Coronavirus Flashcards
de quelle famille font parties les coronavirus?
coronaviridiae
d’où vient l’origine du nom “coronavirus”?
de l’aspect en couronne des protéines qui entourent le virus
de quel type de virus sont les coronovirus?
virus ARN, enveloppé
quelle est la taille moyenne du genome des coronavirus?
27 à 32 KB
Vrai ou faux? le génome du coronavirus est plus gros que celui des autres virus à ADN.
faux, il est plus petit que ceux à ADN, mais relativement gros pour ceux à ARN
nommer les 4 espèces de coronavirus
alpha, beta, gamma et delta
de quel groupe fait partie SARS-Cov-2?
groupe 2 (beta)
quel est la différence entre les groupes 1, 2 et 3?
les groupes 1 et 2 (alpha et beta) sont des virus qui peuvent infecter les humains, alors que le 3 (gamma et delta) infectent plus les volailles et les humains
vrai ou faux? le génome de tous les types de coronavirus codent pour des protéines structurales qui apparaissent chez tous ces virus.
faux, les protéines structurales présentes varient selon l’espèce de coronavirus
dans quel ordre de polarité pouvons-nous observer l’ARN des coronavirus?
polarité + lorsque sous forme ARN génomique, passe en - et revient en + tout en étant transcrit en ARNm
quelles sont les différences entre des virus saisonniers et pandémiques/épidémiques?
les saisonniers sont souvent moins graves et reviennent à chaque année
les épidémiques sont des virus à potentiel pandémiques avec symptômes plus graves, plus sévères (bonne propagation humain-humain)
quels sont ls symptômes des virus saisonniers vs épidémiques?
saisonnier: comme un rhume
épidémiques: pneumonie, détresse respiratoire aigu
la chauve-souris est un bon réservoir de quel type de coronavirus?
SRAS, MERS et SARS-CoV-2
Quel animal a permet de faire l’intermédiaire entre la chauve-souris et les humains dans la propagation du SRAS?
la civette
quel est le rôle du dromadaire dans la propagation des coronavirus?
il joue un rôle d’intermédiaire entre la chauve-souris et les humains dans propagation du MERS
quel est l’intermédiaire entre la chauve-souris et l’humain pour le SARS-CoV-2?
pas connu encore
dans quelle région du globe a-t-on identifier les premiers cas du SRAS et en quelle année?
région de guandong en chine en 2002
quels étaient les symptômes cliniques du SRAS?
syndrome d’allure grippale et diarrhées pour environ 20% des cas
quel était le temps d’incubation du SRAS?
a/d 10 jours
à quoi correspond le temps d’incubation?
c’est le temps que cela prend pour développer les symptômes après le moment du contact avec le virus
quels étaient les moyens de transmission du SRAS?
gouttelettes, contact et possible voie aérienne
qu’est-ce que le nombre reproducteur ?
nombre de nouveaux cas produits par 1 personne affectée
quel était le nombre reproducteur du SRAS?
1 cas génère 2.7 cas
peut-on dire que le SRAS et plus contagieux que la covid-19 actuelle?
non, car l’excrétion maximale du virus est de 12 à 14 jours après début des symptômes, donc plus facile d’isoler les gens avant qu’ils en contaminent d’autres
quelle était la contagiosité totale du SRAS?
4 semaines
quelle serait la source de l’épidémie SRAS? comment cela a été controlé?
la consommation de la civette (animal)
abattage de milliers de civette masquée
le pourcentage de mort du SRAS était de 10%, est-t’il plus ou moins virulent que la covid-19?
beaucoup plus (800 morts pour 8 000 cas total), car la covid est à +-2,3%
le canada a-t’il été touché par cette épidémie du SRAS?
oui, principalement toronto (travailleurs de la santé)
de quelle région est originaire le MERS? et en quelle année le premier cas observé
moyen-orient, arabie saoudite et alentours en 2012
vrai ou faux? l’Amérique du nord n’a pas été touché par le MERS?
faux, les États-Unis oui mais pas le canada
quel épidémie entre le SARS, MERS et COVID-19 est a plus mortelle?
MERS avec 35% de décès
quelle épidémie a mesuré le plus bas nombre de cas?
MERS
quel coronavirus est encore actif selon des études faites en 2019?
MERS et covid-19 actuel
temps d’incubation du MERS?
a/d 14 jours (plus long que SRAS)
quels étaient les symptômes du MERS?
semblable à celui du SRAS, allure grippale, mais sévérité pulmonaire plus variable
comment pouvait se transmette le MERS?
gouttelettes et contact
MERS est-il plus ou moins contagieux que SRAS?
moins en terme de nombre de cas, mais plus en terme de facilité de propagation car produit seulement 1 cas par personne infectée, mais le virus survit a/d 30h sur des surfaces inanimées et pendant très longtemps chez personne infectée
quel est le temps d’excrétion totale du MERS?
6 semaines même si absence de symptômes, donc contagieux longtemps
quel facteur environnementale favorise l’infection des personnes par le MERS?
dromadaires plus jeunes ou en périodes de reproduction
quand apparut la COVID-19?
premier cas de pneumonie inconnue fin 2019 en chine (wuhan)
quand fut identifié le nouveau virus de la covid?
début janvier, très rapidement après l’avertissement à l’OMS
quand avons-nous reçu le premier cas au québec?
fin février
l’urgence sanitaire mondiale fu décrétée avant ou après le premier cas à québec?
avant, fin janvier
à quel moment le variant omicron a été indentifié?
fin 2021 (décembre)
les premières administrations de vaccins se sont produites à quel moment?
fin 2020
quelles sont les hypothèses sur l’origine de la covid-19?
ville de wuhan (marché local) ou laboratoire de culture de coronavirus dans cette région
pour quel élément code le gène NSP12 de la covid-19?
pour l’ARN-polymérase ARN dépendante
qu’est-ce que NSP5?
de la gène codant pour la protéase principale (Mpro)
qu’elle est l’importance de la glycoprotéine spike?
c’est la protéine de surface qui lie le récepteur de cellules humaines lors de l’infection.
pourquoi le MERS n’a pas créer de pandémie?
car son nombre reproducteur est de moins de 1
détaillez brièvement le mécanisme de réplication de SARS-CoV-2?
attachement du virus à la surface d’une cellule via interaction entre protéine S et récepteur angiotensine de conversion 2, clivage de la protéine S en 2 parties, largage du génome viral et réplication ARN, translation au golgi et RE ou formation de virion puis libération par exocytose
quelle est la période d’incubation moyenne de la COVID-19?
environ 5 jours
quelle est le RO de transmission de la covid?
2.5, donc chaque personne infectée peut infectée 2.5 personnes de plus
quel est la caractéristique de la covid qui cause un problème majeur pour la contagiosité?
il y a entre 10 et 80% de personnes infectées qui sont asymptomatiques donc pas possible de savoir si elles doivent s’isoler ou pas.
personnes contagieuses a/d 3 jours avant les symptômes et dure 10-14 jours après
dans quelle tranche d’âge les décès sont les plus fréquents?
au-dessus de 80 ans
combien de variants y avaient-ils au début de la pandémie?
au tout début nous ne parlions pas de variant, mais plus de différence de génotypes circulant
comment identifier maintenant des variants d’intérêts?
les variants d’intérêts sont ceux qui change la transmissibilité, la pathogénicité ou ceux qui entrainent l’évasion immunitaire
qu’est-ce que l’évasion immunitaire?
processus par lequel le virus peut se répliquer même en présence des anticorps car ceux-ci ne le reconnait pas
qu’elles sont les différences entre les variants delta et omicron?
omicron présente une transmissibilité et évasion immunitaire plus grande (affectent plus de gens) mais maladie moins sévère, tandis que delta c’est l’inverse
vrai ou faux? le groupe d’âge 0-18 ans est presque aussi atteint que les adultes de plus de 50 ans.
très faux! le taux de mortalité des enfants est presque nul
quels sont les symptômes les plus courants aperçus chez les patients hospitalisés?
fièvre, toux sèche, difficulté respiratoire, troubles olfactifs et goût
Quel pourcentage de gens sont infectés sans apparition de symptômes?
30%
quels sont les pourcentages de patients présentant des symptômes modérés, sévères et critiques?
55%, 10% et 5%
vrai ou faux? suite à une première infection par la covid-19, l’immunité persiste définitivement, donc impossible d’être infecté à nouveau.
faux, les anticorps restent en effet pendant un certain temps dans le corps, mais ne persiste pas dans le futur, donc une prochaine infection est possible.
Comment se passe la liaison du SARS-2 aux cellules humaines?
les domaines RBD de la protéine S présente à la surface du virus se lie au récepteur ACE2 des cellules.
nommer quelques organes cibles de la covid-19?
poumons, cœur et vaisseaux sanguins, cerveau, yeux, odorat
expliquer le mécanisme d’infection d’une cellule de l’épithélium respiratoire?
virus se lie au récepteur et intègre la cellule, se réplique et libère d’autres virions qui infectent les cellules voisines, tout en entrant en contact avec les macrophages alvéolaires qui libèrent des cytokines pro-inflammatoires
comment est produite une tempête cytokinique systémique?
la sécrétion de cytokines par les macrophages alvéolaires crée un feedback positif qui active les lymphocytes T, les monocytes et d’autres macrophages qui sécrètent encore plus de cytokines
quels sont les effets d’une réponse immune défectueuse?
invasion excessive des monoytes, macrophages et lymphocytes au site d’infection (à cause de la perméabilité vasculaire), tempête cytokinique, oedème pulmonaire et pneumonie, inflammation systémique et organs failure
quelles sont les principales cibles des thérapies pharmacologiques?
les différents chemins inflammatoires, exemple TNF, IL-6, IL-18 ou recrutement des monocytes
quels sont les différents stades de progression de la covid chez un patient infecté?
stade 1: infection précoce=réplication virale en grande quantité donc le traitement serait un anti-viral
stade 2: début des symptômes pulmonaires (fin réplication viral et début réponse inflammatoire)
stade 3: phase hyper-inflammatoire = grosse réponse immunitaire et traitement par immunomodulateur
qu’arrive-t’il aux patients infectés par la covid-19 et l’influenza en même temps?
taux de mortalité plus élevé que lorsqu’infecté par l’une ou l’autre des maladies
quels sont les moyens de diagnostiques du virus?
virologique: écouvillon nasopharyngé (ou salive, gargarisme) suivi d’un RT-PCR
sérologique: prise de sérum sanguin suivi test ELISA ou neutralisation
clinique: symptômes de fièvre OU toux OU dyspnée OU anosmie (perte odorat)
qu’est-ce que les test antigénique et ELISA vont-ils détecter?
les composantes protéines du virus
quel(s) test(s) en laboratoires permet(tent) de détecter les composantes d’acide nucléique du virus?
PCR
quels test en laboratoire vont détecter la réponse immunitaire face au virus?
les tests de détection des anticorps (ELISA) et les tests de neutralisation en présence de virus
vrai ou faux? avant l’apparition des symptômes, les test diagnostiques n’ont pas de fortes de chances d’être positifs.
vrai, les tests vont tester positifs seulement après l’apparition des symptômes
quel test permet de donner un résultat positif plus tôt lors de l’apparition des symptômes?
PCR
quel test donnera un résultat positif même après un certain temps sans symptômes?
détection des anticorps
quel test est moins fiable pour les patients asymptomatiques en raison des nombreux résultats faux positifs?
les tests antigéniques rapides, car sortent souvent négatifs pour les patients sans symptômes alors qu’ils devraient être positif.
Quand est le meilleur moment (au cours de l’infection d’un patient) pour donner un vaccin?
avant l’infection
quand est-il recommandé d’administrer des anticorps monoclonaux neutralisant comme traitement pour la covid-19?
lorsque les patients viennent tout juste d’être exposé ou quand les premiers symptômes apparaissent
quand les symptômes de la covid-19 sont graves et que le patient est dans une forme critique, quel traitement doit lui être administré?
anti-viral (remdesivir) et/ou immunodulateur pour ralentir et/ou arrêter la réponse immunitaire (ex: dexaméthasone)
quel traitement anti-viral peut être donné à des patients infectés de façon modéré?
soit des anticorps monoclonaux ou des antiviraux (molnupiravir, paxlovid ou remdisivir)
donner des exemples de traitement qui pourrait être utilisé contre la covid-19 même si actuellement ne serve pas à ca?
colchicine (traitement de la goutte), tocilizumab et baricitinib (arthrite rhumatoide)
quelle est la cible du médicament remsidivir?
il inhibe la RdRp (arn polymérase)
quel est le mode d’action du molnupiravir?
inducteur de mutations léthales dans l’ARN polymérase virale
quels sont patients de choix pour l’administration du molnupiravir?
les personnes ayant des troubles de santé au préalable et qui seraient plus vulnérables au développement de symptômes sévères (diabétique, immunosupprimé, etc)
quelle est l’efficacité connue du molnupiravir?
30 % de réduction des passages au cas sévères
qu’est-ce que le paxlovid?
c’est un médicament fait d’une double thérapie qui inhibe la protéase 3CLpro et permet de réduire de 87% des morts
quels sont les patients ne pouvons pas recevoir le paxlovid?
ceux qui prennent déjà des médicaments pour d’autres problèmes de santé, ou ceux souffrant d’insuffisance rénale/hépatique
quel traitement se donne par voie intraveineuse uniquement et est donc plus problématique pour les patients non-hospitalisés?
le remdesivir
qu’y a-t’il de différent entre le xevudy et les autres traitements aux anticorps monoclonaux?
celui-ci est n’est pas une combinaison de 2 traitements en 1 et est moins sujet aux mutations de la protéine S chez les variants
quel est le mode d’action des traitements aux anticorps monoclonaux contre la covid-19?
ils vont avoir un effets neutralisant en visant la protéine S du virus et en l’entourant
nommer des exemples d’immunomodulateurs contre la covid-19 et leur effet escompté?
déxaméthasone, tocilizumab, etc :vont inhiber JAK ou neutraliser les effets des cytokines pro-inflammatoires pour réduire la réponse immunitaire
quels sont les types de vaccins viraux pour la covid?
vaccins inactivés (virus inactivés par température ou autre et ne peut pas se répliquer) et virus atténués (mutations présentes ou affaiblissement du virus donc se réplique mais moins bien)
quels sont les vaccins à base d’acide nucléique?
virus ADN (entre au noyau pour transcrire et traduire en protéines virales) et ARN (pas besoin d’entrer au noyau, seulement besoin de traduire en protéines virales)
de quel type de vaccins font partie ceux sous-unitaires et VLP)
vaccins protéiques
de quel façon les vaccins VLP émettent une réponse immunitaire?
ce sont des vaccins à particules qui imitent les particules virales et donc engendrent une réponse immunitaire
quels sont les 2 sortes de vaccins à vecteurs viraux?
le vaccin à vecteur réplicatif et le non-réplicatif ou le vecteur est souvent l’adénovirus qui expriment la protéine S.
quels sont les vaccins approuvés au canada?
pzifer, moderna et astrazeneca
quel vaccin est accepté aux USA mais pas au canada?
johnson et johnson
quels sont les types de vaccins qui sont actuellement en phase 3, qu’est-ce que cela implique?
protéine recombinante et VLP/adjuvant qui pourront peut-être être accepté et approuvé bientôt
quels seraient les types de vaccin plus efficaces?
ceux à acides nucléiques plus que les adénovirus
que nécessite les vaccins sous-unitaires?
un adjuvant
quels sont les avantages des vaccins à virus atténués?
réponse immunitaire plus semblable à l’infection naturelle et protection long terme avec une seule dose
pourquoi le vaccin à base de virus inactivé est meilleur pour certain type de patient (comparé à celui à base de virus atténué)?
chez les patients immunosupprimés (SI affaibli) le vaccin atténué pourrait être tout de même dangereux en raison de la réplication virale
quels sont les désavantages des vaccins inactivés?
plusieurs doses nécessaires avec adjuvants et la culture du virus est longue et pas possible en masse
nommer les désavantages des vaccins atténués?
pas bons pour les gens immunosupprimés, chaine de froid doit être respecté et les virus doivent être cultivés en grande quantité
quels sont les bons et mauvais côtés des vaccins sous-unitaires?
production rapide comparé de ceux viraux, mais réponse immunitaire plus faible et a besoin d’un adjuvant et production plus lente que ceux ADN ou ARN
les vaccins VLP et sous-unitaires sont-ils semblables au niveau des pour et des contre?
non plutôt l’inverse, car réponse immunitaire plus forte pour VLP et conception rapide, mais fabrication plus difficile et grandes quantités non-possible
quel vaccin nécessite une dose plus élevée lors de l’injection?
les vaccins à vecteur viral non-réplicatif
quelles sont les problématiques des vecteurs viraux (réplicatif et non-réplicatif)
réplicatif: plus de tests doivent être faits, chaine de froid nécessaire, production difficile en raison de la culture du virus
Non-réplicatifs: pas de reponse immune si déjà exposé au vecteur préalablement, dose élevé nécessaire et production grande quantité difficile
quel vaccin à vecteur offre une meilleure réponse immune?
celui réplicatif
quelle meilleure réponse immunitaire est offerte entre le vaccin à vecteur viral non-réplicatif et sous-unitaire?
vecteur non-réplicatif
quels vaccins doivent être conservés à basse température et compte dans les points négatifs?
vaccin à vecteur viral réplicatif, atténué et ARN
quels sont les avantages/ désavantages des vaccins ARN et ADN?
ARN: production rapide et pas d’insertion au génome mais pas stable et doit être au froid
ADN: production rapide et peu couteuse, stable à température pièce mais doit entrer au noyau et risque de l’intégrer au génome
