrétions pancréatiques. Cocci et bâtonnet Gram+
- Jéjunum: enterococus faecsalis, lactobacillus, candida albicans
- Iléon: pH devient + alcalin, anaérobie Gram -, enterobacteriaceae
Où se trouve la plus grande population et diversité microbienne ?
Dans le colon, + de 1000 espèces différentes.
La plupart des bactéries sont anaérobies strictes. (95-99%)
Quelles sont les bactéries retrouvées dans le colon ? (6)
- Bacteroides (surtout B.fragilis) –> batonnet Gram - 25%
- Peptostreptococcus –> cocci Gram +
- Clostridium –> batonnet Gram +
- Fusobacterium
- Enterococcus –> cocci Gram +
- E.coli (0,1%)
Comment peut-on restaurer la flore ?
À l’aide de probiotiques composés de lactobacillus et/ou bifidobacterium
Quels sont les autres micro-organismes retrouvés dans le colon ?
- Mycètes: candida albicans
- Protozoaires: Trichomonas hominis, Entamoeba hartmanii et Endolimax nana
Est-ce que l’adhérence est nécessaire comme dans l’intestin grêle ?
Non car le flot est + lent.
Qu’est ce qui permet une concentration de bactéries très élevée ?
L’abondance de nutriments (milieu riche en polysaccharides et en protéines).
Les bactéries prennent 1/4.
Quel est le mécanisme de défense contre l’adhérence des bactéries à la paroi ?
- Le taux de régénérescence élevé (taux de division).
- Épaisse couche de mucus
Pourquoi l’hôte produit du mucus ?
C’est en réponse à des composés bactériens provenant du microbiome.
Quels sont les rôles du microbiome du colon ? (5)
- Digestion des aliments par des enzymes (1er rôle) en succinate, lactate, AG courtes chaînes, acétate, propinate et butyrate.
- Production d’agents antibactériens (bactériocines et colicines) empêchant la colonisation par des pathogènes
- Protection de l’épithélium en y adhérant (transitoire)
- Production de vitamines B et K
- Stimulation antigénique du SI
Qui sont les 1er résidents du colon des nourrissons allaités et des nourrissons non allaités ?
Nourrissions allaités: bifidobacterium.
Nourrissons non allaités: lactobacillus
Lors de l’ingestion de nourriture solide, par qui sont remplacés les colonisateurs initiaux ?
Par une microflore gram - (entererobacteriaceae dont E.coli) qui provoquent une diminution de l’O2 ==> apaprition des bacteroides qui peuvent coloniser que en condition anaérobie.
Quelle est la durée de l’établissement de la flore mature ?
2 ans.
Quelles sont les sources des bactéries colonisantes ? (3)
- Parents et autres proches
- Environnement
- Mode de vie de l’enfant
Que possèdent les consommateurs de viande dans leurs selles ?
Plus de bacteroides et autres anaérobies que les consommateurs de poissons et légumes.
Qu’est ce que les bactéries commensales ?
Ce sont des bactéries de la flore non considérées comme étrangères par le SI et qui renforcent la réponse immune en le gardant en alerte.
Que provoquent une inflammation légère induite par le microbiome ? (2)
-Sécrétion de peptides antibiotiques
-Stimulation des cellules productrices d’anticorps
Ce qui empêche les bactéries de pénétrer la membrane muqueuse.
Donnez 2 exemples de maladies causées par un microbiome du colon incomplet ou perturbé.
- Botulisme infantile chez l’enfant (0-2 ans) par des spores de Clostridium botulinum trouvé dans le miel ==> germination des spores ==> production de neurotoxines ==> paralysie et mort.
- Colite pseudomembraneuse par clostridium difficile ==> sécrétion de toxines ==> détérioration de la muqueuse
Donnez quelques exemples du rôle bénéfique du microbiome du colon ?
- Contrôle de l’appétit
- Production de butyrate par Lactobacillus rhamnosus (nutriment important pour les colonocytes, propriétés anti-inflammatoires)
- Inducteurs de production de sérotonine sécrétés par des espèces sporulantes (clostridium).
Quels sont les rôles de la sérotonine ? (3)
- Dans la dépression
- Dans la santé cardiaque
- Dans la santé des os et gastro-intestinale
Une baisse de la diversité du microbiome peut entraîner une baisse de la fonctionnalité . V ou F ?
C’est vrai.
Pourrait-il y avoir un lien entre une antibiothérapie et une maladie non infectieuse ?
Oui, de manière indirecte.
