Cours 1 - Introduction à la microbiologie Flashcards
Quels sont le sens strict et le sens large de la microbiologie?
Sens strict: Science qui étudie les organismes microscopiques
Sens large : Science qui se définit par les techniques qu’elle emploie
Nommer 4 impacts positifs qu’ont les bactéries chez l’homme
1- Microbiote
2- Source de nourriture
3- Antibiotiques et autres molécules
4- Biothechnologie
Nommer 4 impacts positifs qu’ont les bactéries dans la nature
1- Décomposition (recyclage)
2- Balance écologique
3- Biodégradation
4- Bioremédiation
Quels sont les 4 impacts négatifs des bactéries chez l’homme et dans la nature?
1- Infection
2- Détérioration des aliments
3- Corrosion
4- Mauvaise odeur
Nommer les 6 types de microorganismes
1- Algues 2- Protozoaires 3- Mycètes (levures, moisissures) 4- Bactéries 5- Virus 6- Prion
Définir la cellule et expliquer ses 6 propriétés
Définition simple: Le plus petit commun dénominateur de la matière vivante
Propriétés des cellules :
1- Métabolisme: Les nutriments prélevés dans l’environnement sont transformés dans la cellule et les déchets sont éliminés dans l’environnement. La cellule est un système ouvert.
2- Reproduction: Les éléments chimiques de l’environnement se transforment en de nouvelles cellules sous la conduite de cellules préexistantes.
3- Différentiation: La formation d’une nouvelle structure cellulaire.
4- Communication: Les cellules communiquent ou interagissent par des échanges
de molécules chimiques.
5- Mouvement: Les cellules possèdent diverses formes de motilité (déplacement de cellules et/ou mouvements internes).
6- Évolution: Les cellules contiennent des gènes et évoluent, présentant de nouvelles propriétés biologiques.
VOIR IMAGE COMPARAISON CELLULE DIAPO 19 + lire diapos 20-21 (classification)
Donner la classification des 5 règnes de Whittaker en indiquant leur type cellulaire, niveau d’organisation, nutrition et représentants
- Monères :
- Type cellulaire: Procaryote
- Niveau d’organisation: Unicellulaire
- Nutrition: Autotrophe ou hétérotrophe
- Représentants: Archéobactéries, Cyanobactéries, Eubactéries - Protiste
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d’organisation: Unicellulaire (quelques pluricellulaires)
- Nutrition: Autotrophe ou hétérotrophe
- Représentants: Algues, protozoaires, myxomycètes - Mycètes
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d’organisation: Pluricellulaires (quelques unicellulaires)
- Nutrition: Hétérotrophe
- Représentants: Zygomycètes, Ascomycètes, Basidiomycètes, Levures, Lichens - Plantes
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d’organisation: Pluricellulaires
- Nutrition: Autotrophe
- Représentants: Invasculaires, Vasculaires - Animaux
- Type cellulaire: Eucaryote
- Niveau d’organisation: Pluricellulaires
- Nutrition: Autotrophe
- Représentants: Invertébrés, Vertébrés
D’un point de vue moderne, sur quoi se base la nouvelle classification des règnes de Woese (1990)?
Quelles sont les 4 nouvelles relations phylogénétiques?
Classification basée sur des caractères moléculaires
Cette nouvelle classification suggère de nouvelles relations phylogénétiques:
- Tous les organismes vivants seraient issus d’un ancêtre commun auquel on
a donné le nom de progénote - Tous les organismes vivants pourraient être classés en trois grands règnes différents : eubactéries (Bacteria) archéobactéries (Archaea), et eucaryotes (Eucarya)
- Les mitochondries et les chloroplastes proviendraient, par endosymbiose, de bactéries aérobies et photosynthétiques, respectivement
- Les Archaea seraient phylogénétiquement plus proches des Eukarya que des Bacteria
Quels sont les 3 domaines primaires lorsqu’on classifient les espèces au niveau moléculaire (ARN 16S)?
Bacteria, Archéa et Eucarya
VOIR DIAPO 24
Pour le domaine des Bacteria, quel est:
- Type de cellule
- Organismes (5)
- Dimensions
- Paroi cellulaire
- Membrane cellulaire
- Organelles (6)
- ADN (8)
- Type de cellule : Procaryote
- Organismes : Cyanobactéries, Gram + et Gram - Streptocoques, Staphylocoques etc.
- Dimensions: 1 à 10 μm de longueur (en moyenne)
- Paroi cellulaire: Peptidoglycane
- Membrane cellulaire: Chaînes d’acides gras linéaires liées au glycérol par des liaisons ester
- Organelles : Peu d’organelles
Pas de noyau Inclusions, ribosomes, Flagelles, Pili - ADN: Bicaténaire.
Circulaire et dans le nucléoïde.
Superhélices.
Associé à des protéines un peu semblables aux histones des Eucarya.
Pas d’introns. Généralement 1 seul chromosome. Plasmides, Génome petit
Pour le domaine des Archea, quel est:
- Type de cellule
- Organismes (3)
- Dimensions
- Paroi cellulaire
- Membrane cellulaire
- Organelles (5)
- ADN (8)
- Type de cellule : Procaryote
- Organismes : Méthanogènes Halophiles, Hyperthermophiles
- Dimensions: 1 à 10 μm de longueur (en moyenne)
- Paroi cellulaire: Pseudopeptidoglycane
- Membrane cellulaire: Chaînes d’acides gras linéaires liées au glycérol par des liaisons ester
- Organelles : Peu d’organelles
Pas de noyau Inclusions, ribosomes, Flagelles - ADN: Bicaténaire.
Circulaire et dans le nucléoïde.
Superhélices.
Associé à des protéines similaire aux histones des Eucarya.
Présence d’introns. Généralement 1 seul chromosome. Plasmides, Génome petit
Pour le domaine des Eucarya, quel est:
- Type de cellule
- Organismes (4)
- Dimensions
- Paroi cellulaire (2)
- Membrane cellulaire
- Organelles (7)
- ADN (6)
- Type de cellule : Eucaryote
- Organismes : Protistes
Mycètes, Plantes et Animaux - Dimensions: 1 à 100 μm de longueur (en moyenne)
- Paroi cellulaire: Polysaccharides (plantes) Chitine (mycètes)
- Membrane cellulaire: Chaînes d’acides gras linéaires liées au glycérol par des liaisons ester
- Organelles : Noyau, mitochondries, chloroplastes, Réticulum endoplasmique, Golgi, lysosomes, peroxysomes
- ADN: Bicaténaire.
Très long, linéaire avec beaucoup de régions codant pour aucune protéine ou aucun ARN (Introns). Associé aux histones. Limité par l’enveloppe nucléaire. Organisé en chromosomes. Génome important
Nommer 12 caractéristiques des bactéries
- Règne des monères
- Petites cellules (1-10m)
- S’adaptent très facilement
- Paroi bactérienne
- Peu d’organelles
- Petit génome
- Colonisent toutes sortes d’environnements
- Dominent en nombre et par leur activité métabolique la biosphère
- Passent malgré tout inaperçues
- Grande majorité est cependant inoffensive
- Décomposent les organismes morts et recyclent ainsi les éléments chimiques vitaux • Les eucaryotes ont besoin des procaryotes pour vivre mais le contraire n’est pas nécessairement vrai
Expliquer les 3 traits morphologiques bactériennes
1- Taille: 0,05um à 500 um
2- La forme: Sphérique ou ovale (coque), allongée (bâtonnet, bacille), hélice ou spirale (spirilles - rigides, spirochètes - flexibles), bourgeonnantes et apendiculées, filamenteuses
3- L’arrangement : isolé, amas, paire, chaîne, grappe, tétrade
VOIR image diapo 38, 39, 40
Qu’est-ce que l’Agar?
Agar = agent solidifiant, polymère de D-galactose (algue)
- Poudre ajoutée à un milieu liquide (1,5%)
- Solubilise à ébullition; solidifie à 42C (reste solide mm à 50-60C)
- Non toxique, non métabolisable
