Cours 1- Structure des acides aminés Flashcards

1
Q

Les acides aminés sont dits amphotériques, que signifie ce mot?

A

Signifie que l’élément a à la fois des caractéristiques des acides et des caractéristiques des bases

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2
Q

Dans les protéines, on retrouve seulement les acides aminés de la forme…?

A

L

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3
Q

Quel acide aminé est le seul qui n’est pas chiral?

A

La glycine

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4
Q

Il existe un acide aminé qui possède une énergie presque équivalente en conformation cis et trans, quel est son nom?

A

Proline

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5
Q

Quels sont les 9 acides aminés qui sont non-polaire (chaîne latérale hydrophobe)?

A

Glycine, valine, proline, phénylalanine, alanine, méthionine, leucine, isoleucine, tryptophane

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6
Q

Quels sont les 6 acides aminés polaire non-chargés?

A

Asparagine, glutamine, tyrosine, cystéine, serine, threonine

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7
Q

Quels sont les 3 acides aminés polaire basique (chargé +)?

A

Lysine, arginine, histidine

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8
Q

Quels sont les 2 acides aminés polaire acide (chargé -)?

A

acide aspartique, acide glutamique

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9
Q

Où sont situé les acides aminés hydrophobe dans la structure tridimensionnelle des protéines? Est-ce qu’ils participent aux réactions chimiques?

A

Caché à l’intérieur de la structure, ne participe pas aux réactions naturellement. (interactions faible ou nulle avec l’eau)

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10
Q

Vrai ou faux, dans les protéines, les acides aminés polaires forment des contacts avec le solvant?

A

Vrai, s’ils peuvent former des ponts H (interaction des groupements fonctionnels avec l’eau)

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11
Q

L’histidine a une caractéristique spéciale, quelle est-elle?

A

Le groupement imidazole de l’histidine peut gagner ou perdre un proton en fonction du pH. Donc il peut être soit polaire chargé ou polaire non-chargé selon le pH

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12
Q

Pourquoi est-il possible de classer la glycine parfois parmi les a.a polaires?

A

Car il est non-hydrophobe et non-chargé

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13
Q

Qu’est-ce que le pKa?

A

C’est la mesure quantitative pour indiquer la force d’un acide (pH ou 50% des molécules sont sous la forme acide et 50% des molécules sont sous la forme de la base conjuguée)

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14
Q

Qu’est-ce que le point isoélectrique?

A

C’est le pH où l’acide aminé est électriquement neutre (autant de charges positives que de charges négatives)
(Zwitterion)

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15
Q

Classez en ordre croissant de valeur de pKa les groupes des acides aminés (général)

A

Groupe carboxyle, chaîne latérale et groupe amine

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16
Q

Quels sont les 3 acides aminés qui ont un ordre croissant de valeur de pKa différent?

A

Tyrosine, lysine et arginine (groupe carboxyle, groupe amine, chaîne latérale)

17
Q

Où est situé le lien peptidique entre deux acides aminés?

A

Entre le C=O du premier acide aminé et le N-H du deuxième

18
Q

De quelle façon nomme-t-on un polypeptide?

A

Du N-terminale au C-terminale

19
Q

Qu’est-ce qu’un résidus d’acide aminé?

A

Acide aminé impliqué dans un polypeptide ou protéine (acide aminé au sein d’un polypeptide)

20
Q

Qu’est-ce qu’une structure primaire?

A

Arrangement linéaire des A.A

21
Q

Qu’est-ce qu’une structure secondaire?

A

formations locales de structures tridimensionnelles à plusieurs A.A

22
Q

Qu’est-ce qu’une structure tertiaire?

A

assemblage de structures secondaires en motifs protéiques formant la configuration native de la protéine

23
Q

Qu’est-ce que la structure quaternaire?

A

assemblage de plusieurs polypeptides entre eux pour former une protéine fonctionnelles (sous-unités)