Corynébactéries Flashcards

1
Q

Quel est le premier acide aminé à voir été fermenté? Par quel m.o.?

A

Glutamate/ acide L-glutamique
Par Corynebacterium glutamicum

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Gram?

A

+

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Catalase?

A

+

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Uréase

A

+

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Sporulante?

A

non

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Motile?

A

non

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

pH?

A

entre 6 et 8.5

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Température?

A

10 à 40, pas plus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Division cellulaire?

A

Par cassure

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Comment fonctionne la division par cassure?

A

Les cellules restent attachées après la scission binaire. La cassure aboutit en une disposition angulaire des cellules.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Qu’est-ce que les granules de volutine?

A

Réserve de polyphosphastes inorganiques.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Sources de carbone utilisés?

A

glucose, fructose, mannose, maltose, sucrose et tréhalose.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quel milieu sélectif?

A

Cystéine-Tellurite (colonies noires)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Qu’est-ce qui distingue corynébactéries des corynéformes?

A

Les corynébactéries sont des corynéformes, mais pas tous les corynéformes sont des corynébactéries.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Nommer les genres principaux de corynéformes.

A

Microbacterium
Arthrobacter
Brevibacterium
Propionibacterium
Bifidobacterium

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quels sont les étapes pour produire des mutants surproduction d’acide aminé?

A
  1. Utiliser un mutagène pour induire la mutation désirée.
  2. Isoler les bactéries mutantes.
  3. Cartographier sur le chromosome bactérien le site de la mutation
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Quel mutant on préfère? Délétion ou ponctuel?

A

Délétion pcq pas réversible et pas de leaky

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Quels sont les principaux mutagènes utilisés?

A

NTG, EMS, acide nitreux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Quel est le défi avec le NTG?

A

Plusieurs mutations à la fois

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Quels sont les 2 types de sélection des bactéries mutantes?

A

Direct et indirecte

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Qu’est-ce que la sélection directe?

A

On met les mutants sur un milieu qui contient un analogue de la molécule qu’on veut produire.
Ceux qui poussent sont ceux qui ont une mutation dans le feedback négatif, ce qui fait qu’ils n’ont plus de rétroinhibition ou ils y sont plus résistants. Ou encore, l’analogue a moins d’effet allostérique (répression).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Quel est le défi avec la sélection directe?

A

Trouver la concentration optimale de l’agent de sélection

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

à quoi sert la sélection indirecte?

A

Comprendre la voie de biosynthèse (cartographier)
Détection des mutants auxotrophes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

QU’est-ce que la sélection indirecte?

A

On recherche des auxotrophes pour l’a.a. d’intérêt.
On fait pousser les mutants sur un milieu complet.
On les réplique sur un milieu qui ne possède pas l’a.a.
Ceux qui n’y pousse pas sont ceux qui ont la voie de biosynthèse défaillante.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Quelles sont les stratégies pour obtenir des mutants suproducteurs d’a.a. (les buts visés)?

A

-Élimination génétique des mécanismes de rétroinhibition
-Direction altérée des voies métaboliques
-Augmentation de la concentration d’un substrat pour un enzyme en compétition avec les effecteurs de rétroinhibition
-Diminution de la concentration d’un effecteur ou d’un produit final
-Favoriser l’assimilation des précurseurs
-Inhibition ou inactivation des enzymes de dégradation des a.a. produits

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Quel m.o. est majoritairement responsable de la production d’acide L-glutamique?

A

Corynebacterium glutamicum

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Source de carbone pour produire acide L-Glutamique?

A

Mélasse et hydrolase d’amidon
Glucose, fructose, ribose, maltose, xylose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Source d’azote pour produire acide L-Glutamique?

A

Sels d’ammonium (NH4Cl, NH4SO3)
Urée
Ammoniaque gazeux

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

En plus d’être une source d’azote, en quoi est utile l’ammoniaque gazeux?

A

Permet de maintenir le pH pcq la production d’acide L-Glutamique cause une baisse de pH.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Sans ammonium gazeux en aérobie, le pH diminue. Quel problème cela cause?

A

L’acide alpha-cétoglutarique est accumulé au lieu de l’acide L-Glutamique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Quel facteur de croissance doit être ajouté et strictement contrôlé pour produire l’acide L-Glutamique?

A

Biotine

32
Q

Que se passe-t-il lors du manque d’oxygnène?

A

Les sucres seront fermentés, acide succinique et lactique de produit, mais pas L-glutamique

33
Q

Avec quoi la perméabilité de la bactérie entre en relation?

A

La concentration de biotine

34
Q

La biotine est un co-facteur de…

A

acétyl-coA carboxylase

35
Q

Que fait l’acétyl-coA carboxylase?

A

Responsable de la biosynthèse d’acide oélique

36
Q

Où se trouve l’acide oélique?

A

constituant de la membrane plasmique

37
Q

Quel est l’impact des acides gras saturés C16-C18?

A

Diminution de la biosynthèse de l’acide oélique

38
Q

Que se passe-t-il lorsque Diminution de la biosynthèse de l’acide oélique

A

Moins de phospholipides dans les membranes

39
Q

l’accumulation d’acide-L-glutamique est optimale quand la concentration de biotine est …

A

Suboptimal
Donc moins de biotine, même si meilleure croissance quand +

40
Q

Que pouvons-nous faire pour optimiser la production si on est en quantité excessive de biotine?

A

Ajouter de la pénicilline avec un détergent Tween pour permettre l’excrétion de l’acide-L-glutamique lors de lavage au PBS

41
Q

Céphalosporine et C16-C18 permettent aussi la production d’acide-L-glutamique quand…

A

quantité élevé de biotine dans le milieu (ex mélasse)

42
Q

Pourquoi utiliser des détergents et des antibiotiques lors de la synthèse d’acide L-glutamique?

A

Pour libérer dans le milieu l’acide et éviter l’accumulation intracell et la rétroinhibition.

43
Q

Si la concentration en biotine est optimale, l’accumulation d’acide L-glutamique est…

A

faible

44
Q

Si la concentration en biotine est suboptimale, l’accumulation d’acide L-glutamique est…

A

grande

45
Q

Que se passe-t-il avec l’acide oélique et l’excrétion de l’acide L-glutamique quand la biotine augmente?

A

Augmente
Diminue

46
Q

Nommer 2 antibios qui peuvent être ajoutés pour augmenter l’excrétion

A

Pénicilline
Céphalosporine C

47
Q

Que se passe-t-il avec l’Acide oélique lorsque les acides gras augmentent?

A

diminue

48
Q

Quelles sont les 2 voies possibles pour la synthèse de l’acide L-glutamique une fois la glycolyse faite jusqu’au PEP?

A

PEP en pyruvate
PEP en oxaloacétate

49
Q

Quelle est le type de fermenteur le plus productif pour l’acide L-glutamique?

A

Fermentation continue

50
Q

Pourquoi la fermentation continue demande moins d’énergie?

A

Parce que la mélasse est visqueuse et est ajoutée graduellement au lieu d’en un seul coup

51
Q

Le besoin en énergie est moindre en continue. Mais qu’en est-il des besoins en O2?

A

Ils sont augmentés

52
Q

Que permet la stérilisation du milieu en continue?

A

Économie d’énergie
Contrôle qualité
Meilleure productivité
Élimination des bactéries indésirables

53
Q

Quelle est la concentration optimale finale d’acide L-glutamique?

A

90-120 g/L

54
Q

Comment fait-on pour solubiliser l’acide L-glutamique?

A

Acidification du milieu à pH 3

55
Q

Quelle est l’étape finale pour obtenir les cristaux d’acide L-glutamique?

A

Salification de l’acide épuré et cristallisation par évaporation

56
Q

Quels sont les applications de l’acide L-glutamique?

A

Rehausser la saveur des aliments (mono-sodium de glutamate)
Additif dans les cosmétiques, savon, shampoing, agent de gélification

57
Q

Pour quoi sont utilisés la lysine et la thréonine?

A

Additifs alimentaires

58
Q

À partir de quoi la thréonine et la lysine sont synthétisés?

A

Glycolyse, PEP en oxaloacétate en Acide aspartique puis ramification

59
Q

Comment faire si on veut seulement produire de la thréonine et pas de la lysine?

A

Obtenir un mutant auxotrophe pour la lysine

60
Q

Quels sont les 2 gènes en commun pour la thréonine et la lysine?

A

lysC: aspartokinase (AK)
asd

61
Q

Quelle enzyme est inhibée par la thréonine et la lysine?

A

Aspartokinase

62
Q

Quelles sont les 3 stratégies possibles pour la sélection des souches qui produisent la thréonine?

A

-Auxotrophe pour lysine et autres a.a.
-Enzyme de régulation mutée
-plasmide/ADN exogène codant pour l’opéron thr

63
Q

Quelle est le type de bioréacteur le plus fréquent pour la production de thréonine et la lysine?

A

Fed-batch

64
Q

Quelle est la source de carbone principale pour la prod de thréonine?

A

Fructose

65
Q

Température pour prod de thréonine?

A

38 puis 28 après 17h

66
Q

Que doit-on ajouter fréquemment lors de la prod de thréonine ou de la lysine?

A

Précurseurs de la voie métabolique

67
Q

Facteur de croissance pour la prod de thréonine ou de la lysine?

A

Biotine

68
Q

Comment est recueillie la thréonine?

A

Centrifugation
Acidification
Augmentation de la concentration
Cristallisation
Séparation du liquide
Séchage des cristaux

69
Q

Quelles sont les sources de carbone pour la lysine?

A

Mélasse, acide acétique ou éthanol

70
Q

Quelles sont les sources d’azote pour la lysine?

A

sels de NH3 et de NH4+
Urée

71
Q

à quel pH se fait la prod de la lysine?

A

neutralité

72
Q

Comment est recueillie la lysine?

A

Centrifugation
Absorption sur une résine d’écahnge de cations
Élution avec alkali dilués
Éluat neutralisé avec HCl
Concentration
Cristallisation
Séchage

73
Q

Quel autre a.a. les corynébactéries peuvent être utilisées?

A

Tryptophane

74
Q

Qu’est-ce que la production d’acides aminées par approche enzymatique?

A

Des enzymes qui dégradent spécifiquement un substrat en l’acide aminé désiré.
Les enzymes sont immobilisés et on achemine le substrat de façon continu

75
Q

Pourquoi un mutant auxotrophe DAP est pertinent pour la production de la thréonine?

A

Facilite l’excrétion (moins dans la paroi cell)
+
empêche de faire la lysine