Cours 1 Flashcards
C’est quoi la pangénèse et qui la décrit ?
Les Grecs. L’hérodité était transmise au cours des rapports sexuels par des fragments mini (cheveux ou ongles). L’embryon était assemblé à partir de ses composantes minuscules.
Qu’a fait Gregor Mendel ?
Modèle expérimental sur des pois de couleurs différentes. Les facteurs qui déduisent la couleur se transmettent aux générations suivantes. Définit les notions de dominance et de récessif.
Qu’a fait Charles Darwin ?
L’origine des espèces, les variations qui donnent avantage sélectif vont être transmises à la génération suivante.
Que croyaient les Victoriennes ?
Que les vices et vertus tenaient de la famille.
Qui invente l’eugénisme et c’est quoi ?
Francis Galton. Ensemble des méthodes et pratiques visant à transformer le patrimoine génétique de l’lespece humaine dans le but de le faire tendre vers un idéal déterminé.
Qui est Charles Davenport ?
Meneur du mouvement d’eugénisme aux USA, en recueillant des arbres généalogiques concernant la génétiquende de certain traits.
Qui est Madison Grant ?
Écrit le déclin de la grande race qui devint la bible des nazis.
1 Mettent en place un mouvement de stérilisation.
2 Introduisent l’euthanasie.
Qui est James Watson ?
Établit que l’ADN était une longue molécule composée de 4 bases différentes.
Qui est Maurice Wilkins ?
Physicien qui s’attaque à l’ADN en utilisant la méthode de difraction des rayons X. Convaincue que l’ADN était une hélice de multiple brin.
Qu’est-ce qu’on fait, Francis Crick et James Watson ?
Ils construisent le premier modèle de la molécule d’ADN à trois hélices.
Qu’est-ce que Rosalind Franklin a fait ?
Le contenu d’eau dans l’ADN ne favorise pas une armature centrale, détruit le modele de Watson -Crick. Obtient un cliché au rayon X qui suggèrent une structure de forme hélicoidal.
L’ADN est constitué de chaînes _________.
polynucléotidiques
De quelles deux molécules est composé un nucléoside ?
Une base azotée (A, G, C, T) et un sucre (ribose or désoxyribose)
De quelles trois molécules est composé un nucléotide ?
Une base azotée (A, G, C, T) et un sucre (ribose ou désoxyribose) et un phosphate.
Par quel processus se fait la formation d’un nucléotide ?
La condensation
Par quel type de lien la base et le sucre sont-ils reliés ?
Liaison glycosyle
Par quel type de lien le phosphate et le sucre sont-ils reliés ?
Liaison phosphoester.
Quelles bases sont les purines ?
Adénine et guanine
Quelles bases sont les pyrimidines ?
Thymine et cytosine
Chaque base existe sous 2 configurations en équilibre, les ______ ___________.
États tautomériques
Sous quels états tautomériques existent les bases A et C et quel est l’état préférentiel ?
Amino et imino.
Amino est l’état préférentiel
Sous quels états tautomériques existent les bases G et T et quel est l’état préférentiel ?
Céto et Énole.
Céto est l’état préférentiel.
Vrai ou faux : les bases ne doivent pas toujours être dans leur état tautomérique préférentiel pour que l’appariement Watson-Crick soit
Possible.
Faux, ils doivent.
Qu’assurent les liaisons H⁺ entre les bases (2) ?
– Stabilité thermodynamique de l’hélice
– Spécificité d’appariement des paires de bases
Quels sont les trois facteurs qui affectent la stabilité de la double hélice ?
1 L’entropie
2 L’empilement des bases
3 – Les influences hydrophiles/hydrophobes
Comment l’entropie stabilise la double hélice (3) ?
1 Chaque liaison H entre deux bases en interaction provient de la disparition d’une liaison H.
préexistante avec une molécule d’eau.
2 Lors de la séparation des brins, les molécules d’eau s’alignent le long des bases de la chaine.
3 Quand les brins s’apparient pour reformer la double hélice, les molécules d’eau associées aux
bases sont chassées.
Ceci crée de l’entropie qui stabilise la double hélice.
Comment l’empilement des bases stabilise-t-il la double hélice (2) ?
Les bases azotées sont planes et hydrophobes, alors la façon dont ils s’empilent, une par-dessus l’autre, crée une interaction entre les nuages électroniques de noyaux délocalisés.
La superposition favorise les interactions de Van der Waals qui réduisent l’énergie globale de la molécule.
Comment les influences hydrophiles/hydrophobes stabilisent-elles la double hélice ?
La dualité entre l’armature sucre-phosphate (polaire et hydrophile) et les bases (non-polaire et hydrophobe).
Ces forces électrostatiques créent une forte pression qui colle les deux brins de l’ADN.
Qu’est-ce qui se passe si on tente d’apparier deux bases incompatibles ?
Les deux atomes accepteurs se feront face, alors il n’y aura aucune place pour laisser passer une molécule d’eau.
Comment s’appelle le processus dans lequel certaines bases peuvent ressortir de la double hélice ?
Le pivotement de base.
Dans le pivotement des bases, la base retournée peut devenir quoi et participer dans quels processus (3) ?
Des ligands de certaines enzymes.
1 – Méthylation des bases
2 Recombinaison homologue
3 – Réparation de l’ADN
Vrai ou faux : le pivotement des bases consomme beaucoup d’énergie ?
Faux, parce que les bases retournent une après les autres.
Vrai ou faux : le pas de l’hélice est habituellement à gauche ?
Faux, à droite.
C’est quoi la périodicité de l’ADN ?
10 pb par tour
Chaque paire de bases est décalée de la précédente de quel angle ?
36°
Quel est l’angle qui sépare les 2 sucres de chaque paire ?
120° pour le petit sillon et 140° pour le grand sillons
Pourquoi est-ce que le petit sillon n’est pas riche en information ?
Le profil chimique, plus condensé et moins accessible, des bases A-T et T-A est pareil, donc pas possible de les identifier.
Sous quelle forme se retrouve notre ADN (plus proche des conditions physiologiques ) ?
B
Caractéristique de l’ADN en forme B ?
– -10 pb / tour
– -Grand et petit sillon normal.
+ près condition physiologique
Quelles sont les caractéristiques de l’ADN en forme A ?
– -11 pb / tour
– -Grand sillon + étroit
– -Petit sillon plus large et moins profond.
- Solutions pauvres en eau mais riche en sel
Caractéristique de l’ADN en forme Z ?
– -12 pb / tour
– -Grand sillon aplati à la surface hélicoïdale.
– -Petit sillon très étroit et plus profond.
– Répétitions purines-pyrimidines
- hélice a gauche
Que veut dire un arrangement en hélice d’avion (2) ?
1 Le grand et le petit sillon ont des largeurs différentes.
2 . Modifier localement le nombre de pb par tour.
Quelles configurations peuvent prendre les liaisons glycosyles reliant les bases au sucre ?
Syn ou Anti
Quelle configuration prennent les liaisons glycosyles reliant les bases au sucre dans l’ADN hélice à droite ?
Toujours anti
Quelle configuration prennent les liaisons glycosyles reliant les bases au sucre dans l’ADN hélice à gauche ?
Pour résidus pyrimidiques : anti
Pour résidus puriques : Syn
Alternance anti et syn donne allure en ________
au squelette d’ADN
zigzag
Dans quelles conditions pouvons-nous trouver de l’ADN Z en solution ?
Il doit y avoir une haute concentration d’ions positifs.
Quels sont les noms des processus de séparation et de ré-association de brins d’ADN ?
Dénaturation et hybridation
C’est quoi l’hyperchromicité ?
Quand nous augmentons la température d’une solution d’ADN, nous remarquons aussi une augmentation dans l’absorbance à 260 nm
Comment appelle-t-on la température de fusion de l’ADN et quels sont les 2 facteurs qui l’influencent ?
La Tm
1 – Le contenu en G-C
2 – La force ionique de la solution
Quelle est l’influence de la force ionique sur la Tm ?
Plus la force ionique de la solution augmente, plus la Tm augmente.
Pourquoi Tm augmente avec l’augmentation du contenu de G-C ?
Puisque la liaison G-C comporte 3 liaisons H, alors elle est plus stable.
Différences topologiques entre ADN linéaire et ADN circulaire ?
L’ADN circulaire est topologiquement contraint, parce que le nombre de tour est limité.
C’est quoi le nombre d’enlacement ?
Le nombre de fois qu’un brin d’ADN circulaire doit passer à travers l’autre pour que les 2 brins soient séparés.
Quelles deux composantes géométriques doit-on additionner pour avoir le nombre de tours d’enlacement ?
Le nombre de torsions et le nombre de supertours.
C’est quoi le nombre de torsion ?
Le nombre de tours d’hélice d’un brin autour de l’autre
C’est quoi un supertour ?
L’ADN s’entrecroise sur lui-même.
Quels sont les deux types de supertours possibles et leur description ?
1 Supertour Plectonémiques : enroulement de l’axe longitudinal sur lui-même.
2 Supertour Toroïdaux : enroulement de l’axe longitudinal autour d’un cylindre imaginaire.
Comment pouvons-nous trouver le nombre d’enlacements d’ADN complètement relaxé ?
Le nombre de paires de bases / 10,5
Que fait l’enzyme de DnaseI ?
Élimine le surenroulement et relâche l’ADN.
C’est quoi un sourenroulement négatif ?
Une forme d’emmagasinage d’énergie libre pour faciliter les processus biologiques que nécessite la séparation des 2 brins de la double hélice (réplication ou transcription).
Quelle tendance présentent les régions qui contiennent un déroulement négatif ?
Tendance à se désenrouler partiellement.
C’est quoi un nucléosome ?
Une petite structure dans laquelle l’ADN des cellules eucaryotes est compacté.
C’est quoi une histone ?
Des protéines qui forment le cœur du nucléosome.
Quel est le pas de l’enroulement dans les nucléosomes et à quoi équivaut-il ?
À gauche. équivaut à un surrenrourement négatif.
Qu’est-ce que l’enroulement de l’ADN autour de nucléosomes introduit ?
Une super-hélicité négative.
À quoi servent les topoisomérases ?
À relâcher l’ADN sous-enroulé pour faciliter des processus biologique.
Mécanisme d’action de la topoisomérase 1 ?
Elle modifie la valeur du nombre d’enlacement d’un facteur 1, qui catalyse la coupure transitoire d’un seul brin.
Mécanisme d’action de la topoisomérase 2 ?
Elle modifie la valeur du nombre d’enlacement d’un facteur 2, qui catalyse la coupure transitoire des 2 brins.
Vrai ou faux : les topoisomérases utilisent de l’ATP ?
Faux, juste la topoisomérase 2.
Comment est -ce que les topoisomérases fonctionnent (2) ?
1 Coupent l’ADN en formant un intermédiaire covalent entre un résidu tyrosine et l’ADN.
2- Forment un pont enzymatique pour passr les segments d’ADN un à travers l’autre
A quoi sert l’ion éthidium et comment agit-il ?
Diminue l’enroulement de l’ADN et relâche les ADN circulaires.
S’intercalent entre les bases adjacentes de l’ADN (déstabilisent la double hélice), qui détord localement l’ADN de 26° et réduit la rotation d’une paire de bases à 10°.
Vrai ou faux : l’ion éthidium change l’enlacement sur tous les ADN ?
Faux, pas sur les ADN circulaires.
Comment est-ce que l’ARN diffère de l’ADN (3) ?
1 Lesquelette des ARN contient du ribose au lieu du désoxyribose.
2 Contient de l’uracile à la place de la thymine.
3 Généralement monocaténaire.
À quoi servent les ARNm ?
Ils servent d’intermédiaires entre le gène et la machinerie cellulaire de synthèse des protéines.
À quoi servent les ARNt ?
Ils servent d’adaptateurs entre les codons des ARNm et les acides aminés correspondants.
À quoi servent les ARNr ?
Ils servent un rôle structural, ils composent les ribosomes.
À quoi servent les miARN ?
Ils servent un rôle de régulation.
Vrai ou faux : certains ARN peuvent catalyser des réactions.
Vrai (ARNr)
Vrai ou faux : L’ARN est toujours monocaténaire ?
Faux, elle peut se replier sur elle-même localement pour former des doubles hélices similaires à l’ADN.
Les ARN forment de nombreuses structures secondaires de type tige-boucle, nommées en 3 ?
1 Épingles à cheveux
2 Hernies
3. Simples boucles
C’est quoi une tétra-boucle ?
Une structure secondaire de l’ARN très stable.
C’est quoi un pseudo-noeud ?
L’appariement de bases dans des régions éloignées peut créer des structures secondaires complexes.
Quelle paire de bases additionnelles est présente dans l’ARN qui n’est pas incluse dans le modèle Watson-Crick ?
U-G
Quel type d’ARN peuvent être des enzymes ?
Les rybozymes
À quels critères doivent répondre les ribozymes pour être une enzyme (3) ?
– -Site actif
– Site de fixation du substrat
– Site de fixation d’un cofacteur.
Quel était un des premiers ribozymes découverts et à quoi sert-il ?
La RNase P est impliquée dans la production des ARNt à partir d’un ARN précurseur.
Où retrouvons-nous le ribozyme à tête marteau ?
ribonucléases séquence-spécifiques de certains agents infectieux des plantes, les viroïdes.
C’est quoi un viroïde ?
Agents subviraux qui existent à l’intérieur des cellules en tant que particules d’ARN uniquement, sans capside ni enveloppe.
