Cours 10 : Analyse morphométrique

Question 1

Deux types de caractéristiques quantitatives décrivant la morphologie

Answer 1

1. Caractères morphométriques (longueur des structures)
2. Caractères méristiques (décompte des structures)

Question 2

Landmark

Answer 2

Point correspondant entre différentes formes

Question 3

Critères d’un bon landmark

Answer 3

-Placés sur une structure anatomique ou associé à une structure par une relation mathématique
-En nombre égal entre les spécimens

Question 4

Quel landmark ne pourrait-on pas utiliser pour comparer la truite avec l’achigan

Answer 4

La nageoire adipeuse car pas présente chez l’achigan

Question 5

Configuration

Answer 5

Position de chacun des landmarks dans l’espace cartésien

Question 6

Paramètres de la matrice de configuration donnée pour chaque individu

Answer 6

k x m où
k : nombre de landmarks
m : nombre de dimensions dans l’espace cartésien (2 ou 3)

n : nombre d’individus

Question 7

Est-il pratique de lier n matrices k x m une à la suite de l’autre

Answer 7

Très peu pratique à manipuler
-Plus simple seulement pour rendre les données disponibles

Question 8

Fct R qui permet de lire la matrice en trois dimensions k x m x n

Answer 8

Read.tps

Question 9

Qu’est-ce que la forme d’un caractère

Answer 9

Ce qui reste après avoir retiré la variance due aux translations, dilatations et rotations

Question 10

Translation

Answer 10

Mvt des points selon un vecteur

Question 11

Dilatation

Answer 11

Multiplication des points par un scalaire

Question 12

Rotation

Answer 12

Rotation de tous les points par rapport à une point de référence

Question 13

Comment calculer la variance entre les landmarks de deux configurations

Answer 13

Somme des carrés des écarts

Question 14

Deux types d’analyses pratique pour comparer des populations entre elles

Answer 14

Analyses GPA et OPA

Question 15

Analyse GPA

Answer 15

Compare les formes moyennes des poissons
-ne s’intéresse pas à la directionnalité des changements

Question 16

Test statistique basé sur quelle distribution pour évaluer la forme moyenne des poissons et les écarts à cette moyenne

Answer 16

Fisher

Question 17

Meilleur test pour analyser l’ensemble des landmarks des individus de deux populations

Answer 17

Test non paramétrique de James en bootstrap

Question 18

Analyse OPA

Answer 18

Cherche à savoir si les formes des poissons diffèrent entre les lacs
-S’intéresse à la variation et directionnalité du changement
-Seulement la variance associée à la forme (minimise au maximum translations, rotations et dilatations)

Question 19

L’analyse OPA est-elle symétrique

Answer 19

Non. Asymétrique